MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 36116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021592	TAT	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651362
2	NC_021592	TA	3	6	1466	1471	50 %	50 %	0 %	0 %	518651362
3	NC_021592	TGA	2	6	1477	1482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651362
4	NC_021592	TCT	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651362
5	NC_021592	ATA	2	6	1633	1638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651362
6	NC_021592	TA	3	6	1672	1677	50 %	50 %	0 %	0 %	518651362
7	NC_021592	TAT	2	6	1689	1694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651362
8	NC_021592	TCC	2	6	1763	1768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	518651362
9	NC_021592	TTA	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651362
10	NC_021592	TTC	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651362
11	NC_021592	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	518651362
12	NC_021592	CAG	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651362
13	NC_021592	ATC	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651362
14	NC_021592	ATT	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651362
15	NC_021592	GTAT	2	8	2006	2013	25 %	50 %	25 %	0 %	518651362
16	NC_021592	C	6	6	2034	2039	0 %	0 %	0 %	100 %	518651362
17	NC_021592	TA	3	6	2129	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	518651362
18	NC_021592	TG	3	6	2142	2147	0 %	50 %	50 %	0 %	518651362
19	NC_021592	ATT	2	6	2282	2287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651362
20	NC_021592	T	6	6	2392	2397	0 %	100 %	0 %	0 %	518651362
21	NC_021592	AATA	2	8	2445	2452	75 %	25 %	0 %	0 %	518651363
22	NC_021592	AT	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	518651363
23	NC_021592	TCT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651363
24	NC_021592	TTA	2	6	2555	2560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651363
25	NC_021592	TAT	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651363
26	NC_021592	TCTA	2	8	2646	2653	25 %	50 %	0 %	25 %	518651363
27	NC_021592	CAT	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651363
28	NC_021592	AAT	2	6	2670	2675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651363
29	NC_021592	TACA	2	8	2676	2683	50 %	25 %	0 %	25 %	518651363
30	NC_021592	ACC	2	6	2688	2693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651364
31	NC_021592	AATG	2	8	2698	2705	50 %	25 %	25 %	0 %	518651364
32	NC_021592	TTA	2	6	2760	2765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651364
33	NC_021592	T	8	8	2783	2790	0 %	100 %	0 %	0 %	518651364
34	NC_021592	TAT	2	6	2886	2891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651364
35	NC_021592	T	7	7	2913	2919	0 %	100 %	0 %	0 %	518651364
36	NC_021592	ATTA	2	8	2920	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	518651364
37	NC_021592	TCT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651364
38	NC_021592	TG	3	6	3041	3046	0 %	50 %	50 %	0 %	518651364
39	NC_021592	AT	3	6	3049	3054	50 %	50 %	0 %	0 %	518651364
40	NC_021592	GAAA	2	8	3091	3098	75 %	0 %	25 %	0 %	518651364
41	NC_021592	TCT	2	6	3127	3132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651364
42	NC_021592	TTTA	2	8	3139	3146	25 %	75 %	0 %	0 %	518651364
43	NC_021592	TAT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651364
44	NC_021592	ATA	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651364
45	NC_021592	GCTT	2	8	3398	3405	0 %	50 %	25 %	25 %	518651364
46	NC_021592	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651364
47	NC_021592	A	7	7	3475	3481	100 %	0 %	0 %	0 %	518651364
48	NC_021592	ACA	2	6	3515	3520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651364
49	NC_021592	GAT	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651364
50	NC_021592	T	6	6	3584	3589	0 %	100 %	0 %	0 %	518651364
51	NC_021592	ACC	2	6	3616	3621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651364
52	NC_021592	TAT	2	6	3646	3651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651364
53	NC_021592	AAT	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651365
54	NC_021592	TGG	2	6	3735	3740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651365
55	NC_021592	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651365
56	NC_021592	TAT	2	6	3780	3785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651365
57	NC_021592	TCT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651365
58	NC_021592	TCTAA	2	10	3877	3886	40 %	40 %	0 %	20 %	518651365
59	NC_021592	TGTAT	2	10	3904	3913	20 %	60 %	20 %	0 %	518651365
60	NC_021592	T	7	7	3935	3941	0 %	100 %	0 %	0 %	518651365
61	NC_021592	T	6	6	3961	3966	0 %	100 %	0 %	0 %	518651365
62	NC_021592	CTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651365
63	NC_021592	TC	3	6	4014	4019	0 %	50 %	0 %	50 %	518651365
64	NC_021592	CATTTT	2	12	4061	4072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	518651365
65	NC_021592	ATA	2	6	4128	4133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651365
66	NC_021592	ATTA	2	8	4171	4178	50 %	50 %	0 %	0 %	518651365
67	NC_021592	ATA	2	6	4188	4193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
68	NC_021592	CTT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651366
69	NC_021592	TCAAAA	2	12	4245	4256	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	518651366
70	NC_021592	AT	3	6	4352	4357	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
71	NC_021592	ATT	2	6	4382	4387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
72	NC_021592	ATA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
73	NC_021592	TTA	2	6	4435	4440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
74	NC_021592	TCT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651366
75	NC_021592	ATTTT	2	10	4518	4527	20 %	80 %	0 %	0 %	518651366
76	NC_021592	TCATTA	2	12	4566	4577	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	518651366
77	NC_021592	TA	3	6	4576	4581	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
78	NC_021592	TTG	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651366
79	NC_021592	AAT	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
80	NC_021592	T	7	7	4648	4654	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
81	NC_021592	TAAA	2	8	4701	4708	75 %	25 %	0 %	0 %	518651366
82	NC_021592	T	6	6	4724	4729	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
83	NC_021592	GAG	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651366
84	NC_021592	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
85	NC_021592	TAT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
86	NC_021592	TAA	2	6	4868	4873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
87	NC_021592	TTTC	2	8	4882	4889	0 %	75 %	0 %	25 %	518651366
88	NC_021592	AAT	2	6	4917	4922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
89	NC_021592	T	6	6	4928	4933	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
90	NC_021592	T	7	7	5011	5017	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
91	NC_021592	T	7	7	5030	5036	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
92	NC_021592	ATT	2	6	5051	5056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
93	NC_021592	CAA	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651366
94	NC_021592	ATTT	2	8	5123	5130	25 %	75 %	0 %	0 %	518651366
95	NC_021592	T	8	8	5128	5135	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
96	NC_021592	TTG	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651366
97	NC_021592	CT	3	6	5194	5199	0 %	50 %	0 %	50 %	518651366
98	NC_021592	AT	3	6	5206	5211	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
99	NC_021592	TTTA	2	8	5216	5223	25 %	75 %	0 %	0 %	518651366
100	NC_021592	TA	3	6	5222	5227	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
101	NC_021592	TAT	2	6	5231	5236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
102	NC_021592	TCA	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651366
103	NC_021592	ATTAC	2	10	5280	5289	40 %	40 %	0 %	20 %	518651366
104	NC_021592	AAT	2	6	5334	5339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
105	NC_021592	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651366
106	NC_021592	TAA	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
107	NC_021592	CAT	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651366
108	NC_021592	ATT	2	6	5426	5431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
109	NC_021592	CAA	2	6	5488	5493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651366
110	NC_021592	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651366
111	NC_021592	AAG	2	6	5596	5601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651366
112	NC_021592	TA	3	6	5636	5641	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
113	NC_021592	ATT	2	6	5648	5653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
114	NC_021592	TAT	3	9	5801	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
115	NC_021592	TAT	2	6	5854	5859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
116	NC_021592	TAT	2	6	5870	5875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
117	NC_021592	T	7	7	5875	5881	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
118	NC_021592	GTT	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651366
119	NC_021592	TATTAA	2	12	5899	5910	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
120	NC_021592	TTTA	2	8	5948	5955	25 %	75 %	0 %	0 %	518651366
121	NC_021592	AAT	2	6	5974	5979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651366
122	NC_021592	TTTC	2	8	6009	6016	0 %	75 %	0 %	25 %	518651366
123	NC_021592	AAAT	2	8	6017	6024	75 %	25 %	0 %	0 %	518651366
124	NC_021592	ATG	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651366
125	NC_021592	TGA	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651366
126	NC_021592	ATT	2	6	6092	6097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
127	NC_021592	CTG	2	6	6179	6184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651366
128	NC_021592	TTTA	2	8	6191	6198	25 %	75 %	0 %	0 %	518651366
129	NC_021592	ATT	3	9	6272	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
130	NC_021592	AT	3	6	6301	6306	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
131	NC_021592	T	6	6	6313	6318	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
132	NC_021592	CTT	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651366
133	NC_021592	TTATAA	2	12	6334	6345	50 %	50 %	0 %	0 %	518651366
134	NC_021592	T	7	7	6359	6365	0 %	100 %	0 %	0 %	518651366
135	NC_021592	TTC	2	6	6371	6376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651366
136	NC_021592	TAT	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651366
137	NC_021592	GAT	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651366
138	NC_021592	CCT	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	518651367
139	NC_021592	TTG	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651367
140	NC_021592	T	7	7	6535	6541	0 %	100 %	0 %	0 %	518651367
141	NC_021592	TAT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651367
142	NC_021592	ATT	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651367
143	NC_021592	TAAAT	2	10	6627	6636	60 %	40 %	0 %	0 %	518651367
144	NC_021592	TA	3	6	6660	6665	50 %	50 %	0 %	0 %	518651367
145	NC_021592	ATC	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651367
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148	NC_021592	TTA	2	6	6713	6718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651367
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154	NC_021592	ATT	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651367
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160	NC_021592	ACG	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651367
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162	NC_021592	T	6	6	6956	6961	0 %	100 %	0 %	0 %	518651367
163	NC_021592	ATC	2	6	6966	6971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651367
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167	NC_021592	TAT	2	6	7077	7082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651367
168	NC_021592	TTA	2	6	7100	7105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651367
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170	NC_021592	T	7	7	7161	7167	0 %	100 %	0 %	0 %	518651368
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173	NC_021592	ATT	2	6	7258	7263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651368
174	NC_021592	ATG	2	6	7350	7355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651368
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176	NC_021592	GCAA	2	8	7406	7413	50 %	0 %	25 %	25 %	518651368
177	NC_021592	TGG	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651368
178	NC_021592	TTA	2	6	7455	7460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651368
179	NC_021592	CTTTC	2	10	7472	7481	0 %	60 %	0 %	40 %	518651368
180	NC_021592	TC	3	6	7480	7485	0 %	50 %	0 %	50 %	518651368
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182	NC_021592	TAT	2	6	7587	7592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651368
183	NC_021592	T	6	6	7595	7600	0 %	100 %	0 %	0 %	518651368
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256	NC_021592	TA	3	6	10251	10256	50 %	50 %	0 %	0 %	518651370
257	NC_021592	ATTT	2	8	10918	10925	25 %	75 %	0 %	0 %	518651371
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267	NC_021592	TA	3	6	11289	11294	50 %	50 %	0 %	0 %	518651371
268	NC_021592	AT	4	8	11380	11387	50 %	50 %	0 %	0 %	518651371
269	NC_021592	GAG	2	6	11394	11399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651371
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