MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 19950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	GAG	2	6	24	29	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007777	CCG	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007777	CAC	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007777	CGC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007777	CCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007777	CCG	2	6	1769	1774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007777	GCA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007777	CCG	2	6	1785	1790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007777	GCA	2	6	1792	1797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007777	CCG	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007777	GCA	2	6	1808	1813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007777	TCC	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007777	C	6	6	1829	1834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_007777	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007777	CGC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007777	ACGG	2	8	1962	1969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007777	GAC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007777	GGT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007777	GC	3	6	2160	2165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007777	CCAC	2	8	2176	2183	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_007777	CAA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007777	CTA	3	9	2252	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007777	TCG	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007777	CTG	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007777	AAC	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007777	AGG	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007777	GGCC	2	8	5709	5716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007777	GCT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007777	ATG	2	6	5820	5825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007777	GC	3	6	5863	5868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007777	G	7	7	5897	5903	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007777	GTC	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007777	GGTC	2	8	8002	8009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007777	GCG	2	6	8015	8020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007777	CCGGC	2	10	8032	8041	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_007777	CCCG	2	8	8060	8067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_007777	GAC	2	6	8123	8128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007777	GAGC	2	8	10660	10667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007777	TCGTGG	2	12	10687	10698	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007777	CCAC	2	8	10699	10706	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007777	ACG	2	6	10714	10719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007777	GTGA	2	8	10784	10791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007777	CGG	2	6	10818	10823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007777	G	6	6	11729	11734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007777	CCGC	2	8	11797	11804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_007777	CGG	3	9	12507	12515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007777	GCC	2	6	12528	12533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007777	GCA	2	6	12553	12558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007777	GGT	2	6	12609	12614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007777	CGC	2	6	12653	12658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007777	GGC	2	6	12665	12670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007777	C	6	6	12714	12719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_007777	GGC	2	6	12772	12777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007777	CGGGCC	2	12	12790	12801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007777	TGC	2	6	12806	12811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007777	GAC	2	6	12837	12842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007777	ACG	2	6	12961	12966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007777	GCG	2	6	13060	13065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007777	GACG	2	8	13102	13109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007777	CGC	2	6	17000	17005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007777	GCC	2	6	17010	17015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007777	CGC	2	6	17016	17021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007777	CCG	2	6	17035	17040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007777	CT	4	8	17042	17049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007777	GC	4	8	17109	17116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007777	GC	3	6	17839	17844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007777	CCG	2	6	17903	17908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007777	TTCG	2	8	17922	17929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007777	CGG	2	6	17964	17969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007777	GCG	2	6	18005	18010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007777	CAT	2	6	18012	18017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007777	CCA	2	6	18324	18329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007777	GA	3	6	18422	18427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007777	TGC	2	6	18432	18437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007777	AGTTC	2	10	18498	18507	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007777	G	7	7	18552	18558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007777	AC	3	6	18563	18568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007777	CCG	3	9	18583	18591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007777	CGTGG	2	10	22172	22181	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007777	GCCG	2	8	22219	22226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007777	CG	4	8	22225	22232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007777	CGT	2	6	22255	22260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007777	AAT	2	6	22325	22330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007777	ACG	2	6	22369	22374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007777	TCT	2	6	25343	25348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007777	AGC	2	6	25565	25570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007777	CAG	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007777	GTC	2	6	32161	32166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007777	CG	3	6	32173	32178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007777	CGT	2	6	32221	32226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007777	CG	3	6	32234	32239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007777	GCA	2	6	32252	32257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007777	GTC	2	6	32830	32835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007777	CG	3	6	32842	32847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007777	GTC	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007777	CG	3	6	32903	32908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007777	TCC	2	6	32916	32921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007777	CGT	2	6	34477	34482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007777	CG	3	6	34490	34495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007777	CGG	2	6	35075	35080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007777	CGAC	2	8	35100	35107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007777	ACG	2	6	35131	35136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007777	CCG	2	6	35156	35161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007777	CGG	2	6	35190	35195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007777	CGT	2	6	35587	35592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007777	GGGT	2	8	35680	35687	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007777	GT	3	6	35686	35691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007777	GCGG	2	8	35703	35710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007777	CGG	2	6	37245	37250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007777	ACA	2	6	37279	37284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007777	GCC	2	6	37304	37309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007777	CGG	2	6	37357	37362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007777	GGCC	2	8	37371	37378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007777	GGC	2	6	37390	37395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007777	TGG	2	6	37455	37460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007777	CGGG	2	8	37595	37602	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007777	CGT	2	6	37654	37659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007777	CG	3	6	38557	38562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007777	CGG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007777	G	6	6	38626	38631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007777	CGCC	2	8	38643	38650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_007777	CTC	2	6	38693	38698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007777	GTG	2	6	38776	38781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007777	CGGT	2	8	38829	38836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007777	CTG	2	6	38842	38847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007777	GTCACC	2	12	38848	38859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007777	GGAA	2	8	39382	39389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007777	GCC	2	6	39943	39948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007777	CGGCG	2	10	39953	39962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007777	TCA	2	6	45846	45851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007777	CCGC	2	8	45861	45868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_007777	TTAC	2	8	48790	48797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007777	CAT	2	6	48875	48880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007777	GGGT	2	8	48881	48888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007777	CGG	2	6	48940	48945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007777	GGC	2	6	48993	48998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007777	GAC	2	6	49002	49007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007777	CGTG	2	8	49015	49022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007777	TCGGC	2	10	49134	49143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007777	CCCGG	2	10	49144	49153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_007777	CGG	2	6	49161	49166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007777	CCGG	2	8	49170	49177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007777	ACCG	2	8	49213	49220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007777	CGC	3	9	49246	49254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_007777	CCGG	2	8	51668	51675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007777	CCG	2	6	51684	51689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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