MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 12464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017448	TTGC	2	8	1	8	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017448	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017448	CGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017448	GT	4	8	1577	1584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017448	CGAG	2	8	1629	1636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017448	GTC	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017448	GGC	2	6	1717	1722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017448	CCG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017448	AAAG	2	8	1882	1889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017448	GGC	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017448	CTGA	2	8	2174	2181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017448	GTG	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017448	TGG	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017448	GCC	2	6	2309	2314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017448	ACT	2	6	2346	2351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017448	CT	3	6	2412	2417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017448	ATA	2	6	2487	2492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017448	T	6	6	2525	2530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017448	AAT	2	6	2570	2575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017448	TC	3	6	3977	3982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017448	CTAA	2	8	3992	3999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017448	TC	3	6	5628	5633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017448	CTA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017448	A	6	6	6399	6404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017448	A	6	6	6409	6414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017448	T	7	7	6442	6448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017448	ATTTA	2	10	6449	6458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017448	GGA	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017448	TTTC	2	8	9110	9117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017448	TC	3	6	9119	9124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017448	A	6	6	10820	10825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017448	TTG	2	6	12149	12154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017448	TTG	2	6	12238	12243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017448	TA	3	6	14053	14058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017448	T	7	7	15674	15680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017448	AATA	2	8	15687	15694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017448	A	6	6	15696	15701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017448	GC	3	6	17768	17773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017448	ATT	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017448	ATG	2	6	18037	18042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017448	T	8	8	18053	18060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017448	GCGG	2	8	18077	18084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017448	GTT	2	6	18099	18104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017448	A	6	6	18113	18118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017448	ATTTTT	2	12	19300	19311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017448	A	6	6	20075	20080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017448	T	6	6	20086	20091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017448	T	7	7	20130	20136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017448	TGT	2	6	20138	20143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017448	GT	3	6	20142	20147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017448	A	6	6	20209	20214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017448	TTTA	2	8	20247	20254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017448	A	6	6	20295	20300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017448	T	7	7	20326	20332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017448	A	6	6	22678	22683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017448	TAA	2	6	22695	22700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017448	TGCG	2	8	22714	22721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017448	T	8	8	22737	22744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017448	TAT	2	6	22759	22764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017448	TTTA	2	8	23927	23934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017448	AT	3	6	24024	24029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017448	GGT	3	9	24047	24055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017448	TTG	2	6	24648	24653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017448	GGGCTT	2	12	26318	26329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017448	TAT	2	6	26347	26352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017448	TTTG	2	8	26386	26393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017448	ATC	2	6	26500	26505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017448	TCA	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017448	A	6	6	26517	26522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017448	CCT	2	6	26526	26531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017448	TCC	2	6	26537	26542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017448	AAG	2	6	26543	26548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017448	AGT	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017448	TCT	3	9	26561	26569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017448	GCT	2	6	26576	26581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017448	TCT	2	6	26591	26596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017448	AGC	2	6	26609	26614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017448	CCT	2	6	26622	26627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017448	GTCTTC	2	12	26644	26655	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017448	ATC	2	6	26662	26667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017448	TCT	2	6	26669	26674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017448	GAA	2	6	26780	26785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017448	AAG	2	6	26805	26810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017448	CTG	2	6	26811	26816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017448	GCG	2	6	26859	26864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017448	AT	3	6	27131	27136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017448	TA	3	6	27137	27142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017448	TAAC	2	8	27175	27182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017448	TTAA	2	8	27185	27192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017448	T	6	6	29958	29963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017448	TGT	2	6	29990	29995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017448	TAA	2	6	36270	36275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017448	ATT	2	6	36331	36336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017448	CTT	2	6	37390	37395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017448	ATA	2	6	37405	37410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017448	AGG	2	6	37429	37434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017448	ATAAAG	2	12	37450	37461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017448	AAAG	2	8	37488	37495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017448	ATG	2	6	37500	37505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017448	GACAA	2	10	37566	37575	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017448	ACA	2	6	37579	37584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017448	AAG	2	6	37599	37604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017448	T	6	6	37631	37636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017448	TCC	2	6	39092	39097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017448	ATA	2	6	39111	39116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017448	AT	3	6	39136	39141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017448	TAA	2	6	41249	41254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017448	TTTC	2	8	41265	41272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017448	TGT	2	6	41358	41363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017448	TGG	2	6	41415	41420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017448	CCT	2	6	42250	42255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017448	GTTT	2	8	42306	42313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017448	TA	3	6	42337	42342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017448	TAA	2	6	42350	42355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017448	A	7	7	42354	42360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017448	ATTT	2	8	42391	42398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017448	GA	3	6	46058	46063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017448	ACC	2	6	46212	46217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017448	TTC	2	6	46234	46239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017448	AAT	2	6	46461	46466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017448	AGT	2	6	46468	46473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017448	ATAAGA	2	12	46489	46500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017448	A	7	7	46593	46599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017448	CT	3	6	46684	46689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017448	ACC	2	6	46776	46781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017448	AATT	2	8	46830	46837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017448	GT	3	6	46839	46844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017448	T	6	6	46872	46877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017448	A	6	6	46883	46888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017448	TGG	2	6	46902	46907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017448	TC	3	6	46919	46924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017448	TC	3	6	46947	46952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017448	CG	3	6	46978	46983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017448	GGA	2	6	47008	47013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017448	CTT	2	6	47017	47022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017448	CCAT	2	8	47070	47077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017448	GCGGAC	2	12	47200	47211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017448	TCT	2	6	47226	47231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017448	CTT	2	6	47239	47244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017448	TGG	2	6	47277	47282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017448	GTG	2	6	47306	47311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017448	GCAA	2	8	47358	47365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017448	GTT	2	6	47420	47425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017448	AAG	2	6	47516	47521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017448	TGG	2	6	47580	47585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017448	GAT	3	9	47726	47734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017448	GGA	3	9	47791	47799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017448	ATG	2	6	47802	47807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017448	GCA	2	6	47823	47828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_017448	CTTGG	2	10	149673	149682	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
436	NC_017448	G	6	6	149681	149686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017448	TTTTC	2	10	149930	149939	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
438	NC_017448	GCG	2	6	149947	149952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_017448	CGT	2	6	150110	150115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_017448	CCT	2	6	150331	150336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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444	NC_017448	TCG	2	6	150400	150405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_017448	GTC	2	6	150459	150464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_017448	TGCTT	2	10	150880	150889	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
459	NC_017448	TTG	2	6	150971	150976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_017448	ATG	2	6	150982	150987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_017448	TCG	3	9	151099	151107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_017448	CAG	2	6	151451	151456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_017448	TCC	2	6	151839	151844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
471	NC_017448	T	6	6	151907	151912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_017448	A	6	6	151967	151972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017448	CTTC	2	8	152116	152123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
475	NC_017448	GTC	2	6	152129	152134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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477	NC_017448	GCT	2	6	152173	152178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_017448	TCG	2	6	152218	152223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
479	NC_017448	CTT	2	6	152225	152230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
480	NC_017448	CGG	2	6	152260	152265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_017448	TCT	2	6	152317	152322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_017448	T	6	6	159827	159832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017448	A	6	6	159941	159946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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