MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 11341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009613	AATCA	2	10	2504802	2504811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10002	NC_009613	AAAC	2	8	2504815	2504822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_009613	TAA	2	6	2504832	2504837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_009613	TTC	2	6	2504875	2504880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_009613	ACAT	2	8	2504886	2504893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10006	NC_009613	T	7	7	2504922	2504928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_009613	TAT	2	6	2504944	2504949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_009613	A	6	6	2504979	2504984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_009613	TAATTA	2	12	2504995	2505006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009613	TAA	2	6	2506305	2506310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009613	A	7	7	2506309	2506315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_009613	T	7	7	2506342	2506348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009613	A	6	6	2506378	2506383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_009613	GTTTT	2	10	2506445	2506454	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_009613	AAG	2	6	2506492	2506497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009613	GTTTT	2	10	2506564	2506573	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_009613	GA	3	6	2506676	2506681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009613	A	8	8	2506706	2506713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_009613	TTG	2	6	2507094	2507099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_009613	TTC	2	6	2507198	2507203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_009613	ACTA	2	8	2507212	2507219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_009613	A	6	6	2507305	2507310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009613	AAAG	2	8	2507339	2507346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009613	CGA	2	6	2507348	2507353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_009613	CGC	2	6	2507433	2507438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_009613	AAT	2	6	2507439	2507444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_009613	GAA	2	6	2507511	2507516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009613	T	10	10	2507556	2507565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_009613	TTC	2	6	2507573	2507578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_009613	GT	3	6	2507602	2507607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_009613	TTA	2	6	2507623	2507628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_009613	TAC	2	6	2507630	2507635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_009613	TGG	2	6	2507718	2507723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_009613	AAC	2	6	2507792	2507797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_009613	TAGA	2	8	2507873	2507880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_009613	ACG	2	6	2507895	2507900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_009613	C	7	7	2508001	2508007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10038	NC_009613	ACC	2	6	2508090	2508095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_009613	TC	3	6	2508137	2508142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_009613	ACC	2	6	2508234	2508239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_009613	CCA	2	6	2508253	2508258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_009613	CAA	2	6	2508315	2508320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_009613	CAT	2	6	2508373	2508378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_009613	TAC	2	6	2508460	2508465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_009613	GCC	2	6	2508575	2508580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_009613	TGC	2	6	2508742	2508747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_009613	TC	3	6	2508804	2508809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_009613	TC	3	6	2508824	2508829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_009613	GGTACT	2	12	2508853	2508864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10050	NC_009613	TAGG	2	8	2508982	2508989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_009613	TCA	2	6	2509026	2509031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_009613	TAG	2	6	2509055	2509060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_009613	TTTTC	2	10	2509210	2509219	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10054	NC_009613	ATT	2	6	2509327	2509332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009613	GCT	2	6	2509386	2509391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_009613	CAGA	2	8	2509419	2509426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_009613	TA	3	6	2509446	2509451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009613	TA	3	6	2509535	2509540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_009613	TA	3	6	2509607	2509612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009613	ATC	2	6	2509699	2509704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_009613	TCAACG	2	12	2509715	2509726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_009613	ACT	2	6	2509800	2509805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_009613	TC	3	6	2510025	2510030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10064	NC_009613	TCT	2	6	2510117	2510122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_009613	CTT	2	6	2510145	2510150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_009613	ATTCTA	2	12	2510170	2510181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10067	NC_009613	CAA	2	6	2510186	2510191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_009613	AAC	2	6	2510224	2510229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_009613	TCGC	2	8	2510252	2510259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10070	NC_009613	ACT	2	6	2510261	2510266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_009613	TCT	2	6	2510286	2510291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_009613	TTCAG	2	10	2510311	2510320	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10073	NC_009613	TG	3	6	2510398	2510403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009613	TTCT	2	8	2510579	2510586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_009613	TAA	2	6	2510628	2510633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_009613	ATC	2	6	2510687	2510692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_009613	CCT	2	6	2510734	2510739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_009613	AGGC	2	8	2510747	2510754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_009613	T	6	6	2510795	2510800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_009613	CTTTA	2	10	2510871	2510880	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10081	NC_009613	T	7	7	2510897	2510903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_009613	TGT	2	6	2510940	2510945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_009613	GTA	2	6	2510985	2510990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_009613	AAT	2	6	2511034	2511039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_009613	ATT	2	6	2511045	2511050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_009613	T	6	6	2511049	2511054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_009613	TTAT	2	8	2511092	2511099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_009613	AGG	2	6	2511123	2511128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_009613	GT	3	6	2511255	2511260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_009613	TCCGA	2	10	2511344	2511353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10091	NC_009613	GCT	2	6	2511395	2511400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_009613	CT	3	6	2511399	2511404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_009613	GT	3	6	2511424	2511429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_009613	TGA	2	6	2511450	2511455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_009613	AAC	2	6	2511533	2511538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_009613	GAC	2	6	2511589	2511594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_009613	GCA	2	6	2511601	2511606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_009613	ATC	2	6	2511684	2511689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_009613	TCAA	2	8	2511894	2511901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_009613	GTA	2	6	2511905	2511910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_009613	CTACA	2	10	2511959	2511968	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10102	NC_009613	AAT	2	6	2511986	2511991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_009613	CAC	2	6	2512041	2512046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_009613	GCC	2	6	2512058	2512063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_009613	TCC	2	6	2512105	2512110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_009613	GCT	2	6	2512122	2512127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_009613	TTC	2	6	2512189	2512194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_009613	CTG	2	6	2512285	2512290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_009613	TTACC	2	10	2512379	2512388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10110	NC_009613	GT	3	6	2512438	2512443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009613	ACTAT	2	10	2512456	2512465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10112	NC_009613	TCT	2	6	2512661	2512666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_009613	TCAAT	2	10	2512756	2512765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10114	NC_009613	T	8	8	2512787	2512794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_009613	AGT	2	6	2512838	2512843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_009613	T	6	6	2512849	2512854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_009613	T	7	7	2512877	2512883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_009613	CTTTT	2	10	2512905	2512914	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10119	NC_009613	TAA	2	6	2512992	2512997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_009613	T	8	8	2513011	2513018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_009613	TAA	2	6	2513037	2513042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_009613	TG	3	6	2513047	2513052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_009613	CTT	2	6	2513076	2513081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_009613	T	6	6	2513099	2513104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_009613	T	7	7	2513110	2513116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_009613	GGTTTT	2	12	2513131	2513142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_009613	GTG	2	6	2513143	2513148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_009613	T	9	9	2513159	2513167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10263	NC_009613	ATA	2	6	2524476	2524481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10265	NC_009613	GCA	2	6	2524541	2524546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10266	NC_009613	AT	3	6	2524567	2524572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_009613	GGC	2	6	2524630	2524635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10268	NC_009613	CTG	2	6	2524650	2524655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10279	NC_009613	AAT	2	6	2525203	2525208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10280	NC_009613	AAATT	2	10	2525279	2525288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10281	NC_009613	GAA	2	6	2525303	2525308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10284	NC_009613	A	6	6	2525443	2525448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10290	NC_009613	TAAAA	2	10	2525580	2525589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10291	NC_009613	A	7	7	2525703	2525709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10304	NC_009613	TAA	2	6	2531749	2531754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10320	NC_009613	A	6	6	2537553	2537558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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