MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 12316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	TAA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008369	GAAT	2	8	2661	2668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008369	A	7	7	2680	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008369	TA	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008369	AGT	3	9	2733	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008369	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008369	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008369	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008369	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008369	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008369	T	6	6	2929	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008369	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008369	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008369	ACC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008369	AT	3	6	3022	3027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008369	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008369	ATT	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008369	GAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008369	TA	4	8	4758	4765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008369	CT	3	6	4779	4784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008369	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008369	TTC	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008369	ATC	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008369	CAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008369	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008369	ATTT	2	8	4974	4981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008369	TGG	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008369	GCA	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008369	TTGA	2	8	5124	5131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008369	ACA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008369	TA	3	6	5237	5242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008369	TTTC	2	8	5261	5268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008369	TAG	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008369	TAA	2	6	5337	5342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008369	AGT	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008369	TTTA	2	8	5424	5431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008369	ATT	2	6	5439	5444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008369	ATTA	2	8	5490	5497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008369	CAG	2	6	5522	5527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008369	ATA	2	6	5540	5545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008369	ATA	2	6	5608	5613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008369	CAA	2	6	5696	5701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008369	T	6	6	5703	5708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008369	ATC	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008369	TA	3	6	5844	5849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008369	ATG	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008369	TCT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008369	ACA	2	6	6052	6057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008369	AGT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008369	CAG	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008369	TAGC	2	8	6169	6176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008369	TAC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008369	TTA	2	6	6217	6222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008369	AT	3	6	6307	6312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008369	TAG	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008369	TA	3	6	6362	6367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008369	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008369	ATTA	2	8	6419	6426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008369	TAA	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008369	TGG	2	6	6467	6472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008369	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008369	T	6	6	6505	6510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008369	CAC	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008369	AAT	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008369	TTC	2	6	6547	6552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008369	ATGA	2	8	6570	6577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008369	AGT	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008369	T	6	6	6694	6699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008369	TC	3	6	6747	6752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008369	AT	3	6	6770	6775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008369	TTG	2	6	6803	6808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008369	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008369	T	6	6	6850	6855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008369	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008369	AAT	2	6	7854	7859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008369	GAT	2	6	7860	7865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008369	ATA	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008369	T	7	7	8483	8489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008369	A	6	6	8492	8497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008369	AGC	2	6	8519	8524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008369	T	8	8	8525	8532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008369	ATTA	2	8	8572	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008369	A	6	6	9023	9028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008369	T	6	6	11105	11110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008369	A	7	7	11113	11119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008369	ATTT	2	8	11128	11135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008369	TAG	2	6	11178	11183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008369	ATA	2	6	11190	11195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008369	T	6	6	11684	11689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008369	ATA	2	6	11693	11698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008369	TCT	2	6	11733	11738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008369	ATT	2	6	11741	11746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008369	ATA	2	6	11749	11754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008369	T	6	6	11774	11779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008369	TAA	2	6	15072	15077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008369	TAA	2	6	15092	15097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008369	TGC	2	6	15249	15254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008369	TGA	2	6	15306	15311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008369	ATT	2	6	15471	15476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008369	GCA	2	6	15494	15499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008369	GAT	2	6	15527	15532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008369	GCT	2	6	15543	15548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008369	CTC	2	6	15598	15603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008369	AG	3	6	15621	15626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008369	TGA	2	6	15647	15652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008369	TTA	2	6	16820	16825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008369	ACC	2	6	16905	16910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008369	TA	3	6	16930	16935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008369	T	6	6	16967	16972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008369	AAT	2	6	17011	17016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008369	TGA	2	6	17033	17038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008369	TAA	2	6	17059	17064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008369	TAC	2	6	17121	17126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008369	ATT	2	6	17131	17136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008369	ATT	2	6	17245	17250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008369	TAT	3	9	17262	17270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008369	TAA	2	6	19112	19117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008369	ATT	2	6	19141	19146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008369	AGA	2	6	19164	19169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008369	TAA	2	6	19184	19189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008369	CAAA	2	8	19195	19202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008369	AGCTA	2	10	19221	19230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008369	TGA	2	6	19237	19242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008369	TAAA	2	8	20450	20457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008369	TTAAT	2	10	20462	20471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008369	TAAC	2	8	20472	20479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008369	CAT	2	6	20525	20530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008369	CT	3	6	20538	20543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008369	ACCA	2	8	20610	20617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008369	TGATT	2	10	20649	20658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008369	TAT	2	6	20700	20705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008369	AAT	2	6	20752	20757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008369	TTC	2	6	20770	20775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008369	TAG	2	6	20814	20819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008369	ACC	2	6	20857	20862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008369	ATA	2	6	20865	20870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008369	CAT	2	6	20892	20897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008369	CTG	2	6	20922	20927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008369	TTAA	2	8	20933	20940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008369	TAA	2	6	21073	21078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008369	CAT	2	6	21085	21090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008369	TAAT	2	8	21115	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008369	GAA	2	6	21129	21134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008369	T	6	6	21162	21167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008369	GTT	2	6	21186	21191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008369	CAAGG	2	10	21232	21241	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008369	GTTG	2	8	21243	21250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008369	ATTG	2	8	21281	21288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008369	ATC	2	6	21304	21309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008369	AAG	2	6	21334	21339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008369	AAG	2	6	21359	21364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008369	GTTTTA	2	12	21394	21405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008369	A	7	7	21405	21411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008369	AAAGA	2	10	21429	21438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008369	TA	3	6	21455	21460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008369	TA	3	6	21497	21502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008369	AGA	2	6	21599	21604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008369	TTG	2	6	21609	21614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008369	CAT	2	6	21717	21722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_008369	ACT	2	6	21734	21739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_008369	A	7	7	21875	21881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008369	AAT	2	6	21896	21901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008369	TA	3	6	21962	21967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008369	T	6	6	21970	21975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008369	AT	3	6	21986	21991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008369	A	6	6	21992	21997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008369	A	7	7	22005	22011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008369	TAA	2	6	22062	22067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008369	ATT	2	6	22144	22149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008369	AGTT	2	8	22169	22176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008369	TAA	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008369	T	6	6	22210	22215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008369	ATT	2	6	22216	22221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008369	TTTA	2	8	22228	22235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008369	T	6	6	22245	22250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008369	GTA	2	6	22283	22288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008369	T	6	6	22348	22353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008369	ATA	2	6	22364	22369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008369	TTA	2	6	22381	22386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_008369	ATA	2	6	22392	22397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008369	ATT	3	9	22409	22417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008369	T	6	6	22423	22428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008369	GGC	2	6	22435	22440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_008369	AAGA	2	8	22636	22643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
185	NC_008369	TTA	2	6	22668	22673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008369	CAG	2	6	22698	22703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_008369	T	6	6	22738	22743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008369	TTA	2	6	22752	22757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_008369	TTA	2	6	22773	22778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_008369	TTA	2	6	22873	22878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_008369	T	8	8	24120	24127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_008369	TAAT	2	8	24203	24210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_008369	TTAA	2	8	24265	24272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_008369	T	6	6	24295	24300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_008369	A	7	7	24356	24362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_008369	AAGGTT	2	12	24368	24379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_008369	ATTA	2	8	24875	24882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_008369	ATT	2	6	36840	36845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_008369	AAT	2	6	36867	36872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_008369	ATA	2	6	37605	37610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_008369	TGT	2	6	40303	40308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_008369	TTAT	2	8	40309	40316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008369	A	7	7	40349	40355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_008369	TA	4	8	40833	40840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008369	A	7	7	40862	40868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_008369	ATT	2	6	41879	41884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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