MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 31076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014666	CGGG	2	8	4860307	4860314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18002	NC_014666	GGCC	2	8	4860327	4860334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18003	NC_014666	TGG	2	6	4860419	4860424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_014666	CAG	2	6	4860442	4860447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_014666	GTG	2	6	4860467	4860472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_014666	GCA	2	6	4860721	4860726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_014666	TCG	2	6	4860765	4860770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_014666	GCG	2	6	4860771	4860776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_014666	CGA	2	6	4860808	4860813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_014666	CG	3	6	4860849	4860854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18011	NC_014666	CGT	2	6	4860877	4860882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_014666	GCA	2	6	4860889	4860894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_014666	GC	4	8	4860901	4860908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_014666	CG	3	6	4860912	4860917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18015	NC_014666	CCCG	2	8	4860956	4860963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18016	NC_014666	CGT	2	6	4860980	4860985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_014666	GCC	2	6	4860994	4860999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18018	NC_014666	CACC	2	8	4861053	4861060	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18019	NC_014666	ACC	2	6	4861070	4861075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18020	NC_014666	GCC	2	6	4861096	4861101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18021	NC_014666	CG	3	6	4861102	4861107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18022	NC_014666	C	6	6	4861177	4861182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18023	NC_014666	CAGG	2	8	4861224	4861231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18024	NC_014666	GGA	2	6	4861244	4861249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_014666	GCC	2	6	4861859	4861864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18026	NC_014666	CCA	2	6	4861876	4861881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18027	NC_014666	ACC	2	6	4861905	4861910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18028	NC_014666	CGAA	2	8	4862839	4862846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18029	NC_014666	ACC	2	6	4862882	4862887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_014666	GCC	2	6	4862928	4862933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18031	NC_014666	CCG	2	6	4862942	4862947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18032	NC_014666	CCGG	2	8	4864500	4864507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18033	NC_014666	C	6	6	4864521	4864526	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18034	NC_014666	GAG	2	6	4864564	4864569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_014666	AGG	2	6	4864578	4864583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_014666	CGC	3	9	4864788	4864796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18037	NC_014666	GCG	3	9	4864803	4864811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_014666	CACCGG	2	12	4864854	4864865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18039	NC_014666	CGCGT	2	10	4864872	4864881	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18040	NC_014666	AGG	2	6	4864905	4864910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_014666	AGT	2	6	4865685	4865690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_014666	ACG	2	6	4865803	4865808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_014666	GGCC	2	8	4865815	4865822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18044	NC_014666	GC	3	6	4865832	4865837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_014666	AGGG	2	8	4865855	4865862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_014666	CTGC	2	8	4867022	4867029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18047	NC_014666	CCG	2	6	4867051	4867056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18048	NC_014666	CGG	2	6	4867125	4867130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_014666	CT	3	6	4867138	4867143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18050	NC_014666	AGC	2	6	4867175	4867180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_014666	CCTG	2	8	4867212	4867219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18052	NC_014666	CGT	2	6	4867248	4867253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_014666	CGG	2	6	4867326	4867331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_014666	TGC	2	6	4867336	4867341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_014666	G	6	6	4867368	4867373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_014666	TTC	2	6	4867414	4867419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_014666	CGG	2	6	4867479	4867484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_014666	CGCCC	2	10	4867516	4867525	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18059	NC_014666	CACC	2	8	4867537	4867544	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18060	NC_014666	CGA	2	6	4867607	4867612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_014666	GCCG	2	8	4867689	4867696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18062	NC_014666	CGG	2	6	4867812	4867817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_014666	CCT	2	6	4867834	4867839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18064	NC_014666	CGGCA	2	10	4869621	4869630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18065	NC_014666	GCC	2	6	4869661	4869666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18066	NC_014666	CAC	2	6	4869675	4869680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18067	NC_014666	CTTTGA	2	12	4869829	4869840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18068	NC_014666	CCG	2	6	4870582	4870587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18069	NC_014666	CG	3	6	4870586	4870591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18070	NC_014666	GCG	2	6	4871143	4871148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18071	NC_014666	GTC	2	6	4871189	4871194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18073	NC_014666	CGA	2	6	4871216	4871221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18074	NC_014666	CCCGCC	2	12	4871337	4871348	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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18078	NC_014666	GCC	2	6	4871392	4871397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18082	NC_014666	TCG	2	6	4871502	4871507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_014666	GC	3	6	4871545	4871550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18084	NC_014666	GGC	2	6	4871564	4871569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18087	NC_014666	CGGC	2	8	4871636	4871643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18088	NC_014666	GCCT	2	8	4872159	4872166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18089	NC_014666	CG	4	8	4872177	4872184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18095	NC_014666	GCC	2	6	4874184	4874189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18096	NC_014666	CCGG	2	8	4874213	4874220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18097	NC_014666	GCC	2	6	4874224	4874229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18098	NC_014666	CGG	2	6	4874254	4874259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_014666	TGC	2	6	4874260	4874265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18102	NC_014666	CG	3	6	4876013	4876018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18103	NC_014666	CGC	3	9	4876047	4876055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18107	NC_014666	CGG	3	9	4876092	4876100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_014666	CTGGCA	2	12	4876110	4876121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18109	NC_014666	TGG	2	6	4876135	4876140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_014666	CCG	2	6	4876281	4876286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18111	NC_014666	CAC	2	6	4876337	4876342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18118	NC_014666	CTGC	2	8	4876915	4876922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18119	NC_014666	GTC	2	6	4876928	4876933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18122	NC_014666	GAGT	2	8	4877016	4877023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_014666	ATC	2	6	4877028	4877033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18126	NC_014666	GCCG	2	8	4878473	4878480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18128	NC_014666	CGC	2	6	4879628	4879633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18129	NC_014666	GCT	2	6	4879650	4879655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18130	NC_014666	CGA	2	6	4879670	4879675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18131	NC_014666	GCCG	2	8	4879850	4879857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18132	NC_014666	CACC	2	8	4880992	4880999	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18133	NC_014666	AGCAC	2	10	4881006	4881015	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18134	NC_014666	CGG	2	6	4881060	4881065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18137	NC_014666	CGC	2	6	4882067	4882072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18139	NC_014666	GCC	2	6	4882133	4882138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18160	NC_014666	TGCC	2	8	4889353	4889360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18161	NC_014666	CGG	2	6	4889402	4889407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18162	NC_014666	CGG	2	6	4889409	4889414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18173	NC_014666	CGGC	2	8	4892168	4892175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18174	NC_014666	GTCC	2	8	4892247	4892254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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18243	NC_014666	TCG	2	6	4919597	4919602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18245	NC_014666	GCACG	2	10	4919700	4919709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18246	NC_014666	CGA	2	6	4919721	4919726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18247	NC_014666	GCT	2	6	4919735	4919740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18248	NC_014666	AGC	2	6	4919753	4919758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18249	NC_014666	TCA	2	6	4919798	4919803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18250	NC_014666	CATC	2	8	4919811	4919818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18251	NC_014666	GC	3	6	4919827	4919832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18252	NC_014666	GCC	2	6	4919842	4919847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18253	NC_014666	GGC	2	6	4919862	4919867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18255	NC_014666	GTC	2	6	4919884	4919889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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