MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 26470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017461	CTT	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
2	NC_017461	CTT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
3	NC_017461	GAA	2	6	895	900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805052
4	NC_017461	GCT	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
5	NC_017461	AGT	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
6	NC_017461	TCA	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
7	NC_017461	AATTG	2	10	989	998	40 %	40 %	20 %	0 %	385805052
8	NC_017461	ATC	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
9	NC_017461	TCT	3	9	1107	1115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
10	NC_017461	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
11	NC_017461	CTT	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
12	NC_017461	AGAA	2	8	1386	1393	75 %	0 %	25 %	0 %	385805052
13	NC_017461	CT	3	6	1446	1451	0 %	50 %	0 %	50 %	385805052
14	NC_017461	CCA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385805052
15	NC_017461	CCG	2	6	1580	1585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805052
16	NC_017461	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
17	NC_017461	TTA	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805052
18	NC_017461	CTG	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
19	NC_017461	GGT	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805052
20	NC_017461	AAAT	2	8	1796	1803	75 %	25 %	0 %	0 %	385805052
21	NC_017461	AAT	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
22	NC_017461	AAAATT	2	12	1864	1875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
23	NC_017461	CCTTT	2	10	1891	1900	0 %	60 %	0 %	40 %	385805052
24	NC_017461	GAGT	2	8	1903	1910	25 %	25 %	50 %	0 %	385805052
25	NC_017461	TCC	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805052
26	NC_017461	CAT	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
27	NC_017461	AAT	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
28	NC_017461	ATTCGG	2	12	2193	2204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805052
29	NC_017461	TC	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	385805052
30	NC_017461	AGCTTC	2	12	2438	2449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385805052
31	NC_017461	GCT	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
32	NC_017461	GTA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
33	NC_017461	CA	3	6	2600	2605	50 %	0 %	0 %	50 %	385805052
34	NC_017461	TGG	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805053
35	NC_017461	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805053
36	NC_017461	T	6	6	2935	2940	0 %	100 %	0 %	0 %	385805053
37	NC_017461	T	6	6	2943	2948	0 %	100 %	0 %	0 %	385805053
38	NC_017461	CTT	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805053
39	NC_017461	TTTTC	2	10	2974	2983	0 %	80 %	0 %	20 %	385805053
40	NC_017461	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805053
41	NC_017461	CCT	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805054
42	NC_017461	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
43	NC_017461	CTC	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805055
44	NC_017461	CTA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805055
45	NC_017461	ACTTC	2	10	4689	4698	20 %	40 %	0 %	40 %	385805055
46	NC_017461	GGC	2	6	4700	4705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385805055
47	NC_017461	TGA	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
48	NC_017461	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805055
49	NC_017461	ATT	2	6	4778	4783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805055
50	NC_017461	AAGA	2	8	4789	4796	75 %	0 %	25 %	0 %	385805055
51	NC_017461	AGA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805055
52	NC_017461	TAG	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
53	NC_017461	TC	3	6	5457	5462	0 %	50 %	0 %	50 %	385805056
54	NC_017461	GA	3	6	5501	5506	50 %	0 %	50 %	0 %	385805056
55	NC_017461	ATA	2	6	5537	5542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805056
56	NC_017461	TTA	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805056
57	NC_017461	CTT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805056
58	NC_017461	TCC	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805057
59	NC_017461	CCTT	2	8	5756	5763	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
60	NC_017461	GTTA	2	8	5773	5780	25 %	50 %	25 %	0 %	385805057
61	NC_017461	GA	3	6	5798	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	385805057
62	NC_017461	ATG	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805057
63	NC_017461	TCAT	2	8	5864	5871	25 %	50 %	0 %	25 %	385805057
64	NC_017461	TC	3	6	5951	5956	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
65	NC_017461	CAG	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805057
66	NC_017461	CT	3	6	6038	6043	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
67	NC_017461	GA	3	6	6059	6064	50 %	0 %	50 %	0 %	385805057
68	NC_017461	TCG	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805057
69	NC_017461	TAAGC	2	10	6083	6092	40 %	20 %	20 %	20 %	385805057
70	NC_017461	AAC	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
71	NC_017461	GAG	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805057
72	NC_017461	CAA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
73	NC_017461	AT	3	6	6182	6187	50 %	50 %	0 %	0 %	385805057
74	NC_017461	GTC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805057
75	NC_017461	TA	3	6	6211	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	385805057
76	NC_017461	T	6	6	6221	6226	0 %	100 %	0 %	0 %	385805057
77	NC_017461	ACA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
78	NC_017461	AGC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805057
79	NC_017461	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805057
80	NC_017461	TC	3	6	6356	6361	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
81	NC_017461	CAA	2	6	6414	6419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
82	NC_017461	TTC	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
83	NC_017461	ACT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805057
84	NC_017461	CTT	2	6	6496	6501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
85	NC_017461	ATA	2	6	6532	6537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805057
86	NC_017461	TCCTTT	2	12	6599	6610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
87	NC_017461	CCTT	2	8	6635	6642	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
88	NC_017461	TCCGCC	2	12	6649	6660	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385805057
89	NC_017461	GA	3	6	6945	6950	50 %	0 %	50 %	0 %	385805058
90	NC_017461	AAT	2	6	6977	6982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
91	NC_017461	ATT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805058
92	NC_017461	GCC	2	6	7064	7069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805058
93	NC_017461	AT	3	6	7074	7079	50 %	50 %	0 %	0 %	385805058
94	NC_017461	AAT	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
95	NC_017461	AAT	2	6	7143	7148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
96	NC_017461	AT	3	6	7183	7188	50 %	50 %	0 %	0 %	385805058
97	NC_017461	GCG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385805058
98	NC_017461	ATA	2	6	7282	7287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
99	NC_017461	TTC	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805058
100	NC_017461	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805058
101	NC_017461	TTTTC	2	10	7337	7346	0 %	80 %	0 %	20 %	385805058
102	NC_017461	TA	3	6	7353	7358	50 %	50 %	0 %	0 %	385805058
103	NC_017461	T	6	6	7397	7402	0 %	100 %	0 %	0 %	385805058
104	NC_017461	TTCCT	2	10	7471	7480	0 %	60 %	0 %	40 %	385805058
105	NC_017461	TTC	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805058
106	NC_017461	CGA	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805058
107	NC_017461	CCG	3	9	7623	7631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805058
108	NC_017461	AG	3	6	7644	7649	50 %	0 %	50 %	0 %	385805058
109	NC_017461	CTA	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805058
110	NC_017461	ATA	2	6	7671	7676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
111	NC_017461	ATT	2	6	7683	7688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805058
112	NC_017461	CTC	2	6	7713	7718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805059
113	NC_017461	TTC	2	6	7738	7743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805059
114	NC_017461	CAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805059
115	NC_017461	T	6	6	7819	7824	0 %	100 %	0 %	0 %	385805059
116	NC_017461	TCTCA	2	10	7855	7864	20 %	40 %	0 %	40 %	385805059
117	NC_017461	TTA	2	6	8120	8125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
118	NC_017461	AT	3	6	8226	8231	50 %	50 %	0 %	0 %	385805060
119	NC_017461	ATGA	2	8	8288	8295	50 %	25 %	25 %	0 %	385805060
120	NC_017461	GA	3	6	8429	8434	50 %	0 %	50 %	0 %	385805060
121	NC_017461	ATT	2	6	8461	8466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
122	NC_017461	GCC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805060
123	NC_017461	AGC	2	6	8524	8529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805060
124	NC_017461	GC	3	6	8559	8564	0 %	0 %	50 %	50 %	385805060
125	NC_017461	TGT	2	6	8578	8583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385805060
126	NC_017461	AT	4	8	8655	8662	50 %	50 %	0 %	0 %	385805060
127	NC_017461	TAA	2	6	8700	8705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805060
128	NC_017461	TTTC	2	8	8727	8734	0 %	75 %	0 %	25 %	385805060
129	NC_017461	TCC	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805060
130	NC_017461	AAT	2	6	9017	9022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805060
131	NC_017461	ATT	2	6	9110	9115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
132	NC_017461	CCT	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805060
133	NC_017461	ATT	2	6	9122	9127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
134	NC_017461	GAA	2	6	9139	9144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805060
135	NC_017461	TA	3	6	9267	9272	50 %	50 %	0 %	0 %	385805060
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262	NC_017461	G	6	6	16641	16646	0 %	0 %	100 %	0 %	385805073
263	NC_017461	AG	3	6	16670	16675	50 %	0 %	50 %	0 %	385805073
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265	NC_017461	AAC	2	6	16739	16744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805073
266	NC_017461	GAA	2	6	16789	16794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805073
267	NC_017461	CGT	2	6	17608	17613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805074
268	NC_017461	C	6	6	17689	17694	0 %	0 %	0 %	100 %	385805074
269	NC_017461	TC	3	6	17739	17744	0 %	50 %	0 %	50 %	385805074
270	NC_017461	GCCAA	2	10	17746	17755	40 %	0 %	20 %	40 %	385805074
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273	NC_017461	CCT	2	6	17871	17876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805074
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279	NC_017461	AGATAG	2	12	18171	18182	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805075
280	NC_017461	AT	3	6	18317	18322	50 %	50 %	0 %	0 %	385805076
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