MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 plasmid pFN3

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009506	TGA	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009506	TTA	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009506	TAT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009506	A	6	6	51	56	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009506	T	8	8	80	87	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009506	TA	3	6	99	104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009506	ATAAA	2	10	146	155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009506	AGTA	2	8	171	178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009506	T	7	7	202	208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009506	T	6	6	252	257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009506	ATATA	2	10	269	278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009506	CTT	2	6	294	299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009506	CTA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009506	GAA	2	6	319	324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009506	T	8	8	334	341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009506	ATA	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009506	TAT	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009506	TTA	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009506	CAG	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009506	T	6	6	430	435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009506	TAAT	2	8	447	454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009506	A	6	6	466	471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009506	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009506	T	7	7	510	516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009506	ATT	2	6	524	529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009506	TAA	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009506	TA	3	6	573	578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009506	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009506	TA	3	6	645	650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009506	TATT	2	8	670	677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009506	TTA	3	9	678	686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009506	AATA	2	8	709	716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009506	AAT	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009506	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009506	ACC	2	6	763	768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009506	T	7	7	839	845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009506	T	7	7	848	854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009506	T	6	6	860	865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009506	ACT	3	9	887	895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009506	GTA	5	15	905	919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009506	ATTT	2	8	924	931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009506	TAT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009506	ATA	2	6	948	953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009506	TA	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009506	A	6	6	973	978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009506	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009506	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009506	T	6	6	1049	1054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009506	ATA	2	6	1060	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009506	T	6	6	1081	1086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009506	A	7	7	1087	1093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009506	TAG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009506	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009506	T	8	8	1136	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009506	ATA	2	6	1146	1151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009506	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009506	TAT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009506	AAAT	2	8	1198	1205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009506	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009506	ATA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009506	AT	3	6	1256	1261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009506	A	6	6	1262	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009506	TAT	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009506	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009506	A	6	6	1295	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009506	A	7	7	3005	3011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009506	TA	3	6	3016	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009506	ATA	3	9	3019	3027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009506	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009506	A	7	7	3456	3462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009506	TA	3	6	3470	3475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009506	ATAA	2	8	3488	3495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009506	T	7	7	3509	3515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009506	T	8	8	3560	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009506	TTA	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009506	TTATA	2	10	3587	3596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009506	A	6	6	3601	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009506	T	8	8	3630	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009506	ATTCT	2	10	3640	3649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009506	AAAAG	2	10	3691	3700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009506	AAT	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009506	T	6	6	3712	3717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009506	GTA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009506	TCT	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009506	GAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009506	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009506	TATTGT	2	12	3936	3947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009506	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009506	TA	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009506	TTA	2	6	3996	4001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009506	T	7	7	4005	4011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009506	TA	3	6	4017	4022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009506	TA	3	6	4039	4044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009506	T	8	8	4048	4055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009506	TA	3	6	4062	4067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009506	TAAAA	2	10	4137	4146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009506	TA	3	6	4181	4186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009506	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009506	TA	3	6	4228	4233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009506	TA	3	6	4253	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009506	TATT	2	8	4278	4285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009506	TTA	3	9	4286	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009506	A	8	8	4308	4315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009506	AATA	2	8	4320	4327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009506	AAT	2	6	4342	4347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009506	T	8	8	4452	4459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009506	TTTCT	2	10	4461	4470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009506	AAAT	2	8	4479	4486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009506	ACT	3	9	4496	4504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009506	GTA	5	15	4514	4528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009506	AT	3	6	4531	4536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009506	T	7	7	4543	4549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009506	AAT	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009506	ATA	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009506	ATA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009506	A	7	7	4594	4600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009506	A	6	6	4615	4620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009506	T	6	6	4640	4645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009506	T	6	6	4661	4666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009506	ATT	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009506	T	6	6	4714	4719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009506	T	6	6	4756	4761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009506	TTTAAA	2	12	4778	4789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009506	TAA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009506	A	7	7	4815	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009506	A	7	7	4831	4837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009506	TAAAA	2	10	4876	4885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009506	A	7	7	4882	4888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009506	A	7	7	6755	6761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009506	TAT	2	6	6771	6776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009506	A	8	8	7204	7211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009506	TA	3	6	7219	7224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009506	CA	3	6	7234	7239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009506	T	7	7	7242	7248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009506	A	6	6	7256	7261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009506	T	7	7	7287	7293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009506	T	8	8	7311	7318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009506	GACA	2	8	7354	7361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009506	TAA	2	6	7409	7414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009506	T	7	7	7462	7468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009506	AAT	2	6	7518	7523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009506	TAT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009506	GTAA	2	8	10295	10302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009506	TATAA	2	10	10352	10361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009506	A	7	7	10360	10366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009506	TTTATA	2	12	10395	10406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009506	TA	3	6	10416	10421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009506	AACT	2	8	11060	11067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009506	ATTTTT	2	12	11077	11088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009506	A	6	6	11900	11905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.