MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020054	TGATC	2	10	529156	529165	20 %	40 %	20 %	20 %	436833795
10002	NC_020054	TCC	2	6	529236	529241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833795
10003	NC_020054	GCC	2	6	529245	529250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833795
10004	NC_020054	CGCC	2	8	529261	529268	0 %	0 %	25 %	75 %	436833795
10005	NC_020054	TGT	2	6	529288	529293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833795
10006	NC_020054	G	6	6	529395	529400	0 %	0 %	100 %	0 %	436833795
10007	NC_020054	CGG	2	6	529429	529434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833795
10008	NC_020054	TCG	2	6	529437	529442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
10009	NC_020054	GTC	2	6	529488	529493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
10010	NC_020054	TGA	3	9	529545	529553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833795
10011	NC_020054	CGA	2	6	529567	529572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833795
10012	NC_020054	CGC	2	6	529597	529602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833795
10013	NC_020054	GCGA	2	8	529617	529624	25 %	0 %	50 %	25 %	436833795
10014	NC_020054	CCCA	2	8	529628	529635	25 %	0 %	0 %	75 %	436833795
10015	NC_020054	GCC	4	12	529664	529675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833795
10016	NC_020054	CGT	2	6	529678	529683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
10017	NC_020054	TGAGCG	2	12	529759	529770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436833795
10018	NC_020054	CCA	2	6	529827	529832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833796
10019	NC_020054	CCG	2	6	529836	529841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833796
10020	NC_020054	ACCC	2	8	529844	529851	25 %	0 %	0 %	75 %	436833796
10021	NC_020054	TGA	2	6	529870	529875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833796
10022	NC_020054	CG	3	6	530161	530166	0 %	0 %	50 %	50 %	436833797
10023	NC_020054	ATCA	2	8	530186	530193	50 %	25 %	0 %	25 %	436833797
10024	NC_020054	GTAA	2	8	530210	530217	50 %	25 %	25 %	0 %	436833797
10025	NC_020054	GC	3	6	530264	530269	0 %	0 %	50 %	50 %	436833797
10026	NC_020054	CGGT	2	8	530310	530317	0 %	25 %	50 %	25 %	436833797
10027	NC_020054	GAC	2	6	530357	530362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10028	NC_020054	CAG	2	6	530423	530428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10029	NC_020054	TCA	2	6	530448	530453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833797
10030	NC_020054	CGT	2	6	530476	530481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10031	NC_020054	GCT	2	6	530545	530550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10032	NC_020054	TAG	2	6	530636	530641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833797
10033	NC_020054	ACC	2	6	530647	530652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833797
10034	NC_020054	AAC	2	6	530709	530714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833797
10035	NC_020054	CGT	2	6	530785	530790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10036	NC_020054	CGT	2	6	530867	530872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10037	NC_020054	CGC	3	9	530900	530908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833797
10038	NC_020054	CAG	2	6	530929	530934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10039	NC_020054	AGCG	2	8	530960	530967	25 %	0 %	50 %	25 %	436833797
10040	NC_020054	GT	3	6	530983	530988	0 %	50 %	50 %	0 %	436833797
10041	NC_020054	GAATC	2	10	531016	531025	40 %	20 %	20 %	20 %	436833797
10042	NC_020054	GCA	2	6	531067	531072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
10043	NC_020054	GT	3	6	531107	531112	0 %	50 %	50 %	0 %	436833797
10044	NC_020054	GTG	2	6	531135	531140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833798
10045	NC_020054	AC	3	6	531204	531209	50 %	0 %	0 %	50 %	436833798
10046	NC_020054	ACG	2	6	531254	531259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833798
10047	NC_020054	CGAC	2	8	531294	531301	25 %	0 %	25 %	50 %	436833798
10048	NC_020054	GCTGG	2	10	531310	531319	0 %	20 %	60 %	20 %	436833798
10049	NC_020054	TTC	2	6	531430	531435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833798
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10052	NC_020054	TGG	2	6	531725	531730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833798
10053	NC_020054	GTC	2	6	531739	531744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833798
10054	NC_020054	TGG	2	6	532146	532151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833799
10055	NC_020054	AC	3	6	532395	532400	50 %	0 %	0 %	50 %	436833799
10056	NC_020054	CGC	2	6	532428	532433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833799
10057	NC_020054	GCT	2	6	532444	532449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833799
10058	NC_020054	AGC	2	6	532466	532471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833799
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10060	NC_020054	GCGCT	2	10	532556	532565	0 %	20 %	40 %	40 %	436833799
10061	NC_020054	GCC	3	9	532586	532594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833799
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10064	NC_020054	GCT	2	6	532648	532653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833799
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10077	NC_020054	CCTG	2	8	533192	533199	0 %	25 %	25 %	50 %	436833799
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10112	NC_020054	GCG	2	6	535015	535020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833800
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10115	NC_020054	AAT	2	6	535079	535084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436833800
10116	NC_020054	GTG	2	6	535269	535274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833801
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10118	NC_020054	TTC	2	6	535309	535314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833801
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10239	NC_020054	CTG	2	6	542369	542374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833808
10240	NC_020054	GCT	2	6	542467	542472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833808
10241	NC_020054	GGCG	2	8	542515	542522	0 %	0 %	75 %	25 %	436833808
10242	NC_020054	TCG	2	6	542556	542561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833808
10243	NC_020054	CTG	2	6	542660	542665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833808
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10254	NC_020054	CCTG	2	8	543166	543173	0 %	25 %	25 %	50 %	436833809
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10264	NC_020054	TCG	2	6	543356	543361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833809
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10328	NC_020054	GGCCA	2	10	547178	547187	20 %	0 %	40 %	40 %	436833813
10329	NC_020054	AAGC	2	8	547238	547245	50 %	0 %	25 %	25 %	436833813
10330	NC_020054	CTG	2	6	547250	547255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833813
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10338	NC_020054	GTAC	2	8	547828	547835	25 %	25 %	25 %	25 %	436833814
10339	NC_020054	AAC	2	6	547836	547841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833814
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10342	NC_020054	CAG	2	6	547959	547964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833814
10343	NC_020054	GCA	3	9	547990	547998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833814
10344	NC_020054	CAA	2	6	548132	548137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833814
10345	NC_020054	CAC	2	6	548189	548194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833814
10346	NC_020054	CGA	2	6	548215	548220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833814
10347	NC_020054	T	6	6	548566	548571	0 %	100 %	0 %	0 %	436833815
10348	NC_020054	CGA	2	6	548648	548653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833815
10349	NC_020054	GATACC	2	12	548715	548726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436833815
10350	NC_020054	CAG	2	6	548759	548764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833815
10351	NC_020054	TCAA	2	8	548874	548881	50 %	25 %	0 %	25 %	436833815
10352	NC_020054	GCC	2	6	549063	549068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833815
10353	NC_020054	CTA	2	6	549087	549092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833815
10354	NC_020054	TGC	2	6	549226	549231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833815
10355	NC_020054	GC	3	6	549253	549258	0 %	0 %	50 %	50 %	436833815
10356	NC_020054	CGT	2	6	549286	549291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833815
10357	NC_020054	TTCGT	2	10	549452	549461	0 %	60 %	20 %	20 %	436833815
10358	NC_020054	ACT	2	6	549531	549536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833815
10359	NC_020054	CGG	2	6	549591	549596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833815
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10474	NC_020054	CGTC	2	8	556760	556767	0 %	25 %	25 %	50 %	436833820
10475	NC_020054	CGA	2	6	556795	556800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833820
10476	NC_020054	TCG	2	6	556826	556831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833820
10477	NC_020054	CGG	2	6	556842	556847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833820
10478	NC_020054	CGT	2	6	556893	556898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833820
10479	NC_020054	CAT	2	6	556902	556907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833820
10480	NC_020054	CTG	2	6	556930	556935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833820
10481	NC_020054	GGT	2	6	557059	557064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833820
10482	NC_020054	GTA	2	6	557068	557073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833820
10483	NC_020054	CAC	2	6	557117	557122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833820
10484	NC_020054	GCCGG	2	10	557146	557155	0 %	0 %	60 %	40 %	436833820
10485	NC_020054	GCG	2	6	557219	557224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833820
10486	NC_020054	CCA	2	6	557316	557321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833820
10487	NC_020054	CTGG	2	8	557356	557363	0 %	25 %	50 %	25 %	436833820
10488	NC_020054	GTC	2	6	557405	557410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833820
10489	NC_020054	CGC	3	9	557415	557423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833820
10490	NC_020054	A	6	6	557766	557771	100 %	0 %	0 %	0 %	436833821
10491	NC_020054	TGT	2	6	557839	557844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833821
10492	NC_020054	TGC	2	6	557845	557850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833821
10493	NC_020054	C	6	6	557855	557860	0 %	0 %	0 %	100 %	436833821
10494	NC_020054	AGC	2	6	557869	557874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833821
10495	NC_020054	CGC	2	6	558020	558025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833821
10496	NC_020054	ACC	2	6	558027	558032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833821
10497	NC_020054	GAC	2	6	558145	558150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833821
10498	NC_020054	GCT	2	6	558179	558184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833821
10499	NC_020054	GGAC	2	8	558190	558197	25 %	0 %	50 %	25 %	436833821
10500	NC_020054	CGA	2	6	558213	558218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833821

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