MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 20240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	CAA	2	6	42	47	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009441	ATT	2	6	1745	1750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009441	T	7	7	1769	1775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009441	A	7	7	1889	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009441	A	7	7	2999	3005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009441	ATT	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009441	ACA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009441	T	7	7	3034	3040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009441	T	9	9	3062	3070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009441	T	7	7	3124	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009441	TAA	2	6	3147	3152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009441	ATTT	2	8	3160	3167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009441	T	6	6	5109	5114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009441	ATT	2	6	7511	7516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009441	TAT	2	6	7529	7534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009441	TAAT	2	8	7537	7544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009441	A	7	7	7550	7556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009441	T	6	6	8473	8478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009441	T	8	8	8524	8531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009441	AAAC	2	8	8539	8546	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009441	ATT	3	9	8670	8678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009441	CAAA	2	8	8684	8691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009441	CAAA	2	8	8695	8702	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009441	A	6	6	9762	9767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009441	TAAT	2	8	11147	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009441	AGAA	2	8	11162	11169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009441	A	8	8	13324	13331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009441	AAAT	2	8	13337	13344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009441	T	7	7	13351	13357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009441	TTC	2	6	14018	14023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009441	CAA	2	6	14091	14096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009441	ATG	2	6	14140	14145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009441	A	6	6	14207	14212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009441	T	6	6	14280	14285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009441	TTAA	2	8	14321	14328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009441	CTTT	2	8	14339	14346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009441	AAT	2	6	14361	14366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009441	T	6	6	14395	14400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009441	TAT	2	6	14415	14420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009441	ATA	2	6	14432	14437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009441	TAAAA	2	10	14445	14454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009441	ATC	2	6	14457	14462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009441	A	7	7	14482	14488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009441	TTA	2	6	14514	14519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009441	ACTC	2	8	16153	16160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009441	GTT	2	6	16966	16971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009441	AAG	2	6	16972	16977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009441	GAA	2	6	16989	16994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009441	ATTA	2	8	17004	17011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009441	T	6	6	17061	17066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009441	A	7	7	18601	18607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009441	AAAT	2	8	18646	18653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009441	AGTG	2	8	18712	18719	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009441	TAT	2	6	18723	18728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009441	T	6	6	20211	20216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009441	TGG	2	6	20237	20242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009441	TTTTC	2	10	20244	20253	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009441	TTA	2	6	20726	20731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009441	T	7	7	20751	20757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009441	A	6	6	20809	20814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009441	ATA	2	6	20819	20824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009441	TTAT	2	8	20830	20837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009441	A	7	7	20899	20905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009441	T	7	7	22098	22104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009441	A	8	8	22112	22119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009441	TAA	2	6	23782	23787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009441	AAT	2	6	23788	23793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009441	AGAC	2	8	23847	23854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009441	TCT	2	6	23890	23895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009441	AGA	2	6	23911	23916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009441	AAT	2	6	23937	23942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009441	TGT	2	6	23986	23991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009441	TA	3	6	24013	24018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009441	TTAA	2	8	24019	24026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009441	TTAAA	2	10	24040	24049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009441	TTC	2	6	24076	24081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009441	A	6	6	24103	24108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009441	CGA	2	6	24144	24149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009441	CGC	2	6	24229	24234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009441	ACC	2	6	24239	24244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009441	GCT	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009441	AGC	2	6	24263	24268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009441	ATT	2	6	24274	24279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009441	AAGT	2	8	24343	24350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009441	TCC	2	6	24368	24373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009441	ATT	2	6	24416	24421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009441	TAC	2	6	24424	24429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009441	TGG	2	6	24512	24517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009441	ACA	2	6	24587	24592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009441	TAGA	2	8	24667	24674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009441	ACG	2	6	24689	24694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009441	C	7	7	24795	24801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_009441	ACC	2	6	24884	24889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009441	TC	3	6	24931	24936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009441	ACC	2	6	25028	25033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009441	CCA	2	6	25047	25052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009441	CAA	2	6	25108	25113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009441	CGC	2	6	25135	25140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009441	CAT	2	6	25166	25171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009441	TAC	2	6	25253	25258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009441	GCC	2	6	25368	25373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009441	TTCAA	2	10	25386	25395	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009441	TC	3	6	25595	25600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009441	TC	3	6	25615	25620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009441	GGTACT	2	12	25644	25655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009441	TAC	2	6	25759	25764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009441	TCA	2	6	25817	25822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009441	TAG	2	6	25846	25851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009441	TTTTC	2	10	26001	26010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009441	CCT	2	6	26024	26029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009441	ATT	2	6	26118	26123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009441	GCT	2	6	26177	26182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009441	AT	3	6	26238	26243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009441	TAAC	2	8	26410	26417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009441	TCC	2	6	26525	26530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009441	TG	3	6	26533	26538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009441	ACT	2	6	26591	26596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009441	CAG	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009441	TC	3	6	26816	26821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009441	CCG	2	6	26849	26854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009441	CTAT	2	8	26899	26906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009441	TTA	2	6	26912	26917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009441	TGCA	2	8	26971	26978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009441	TCGC	2	8	27043	27050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009441	ACT	2	6	27052	27057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009441	TCT	2	6	27077	27082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009441	TTCAG	2	10	27102	27111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009441	TG	4	8	27187	27194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009441	T	8	8	27313	27320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009441	T	6	6	27322	27327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009441	A	6	6	27341	27346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009441	TTA	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009441	GTC	2	6	27416	27421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009441	CCT	2	6	27498	27503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009441	AGGC	2	8	27511	27518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009441	ATT	2	6	27579	27584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009441	CTT	2	6	27617	27622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009441	AGT	2	6	27683	27688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009441	GTA	2	6	27728	27733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009441	T	8	8	27781	27788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009441	TCA	2	6	27837	27842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009441	AGG	2	6	27886	27891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009441	GT	3	6	28018	28023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009441	TCCGA	2	10	28107	28116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_009441	GCT	2	6	28158	28163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009441	CT	3	6	28162	28167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009441	GT	3	6	28187	28192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009441	TGA	2	6	28213	28218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009441	AAC	2	6	28296	28301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009441	GAC	2	6	28352	28357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009441	GCA	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009441	ATC	2	6	28447	28452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009441	GTA	2	6	28668	28673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009441	CTACA	2	10	28722	28731	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_009441	CAG	2	6	28762	28767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_009441	CAC	2	6	28804	28809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_009441	TCC	2	6	28868	28873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_009441	GCT	2	6	28885	28890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_009441	TCT	2	6	28953	28958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_009441	CTG	2	6	29048	29053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_009441	TTACC	2	10	29142	29151	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_009441	ATA	2	6	29219	29224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009441	TTTC	2	8	29434	29441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_009441	TCAAT	2	10	29503	29512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_009441	TC	3	6	29548	29553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_009441	AAAACT	2	12	29565	29576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_009441	A	7	7	29604	29610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009441	T	9	9	29619	29627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009441	T	7	7	29634	29640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009441	T	6	6	29644	29649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009441	T	9	9	29733	29741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009441	TCT	2	6	29749	29754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_009441	ACC	2	6	29818	29823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_009441	TTTA	2	8	29824	29831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009441	TA	3	6	29851	29856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009441	T	6	6	29866	29871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009441	ACTC	2	8	29886	29893	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
178	NC_009441	T	6	6	29919	29924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_009441	TTTA	2	8	29945	29952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_009441	GGTTTG	2	12	29977	29988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_009441	TA	3	6	30193	30198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009441	A	9	9	30208	30216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009441	TA	4	8	30267	30274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009441	TA	4	8	30294	30301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009441	AT	4	8	30319	30326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009441	TGTA	2	8	30327	30334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009441	A	8	8	32380	32387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009441	A	7	7	32957	32963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009441	TAAG	3	12	32964	32975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009441	A	6	6	33295	33300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_009441	TTAT	2	8	33301	33308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009441	ATTCA	2	10	33342	33351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_009441	TTAC	2	8	33750	33757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
195	NC_009441	T	6	6	33792	33797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_009441	AGT	2	6	34436	34441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_009441	A	9	9	48242	48250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_009441	AT	3	6	59741	59746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_009441	T	9	9	60435	60443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009441	TAC	2	6	60447	60452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_009441	A	6	6	60513	60518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009441	A	8	8	60542	60549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009441	AAT	2	6	60571	60576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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