MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 13882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019551	TAT	2	6	411249	411254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019551	AT	3	6	411304	411309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019551	ATT	2	6	411317	411322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019551	AAG	2	6	411349	411354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019551	CAA	2	6	411367	411372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_019551	GAT	2	6	411411	411416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_019551	TGG	2	6	411440	411445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019551	TTG	2	6	411501	411506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_019551	A	6	6	411548	411553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_019551	TA	3	6	411556	411561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019551	GCA	2	6	411608	411613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_019551	TA	3	6	411691	411696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_019551	AAGA	2	8	411697	411704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019551	TTTCT	2	10	411719	411728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3015	NC_019551	AGA	2	6	411744	411749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_019551	AT	3	6	411782	411787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_019551	AGT	2	6	411948	411953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_019551	TCA	2	6	411968	411973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_019551	TGA	2	6	411992	411997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_019551	AAC	2	6	412064	412069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_019551	TGT	2	6	412070	412075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019551	CTA	2	6	412080	412085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_019551	TAT	2	6	414023	414028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_019551	TA	5	10	414070	414079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_019551	CAG	2	6	414093	414098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_019551	ACC	2	6	414232	414237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_019551	ATC	2	6	414328	414333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_019551	CTT	2	6	414369	414374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_019551	T	6	6	414373	414378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_019551	CTTTTT	2	12	414438	414449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3031	NC_019551	TTA	2	6	414492	414497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019551	TC	3	6	414544	414549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_019551	CAA	2	6	414558	414563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_019551	AAT	2	6	414571	414576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019551	TGA	2	6	414632	414637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019551	CTT	3	9	414654	414662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_019551	CT	3	6	414748	414753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_019551	TC	3	6	414822	414827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_019551	T	6	6	414847	414852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019551	TA	3	6	414854	414859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019551	TACCT	2	10	414889	414898	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_019551	ATC	2	6	414949	414954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_019551	AGT	2	6	414981	414986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019551	TGAA	2	8	415031	415038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019551	TCT	2	6	415059	415064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_019551	TAG	2	6	415101	415106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_019551	GAT	2	6	415124	415129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_019551	ATAA	2	8	415159	415166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019551	ATT	2	6	415237	415242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019551	AAT	2	6	415251	415256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019551	CA	3	6	415295	415300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_019551	AGA	2	6	415302	415307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019551	T	7	7	415460	415466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019551	A	6	6	415483	415488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019551	T	7	7	415502	415508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019551	CAC	2	6	415572	415577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_019551	ATCT	2	8	415641	415648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_019551	T	7	7	415693	415699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019551	TAT	2	6	415725	415730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019551	AT	4	8	415729	415736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019551	CAA	2	6	415740	415745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_019551	TTTA	2	8	415750	415757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019551	AATT	2	8	415788	415795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019551	TAAC	2	8	415839	415846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_019551	TCT	2	6	415847	415852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_019551	CTTTG	2	10	415870	415879	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3067	NC_019551	ATT	2	6	415883	415888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_019551	ATTG	2	8	415926	415933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019551	TA	3	6	415972	415977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_019551	T	6	6	416049	416054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_019551	TTA	2	6	416070	416075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_019551	TTA	2	6	416088	416093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_019551	T	6	6	416099	416104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019551	TA	4	8	416200	416207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_019551	CTC	2	6	416406	416411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_019551	CACC	2	8	416414	416421	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3077	NC_019551	TAAA	2	8	416428	416435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_019551	AAG	2	6	416550	416555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_019551	TA	3	6	416583	416588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_019551	A	6	6	416592	416597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_019551	TTA	2	6	416600	416605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019551	ATT	2	6	416606	416611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_019551	TGTTA	2	10	417160	417169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_019551	TTTTA	2	10	417174	417183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019551	TAAAT	2	10	417220	417229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_019551	ATTT	2	8	417237	417244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019551	T	7	7	417279	417285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_019551	AT	3	6	417411	417416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_019551	A	6	6	417426	417431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_019551	A	6	6	417435	417440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_019551	A	6	6	417447	417452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_019551	A	7	7	417457	417463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019551	A	7	7	417466	417472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_019551	GAG	2	6	417488	417493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_019551	TAT	2	6	417500	417505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_019551	AT	3	6	417571	417576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019551	TA	3	6	417577	417582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_019551	AGT	2	6	417613	417618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_019551	TGG	2	6	417676	417681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_019551	ATA	2	6	417810	417815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_019551	GATG	2	8	417850	417857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019551	TGG	2	6	417880	417885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_019551	CCA	2	6	417895	417900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_019551	GAT	2	6	417929	417934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019551	GCA	2	6	417978	417983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_019551	TG	4	8	418030	418037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_019551	AAG	2	6	418038	418043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_019551	GGA	2	6	418073	418078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_019551	GGA	2	6	418104	418109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019551	CAG	2	6	418146	418151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_019551	G	6	6	418164	418169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019551	GGT	2	6	418211	418216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_019551	GAA	2	6	418603	418608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019551	AGAT	2	8	418644	418651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019551	TGC	2	6	418679	418684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_019551	GTC	2	6	418691	418696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_019551	CAT	2	6	418759	418764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_019551	GGA	2	6	418803	418808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_019551	GAC	2	6	418816	418821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_019551	TCA	2	6	418828	418833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_019551	AC	3	6	418854	418859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_019551	AC	3	6	419023	419028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_019551	CCT	2	6	419160	419165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_019551	AGAATA	2	12	419181	419192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_019551	GAATA	2	10	419252	419261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_019551	CCA	2	6	419334	419339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_019551	CCA	2	6	419424	419429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_019551	TTTA	2	8	419434	419441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_019551	ACTC	2	8	419630	419637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_019551	GTA	2	6	419714	419719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_019551	GCGA	2	8	419723	419730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_019551	TAG	2	6	419766	419771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_019551	AAT	2	6	419819	419824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_019551	G	6	6	419885	419890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_019551	TCC	2	6	419895	419900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3136	NC_019551	GTA	2	6	420194	420199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_019551	GGA	2	6	420206	420211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3267	NC_019551	TAT	2	6	436908	436913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3270	NC_019551	TAT	2	6	437702	437707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_019551	GTA	2	6	437714	437719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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