MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 chromosome

Total Repeats: 8487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017453	AAC	2	6	1799353	1799358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017453	TTG	2	6	1799369	1799374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017453	TGGATA	2	12	1799415	1799426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017453	TAAT	2	8	1799580	1799587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017453	A	6	6	1799596	1799601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017453	ATC	2	6	1799664	1799669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_017453	TATTT	2	10	1799670	1799679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017453	ATT	2	6	1799692	1799697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017453	AAAGCT	2	12	1799698	1799709	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8010	NC_017453	TTTGCT	2	12	1799710	1799721	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8011	NC_017453	T	6	6	1799732	1799737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017453	CAGT	2	8	1799780	1799787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_017453	AAT	2	6	1799927	1799932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017453	T	6	6	1799969	1799974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017453	ACT	2	6	1799976	1799981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_017453	ATT	2	6	1799987	1799992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017453	TTA	2	6	1800093	1800098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017453	GTA	2	6	1800120	1800125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017453	T	7	7	1800131	1800137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017453	TA	3	6	1800152	1800157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017453	TACT	2	8	1800176	1800183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_017453	CTA	2	6	1800216	1800221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_017453	TTTA	2	8	1800224	1800231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017453	TGA	2	6	1800239	1800244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017453	CAG	2	6	1800247	1800252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_017453	T	6	6	1800275	1800280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017453	TTAT	2	8	1800330	1800337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017453	T	7	7	1800348	1800354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017453	TTC	2	6	1800409	1800414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_017453	T	7	7	1800449	1800455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017453	GCAG	2	8	1800471	1800478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_017453	GAA	2	6	1800500	1800505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017453	A	7	7	1800516	1800522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017453	CTG	2	6	1800542	1800547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_017453	TAA	2	6	1800556	1800561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017453	TAT	2	6	1800626	1800631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017453	T	7	7	1800647	1800653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017453	TTA	2	6	1801450	1801455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017453	GAA	2	6	1801533	1801538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017453	CT	3	6	1801541	1801546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_017453	TGA	2	6	1801572	1801577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017453	TAA	2	6	1801581	1801586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017453	AAAG	2	8	1801591	1801598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017453	GTTA	2	8	1801632	1801639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017453	A	7	7	1801687	1801693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017453	GTT	2	6	1801699	1801704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017453	A	7	7	1801730	1801736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017453	GGT	2	6	1801796	1801801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017453	CCT	2	6	1801802	1801807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_017453	CTT	2	6	1801855	1801860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_017453	GAT	2	6	1801880	1801885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017453	ATA	2	6	1801933	1801938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017453	CT	3	6	1801949	1801954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_017453	AAGTC	2	10	1801963	1801972	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8055	NC_017453	A	7	7	1801985	1801991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017453	TAC	2	6	1801994	1801999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_017453	ACT	2	6	1807377	1807382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_017453	ATTA	2	8	1807393	1807400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017453	AACA	2	8	1807403	1807410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8060	NC_017453	AAG	2	6	1811648	1811653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017453	CTA	2	6	1811664	1811669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017453	ATA	2	6	1811682	1811687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017453	ATA	2	6	1811690	1811695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017453	TAC	2	6	1811714	1811719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017453	TTAT	2	8	1811733	1811740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017453	AAAT	2	8	1811763	1811770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017453	A	6	6	1811839	1811844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017453	ATT	2	6	1811878	1811883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_017453	TTTA	2	8	1813284	1813291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017453	TTA	2	6	1813303	1813308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017453	TAT	2	6	1814519	1814524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017453	ATT	2	6	1814535	1814540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017453	TAA	3	9	1814548	1814556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017453	TA	3	6	1814620	1814625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8080	NC_017453	TCC	2	6	1816314	1816319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8081	NC_017453	TCA	2	6	1816388	1816393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8083	NC_017453	A	7	7	1816472	1816478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017453	TATTT	2	10	1816489	1816498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_017453	TTG	2	6	1816681	1816686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017453	TAT	2	6	1816696	1816701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017453	TAT	2	6	1816707	1816712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_017453	CTGA	2	8	1816840	1816847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8094	NC_017453	AT	3	6	1816922	1816927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017453	A	7	7	1816934	1816940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_017453	TAT	2	6	1817068	1817073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017453	CTG	2	6	1817117	1817122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_017453	TA	3	6	1817125	1817130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017453	TAT	2	6	1817177	1817182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017453	AAT	2	6	1817276	1817281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017453	AAT	2	6	1817312	1817317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017453	T	6	6	1817331	1817336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017453	ACA	2	6	1817338	1817343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8109	NC_017453	TTC	2	6	1817375	1817380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_017453	GCA	2	6	1817535	1817540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_017453	GTT	2	6	1817551	1817556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017453	GTTT	2	8	1817565	1817572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017453	TAAA	2	8	1817618	1817625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017453	CA	3	6	1817661	1817666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_017453	TA	3	6	1820679	1820684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8118	NC_017453	AAT	2	6	1821941	1821946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017453	TAA	2	6	1821957	1821962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8121	NC_017453	TAA	2	6	1822003	1822008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017453	TGA	2	6	1822371	1822376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8124	NC_017453	AG	3	6	1822479	1822484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017453	ACA	2	6	1823153	1823158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_017453	AT	3	6	1823173	1823178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017453	GAAC	2	8	1823180	1823187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_017453	ATTA	2	8	1823195	1823202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017453	T	7	7	1823429	1823435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017453	TAT	2	6	1823452	1823457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017453	AACC	2	8	1823461	1823468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.