MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 19950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007777	CGG	2	6	159273	159278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_007777	CAC	2	6	159297	159302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_007777	CGG	2	6	159399	159404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007777	GC	3	6	159633	159638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_007777	GCT	2	6	159666	159671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007777	CCGT	2	8	159764	159771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
507	NC_007777	CGG	2	6	159777	159782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007777	GCT	2	6	159820	159825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007777	CGCC	2	8	159882	159889	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
510	NC_007777	GC	3	6	159909	159914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_007777	GCG	2	6	159919	159924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007777	GTC	2	6	159980	159985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_007777	GCC	2	6	160008	160013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_007777	CGG	2	6	160033	160038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_007777	CCT	2	6	161416	161421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_007777	TCA	2	6	161467	161472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007777	GCA	2	6	161497	161502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_007777	CAC	2	6	161554	161559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_007777	GAC	2	6	161565	161570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_007777	CGGAC	2	10	161573	161582	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
521	NC_007777	TCA	2	6	161596	161601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007777	CGA	2	6	161642	161647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_007777	ATAG	2	8	162745	162752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007777	TCC	2	6	162758	162763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_007777	AGT	2	6	162767	162772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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527	NC_007777	GGT	2	6	162790	162795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007777	TAC	2	6	163658	163663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_007777	CTG	2	6	163750	163755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007777	GAT	2	6	163779	163784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007777	AG	3	6	163789	163794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007777	TCG	2	6	163803	163808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_007777	TGCC	2	8	163845	163852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
534	NC_007777	GCG	2	6	163877	163882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_007777	GTC	2	6	163892	163897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007777	GGC	2	6	163989	163994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007777	GT	3	6	164031	164036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007777	ACGG	2	8	164102	164109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
539	NC_007777	CGA	2	6	164115	164120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_007777	GAC	2	6	164125	164130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_007777	CGT	2	6	164733	164738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_007777	CA	3	6	164763	164768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_007777	T	6	6	164802	164807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007777	CG	3	6	164840	164845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_007777	TGA	2	6	164847	164852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007777	GGTCCG	2	12	164866	164877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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548	NC_007777	TGCGG	2	10	164937	164946	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
549	NC_007777	CGG	2	6	164975	164980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_007777	CTT	2	6	165040	165045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_007777	CTG	2	6	165058	165063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007777	GGC	2	6	165138	165143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_007777	TTC	2	6	165194	165199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_007777	CG	3	6	165204	165209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_007777	AC	3	6	165226	165231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_007777	TCT	2	6	165259	165264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007777	GCA	2	6	165329	165334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_007777	CCGC	2	8	165341	165348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
559	NC_007777	TTTC	2	8	165388	165395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_007777	TCCCT	2	10	165403	165412	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
561	NC_007777	CG	3	6	165911	165916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_007777	GAGAA	2	10	165953	165962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007777	CGG	2	6	166014	166019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_007777	CCG	2	6	167712	167717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_007777	TGCA	2	8	167752	167759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_007777	CG	5	10	167768	167777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_007777	TGCG	2	8	167778	167785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_007777	CG	3	6	167792	167797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_007777	CA	3	6	167806	167811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_007777	CAC	2	6	167826	167831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_007777	ACCC	2	8	167867	167874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
572	NC_007777	CCG	2	6	168490	168495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_007777	TC	3	6	168544	168549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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576	NC_007777	CGT	2	6	169306	169311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_007777	GCG	2	6	169406	169411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_007777	GCA	2	6	169539	169544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_007777	CGA	2	6	170491	170496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_007777	CG	3	6	170757	170762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_007777	TGA	2	6	170828	170833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_007777	CGT	2	6	170858	170863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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604	NC_007777	ACGT	2	8	171786	171793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_007777	GTTGA	2	10	171807	171816	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
606	NC_007777	ACT	2	6	173684	173689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007777	ATCGA	2	10	173693	173702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
608	NC_007777	CGC	2	6	173730	173735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_007777	CAC	2	6	173759	173764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_007777	CAT	2	6	173889	173894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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612	NC_007777	CGC	2	6	173970	173975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_007777	TCC	2	6	174766	174771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_007777	CGG	2	6	174789	174794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007777	CCG	2	6	174807	174812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_007777	TGG	2	6	174832	174837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_007777	CGC	2	6	175646	175651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_007777	GCG	3	9	175656	175664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_007777	CCGCG	2	10	175752	175761	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
622	NC_007777	AGA	2	6	176862	176867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007777	GCCCG	2	10	176988	176997	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
624	NC_007777	CGT	2	6	177000	177005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_007777	AGCCG	2	10	177616	177625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
626	NC_007777	GTCTG	2	10	177630	177639	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
627	NC_007777	GCTACC	2	12	177642	177653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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632	NC_007777	TGG	3	9	179191	179199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_007777	GAT	2	6	179990	179995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007777	CCG	2	6	180008	180013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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