MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 37506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009921	CGG	2	6	17	22	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009921	CCCG	2	8	32	39	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009921	C	6	6	64	69	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_009921	CG	3	6	1978	1983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009921	CG	3	6	2013	2018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009921	GGCCC	2	10	2112	2121	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_009921	ACC	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009921	CGG	2	6	2170	2175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009921	CGT	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009921	GCGGA	2	10	2291	2300	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009921	GCC	2	6	2307	2312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009921	CG	3	6	2393	2398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009921	GGA	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009921	GGCC	2	8	2431	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009921	CG	3	6	2455	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009921	GTCCG	2	10	2572	2581	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009921	GAGTCC	2	12	2609	2620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009921	TCGG	2	8	2687	2694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009921	CGG	2	6	2717	2722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009921	GGGTG	2	10	2728	2737	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009921	GAA	2	6	2822	2827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009921	GCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009921	TCG	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009921	CG	3	6	6517	6522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009921	CG	3	6	6540	6545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009921	CGG	2	6	6563	6568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009921	TCG	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009921	GC	3	6	7399	7404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009921	GCGG	2	8	7411	7418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009921	CGG	2	6	7497	7502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009921	CGG	2	6	9594	9599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009921	GCCCG	2	10	9661	9670	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_009921	GTGAC	2	10	12230	12239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009921	GGC	2	6	12247	12252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009921	CG	3	6	12258	12263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009921	TCG	2	6	12264	12269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009921	CCG	2	6	14276	14281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009921	GCG	2	6	14293	14298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009921	TCA	2	6	14330	14335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009921	GGT	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009921	TC	3	6	14468	14473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009921	GAC	2	6	14559	14564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009921	CGG	2	6	14570	14575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009921	GAG	2	6	14595	14600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009921	TCCCC	2	10	14776	14785	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_009921	GGCC	2	8	14825	14832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009921	GTGCT	2	10	14863	14872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009921	GAT	2	6	14902	14907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009921	TGCG	2	8	14929	14936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009921	GCG	2	6	14969	14974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009921	CGG	2	6	15006	15011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009921	CGG	3	9	15150	15158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009921	CGGG	2	8	15169	15176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009921	CCG	2	6	15183	15188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009921	GAG	2	6	15234	15239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009921	CCT	2	6	19301	19306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009921	CAA	2	6	19402	19407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009921	GTCC	2	8	19465	19472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009921	CGG	2	6	19501	19506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009921	GCG	2	6	19514	19519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009921	GCC	2	6	19523	19528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009921	TCG	2	6	19972	19977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009921	CCG	2	6	20107	20112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009921	GCG	2	6	20135	20140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009921	GGC	2	6	20148	20153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009921	CGGC	2	8	21500	21507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009921	GAC	2	6	21537	21542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009921	GCC	2	6	21553	21558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009921	ACC	2	6	21560	21565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009921	CCGA	2	8	21610	21617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009921	CCG	2	6	21627	21632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009921	CGC	2	6	21645	21650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009921	CCG	2	6	21677	21682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009921	CGC	2	6	21708	21713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009921	CGG	2	6	21731	21736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009921	TCC	2	6	22853	22858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009921	GTG	2	6	22904	22909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009921	CGG	3	9	22918	22926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009921	GGT	2	6	22945	22950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009921	AGC	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009921	CGG	2	6	23039	23044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009921	AGA	2	6	23045	23050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009921	GTC	2	6	23052	23057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009921	GCGTG	2	10	23173	23182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009921	CGGG	2	8	23193	23200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009921	CGCT	2	8	24345	24352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009921	CCG	2	6	24417	24422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009921	CGG	2	6	24432	24437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009921	CGG	2	6	24496	24501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009921	G	6	6	24517	24522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009921	CCG	2	6	24539	24544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009921	ACA	2	6	24594	24599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009921	CA	3	6	24631	24636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009921	GC	3	6	25043	25048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009921	CCA	2	6	25686	25691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009921	GCC	2	6	25713	25718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009921	CCGG	5	20	25750	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009921	GT	3	6	25789	25794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009921	TCG	2	6	25819	25824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009921	CCG	2	6	25840	25845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009921	CCGGC	2	10	26028	26037	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_009921	GCCG	2	8	26060	26067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009921	GTCC	2	8	26119	26126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009921	GC	3	6	26151	26156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009921	GAA	2	6	26763	26768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009921	GCA	2	6	26792	26797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009921	CAG	2	6	26799	26804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009921	GC	3	6	26832	26837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009921	GCC	2	6	26864	26869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009921	TGC	2	6	26899	26904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009921	GTC	2	6	26909	26914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009921	CCGGC	2	10	26919	26928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_009921	GC	3	6	26932	26937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009921	CG	3	6	29581	29586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009921	CGT	2	6	29661	29666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009921	CGG	2	6	29682	29687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009921	GCG	2	6	29710	29715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009921	TGT	2	6	29720	29725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009921	CG	3	6	29731	29736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009921	GC	3	6	29756	29761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009921	CGG	2	6	29775	29780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009921	GGA	2	6	29786	29791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009921	AT	3	6	29801	29806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009921	TCG	2	6	29865	29870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009921	CGCCAT	3	18	29872	29889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009921	GCCC	2	8	30695	30702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_009921	GCG	2	6	30706	30711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009921	CGGC	2	8	30771	30778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009921	CGC	2	6	30788	30793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009921	CGC	3	9	30818	30826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009921	GCG	2	6	30838	30843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009921	CGGG	2	8	30844	30851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009921	GCGG	2	8	30855	30862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009921	CGGG	2	8	30872	30879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009921	GCCT	2	8	32017	32024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009921	TCC	2	6	32045	32050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009921	CGC	2	6	32051	32056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009921	TCG	2	6	32067	32072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009921	CCG	2	6	32082	32087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_009921	CGT	2	6	32106	32111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009921	CTCG	2	8	32120	32127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009921	CG	3	6	32126	32131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009921	GCTT	2	8	32171	32178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009921	ACGATG	2	12	32187	32198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_009921	CGA	2	6	32215	32220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009921	ATTTT	2	10	32341	32350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009921	GGT	2	6	32381	32386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_009921	ATT	2	6	32518	32523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_009921	TCCG	2	8	45070	45077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
286	NC_009921	GGC	2	6	45092	45097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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