MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 31076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014666	GGTAC	2	10	3336354	3336363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13002	NC_014666	CCG	2	6	3338748	3338753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13003	NC_014666	GTG	2	6	3338786	3338791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_014666	GAC	2	6	3338797	3338802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_014666	CG	3	6	3338810	3338815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_014666	GTC	2	6	3338869	3338874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_014666	CGA	2	6	3338983	3338988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_014666	CGGT	2	8	3339010	3339017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13009	NC_014666	GTC	2	6	3339019	3339024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_014666	CGG	2	6	3339143	3339148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_014666	GAT	2	6	3339168	3339173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_014666	CGC	2	6	3339174	3339179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_014666	CGC	2	6	3339213	3339218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_014666	GGT	2	6	3339264	3339269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_014666	GAAG	2	8	3339311	3339318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_014666	CGT	2	6	3339355	3339360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_014666	GGC	2	6	3339406	3339411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_014666	CAA	2	6	3339432	3339437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_014666	TCGG	2	8	3339451	3339458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13020	NC_014666	GTC	2	6	3339462	3339467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_014666	CGA	2	6	3339480	3339485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_014666	CTG	2	6	3339496	3339501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_014666	CGA	3	9	3339504	3339512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_014666	GGC	2	6	3339515	3339520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_014666	GTG	2	6	3339536	3339541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_014666	GAC	2	6	3339549	3339554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_014666	GGT	2	6	3339577	3339582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_014666	TTC	2	6	3339595	3339600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_014666	CGG	2	6	3339644	3339649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_014666	ACA	2	6	3339707	3339712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_014666	AGG	2	6	3339860	3339865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_014666	GGC	2	6	3339964	3339969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_014666	AG	3	6	3340003	3340008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_014666	ACC	2	6	3340016	3340021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_014666	GCC	2	6	3340072	3340077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_014666	TCT	2	6	3340094	3340099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_014666	CGG	2	6	3340106	3340111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_014666	ACG	2	6	3340130	3340135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_014666	GCC	2	6	3340345	3340350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_014666	GGC	2	6	3340755	3340760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_014666	GGCC	2	8	3340767	3340774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_014666	CCG	2	6	3340813	3340818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_014666	CAG	2	6	3340824	3340829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_014666	CGA	2	6	3340850	3340855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_014666	TGC	2	6	3340859	3340864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_014666	GGT	2	6	3340883	3340888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_014666	CGT	2	6	3340904	3340909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_014666	CCG	2	6	3340961	3340966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_014666	CCT	2	6	3340973	3340978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13050	NC_014666	C	6	6	3340982	3340987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13051	NC_014666	GCA	2	6	3340992	3340997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_014666	TCGG	2	8	3341016	3341023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13053	NC_014666	CAC	2	6	3341030	3341035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_014666	GCG	2	6	3341048	3341053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_014666	TGGCTC	2	12	3341098	3341109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_014666	CGA	2	6	3341113	3341118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_014666	CGGGA	2	10	3341147	3341156	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13058	NC_014666	CCA	2	6	3342365	3342370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_014666	CG	3	6	3342379	3342384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13060	NC_014666	CGA	2	6	3343841	3343846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_014666	CCTG	2	8	3344938	3344945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_014666	TC	3	6	3345009	3345014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_014666	ATT	2	6	3345131	3345136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_014666	AGT	2	6	3345158	3345163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_014666	GTC	2	6	3345177	3345182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_014666	CCG	2	6	3345183	3345188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_014666	CGT	2	6	3345243	3345248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_014666	GC	3	6	3345254	3345259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_014666	CG	3	6	3345310	3345315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13070	NC_014666	CTC	2	6	3345317	3345322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_014666	GA	3	6	3345372	3345377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_014666	CGA	2	6	3346686	3346691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_014666	CGC	3	9	3346703	3346711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13074	NC_014666	TCT	2	6	3346720	3346725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_014666	CCG	2	6	3347831	3347836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_014666	CTG	2	6	3347851	3347856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_014666	CCGG	2	8	3347893	3347900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_014666	CAC	2	6	3348613	3348618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13079	NC_014666	CCG	2	6	3348773	3348778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13080	NC_014666	CCAT	2	8	3348793	3348800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_014666	CGG	2	6	3348833	3348838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_014666	ACCG	2	8	3348940	3348947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13083	NC_014666	CG	3	6	3348982	3348987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_014666	CAG	2	6	3349020	3349025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_014666	GCG	3	9	3349043	3349051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_014666	GGT	2	6	3349053	3349058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_014666	GGCGCG	2	12	3349071	3349082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_014666	CGGT	2	8	3349094	3349101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13089	NC_014666	TGG	2	6	3349157	3349162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_014666	GAG	2	6	3349186	3349191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_014666	GCT	2	6	3350016	3350021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_014666	GTC	2	6	3350022	3350027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_014666	CAG	2	6	3350098	3350103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_014666	TCC	2	6	3350124	3350129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_014666	CGA	2	6	3350165	3350170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_014666	GCG	2	6	3350236	3350241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_014666	CGG	2	6	3350267	3350272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_014666	CG	3	6	3350285	3350290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_014666	CGC	2	6	3350318	3350323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_014666	GGC	2	6	3350324	3350329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_014666	GCCC	2	8	3350333	3350340	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13102	NC_014666	CA	3	6	3350361	3350366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_014666	GCC	2	6	3350378	3350383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_014666	CCA	2	6	3350394	3350399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_014666	ATC	2	6	3350411	3350416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_014666	ATC	2	6	3350424	3350429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_014666	CGG	2	6	3350486	3350491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_014666	GGC	2	6	3350525	3350530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_014666	GCG	2	6	3350534	3350539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_014666	GCC	2	6	3350543	3350548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13111	NC_014666	CGG	2	6	3350557	3350562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_014666	CAC	2	6	3350563	3350568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_014666	CCG	2	6	3350601	3350606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13114	NC_014666	CGA	2	6	3350643	3350648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_014666	ACCCG	2	10	3350723	3350732	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13116	NC_014666	TGC	2	6	3350759	3350764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_014666	CA	3	6	3350855	3350860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_014666	TCG	2	6	3350863	3350868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_014666	CCG	2	6	3350911	3350916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13120	NC_014666	TCG	2	6	3350920	3350925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_014666	GT	3	6	3350959	3350964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_014666	CGGT	2	8	3351004	3351011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13123	NC_014666	GTG	2	6	3351043	3351048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_014666	GCG	3	9	3351058	3351066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_014666	CGG	2	6	3351107	3351112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_014666	GTCTG	2	10	3352417	3352426	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13127	NC_014666	CGC	2	6	3353422	3353427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_014666	CGG	2	6	3353451	3353456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_014666	ACC	2	6	3353459	3353464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13132	NC_014666	CCGC	2	8	3357104	3357111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13133	NC_014666	CGC	2	6	3357152	3357157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13134	NC_014666	CTTG	2	8	3357190	3357197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13140	NC_014666	CG	3	6	3357373	3357378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13141	NC_014666	CCGGG	2	10	3357381	3357390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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13166	NC_014666	TCG	2	6	3369351	3369356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13252	NC_014666	CG	3	6	3402296	3402301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13253	NC_014666	AGGG	2	8	3402307	3402314	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_014666	GCCGG	2	10	3403552	3403561	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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13256	NC_014666	CAT	2	6	3404861	3404866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13257	NC_014666	CGA	2	6	3404874	3404879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13258	NC_014666	CG	4	8	3404881	3404888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13259	NC_014666	CGG	2	6	3404948	3404953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13260	NC_014666	GCC	2	6	3405016	3405021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13261	NC_014666	CGG	2	6	3405026	3405031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13262	NC_014666	GGC	4	12	3405054	3405065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13263	NC_014666	CGGC	3	12	3405062	3405073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13264	NC_014666	GCAC	2	8	3405079	3405086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13267	NC_014666	CGG	2	6	3405170	3405175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13270	NC_014666	GTG	2	6	3405277	3405282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13271	NC_014666	GC	3	6	3405289	3405294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13272	NC_014666	GCG	2	6	3405320	3405325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13287	NC_014666	CTG	2	6	3414659	3414664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13288	NC_014666	CCG	2	6	3414665	3414670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13289	NC_014666	CG	3	6	3414721	3414726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13290	NC_014666	GGC	2	6	3414746	3414751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13385	NC_014666	CGC	2	6	3465418	3465423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13389	NC_014666	CGG	2	6	3467741	3467746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13500	NC_014666	GC	3	6	3525618	3525623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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