MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 31076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014666	GGC	2	6	14	19	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014666	CCA	2	6	41	46	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014666	CCG	2	6	92	97	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014666	CCA	2	6	99	104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014666	GAG	2	6	140	145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014666	CGC	2	6	1701	1706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014666	GGCCAG	2	12	1728	1739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014666	GCC	2	6	1741	1746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014666	ACC	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014666	CCCGG	2	10	1825	1834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014666	CGG	2	6	1898	1903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014666	GCCG	2	8	1930	1937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014666	CGGGG	2	10	1980	1989	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014666	GCCG	2	8	2003	2010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014666	CTG	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014666	GCG	2	6	2148	2153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014666	CGT	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014666	CGA	2	6	2326	2331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014666	GGT	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014666	CCGC	2	8	2404	2411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014666	GCCC	2	8	2436	2443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014666	GAC	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014666	ACC	2	6	2552	2557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014666	CTA	3	9	2650	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014666	ATTT	2	8	2670	2677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014666	GA	3	6	2680	2685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014666	GAA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014666	TCG	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014666	GAGG	2	8	2863	2870	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014666	CGG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014666	GCC	2	6	5833	5838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014666	G	7	7	5848	5854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014666	TGT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014666	AG	3	6	6060	6065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014666	TGGC	2	8	10617	10624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014666	GAG	2	6	11927	11932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014666	CGC	2	6	11957	11962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014666	GGT	2	6	12074	12079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014666	CGC	2	6	12118	12123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014666	G	6	6	12159	12164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014666	TTC	2	6	12229	12234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014666	T	6	6	12272	12277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014666	AGT	2	6	12315	12320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014666	GTGG	2	8	12324	12331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014666	CG	3	6	12481	12486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014666	GCT	2	6	12560	12565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014666	TGG	2	6	16597	16602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014666	GCCG	2	8	16659	16666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014666	AGC	2	6	16682	16687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014666	ACC	2	6	16724	16729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014666	CG	3	6	16747	16752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014666	GC	3	6	16786	16791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014666	GTG	2	6	16792	16797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014666	CAT	2	6	18556	18561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014666	GCCA	2	8	18582	18589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014666	GCG	2	6	18643	18648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014666	GTC	2	6	18680	18685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014666	GTC	3	9	18923	18931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014666	CTG	2	6	18951	18956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014666	TTG	2	6	19125	19130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014666	CCT	2	6	19329	19334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014666	GGAGCC	2	12	19566	19577	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014666	CTGT	2	8	19655	19662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014666	GC	4	8	19740	19747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014666	CT	3	6	19777	19782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014666	CG	3	6	20735	20740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014666	CG	3	6	20748	20753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014666	CAT	2	6	20799	20804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014666	ATC	2	6	20826	20831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014666	CGA	2	6	20843	20848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014666	CGG	2	6	20896	20901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014666	CCG	2	6	20939	20944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014666	GGT	2	6	20996	21001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014666	CTGTT	2	10	21041	21050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014666	CGG	2	6	21071	21076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014666	G	6	6	21075	21080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014666	G	6	6	21084	21089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014666	CGC	2	6	21844	21849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014666	CGC	2	6	23436	23441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014666	GGC	2	6	23442	23447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014666	TCG	2	6	23450	23455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014666	CGG	2	6	23456	23461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014666	CAG	2	6	24020	24025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014666	CGT	2	6	24070	24075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014666	CCGGG	2	10	24084	24093	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014666	GCAA	2	8	24512	24519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014666	ACA	2	6	24520	24525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014666	TAG	2	6	24561	24566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014666	CA	3	6	24601	24606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014666	CGGGTA	2	12	24627	24638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014666	AGG	2	6	24640	24645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014666	GCC	2	6	25437	25442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014666	TCT	2	6	25487	25492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014666	GGT	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014666	CGG	2	6	27244	27249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014666	CCG	2	6	27276	27281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014666	CAG	2	6	29199	29204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014666	CG	3	6	29206	29211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014666	CCT	2	6	29214	29219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014666	GCG	2	6	29234	29239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014666	CCG	2	6	29695	29700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014666	CTGC	2	8	30058	30065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014666	ACC	2	6	30066	30071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014666	TTC	2	6	30079	30084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014666	TGG	2	6	30093	30098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014666	CGGC	2	8	30181	30188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014666	TCCC	2	8	30265	30272	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_014666	TGC	2	6	31802	31807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014666	CGGA	2	8	31877	31884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014666	ATC	2	6	32015	32020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014666	GTC	2	6	32021	32026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014666	CGG	2	6	32062	32067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014666	CGA	2	6	32076	32081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014666	TCT	2	6	32100	32105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014666	CAG	2	6	32201	32206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014666	CGG	2	6	32233	32238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014666	CAGAT	2	10	32310	32319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014666	GCG	2	6	32442	32447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014666	GGC	2	6	32472	32477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014666	GCG	2	6	32479	32484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014666	CTGG	2	8	32492	32499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014666	CTG	2	6	32505	32510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014666	CGCGG	2	10	32553	32562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014666	GCGG	2	8	32565	32572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014666	CCA	2	6	32575	32580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014666	GCG	2	6	32609	32614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014666	ACC	2	6	34140	34145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014666	CGG	2	6	34152	34157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014666	GCGG	2	8	34217	34224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014666	ACA	2	6	34244	34249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014666	CCA	2	6	34260	34265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014666	GGA	2	6	34813	34818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014666	GCC	2	6	34834	34839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014666	C	7	7	35962	35968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_014666	CG	3	6	35973	35978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014666	CG	3	6	36011	36016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014666	CACC	2	8	36083	36090	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_014666	CGA	2	6	36115	36120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014666	CGT	2	6	36141	36146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014666	CGGA	2	8	36200	36207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014666	TGG	2	6	36277	36282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014666	CTAC	2	8	36293	36300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014666	CGGC	2	8	36320	36327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014666	CGG	2	6	36403	36408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014666	TGG	2	6	36429	36434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014666	GCCC	2	8	37309	37316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_014666	ATGG	2	8	37348	37355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014666	GA	3	6	37376	37381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014666	TCGGG	2	10	37513	37522	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014666	GAAGCG	2	12	37592	37603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014666	CGT	2	6	37633	37638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014666	GGC	2	6	37682	37687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014666	CGG	2	6	37839	37844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014666	GGC	2	6	37867	37872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014666	ACC	2	6	37889	37894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_014666	GTC	2	6	37920	37925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_014666	TGC	2	6	37956	37961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014666	CGG	2	6	37993	37998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014666	ACC	2	6	38029	38034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_014666	GCG	2	6	38106	38111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_014666	CGGC	2	8	39609	39616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_014666	AAG	2	6	39639	39644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014666	CGG	2	6	42745	42750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_014666	CCT	2	6	42941	42946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_014666	GCCG	2	8	43009	43016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_014666	TCG	2	6	43611	43616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014666	TCC	2	6	43618	43623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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179	NC_014666	CGG	2	6	46348	46353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_014666	TGC	2	6	46359	46364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_014666	GTG	2	6	46384	46389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014666	CGGC	2	8	46391	46398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_014666	GCC	2	6	47560	47565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_014666	GTCG	2	8	47592	47599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
185	NC_014666	GGT	2	6	47625	47630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_014666	TGG	2	6	47663	47668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014666	TGT	2	6	47739	47744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014666	TAA	2	6	47773	47778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014666	ACC	2	6	48622	48627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_014666	CGG	2	6	48654	48659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_014666	CGG	2	6	49381	49386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_014666	TAG	2	6	51786	51791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_014666	GC	4	8	75694	75701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
279	NC_014666	CGGT	2	8	77171	77178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
280	NC_014666	ACG	2	6	77200	77205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_014666	TCG	2	6	77276	77281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_014666	GCG	2	6	77421	77426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_014666	GTG	2	6	121877	121882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_014666	GC	3	6	126708	126713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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