MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 32636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	A	8	8	298	305	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
2	NC_019551	A	9	9	307	315	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
3	NC_019551	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
4	NC_019551	CAA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937996
5	NC_019551	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937996
6	NC_019551	TAA	2	6	496	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937996
7	NC_019551	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
8	NC_019551	A	6	6	516	521	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
9	NC_019551	T	7	7	556	562	0 %	100 %	0 %	0 %	422937996
10	NC_019551	CAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937996
11	NC_019551	AGA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
12	NC_019551	AGT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937996
13	NC_019551	AAG	2	6	632	637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
14	NC_019551	TCA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937996
15	NC_019551	AGA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
16	NC_019551	TGT	2	6	769	774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937996
17	NC_019551	AGC	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422937996
18	NC_019551	TGG	2	6	859	864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422937996
19	NC_019551	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	422937996
20	NC_019551	ATT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937996
21	NC_019551	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937996
22	NC_019551	CAAGAT	2	12	995	1006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422937996
23	NC_019551	TGAT	2	8	1044	1051	25 %	50 %	25 %	0 %	422937996
24	NC_019551	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
25	NC_019551	A	6	6	1268	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
26	NC_019551	CAG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422937996
27	NC_019551	GTAC	2	8	1331	1338	25 %	25 %	25 %	25 %	422937996
28	NC_019551	TAC	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937996
29	NC_019551	CTA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937996
30	NC_019551	GCTT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	422937996
31	NC_019551	AAGAA	2	10	1455	1464	80 %	0 %	20 %	0 %	422937996
32	NC_019551	ATA	2	6	1476	1481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937996
33	NC_019551	GTT	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937996
34	NC_019551	AAG	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
35	NC_019551	TGG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422937996
36	NC_019551	ATGC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	25 %	25 %	422937996
37	NC_019551	GAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937996
38	NC_019551	TAAA	2	8	1748	1755	75 %	25 %	0 %	0 %	422937996
39	NC_019551	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	422937997
40	NC_019551	TAT	2	6	1872	1877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
41	NC_019551	ATA	3	9	1899	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
42	NC_019551	AGTT	2	8	1960	1967	25 %	50 %	25 %	0 %	422937997
43	NC_019551	TGAT	2	8	2043	2050	25 %	50 %	25 %	0 %	422937997
44	NC_019551	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
45	NC_019551	AGCA	2	8	2157	2164	50 %	0 %	25 %	25 %	422937997
46	NC_019551	CAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937997
47	NC_019551	TCA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937997
48	NC_019551	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
49	NC_019551	ATG	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937997
50	NC_019551	CTA	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937997
51	NC_019551	A	7	7	2380	2386	100 %	0 %	0 %	0 %	422937997
52	NC_019551	AGA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937997
53	NC_019551	ATA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
54	NC_019551	ATT	2	6	2590	2595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
55	NC_019551	TAA	2	6	2674	2679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
56	NC_019551	GAA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937997
57	NC_019551	TCTA	2	8	2801	2808	25 %	50 %	0 %	25 %	422937997
58	NC_019551	ATA	2	6	2853	2858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
59	NC_019551	GTTT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	422937997
60	NC_019551	ATT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
61	NC_019551	CAACA	2	10	7198	7207	60 %	0 %	0 %	40 %	422937998
62	NC_019551	TAAGAG	2	12	7243	7254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422937998
63	NC_019551	GTTT	2	8	7263	7270	0 %	75 %	25 %	0 %	422937998
64	NC_019551	TAA	2	6	7278	7283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937998
65	NC_019551	TAA	2	6	7359	7364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937998
66	NC_019551	TGA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937998
67	NC_019551	GA	3	6	7406	7411	50 %	0 %	50 %	0 %	422937998
68	NC_019551	TGA	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937998
69	NC_019551	TTG	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937998
70	NC_019551	AAAT	2	8	7470	7477	75 %	25 %	0 %	0 %	422937998
71	NC_019551	AGG	2	6	7483	7488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	422937998
72	NC_019551	TGA	2	6	7504	7509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937998
73	NC_019551	TATG	2	8	7558	7565	25 %	50 %	25 %	0 %	422937998
74	NC_019551	TGTA	2	8	7567	7574	25 %	50 %	25 %	0 %	422937998
75	NC_019551	TTA	2	6	7597	7602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937998
76	NC_019551	GCT	2	6	7607	7612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422937998
77	NC_019551	TGGTTT	2	12	7675	7686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937998
78	NC_019551	GA	3	6	7737	7742	50 %	0 %	50 %	0 %	422937998
79	NC_019551	TCA	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937998
80	NC_019551	ACA	2	6	7886	7891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937998
81	NC_019551	TAA	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937998
82	NC_019551	TTG	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937998
83	NC_019551	T	6	6	8023	8028	0 %	100 %	0 %	0 %	422937998
84	NC_019551	CAG	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422937998
85	NC_019551	TAT	2	6	8063	8068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937998
86	NC_019551	CT	3	6	8073	8078	0 %	50 %	0 %	50 %	422937998
87	NC_019551	A	7	7	8197	8203	100 %	0 %	0 %	0 %	422937999
88	NC_019551	TGG	2	6	8226	8231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422937999
89	NC_019551	TGG	2	6	8262	8267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422937999
90	NC_019551	TGA	2	6	8334	8339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937999
91	NC_019551	GAT	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937999
92	NC_019551	GAT	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937999
93	NC_019551	CAG	2	6	8474	8479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422937999
94	NC_019551	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937999
95	NC_019551	A	6	6	8567	8572	100 %	0 %	0 %	0 %	422937999
96	NC_019551	CTG	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422937999
97	NC_019551	TA	3	6	8678	8683	50 %	50 %	0 %	0 %	422937999
98	NC_019551	AAT	2	6	8729	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937999
99	NC_019551	TGTTT	2	10	8906	8915	0 %	80 %	20 %	0 %	422938000
100	NC_019551	CTA	2	6	8929	8934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938000
101	NC_019551	TA	3	6	8941	8946	50 %	50 %	0 %	0 %	422938000
102	NC_019551	A	6	6	8968	8973	100 %	0 %	0 %	0 %	422938000
103	NC_019551	TAAAGG	2	12	9018	9029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938000
104	NC_019551	ATT	2	6	9076	9081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938000
105	NC_019551	ATG	2	6	9101	9106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938000
106	NC_019551	AAC	2	6	9111	9116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938000
107	NC_019551	CAA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938000
108	NC_019551	AAG	2	6	9203	9208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938000
109	NC_019551	AGC	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938000
110	NC_019551	AGCA	2	8	9325	9332	50 %	0 %	25 %	25 %	422938001
111	NC_019551	TCTT	2	8	9371	9378	0 %	75 %	0 %	25 %	422938001
112	NC_019551	CA	3	6	9432	9437	50 %	0 %	0 %	50 %	422938001
113	NC_019551	CTA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938001
114	NC_019551	AGA	2	6	9467	9472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938001
115	NC_019551	ATG	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938001
116	NC_019551	AAG	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938001
117	NC_019551	A	6	6	9606	9611	100 %	0 %	0 %	0 %	422938001
118	NC_019551	GTG	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422938001
119	NC_019551	CAG	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938001
120	NC_019551	AGCA	2	8	9753	9760	50 %	0 %	25 %	25 %	422938001
121	NC_019551	AAG	2	6	9874	9879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938002
122	NC_019551	TAT	2	6	9911	9916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938002
123	NC_019551	AGG	2	6	9941	9946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	422938002
124	NC_019551	ATT	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938002
125	NC_019551	AT	3	6	9972	9977	50 %	50 %	0 %	0 %	422938002
126	NC_019551	ATC	2	6	9986	9991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938002
127	NC_019551	ACA	2	6	9999	10004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938002
128	NC_019551	GCA	2	6	10050	10055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938002
129	NC_019551	TTG	2	6	10057	10062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422938002
130	NC_019551	GTTGAT	2	12	10107	10118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	422938002
131	NC_019551	GGA	2	6	10188	10193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	422938002
132	NC_019551	GTA	2	6	10203	10208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938002
133	NC_019551	TGC	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938002
134	NC_019551	CAAG	2	8	10281	10288	50 %	0 %	25 %	25 %	422938002
135	NC_019551	TGG	2	6	10412	10417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422938002
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142	NC_019551	TAA	2	6	10781	10786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938002
143	NC_019551	AAG	2	6	10807	10812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938002
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262	NC_019551	TCA	2	6	18723	18728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938007
263	NC_019551	ATA	2	6	18749	18754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938007
264	NC_019551	ATT	2	6	18914	18919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938007
265	NC_019551	TAAT	2	8	18961	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	422938007
266	NC_019551	GAC	2	6	18985	18990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938007
267	NC_019551	ATC	2	6	19043	19048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938007
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273	NC_019551	ACA	2	6	19718	19723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938008
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284	NC_019551	ACC	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422938008
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286	NC_019551	GTA	2	6	20228	20233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938008
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