MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 31076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014666	GGCCC	2	10	267302	267311	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1002	NC_014666	CCCG	2	8	267324	267331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1003	NC_014666	CCA	2	6	267334	267339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_014666	GCA	2	6	268602	268607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_014666	GC	3	6	268645	268650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_014666	CCG	2	6	268662	268667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_014666	CGT	2	6	268762	268767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014666	CTA	2	6	270080	270085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014666	CGC	2	6	270118	270123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014666	GCC	2	6	270179	270184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_014666	CG	3	6	270194	270199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_014666	CCTGCG	2	12	271435	271446	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_014666	CGGC	2	8	271479	271486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_014666	GC	3	6	271485	271490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_014666	CCGC	2	8	271636	271643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1016	NC_014666	GA	3	6	271657	271662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014666	AGT	2	6	271665	271670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014666	CTC	2	6	271712	271717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_014666	GGTCG	2	10	271758	271767	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_014666	GCC	2	6	271840	271845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_014666	GGC	2	6	271856	271861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014666	CGG	2	6	271880	271885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014666	GCCG	2	8	271887	271894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_014666	GCC	2	6	271933	271938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_014666	TGGG	2	8	271942	271949	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014666	G	6	6	271992	271997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014666	TCGG	2	8	271999	272006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_014666	CGG	2	6	272079	272084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_014666	GTCG	2	8	272136	272143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_014666	GGCG	2	8	272150	272157	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_014666	GGT	2	6	273018	273023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014666	CGA	2	6	273135	273140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_014666	AGTC	2	8	273148	273155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_014666	TGG	2	6	273177	273182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014666	CG	3	6	273212	273217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_014666	TTC	2	6	273231	273236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_014666	CGGGG	2	10	273302	273311	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_014666	GCC	2	6	273326	273331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_014666	GTC	2	6	273349	273354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014666	AC	3	6	273425	273430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_014666	CCGG	2	8	273457	273464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_014666	CG	4	8	273471	273478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_014666	CG	3	6	273481	273486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_014666	GT	3	6	273517	273522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014666	CACG	2	8	273599	273606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_014666	TG	3	6	273609	273614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014666	AAAC	2	8	273634	273641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_014666	GCC	2	6	273652	273657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_014666	TG	3	6	273743	273748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014666	CGG	2	6	273788	273793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014666	TCGT	2	8	273807	273814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_014666	CCG	2	6	273818	273823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_014666	GTGA	2	8	273892	273899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014666	C	8	8	273901	273908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1055	NC_014666	CGGG	2	8	273942	273949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_014666	G	6	6	273947	273952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014666	TGG	2	6	273953	273958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014666	GGGC	2	8	274075	274082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_014666	CGG	2	6	274139	274144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_014666	CA	3	6	274161	274166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_014666	CCG	2	6	274192	274197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_014666	GC	3	6	274245	274250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_014666	CTG	2	6	274275	274280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014666	GGCC	2	8	274397	274404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_014666	CGG	2	6	274412	274417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014666	ATC	2	6	274437	274442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014666	TC	3	6	274558	274563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_014666	GGCG	2	8	274632	274639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_014666	CGG	2	6	274640	274645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014666	AC	3	6	274715	274720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_014666	GCC	2	6	274727	274732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_014666	GGC	2	6	274742	274747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014666	CGGG	2	8	274772	274779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_014666	GGCA	2	8	275884	275891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_014666	CAGG	2	8	275927	275934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_014666	CG	3	6	275962	275967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_014666	GCC	2	6	276027	276032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_014666	GCC	2	6	276052	276057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_014666	GCG	2	6	277091	277096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_014666	CGA	2	6	277148	277153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014666	GAG	2	6	277161	277166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_014666	GC	3	6	277213	277218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_014666	CGGC	2	8	277224	277231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_014666	GTCCG	2	10	277236	277245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1085	NC_014666	GGT	2	6	277294	277299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014666	TG	3	6	277318	277323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014666	TGC	2	6	277330	277335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_014666	GCT	2	6	277350	277355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014666	CG	4	8	277379	277386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_014666	CGGG	2	8	277396	277403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_014666	CG	3	6	277418	277423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_014666	GGC	2	6	277428	277433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014666	AGG	2	6	277448	277453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014666	CG	3	6	278700	278705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_014666	CGCGG	2	10	278707	278716	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_014666	TCCTC	2	10	278725	278734	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1097	NC_014666	AGGG	2	8	279357	279364	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014666	CCA	3	9	279380	279388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_014666	GC	3	6	279389	279394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_014666	GC	3	6	279474	279479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_014666	TGG	2	6	279483	279488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014666	GCT	2	6	279491	279496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014666	TCT	2	6	279550	279555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_014666	GCC	2	6	279557	279562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_014666	ATG	2	6	279614	279619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014666	CCCCGG	2	12	279647	279658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_014666	GT	3	6	279683	279688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014666	GGGAG	2	10	279691	279700	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014666	GC	3	6	279712	279717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_014666	CAG	2	6	280792	280797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014666	CGA	2	6	280801	280806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014666	GGCCGG	2	12	280841	280852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014666	GAC	3	9	281671	281679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014666	CCA	2	6	281739	281744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_014666	C	7	7	283962	283968	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1116	NC_014666	C	6	6	283978	283983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1117	NC_014666	GC	3	6	284117	284122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_014666	CGT	3	9	284126	284134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_014666	CGG	2	6	284161	284166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014666	CG	3	6	284167	284172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_014666	CTG	2	6	284192	284197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014666	GGC	2	6	284216	284221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014666	GACG	2	8	284303	284310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_014666	CGGC	2	8	284311	284318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_014666	CGGC	2	8	284377	284384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_014666	CGG	2	6	284395	284400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014666	GGC	2	6	286198	286203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014666	GC	4	8	286214	286221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_014666	CGA	2	6	286256	286261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_014666	GAGGC	2	10	286380	286389	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_014666	GGC	2	6	287192	287197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014666	GCC	2	6	287245	287250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_014666	GGC	2	6	287347	287352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_014666	CGTG	2	8	287397	287404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_014666	G	6	6	287409	287414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014666	CGC	2	6	287415	287420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_014666	CAT	2	6	287662	287667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_014666	CCG	2	6	287826	287831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_014666	TCC	2	6	290118	290123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1140	NC_014666	ATC	2	6	290329	290334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_014666	CCG	2	6	290377	290382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_014666	CCT	2	6	290427	290432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1143	NC_014666	GCT	2	6	290437	290442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_014666	CCG	2	6	290551	290556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_014666	GA	3	6	290570	290575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_014666	CGA	2	6	292062	292067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1161	NC_014666	TCG	2	6	297023	297028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1165	NC_014666	CGG	2	6	297212	297217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_014666	GTC	2	6	297237	297242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1170	NC_014666	CCGA	2	8	298155	298162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1171	NC_014666	CCGG	2	8	298182	298189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1172	NC_014666	CGGC	2	8	298196	298203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1173	NC_014666	GGC	2	6	298205	298210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1175	NC_014666	CG	3	6	299030	299035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1183	NC_014666	GGT	2	6	299325	299330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1187	NC_014666	CCG	2	6	299923	299928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1252	NC_014666	C	6	6	309371	309376	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1259	NC_014666	CCCG	2	8	309900	309907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1260	NC_014666	GCG	2	6	309920	309925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_014666	CGGCG	2	10	309929	309938	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1262	NC_014666	GCC	2	6	309946	309951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1263	NC_014666	CGA	2	6	309975	309980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_014666	GAC	2	6	310041	310046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1270	NC_014666	ATC	2	6	310448	310453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1272	NC_014666	CTCG	2	8	310590	310597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1274	NC_014666	AGC	2	6	310760	310765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_014666	GCC	2	6	354084	354089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1452	NC_014666	CGCGG	2	10	356700	356709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1482	NC_014666	CGA	2	6	361632	361637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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