MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020054	CGC	2	6	815069	815074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834031
15002	NC_020054	TCG	2	6	815090	815095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834031
15003	NC_020054	TTCG	2	8	815143	815150	0 %	50 %	25 %	25 %	436834031
15004	NC_020054	TCG	2	6	815318	815323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834031
15005	NC_020054	CGG	2	6	815348	815353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834031
15006	NC_020054	CCA	2	6	815445	815450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436834031
15007	NC_020054	GAC	3	9	815497	815505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834031
15008	NC_020054	CCG	2	6	815531	815536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834031
15009	NC_020054	GGC	2	6	815697	815702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834031
15010	NC_020054	TGT	2	6	815729	815734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436834031
15011	NC_020054	GATT	2	8	815808	815815	25 %	50 %	25 %	0 %	436834031
15012	NC_020054	A	6	6	815818	815823	100 %	0 %	0 %	0 %	436834031
15013	NC_020054	CGC	2	6	815824	815829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834031
15014	NC_020054	GGCGG	2	10	815941	815950	0 %	0 %	80 %	20 %	436834031
15015	NC_020054	GTTT	2	8	815960	815967	0 %	75 %	25 %	0 %	436834031
15016	NC_020054	TGTT	2	8	816015	816022	0 %	75 %	25 %	0 %	436834031
15017	NC_020054	CGC	2	6	816046	816051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834031
15018	NC_020054	T	6	6	816137	816142	0 %	100 %	0 %	0 %	436834031
15019	NC_020054	AATAA	2	10	816161	816170	80 %	20 %	0 %	0 %	436834031
15020	NC_020054	ATT	2	6	816185	816190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436834031
15021	NC_020054	ATG	2	6	816210	816215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436834032
15022	NC_020054	T	6	6	816277	816282	0 %	100 %	0 %	0 %	436834032
15023	NC_020054	AACA	2	8	816320	816327	75 %	0 %	0 %	25 %	436834032
15024	NC_020054	GTT	2	6	816340	816345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436834032
15025	NC_020054	TGAT	2	8	816351	816358	25 %	50 %	25 %	0 %	436834032
15026	NC_020054	GTTC	2	8	816388	816395	0 %	50 %	25 %	25 %	436834032
15027	NC_020054	T	6	6	816449	816454	0 %	100 %	0 %	0 %	436834032
15028	NC_020054	GT	3	6	816549	816554	0 %	50 %	50 %	0 %	436834033
15029	NC_020054	CTG	2	6	816603	816608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834033
15030	NC_020054	TCG	3	9	816757	816765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834033
15031	NC_020054	CTT	2	6	816836	816841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436834033
15032	NC_020054	AGC	2	6	816844	816849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834033
15033	NC_020054	GAA	2	6	816873	816878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436834033
15034	NC_020054	TCCAGA	2	12	816883	816894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436834033
15035	NC_020054	GGT	2	6	816956	816961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436834033
15036	NC_020054	TCG	2	6	816988	816993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834033
15037	NC_020054	CAG	2	6	816999	817004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834033
15038	NC_020054	GTT	2	6	817079	817084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436834033
15039	NC_020054	GTC	2	6	817222	817227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834033
15040	NC_020054	CAC	2	6	817287	817292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436834034
15041	NC_020054	TGC	2	6	817444	817449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834034
15042	NC_020054	TCGG	2	8	817491	817498	0 %	25 %	50 %	25 %	436834034
15043	NC_020054	CCT	2	6	817526	817531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436834034
15044	NC_020054	CGG	2	6	817589	817594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834034
15045	NC_020054	GCA	2	6	817601	817606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834034
15046	NC_020054	TCG	2	6	817660	817665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834034
15047	NC_020054	CAG	2	6	817731	817736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834034
15048	NC_020054	TTCGTC	2	12	817740	817751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	436834034
15049	NC_020054	TGC	2	6	817772	817777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834034
15050	NC_020054	CGA	2	6	817829	817834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834034
15051	NC_020054	TGGT	2	8	817858	817865	0 %	50 %	50 %	0 %	436834034
15052	NC_020054	AGTG	2	8	817882	817889	25 %	25 %	50 %	0 %	436834034
15053	NC_020054	CCA	2	6	817946	817951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436834034
15054	NC_020054	CAT	2	6	818197	818202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436834035
15055	NC_020054	TAT	2	6	818209	818214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436834035
15056	NC_020054	CAT	2	6	818225	818230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436834035
15057	NC_020054	CAC	2	6	818234	818239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436834035
15058	NC_020054	ACC	2	6	818241	818246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436834035
15059	NC_020054	GTG	2	6	818282	818287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436834035
15060	NC_020054	GTG	2	6	818315	818320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436834035
15061	NC_020054	TACT	2	8	818456	818463	25 %	50 %	0 %	25 %	436834035
15062	NC_020054	TAT	2	6	818467	818472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436834035
15063	NC_020054	CAC	2	6	818489	818494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436834035
15064	NC_020054	CG	3	6	818505	818510	0 %	0 %	50 %	50 %	436834035
15065	NC_020054	GAA	2	6	818545	818550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436834035
15066	NC_020054	A	6	6	818558	818563	100 %	0 %	0 %	0 %	436834035
15067	NC_020054	TG	3	6	818610	818615	0 %	50 %	50 %	0 %	436834036
15068	NC_020054	GGGGCT	2	12	818623	818634	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	436834036
15069	NC_020054	GCC	2	6	818650	818655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834036
15070	NC_020054	GAC	2	6	818698	818703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15071	NC_020054	AAC	2	6	818792	818797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436834036
15072	NC_020054	CGCTGG	2	12	818867	818878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	436834036
15073	NC_020054	CTG	2	6	818896	818901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15074	NC_020054	TGGC	2	8	818941	818948	0 %	25 %	50 %	25 %	436834036
15075	NC_020054	GCC	2	6	818954	818959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834036
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15077	NC_020054	CAA	2	6	819024	819029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436834036
15078	NC_020054	ACG	2	6	819053	819058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15079	NC_020054	CGA	2	6	819066	819071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15080	NC_020054	GCG	2	6	819121	819126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834036
15081	NC_020054	GCG	2	6	819142	819147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834036
15082	NC_020054	TCA	2	6	819239	819244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436834036
15083	NC_020054	CGG	2	6	819301	819306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834036
15084	NC_020054	TGC	2	6	819335	819340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834036
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15086	NC_020054	ACA	2	6	819370	819375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436834036
15087	NC_020054	ACCG	2	8	819480	819487	25 %	0 %	25 %	50 %	436834036
15088	NC_020054	GGT	2	6	819580	819585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436834036
15089	NC_020054	TGC	2	6	819605	819610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15090	NC_020054	TAG	2	6	819627	819632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436834036
15091	NC_020054	CGA	2	6	819666	819671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15092	NC_020054	TAT	2	6	819690	819695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436834036
15093	NC_020054	G	7	7	819696	819702	0 %	0 %	100 %	0 %	436834036
15094	NC_020054	GAC	2	6	819708	819713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
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15097	NC_020054	TGC	2	6	819794	819799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834036
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15099	NC_020054	GCA	2	6	819834	819839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15100	NC_020054	GCTG	2	8	819912	819919	0 %	25 %	50 %	25 %	436834036
15101	NC_020054	TGC	2	6	819920	819925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15102	NC_020054	TGC	2	6	819929	819934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15103	NC_020054	GAA	2	6	819937	819942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436834036
15104	NC_020054	ATC	2	6	819971	819976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436834036
15105	NC_020054	CGC	2	6	820002	820007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834036
15106	NC_020054	GC	3	6	820006	820011	0 %	0 %	50 %	50 %	436834036
15107	NC_020054	GCG	2	6	820047	820052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834036
15108	NC_020054	CTC	2	6	820114	820119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436834036
15109	NC_020054	CAG	2	6	820156	820161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834036
15110	NC_020054	CG	3	6	820174	820179	0 %	0 %	50 %	50 %	436834036
15111	NC_020054	GTT	2	6	820188	820193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436834036
15112	NC_020054	AAT	2	6	820213	820218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436834036
15113	NC_020054	ATG	2	6	820221	820226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436834036
15114	NC_020054	CCG	2	6	820324	820329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834037
15115	NC_020054	CGC	2	6	820354	820359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834037
15116	NC_020054	GAA	2	6	820397	820402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436834037
15117	NC_020054	TGG	2	6	820597	820602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436834037
15118	NC_020054	GTC	2	6	820604	820609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834037
15119	NC_020054	CAT	2	6	820622	820627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436834037
15120	NC_020054	GAT	2	6	820634	820639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436834037
15121	NC_020054	CTT	2	6	820664	820669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436834037
15122	NC_020054	GTC	2	6	820778	820783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834037
15123	NC_020054	CGC	2	6	820816	820821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834037
15124	NC_020054	CCGTA	2	10	820836	820845	20 %	20 %	20 %	40 %	436834037
15125	NC_020054	CAGC	2	8	820924	820931	25 %	0 %	25 %	50 %	436834037
15126	NC_020054	CTT	2	6	821032	821037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436834037
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15130	NC_020054	GCC	2	6	821358	821363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834038
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15236	NC_020054	T	6	6	826954	826959	0 %	100 %	0 %	0 %	436834042
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15238	NC_020054	ACG	2	6	827117	827122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834042
15239	NC_020054	CCG	2	6	827132	827137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834042
15240	NC_020054	TGCC	2	8	827232	827239	0 %	25 %	25 %	50 %	436834042
15241	NC_020054	TCA	2	6	827351	827356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436834042
15242	NC_020054	GTC	2	6	827413	827418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834042
15243	NC_020054	CGT	2	6	827495	827500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834042
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15245	NC_020054	TCG	2	6	827566	827571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436834042
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15250	NC_020054	TGG	2	6	827886	827891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436834042
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15254	NC_020054	CGTG	2	8	828044	828051	0 %	25 %	50 %	25 %	436834042
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15267	NC_020054	AAC	2	6	829138	829143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436834043
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15300	NC_020054	CTCG	2	8	830698	830705	0 %	25 %	25 %	50 %	436834045
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15310	NC_020054	GGC	2	6	831104	831109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834045
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15330	NC_020054	CGAC	2	8	832132	832139	25 %	0 %	25 %	50 %	436834047
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15342	NC_020054	GAA	2	6	832723	832728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436834047
15343	NC_020054	GCCG	2	8	832846	832853	0 %	0 %	50 %	50 %	436834047
15344	NC_020054	CGC	2	6	832857	832862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834047
15345	NC_020054	GTTG	2	8	832878	832885	0 %	50 %	50 %	0 %	436834047
15346	NC_020054	CGG	2	6	832896	832901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834047
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15350	NC_020054	TCGCC	2	10	833025	833034	0 %	20 %	20 %	60 %	436834047
15351	NC_020054	AGC	2	6	833042	833047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834047
15352	NC_020054	A	6	6	833056	833061	100 %	0 %	0 %	0 %	436834047
15353	NC_020054	TCGA	2	8	833064	833071	25 %	25 %	25 %	25 %	436834047
15354	NC_020054	GTAT	2	8	833179	833186	25 %	50 %	25 %	0 %	436834047
15355	NC_020054	CGC	2	6	833196	833201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834047
15356	NC_020054	TCTA	2	8	833214	833221	25 %	50 %	0 %	25 %	436834047
15357	NC_020054	GACG	2	8	833306	833313	25 %	0 %	50 %	25 %	436834047
15358	NC_020054	CGGC	2	8	833337	833344	0 %	0 %	50 %	50 %	436834047
15359	NC_020054	TTCA	2	8	833357	833364	25 %	50 %	0 %	25 %	436834047
15360	NC_020054	CCGA	2	8	833396	833403	25 %	0 %	25 %	50 %	436834047
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15472	NC_020054	CACT	2	8	839595	839602	25 %	25 %	0 %	50 %	436834053
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15478	NC_020054	GCC	3	9	839962	839970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436834053
15479	NC_020054	AATA	2	8	840019	840026	75 %	25 %	0 %	0 %	436834053
15480	NC_020054	CGG	3	9	840164	840172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436834053
15481	NC_020054	C	6	6	840184	840189	0 %	0 %	0 %	100 %	436834053
15482	NC_020054	AAG	2	6	840206	840211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436834053
15483	NC_020054	G	7	7	840216	840222	0 %	0 %	100 %	0 %	436834053
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15491	NC_020054	CGA	2	6	840447	840452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436834053
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