MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 31076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014666	CCGG	2	8	5247938	5247945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_014666	CGGC	2	8	5249595	5249602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19003	NC_014666	CGA	2	6	5251457	5251462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_014666	CG	3	6	5251562	5251567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19005	NC_014666	GGCA	2	8	5251570	5251577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19006	NC_014666	CCCG	2	8	5257041	5257048	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19007	NC_014666	CCA	2	6	5257064	5257069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19008	NC_014666	ACG	2	6	5257894	5257899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19009	NC_014666	GGC	2	6	5257919	5257924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19010	NC_014666	GAT	2	6	5257928	5257933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_014666	GCCC	2	8	5258733	5258740	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19012	NC_014666	CCG	2	6	5258742	5258747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19013	NC_014666	GGGC	2	8	5258759	5258766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19014	NC_014666	GTCC	2	8	5258790	5258797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19015	NC_014666	TCA	2	6	5260066	5260071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19016	NC_014666	GTG	2	6	5260072	5260077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_014666	ACG	2	6	5260093	5260098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_014666	ACCG	2	8	5260106	5260113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19019	NC_014666	GCC	2	6	5260119	5260124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19020	NC_014666	CAGC	2	8	5260127	5260134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19021	NC_014666	GCG	2	6	5260147	5260152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_014666	AT	3	6	5260184	5260189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_014666	GCC	2	6	5260225	5260230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19024	NC_014666	CCA	2	6	5260277	5260282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19025	NC_014666	CGC	2	6	5260300	5260305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19026	NC_014666	CGAC	2	8	5260345	5260352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19027	NC_014666	CGGCCG	2	12	5260354	5260365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19028	NC_014666	GCC	2	6	5260379	5260384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19029	NC_014666	CGG	2	6	5260414	5260419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_014666	TCGG	2	8	5260422	5260429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19031	NC_014666	AAG	2	6	5260480	5260485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_014666	CAT	2	6	5260502	5260507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_014666	CGG	2	6	5260513	5260518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_014666	GCC	3	9	5260540	5260548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19035	NC_014666	CGGT	2	8	5260647	5260654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19036	NC_014666	GCC	2	6	5260661	5260666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19037	NC_014666	AAG	2	6	5260689	5260694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_014666	CG	3	6	5260732	5260737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19039	NC_014666	GCG	2	6	5261622	5261627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_014666	TC	3	6	5261672	5261677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19041	NC_014666	CG	3	6	5261692	5261697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19042	NC_014666	GAC	2	6	5261701	5261706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19043	NC_014666	CCG	2	6	5262659	5262664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19044	NC_014666	CGG	2	6	5264348	5264353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19045	NC_014666	CGC	2	6	5264368	5264373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19046	NC_014666	GCT	2	6	5264410	5264415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_014666	G	7	7	5266659	5266665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_014666	ATATCT	2	12	5266695	5266706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19049	NC_014666	TCG	2	6	5266716	5266721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19050	NC_014666	CCG	2	6	5268450	5268455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19051	NC_014666	ACA	2	6	5269339	5269344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_014666	ACA	2	6	5269356	5269361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_014666	CCGG	2	8	5269374	5269381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19054	NC_014666	CG	3	6	5270596	5270601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19055	NC_014666	GC	3	6	5270602	5270607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19056	NC_014666	CGCC	2	8	5270614	5270621	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19057	NC_014666	TCA	2	6	5270624	5270629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19058	NC_014666	GGC	2	6	5272579	5272584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19059	NC_014666	CCCG	2	8	5272589	5272596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19060	NC_014666	CTGC	2	8	5272651	5272658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19061	NC_014666	GCCGC	2	10	5272674	5272683	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19062	NC_014666	CGC	2	6	5272722	5272727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19063	NC_014666	CAA	2	6	5272734	5272739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19064	NC_014666	CGA	2	6	5272785	5272790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_014666	ATC	2	6	5272810	5272815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19066	NC_014666	GAT	2	6	5272841	5272846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19067	NC_014666	GTCGA	2	10	5272871	5272880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19068	NC_014666	GCC	2	6	5272899	5272904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19069	NC_014666	CCGG	2	8	5277466	5277473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19070	NC_014666	GCC	2	6	5277546	5277551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19071	NC_014666	GCC	2	6	5277583	5277588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19072	NC_014666	AT	3	6	5277610	5277615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_014666	CCGA	2	8	5277638	5277645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19074	NC_014666	GAG	2	6	5281055	5281060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_014666	TCG	2	6	5282177	5282182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19076	NC_014666	CGGC	2	8	5282656	5282663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19077	NC_014666	CTC	2	6	5284311	5284316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19078	NC_014666	CAC	2	6	5284322	5284327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19079	NC_014666	AT	4	8	5284411	5284418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_014666	GAC	2	6	5284470	5284475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19081	NC_014666	ACA	2	6	5285632	5285637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19082	NC_014666	ACC	2	6	5285644	5285649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19083	NC_014666	TGG	2	6	5285654	5285659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19084	NC_014666	GAG	2	6	5285700	5285705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19085	NC_014666	GGCGCG	2	12	5286814	5286825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19086	NC_014666	TCC	2	6	5286948	5286953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19087	NC_014666	CTG	2	6	5287023	5287028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19088	NC_014666	ATC	2	6	5287075	5287080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19089	NC_014666	GTT	2	6	5287100	5287105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19090	NC_014666	CGG	2	6	5287112	5287117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_014666	TCG	2	6	5287132	5287137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19092	NC_014666	CGC	2	6	5287140	5287145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19093	NC_014666	CGC	2	6	5287196	5287201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19094	NC_014666	GCAG	2	8	5287228	5287235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19095	NC_014666	ACT	2	6	5287261	5287266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19096	NC_014666	GCC	2	6	5287286	5287291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19097	NC_014666	GGT	2	6	5287324	5287329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_014666	CCG	2	6	5287343	5287348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19099	NC_014666	ATC	2	6	5287428	5287433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19100	NC_014666	CGG	2	6	5287440	5287445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19101	NC_014666	CAT	2	6	5287456	5287461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19102	NC_014666	CGG	2	6	5287549	5287554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19103	NC_014666	CCG	2	6	5287558	5287563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19104	NC_014666	CTC	2	6	5287631	5287636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19105	NC_014666	CCA	2	6	5287646	5287651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19106	NC_014666	GGCC	2	8	5287652	5287659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19107	NC_014666	CAGCC	2	10	5287746	5287755	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19108	NC_014666	GCC	2	6	5287769	5287774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19109	NC_014666	GCGGCC	2	12	5287775	5287786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19110	NC_014666	CAG	2	6	5287795	5287800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19111	NC_014666	TCG	2	6	5287819	5287824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19112	NC_014666	CTC	2	6	5289881	5289886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19113	NC_014666	AT	3	6	5289903	5289908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_014666	AGG	2	6	5290597	5290602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_014666	CCGC	2	8	5291488	5291495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19116	NC_014666	GCC	2	6	5291509	5291514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19117	NC_014666	GCG	2	6	5291530	5291535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19118	NC_014666	GC	3	6	5293791	5293796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19119	NC_014666	CCG	2	6	5293806	5293811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19120	NC_014666	GCGTC	2	10	5293820	5293829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19121	NC_014666	GCC	3	9	5293837	5293845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19122	NC_014666	CTCCAG	2	12	5293923	5293934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19123	NC_014666	CTG	2	6	5293966	5293971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19124	NC_014666	GCC	2	6	5294122	5294127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19125	NC_014666	GCCC	2	8	5295254	5295261	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19126	NC_014666	CCG	2	6	5295271	5295276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19127	NC_014666	GCG	2	6	5295348	5295353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19129	NC_014666	GCG	2	6	5295399	5295404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19130	NC_014666	CG	3	6	5295406	5295411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19131	NC_014666	GGT	2	6	5295444	5295449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19136	NC_014666	GCG	2	6	5297634	5297639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19145	NC_014666	CGG	2	6	5303621	5303626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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