MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020054	CAG	2	6	52436	52441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1002	NC_020054	TCG	2	6	52453	52458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1003	NC_020054	AC	3	6	52465	52470	50 %	0 %	0 %	50 %	436833440
1004	NC_020054	CGG	2	6	52471	52476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1005	NC_020054	G	6	6	52475	52480	0 %	0 %	100 %	0 %	436833440
1006	NC_020054	CGGGTT	2	12	52549	52560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436833440
1007	NC_020054	CCGG	2	8	52629	52636	0 %	0 %	50 %	50 %	436833440
1008	NC_020054	GGT	2	6	52658	52663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833440
1009	NC_020054	CGG	2	6	52672	52677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1010	NC_020054	CGC	2	6	52733	52738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1011	NC_020054	GTT	2	6	52758	52763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833440
1012	NC_020054	TGC	2	6	52764	52769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1013	NC_020054	CCG	2	6	52807	52812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1014	NC_020054	CGCC	2	8	52888	52895	0 %	0 %	25 %	75 %	436833440
1015	NC_020054	CGC	2	6	52975	52980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1016	NC_020054	CGT	2	6	53048	53053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1017	NC_020054	CTG	2	6	53082	53087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1018	NC_020054	AGC	2	6	53091	53096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1019	NC_020054	TCG	2	6	53139	53144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1020	NC_020054	ACC	2	6	53178	53183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833440
1021	NC_020054	CATA	2	8	53202	53209	50 %	25 %	0 %	25 %	436833440
1022	NC_020054	CGG	2	6	53224	53229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1023	NC_020054	CAC	2	6	53264	53269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833440
1024	NC_020054	GACT	2	8	53271	53278	25 %	25 %	25 %	25 %	436833440
1025	NC_020054	CAAC	2	8	53281	53288	50 %	0 %	0 %	50 %	436833440
1026	NC_020054	GCG	3	9	53323	53331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1027	NC_020054	CCCCG	2	10	53345	53354	0 %	0 %	20 %	80 %	436833440
1028	NC_020054	GCC	2	6	53486	53491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1029	NC_020054	CTGG	2	8	53534	53541	0 %	25 %	50 %	25 %	436833440
1030	NC_020054	GCG	2	6	53557	53562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1031	NC_020054	CAC	3	9	53594	53602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833440
1032	NC_020054	TGG	2	6	53626	53631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833440
1033	NC_020054	TGG	2	6	53689	53694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833440
1034	NC_020054	CGG	2	6	53707	53712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833440
1035	NC_020054	GAT	2	6	53780	53785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833440
1036	NC_020054	GTCGG	2	10	53817	53826	0 %	20 %	60 %	20 %	436833440
1037	NC_020054	CGC	2	6	53836	53841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1038	NC_020054	CTGA	2	8	53891	53898	25 %	25 %	25 %	25 %	436833440
1039	NC_020054	GC	3	6	53996	54001	0 %	0 %	50 %	50 %	436833440
1040	NC_020054	CGT	2	6	54017	54022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1041	NC_020054	GCC	2	6	54045	54050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1042	NC_020054	GCC	2	6	54060	54065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833440
1043	NC_020054	CTGGC	2	10	54072	54081	0 %	20 %	40 %	40 %	436833440
1044	NC_020054	CAG	2	6	54083	54088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1045	NC_020054	AGC	2	6	54093	54098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1046	NC_020054	ACCA	2	8	54118	54125	50 %	0 %	0 %	50 %	436833440
1047	NC_020054	AGC	2	6	54143	54148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833440
1048	NC_020054	ACTG	2	8	54151	54158	25 %	25 %	25 %	25 %	436833440
1049	NC_020054	TTGG	2	8	54162	54169	0 %	50 %	50 %	0 %	436833440
1050	NC_020054	CGT	2	6	54419	54424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833441
1051	NC_020054	CCG	2	6	54461	54466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833441
1052	NC_020054	GGGCG	2	10	54533	54542	0 %	0 %	80 %	20 %	436833441
1053	NC_020054	GAT	2	6	54563	54568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833441
1054	NC_020054	ATG	2	6	54576	54581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833441
1055	NC_020054	CTC	2	6	54582	54587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833441
1056	NC_020054	CGA	2	6	54596	54601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833441
1057	NC_020054	A	6	6	54790	54795	100 %	0 %	0 %	0 %	436833442
1058	NC_020054	CCAAA	2	10	54837	54846	60 %	0 %	0 %	40 %	436833442
1059	NC_020054	CGA	2	6	54857	54862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833442
1060	NC_020054	ACC	2	6	54898	54903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833442
1061	NC_020054	GGCA	2	8	54952	54959	25 %	0 %	50 %	25 %	436833442
1062	NC_020054	GTG	2	6	54967	54972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833442
1063	NC_020054	GGC	2	6	55014	55019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833442
1064	NC_020054	CGT	2	6	55023	55028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833442
1065	NC_020054	ACG	2	6	55072	55077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833442
1066	NC_020054	A	6	6	55123	55128	100 %	0 %	0 %	0 %	436833442
1067	NC_020054	GCCC	2	8	55135	55142	0 %	0 %	25 %	75 %	436833442
1068	NC_020054	ACG	2	6	55169	55174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833442
1069	NC_020054	AAC	2	6	55177	55182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833442
1070	NC_020054	CGG	2	6	55200	55205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833442
1071	NC_020054	CGG	2	6	55329	55334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833442
1072	NC_020054	GTC	2	6	55338	55343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833442
1073	NC_020054	GCT	2	6	55396	55401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833442
1074	NC_020054	CGC	2	6	55485	55490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833442
1075	NC_020054	TTCC	2	8	55530	55537	0 %	50 %	0 %	50 %	436833442
1076	NC_020054	CGG	3	9	55609	55617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833443
1077	NC_020054	GACC	2	8	55628	55635	25 %	0 %	25 %	50 %	436833443
1078	NC_020054	TGCAGA	2	12	55657	55668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436833443
1079	NC_020054	CGC	2	6	55673	55678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833443
1080	NC_020054	AAC	2	6	55683	55688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833443
1081	NC_020054	CACGC	2	10	55776	55785	20 %	0 %	20 %	60 %	436833443
1082	NC_020054	CAC	3	9	55832	55840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833443
1083	NC_020054	GGCT	2	8	55899	55906	0 %	25 %	50 %	25 %	436833443
1084	NC_020054	CGG	2	6	55976	55981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833443
1085	NC_020054	TGG	2	6	56023	56028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833443
1086	NC_020054	GCCC	2	8	56090	56097	0 %	0 %	25 %	75 %	436833443
1087	NC_020054	CGA	2	6	56171	56176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833443
1088	NC_020054	GGC	2	6	56274	56279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833443
1089	NC_020054	CCGG	2	8	56314	56321	0 %	0 %	50 %	50 %	436833443
1090	NC_020054	GCAGGT	2	12	56339	56350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436833443
1091	NC_020054	TCGCC	2	10	56527	56536	0 %	20 %	20 %	60 %	436833444
1092	NC_020054	T	6	6	56576	56581	0 %	100 %	0 %	0 %	436833444
1093	NC_020054	A	6	6	56597	56602	100 %	0 %	0 %	0 %	436833444
1094	NC_020054	CGT	2	6	56614	56619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833444
1095	NC_020054	ACG	2	6	56631	56636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833444
1096	NC_020054	CCG	2	6	56661	56666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833444
1097	NC_020054	AGC	2	6	56770	56775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833444
1098	NC_020054	CTGG	2	8	56779	56786	0 %	25 %	50 %	25 %	436833444
1099	NC_020054	TCT	3	9	56820	56828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833444
1100	NC_020054	GCG	2	6	56843	56848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833444
1101	NC_020054	GTTACG	2	12	56867	56878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436833444
1102	NC_020054	CTG	2	6	57020	57025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833444
1103	NC_020054	GCT	2	6	57079	57084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833444
1104	NC_020054	CTG	2	6	57143	57148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833444
1105	NC_020054	GCC	2	6	57176	57181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833444
1106	NC_020054	CAA	2	6	57196	57201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833444
1107	NC_020054	CGCTGG	2	12	57225	57236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	436833444
1108	NC_020054	GC	3	6	57325	57330	0 %	0 %	50 %	50 %	436833444
1109	NC_020054	TAC	2	6	57350	57355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833444
1110	NC_020054	GATC	2	8	57549	57556	25 %	25 %	25 %	25 %	436833445
1111	NC_020054	GCA	2	6	57618	57623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833445
1112	NC_020054	CGC	2	6	57640	57645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833445
1113	NC_020054	ATT	2	6	57752	57757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833445
1114	NC_020054	TGG	2	6	57764	57769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833445
1115	NC_020054	GCAG	2	8	57790	57797	25 %	0 %	50 %	25 %	436833445
1116	NC_020054	GGC	2	6	57863	57868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833445
1117	NC_020054	ATT	2	6	58067	58072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833445
1118	NC_020054	C	6	6	58078	58083	0 %	0 %	0 %	100 %	436833445
1119	NC_020054	CAA	2	6	58281	58286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833445
1120	NC_020054	CTG	2	6	58318	58323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833445
1121	NC_020054	CTG	2	6	58384	58389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833445
1122	NC_020054	CAC	2	6	58419	58424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833445
1123	NC_020054	CAC	2	6	58446	58451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833445
1124	NC_020054	CTA	2	6	58452	58457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833445
1125	NC_020054	GAT	2	6	58492	58497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833445
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1129	NC_020054	GAT	2	6	58665	58670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833445
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1131	NC_020054	CGA	2	6	58716	58721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833445
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1251	NC_020054	CGTC	2	8	65153	65160	0 %	25 %	25 %	50 %	436833451
1252	NC_020054	TGC	2	6	65178	65183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833451
1253	NC_020054	GT	3	6	65205	65210	0 %	50 %	50 %	0 %	436833451
1254	NC_020054	TGGT	2	8	65297	65304	0 %	50 %	50 %	0 %	436833451
1255	NC_020054	GTT	3	9	65329	65337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833451
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1275	NC_020054	TGGT	2	8	66236	66243	0 %	50 %	50 %	0 %	436833451
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1283	NC_020054	GCG	2	6	66952	66957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833452
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1370	NC_020054	CGC	2	6	71322	71327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833456
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1375	NC_020054	TGC	3	9	71523	71531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833456
1376	NC_020054	TGC	2	6	71567	71572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833456
1377	NC_020054	GCT	3	9	71605	71613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833456
1378	NC_020054	GTT	2	6	71656	71661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833456
1379	NC_020054	GCT	2	6	71662	71667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833456
1380	NC_020054	TGG	2	6	71748	71753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833456
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1387	NC_020054	GCC	2	6	71977	71982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833456
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1492	NC_020054	ATG	2	6	76825	76830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833459
1493	NC_020054	CA	3	6	76843	76848	50 %	0 %	0 %	50 %	436833459
1494	NC_020054	TGG	3	9	76880	76888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833459
1495	NC_020054	CAG	2	6	76939	76944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833459
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1497	NC_020054	AGC	2	6	77024	77029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833459
1498	NC_020054	GC	3	6	77041	77046	0 %	0 %	50 %	50 %	436833459
1499	NC_020054	TCG	2	6	77140	77145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833459
1500	NC_020054	GAT	2	6	77173	77178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833459

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