MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 12376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017909	TAT	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017909	TTA	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017909	ATT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017909	ACA	2	6	3208	3213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017909	AT	3	6	3216	3221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017909	TTC	2	6	3222	3227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017909	TA	3	6	3228	3233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017909	ATT	2	6	3241	3246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017909	ACTT	2	8	3270	3277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017909	TAG	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017909	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017909	ATA	2	6	3411	3416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017909	AGC	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017909	TTCA	2	8	3430	3437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017909	TGG	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017909	CAG	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017909	A	6	6	3580	3585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017909	TTAG	2	8	3599	3606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017909	TAT	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017909	TAT	2	6	3636	3641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017909	TGG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017909	A	6	6	3672	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017909	TAT	2	6	3805	3810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017909	AAATG	2	10	3838	3847	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017909	AGCAA	2	10	3853	3862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017909	T	6	6	3921	3926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017909	TTTGAT	2	12	3940	3951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017909	GAT	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017909	CTT	2	6	3981	3986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017909	AAC	2	6	3988	3993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017909	TA	3	6	4113	4118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017909	TGA	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017909	ATA	2	6	4196	4201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017909	AT	3	6	4207	4212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017909	TCA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017909	TA	4	8	4304	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017909	AT	3	6	4317	4322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017909	CTT	2	6	4323	4328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017909	CTG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017909	A	6	6	4392	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017909	AT	3	6	4417	4422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017909	AT	3	6	4472	4477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017909	AT	3	6	5957	5962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017909	ATA	2	6	5983	5988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017909	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017909	A	8	8	6254	6261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017909	CATTT	2	10	6317	6326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017909	AGT	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017909	ATA	2	6	6392	6397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017909	ATAA	2	8	6402	6409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017909	CAG	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017909	GAT	3	9	6452	6460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017909	TTA	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017909	A	7	7	6524	6530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017909	TTA	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017909	AAG	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017909	AGA	2	6	6637	6642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017909	AGA	2	6	6655	6660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017909	AGAT	2	8	6699	6706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017909	AAT	2	6	6745	6750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017909	TAA	2	6	6784	6789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017909	AT	4	8	6835	6842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017909	CTA	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017909	ATA	2	6	6879	6884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017909	TAA	2	6	6886	6891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017909	ACT	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017909	ACA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017909	A	8	8	6973	6980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017909	ATGG	2	8	7009	7016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017909	T	6	6	7101	7106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017909	A	6	6	7129	7134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017909	AACA	2	8	7136	7143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017909	AAC	2	6	7157	7162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017909	TGG	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017909	T	6	6	7254	7259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017909	TAA	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017909	TGA	2	6	7292	7297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017909	A	6	6	7341	7346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017909	TTA	2	6	7381	7386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017909	A	6	6	7630	7635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017909	AGTA	2	8	7660	7667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017909	TGT	2	6	7676	7681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017909	TAA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017909	TAA	2	6	7751	7756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017909	T	7	7	7775	7781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017909	ATA	2	6	7815	7820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017909	ATT	3	9	7831	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017909	A	8	8	7841	7848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017909	TGG	2	6	7860	7865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017909	GGC	2	6	7867	7872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017909	CT	3	6	7897	7902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017909	ACT	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017909	AAGA	2	8	8068	8075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017909	TTA	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017909	CAG	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017909	T	6	6	8170	8175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017909	TTA	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017909	TTA	2	6	8205	8210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017909	TAT	3	9	8307	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017909	TAAT	2	8	9642	9649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017909	AGA	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017909	A	7	7	9679	9685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017909	AGA	2	6	10649	10654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017909	TAC	2	6	10669	10674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017909	AG	3	6	10726	10731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017909	A	6	6	10748	10753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017909	AAC	2	6	15254	15259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017909	TGA	2	6	15267	15272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017909	GAA	2	6	15282	15287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017909	A	6	6	15286	15291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017909	GTT	2	6	15379	15384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017909	TAAT	2	8	15442	15449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017909	TAT	2	6	15493	15498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017909	CTG	2	6	15519	15524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017909	GA	3	6	15570	15575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017909	A	6	6	15596	15601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017909	TAT	2	6	15767	15772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017909	T	7	7	15780	15786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017909	ATAA	2	8	15787	15794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017909	AT	3	6	15815	15820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017909	T	6	6	15898	15903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017909	ATT	2	6	17016	17021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017909	GA	3	6	17127	17132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017909	TTA	2	6	17139	17144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017909	GGA	2	6	17168	17173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017909	T	7	7	17182	17188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017909	CAT	2	6	17243	17248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017909	TCT	2	6	17271	17276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017909	AT	3	6	17366	17371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017909	CT	3	6	17406	17411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017909	ATT	2	6	17432	17437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017909	A	6	6	17444	17449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017909	ACT	2	6	17484	17489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017909	TAC	2	6	17524	17529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017909	CA	3	6	17533	17538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017909	TATTTA	2	12	17563	17574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017909	CTT	2	6	17611	17616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017909	CAT	2	6	17629	17634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017909	ATCT	2	8	17644	17651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017909	ATT	3	9	17663	17671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017909	AGG	2	6	17809	17814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017909	TAG	2	6	19429	19434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017909	T	6	6	19735	19740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017909	A	6	6	19807	19812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017909	TTA	2	6	19841	19846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017909	CTA	2	6	19860	19865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017909	GTA	2	6	19928	19933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017909	TCT	2	6	20816	20821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017909	TA	3	6	20833	20838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017909	AGA	2	6	20883	20888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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