MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 12316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008369	TAA	2	6	559070	559075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_008369	ACA	2	6	559080	559085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_008369	ACTA	2	8	559086	559093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_008369	GTG	2	6	559111	559116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_008369	ATT	2	6	559117	559122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008369	CAA	2	6	559218	559223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_008369	A	6	6	559272	559277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008369	ATA	2	6	559407	559412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008369	AT	3	6	559414	559419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008369	TG	3	6	559441	559446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008369	CTT	2	6	559484	559489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_008369	AGTA	2	8	559545	559552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008369	GTT	2	6	559590	559595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008369	ATGT	2	8	559613	559620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008369	T	7	7	559630	559636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008369	GTT	2	6	559724	559729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_008369	TTA	2	6	559784	559789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008369	TAT	2	6	559793	559798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008369	TAA	2	6	559799	559804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008369	TAT	2	6	559808	559813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008369	AT	3	6	559839	559844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008369	TAA	2	6	559942	559947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008369	TTG	2	6	559962	559967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008369	GCA	2	6	560023	560028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_008369	GT	3	6	560042	560047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008369	CAG	2	6	560063	560068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_008369	AAAC	2	8	560128	560135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_008369	TTA	2	6	560182	560187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008369	GCT	2	6	560224	560229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_008369	ACAG	2	8	560346	560353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_008369	A	6	6	560386	560391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008369	ATT	2	6	560470	560475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_008369	TGTA	2	8	560478	560485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_008369	AAG	2	6	560531	560536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008369	CAA	2	6	560674	560679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_008369	AAG	2	6	560728	560733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008369	TATT	2	8	560909	560916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008369	TAT	2	6	560921	560926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_008369	TA	3	6	560932	560937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008369	TAT	2	6	560951	560956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008369	GTAT	2	8	562427	562434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008369	AGTTA	2	10	562437	562446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_008369	A	6	6	562706	562711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008369	TAA	2	6	562719	562724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_008369	ACTTTA	2	12	562765	562776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3546	NC_008369	ATTTA	2	10	562822	562831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008369	AG	3	6	562840	562845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008369	TTTAG	2	10	564614	564623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008369	ATT	2	6	564664	564669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008369	TCC	2	6	568577	568582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_008369	AT	3	6	568591	568596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_008369	T	6	6	568603	568608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_008369	AGC	2	6	570898	570903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_008369	CCT	2	6	572616	572621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_008369	GTT	2	6	572637	572642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_008369	TTTA	2	8	572678	572685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_008369	AACT	2	8	572687	572694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_008369	TA	3	6	572713	572718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008369	TAAA	2	8	572741	572748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008369	ATT	2	6	572758	572763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008369	ATT	2	6	572814	572819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008369	TTA	2	6	573181	573186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008369	AG	3	6	575443	575448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008369	TAA	2	6	580738	580743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_008369	TAT	2	6	580759	580764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_008369	T	6	6	580764	580769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008369	GTT	2	6	580771	580776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_008369	T	6	6	580775	580780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008369	TA	3	6	580794	580799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008369	AATA	2	8	580857	580864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_008369	TAT	2	6	580874	580879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_008369	T	6	6	580881	580886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008369	GAT	2	6	580898	580903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3576	NC_008369	TAA	2	6	580948	580953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_008369	ATT	2	6	581140	581145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_008369	ATG	2	6	581183	581188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008369	ATT	2	6	581202	581207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008369	GGA	2	6	581249	581254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_008369	TAT	2	6	581266	581271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_008369	ATT	2	6	581334	581339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_008369	TTG	2	6	581518	581523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_008369	AAGA	2	8	581714	581721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008369	TTTCT	2	10	581736	581745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3601	NC_008369	T	8	8	581898	581905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008369	ATA	2	6	581909	581914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008369	AT	3	6	597854	597859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_008369	ATA	2	6	597914	597919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008369	A	6	6	597998	598003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008369	TAA	2	6	598012	598017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3609	NC_008369	ATT	2	6	598109	598114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008369	GA	3	6	598272	598277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008369	ATG	3	9	598298	598306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3613	NC_008369	A	6	6	598338	598343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008369	GCG	2	6	598360	598365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3618	NC_008369	CTTA	2	8	598441	598448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_008369	AAT	2	6	598480	598485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3623	NC_008369	TCA	2	6	598724	598729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_008369	TGA	2	6	598739	598744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_008369	ATC	2	6	598858	598863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_008369	GA	3	6	598927	598932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_008369	CCTATT	2	12	598974	598985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_008369	TGG	2	6	599090	599095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_008369	AATTT	2	10	599361	599370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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