MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 13882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019551	AGA	2	6	548457	548462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_019551	TA	3	6	548464	548469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019551	TAA	2	6	548494	548499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019551	TGA	2	6	548535	548540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_019551	ACT	2	6	548569	548574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_019551	GA	3	6	548654	548659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019551	ACA	2	6	548671	548676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_019551	CTT	2	6	548708	548713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_019551	ATC	2	6	548719	548724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_019551	AGG	2	6	548757	548762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019551	GTT	2	6	548782	548787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019551	GCG	2	6	548810	548815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_019551	CAC	2	6	548848	548853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_019551	AACTT	2	10	548854	548863	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4015	NC_019551	TAA	2	6	548917	548922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019551	TCA	2	6	548958	548963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_019551	ATTTT	2	10	548985	548994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_019551	CAT	2	6	549086	549091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_019551	TTA	2	6	549094	549099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019551	TTC	2	6	549159	549164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_019551	TCA	3	9	549199	549207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_019551	TAA	2	6	549261	549266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_019551	TA	3	6	549345	549350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_019551	AGAAA	2	10	549405	549414	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_019551	TCTT	2	8	549429	549436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_019551	TA	3	6	549437	549442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019551	TGC	2	6	549520	549525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_019551	TAT	2	6	549569	549574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_019551	T	6	6	549580	549585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_019551	ACA	2	6	549626	549631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_019551	CCA	2	6	549688	549693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_019551	ATC	2	6	549717	549722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_019551	TTG	2	6	549761	549766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_019551	CTT	2	6	549779	549784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_019551	AAT	2	6	549811	549816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019551	AT	3	6	549824	549829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_019551	ATA	2	6	549879	549884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_019551	TCC	2	6	549896	549901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_019551	AATA	2	8	549939	549946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_019551	TCA	2	6	549961	549966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_019551	GTAT	2	8	549970	549977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019551	AAT	2	6	550005	550010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019551	CTT	2	6	550022	550027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_019551	CAG	2	6	550087	550092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_019551	T	6	6	550119	550124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019551	TAAT	2	8	550137	550144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019551	A	6	6	550159	550164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_019551	A	7	7	550220	550226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019551	TAA	2	6	550854	550859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_019551	AATA	2	8	550863	550870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_019551	ACTAA	2	10	550871	550880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4052	NC_019551	ATT	2	6	551417	551422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019551	TA	3	6	551437	551442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019551	T	6	6	551448	551453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019551	A	6	6	552081	552086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019551	CTAA	2	8	555963	555970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_019551	AATT	2	8	555998	556005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_019551	AT	3	6	556024	556029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_019551	AT	3	6	556051	556056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_019551	TAT	2	6	556064	556069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_019551	TAAT	2	8	556087	556094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_019551	AATA	2	8	556099	556106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019551	TAA	2	6	556170	556175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019551	TA	3	6	556259	556264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019551	AGAAA	2	10	556319	556328	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_019551	TCTT	2	8	556343	556350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_019551	TA	3	6	556351	556356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_019551	TGC	2	6	556434	556439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_019551	TAT	2	6	556483	556488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019551	T	6	6	556494	556499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_019551	ACA	2	6	556540	556545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_019551	CCA	2	6	556602	556607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_019551	ATC	2	6	556631	556636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_019551	TTG	2	6	556675	556680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019551	CTT	2	6	556693	556698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_019551	AAT	2	6	556725	556730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019551	AT	3	6	556738	556743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019551	ATA	2	6	556793	556798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_019551	TCC	2	6	556810	556815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_019551	AATA	2	8	556853	556860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019551	TCA	2	6	556875	556880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_019551	GTAT	2	8	556884	556891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019551	AAT	2	6	556919	556924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019551	CTT	2	6	556936	556941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_019551	CAG	2	6	557001	557006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_019551	T	6	6	557033	557038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_019551	ATG	2	6	557063	557068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019551	TA	3	6	557232	557237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_019551	TCG	2	6	557256	557261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_019551	TAA	2	6	557298	557303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_019551	ACA	2	6	557308	557313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_019551	ACTA	2	8	557314	557321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_019551	GTG	2	6	557339	557344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019551	ATT	2	6	557345	557350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019551	CAA	2	6	557446	557451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_019551	A	6	6	557500	557505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019551	ATA	2	6	557635	557640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019551	AT	3	6	557642	557647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_019551	TG	3	6	557669	557674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_019551	CTT	2	6	557712	557717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_019551	AGTA	2	8	557773	557780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019551	GTT	2	6	557818	557823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_019551	ATGT	2	8	557841	557848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019551	T	7	7	557858	557864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019551	GTT	2	6	557952	557957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_019551	TTA	2	6	558012	558017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019551	TAT	2	6	558021	558026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019551	TAA	2	6	558027	558032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019551	TAT	2	6	558036	558041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019551	AT	3	6	558067	558072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019551	TAA	2	6	558170	558175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_019551	TTG	2	6	558190	558195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019551	GCA	2	6	558251	558256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_019551	GGT	2	6	558266	558271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_019551	GT	3	6	558270	558275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019551	CAG	2	6	558291	558296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019551	AAAC	2	8	558356	558363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_019551	TTA	2	6	558410	558415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019551	GCT	2	6	558452	558457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_019551	ACAG	2	8	558574	558581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_019551	A	6	6	558614	558619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_019551	ATT	2	6	558698	558703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_019551	TGTA	2	8	558706	558713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019551	AAG	2	6	558759	558764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019551	CAA	2	6	558902	558907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_019551	AAG	2	6	558956	558961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019551	TATT	2	8	559137	559144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_019551	TAT	2	6	559149	559154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_019551	TA	3	6	559160	559165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019551	TAT	2	6	559179	559184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_019551	GTAT	2	8	560655	560662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_019551	AGTTA	2	10	560665	560674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_019551	A	6	6	560934	560939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_019551	TAA	2	6	560947	560952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_019551	ACTTTA	2	12	560993	561004	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4136	NC_019551	ATTTA	2	10	561050	561059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_019551	AG	3	6	561068	561073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_019551	TTTAG	2	10	562842	562851	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_019551	ATA	2	6	604129	604134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_019551	T	7	7	604627	604633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_019551	TA	3	6	605661	605666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_019551	AGAAA	2	10	605721	605730	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4413	NC_019551	TTAATG	2	12	614633	614644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_019551	ATT	2	6	614645	614650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_019551	AT	3	6	614672	614677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4416	NC_019551	ATTA	2	8	614690	614697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4417	NC_019551	AATT	2	8	617362	617369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4421	NC_019551	ATTT	2	8	617455	617462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4422	NC_019551	CTA	2	6	617495	617500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4425	NC_019551	ATC	2	6	620677	620682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4427	NC_019551	AGC	2	6	620718	620723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4432	NC_019551	ATG	2	6	620970	620975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4434	NC_019551	CTA	2	6	621043	621048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4436	NC_019551	AAT	2	6	621101	621106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4440	NC_019551	ATA	2	6	621284	621289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4447	NC_019551	TTCTT	2	10	621663	621672	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4448	NC_019551	T	7	7	621691	621697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4449	NC_019551	CTT	2	6	621738	621743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4450	NC_019551	CTT	2	6	621763	621768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4451	NC_019551	GAT	2	6	621793	621798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4453	NC_019551	CAAC	2	8	621852	621859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4455	NC_019551	AAC	2	6	621911	621916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4457	NC_019551	CTT	2	6	621967	621972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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