MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 28876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	CGG	2	6	35	40	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008278	GCGG	2	8	42	49	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008278	GAC	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008278	G	6	6	118	123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008278	CGC	2	6	124	129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008278	CGG	2	6	178	183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008278	GAC	2	6	201	206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008278	GAC	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008278	CCCA	2	8	367	374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008278	CCGC	2	8	386	393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_008278	GAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008278	CGGC	2	8	2413	2420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008278	GGT	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008278	GGA	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008278	GCT	2	6	2566	2571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008278	CCAC	2	8	2607	2614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_008278	CTC	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008278	CTA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008278	CCA	2	6	2689	2694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008278	TCT	2	6	2707	2712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008278	AAG	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008278	GAGC	2	8	2767	2774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008278	GTG	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008278	CCGC	2	8	2826	2833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_008278	GCC	2	6	2838	2843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008278	CGA	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008278	CCCGA	2	10	5252	5261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008278	CCCCGA	2	12	5262	5273	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008278	CGTCGG	2	12	5274	5285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008278	CGT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008278	CGGCG	2	10	5375	5384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008278	TCC	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008278	CGG	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008278	CCG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008278	CGG	2	6	5443	5448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008278	CGG	3	9	5470	5478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008278	CGG	3	9	5484	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008278	GCG	2	6	5503	5508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008278	GAC	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008278	CGGC	2	8	5960	5967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008278	CGGC	2	8	5985	5992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008278	CGC	2	6	6206	6211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008278	CGT	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008278	GC	3	6	6232	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008278	G	6	6	6266	6271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008278	CCG	2	6	6281	6286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008278	CGG	2	6	6339	6344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008278	CGG	2	6	8342	8347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008278	CG	3	6	8355	8360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008278	TGC	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008278	GAC	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008278	TGGC	2	8	8406	8413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008278	CCG	2	6	8417	8422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008278	CCG	2	6	8436	8441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008278	GAC	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008278	CGC	2	6	11111	11116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008278	CGGC	2	8	11972	11979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008278	GCG	2	6	11989	11994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008278	CGG	2	6	12039	12044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008278	CGCC	2	8	12077	12084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_008278	TCG	2	6	12088	12093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008278	ACG	2	6	12112	12117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008278	CCG	2	6	12129	12134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008278	ACG	2	6	12139	12144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008278	GCCC	2	8	12157	12164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_008278	GTCC	2	8	12211	12218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008278	GAG	2	6	12231	12236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008278	ACGG	2	8	12903	12910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008278	CGG	3	9	12908	12916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008278	CCG	2	6	12931	12936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008278	GGT	2	6	13011	13016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008278	GCC	2	6	13056	13061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008278	GGC	2	6	13067	13072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008278	G	6	6	13097	13102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008278	C	6	6	13107	13112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_008278	C	6	6	13116	13121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_008278	GTGGC	2	10	13126	13135	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008278	TCCCT	2	10	13148	13157	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_008278	GCG	2	6	13238	13243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008278	GCA	2	6	13263	13268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008278	CGC	2	6	13302	13307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008278	GC	3	6	13318	13323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008278	TCG	2	6	13972	13977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008278	CGC	2	6	14014	14019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008278	CTG	2	6	14054	14059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008278	GT	3	6	14113	14118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008278	CTG	2	6	14135	14140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008278	GTGC	2	8	14199	14206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008278	GGAAG	2	10	14335	14344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008278	CGGG	2	8	14360	14367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008278	CCG	2	6	14369	14374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008278	CGC	2	6	14384	14389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_008278	CCG	2	6	14401	14406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008278	TGC	2	6	14437	14442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008278	CCT	2	6	15399	15404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008278	AGA	2	6	15427	15432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008278	TTC	2	6	15449	15454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008278	TGG	2	6	15468	15473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008278	CCG	2	6	15533	15538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008278	GCC	2	6	15998	16003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008278	CCT	2	6	16004	16009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008278	CGG	2	6	16017	16022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008278	CG	3	6	16058	16063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008278	TG	3	6	16697	16702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008278	CGG	2	6	16727	16732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008278	GAG	2	6	16739	16744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008278	CGC	3	9	16934	16942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008278	CCG	2	6	16956	16961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008278	GCT	2	6	16968	16973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008278	CGC	2	6	16978	16983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008278	CGT	2	6	17003	17008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008278	CCCG	2	8	17025	17032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_008278	CG	3	6	17068	17073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008278	CGG	2	6	17125	17130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008278	CGG	2	6	17150	17155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008278	GCCG	2	8	17160	17167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008278	GCC	3	9	17175	17183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008278	CG	3	6	17184	17189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008278	GC	3	6	17191	17196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008278	CGG	2	6	17197	17202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008278	CGGA	2	8	17204	17211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008278	CGG	3	9	17916	17924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008278	TCG	3	9	17930	17938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008278	CGT	2	6	17949	17954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008278	CGT	2	6	17967	17972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008278	GGC	2	6	17992	17997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008278	CGG	2	6	18010	18015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008278	TGG	2	6	18018	18023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008278	CCCG	2	8	18030	18037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_008278	CGT	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008278	GGC	2	6	18051	18056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008278	CGG	2	6	18070	18075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008278	CCG	2	6	18083	18088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008278	CCG	2	6	18100	18105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008278	GCG	2	6	18533	18538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008278	ACG	2	6	18579	18584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008278	CGGG	3	12	18851	18862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008278	CGGCGC	2	12	18887	18898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008278	CGG	2	6	18911	18916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008278	TCT	2	6	18926	18931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008278	CGGC	2	8	18945	18952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008278	CGG	2	6	18969	18974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008278	CCGG	2	8	19005	19012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008278	CGG	2	6	19035	19040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008278	CGG	2	6	19049	19054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008278	ACG	2	6	19056	19061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008278	GCG	2	6	21658	21663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008278	GTG	2	6	23019	23024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_008278	ACC	2	6	23073	23078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_008278	ACA	2	6	23102	23107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008278	TCCG	2	8	23131	23138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008278	CTT	2	6	23181	23186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008278	CGGC	2	8	23241	23248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_008278	CCGG	2	8	23260	23267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_008278	CG	3	6	23319	23324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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160	NC_008278	GACC	2	8	23382	23389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_008278	GGC	2	6	23400	23405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_008278	GCC	2	6	23809	23814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_008278	CCGG	2	8	24673	24680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_008278	CGTG	2	8	24722	24729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_008278	GGC	2	6	24767	24772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_008278	TCCA	2	8	24825	24832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_008278	TCCGT	2	10	24837	24846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_008278	GGA	2	6	24941	24946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008278	CGC	2	6	24954	24959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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176	NC_008278	G	6	6	25134	25139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_008278	GCG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_008278	TGG	2	6	25227	25232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008278	GGCC	2	8	25327	25334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_008278	CCG	2	6	25367	25372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_008278	TGCCG	2	10	25379	25388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_008278	CCG	2	6	25412	25417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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191	NC_008278	GTC	2	6	25533	25538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_008278	GTG	2	6	25619	25624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
195	NC_008278	GCCC	2	8	25645	25652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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232	NC_008278	CCGG	2	8	28834	28841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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251	NC_008278	ATCGG	2	10	31050	31059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_008278	G	6	6	31862	31867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_008278	CGTGC	2	10	36526	36535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
269	NC_008278	TCA	2	6	38741	38746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_008278	CGG	2	6	42823	42828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_008278	CGG	2	6	42877	42882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_008278	CGG	2	6	42888	42893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_008278	CGG	2	6	42904	42909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_008278	AG	3	6	46812	46817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_008278	GGCG	2	8	46868	46875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
286	NC_008278	GGCA	2	8	46885	46892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
287	NC_008278	CCG	2	6	49397	49402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_008278	CGC	2	6	49421	49426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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290	NC_008278	TTCC	2	8	49452	49459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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431	NC_008278	GACG	2	8	98604	98611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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433	NC_008278	GCCC	2	8	98646	98653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
434	NC_008278	CGC	2	6	98678	98683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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439	NC_008278	GGT	2	6	98866	98871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
440	NC_008278	GCCC	2	8	98879	98886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
441	NC_008278	GGC	2	6	98887	98892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_008278	CGG	2	6	98919	98924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_008278	CGT	2	6	103745	103750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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