MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 41265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017450	TACTA	2	10	279365	279374	40 %	40 %	0 %	20 %	385792223
6002	NC_017450	ATG	2	6	279398	279403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792223
6003	NC_017450	TA	3	6	279461	279466	50 %	50 %	0 %	0 %	385792223
6004	NC_017450	CTA	2	6	279517	279522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792223
6005	NC_017450	ATA	2	6	279553	279558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792223
6006	NC_017450	A	7	7	279599	279605	100 %	0 %	0 %	0 %	385792223
6007	NC_017450	CAAC	2	8	279888	279895	50 %	0 %	0 %	50 %	385792224
6008	NC_017450	ATT	2	6	279960	279965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385792224
6009	NC_017450	ATAA	2	8	280068	280075	75 %	25 %	0 %	0 %	385792224
6010	NC_017450	TTTA	2	8	280127	280134	25 %	75 %	0 %	0 %	385792225
6011	NC_017450	AGA	2	6	280139	280144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385792225
6012	NC_017450	TA	4	8	280194	280201	50 %	50 %	0 %	0 %	385792225
6013	NC_017450	GAT	2	6	280326	280331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792225
6014	NC_017450	A	6	6	280338	280343	100 %	0 %	0 %	0 %	385792225
6015	NC_017450	TGA	2	6	280361	280366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792225
6016	NC_017450	A	6	6	280422	280427	100 %	0 %	0 %	0 %	385792225
6017	NC_017450	GCTC	2	8	280449	280456	0 %	25 %	25 %	50 %	385792225
6018	NC_017450	GGA	2	6	280499	280504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385792225
6019	NC_017450	TCG	2	6	280511	280516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385792225
6020	NC_017450	TCA	2	6	280536	280541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792225
6021	NC_017450	TAA	2	6	280561	280566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792225
6022	NC_017450	AGTATG	2	12	280624	280635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792225
6023	NC_017450	CAG	2	6	280645	280650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385792225
6024	NC_017450	AAT	2	6	280656	280661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792225
6025	NC_017450	AG	3	6	280671	280676	50 %	0 %	50 %	0 %	385792225
6026	NC_017450	TAA	2	6	280688	280693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792225
6027	NC_017450	ATC	2	6	280733	280738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792225
6028	NC_017450	A	7	7	280757	280763	100 %	0 %	0 %	0 %	385792225
6029	NC_017450	CCA	2	6	280824	280829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792225
6030	NC_017450	AGCAG	2	10	280868	280877	40 %	0 %	40 %	20 %	385792225
6031	NC_017450	A	7	7	281299	281305	100 %	0 %	0 %	0 %	385792226
6032	NC_017450	AAAT	2	8	281319	281326	75 %	25 %	0 %	0 %	385792226
6033	NC_017450	GGT	2	6	281359	281364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385792226
6034	NC_017450	TCT	2	6	281365	281370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385792226
6035	NC_017450	AGA	2	6	281376	281381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385792226
6036	NC_017450	A	6	6	281381	281386	100 %	0 %	0 %	0 %	385792226
6037	NC_017450	AAGC	2	8	281398	281405	50 %	0 %	25 %	25 %	385792226
6038	NC_017450	TAG	2	6	281450	281455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792226
6039	NC_017450	AG	4	8	281469	281476	50 %	0 %	50 %	0 %	385792226
6040	NC_017450	CTT	2	6	281480	281485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385792226
6041	NC_017450	AATA	2	8	281514	281521	75 %	25 %	0 %	0 %	385792226
6042	NC_017450	TAG	2	6	281528	281533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792226
6043	NC_017450	GAAA	2	8	281595	281602	75 %	0 %	25 %	0 %	385792226
6044	NC_017450	AGA	2	6	281610	281615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385792226
6045	NC_017450	CAAT	2	8	281666	281673	50 %	25 %	0 %	25 %	385792226
6046	NC_017450	AAT	2	6	281712	281717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792226
6047	NC_017450	ATTTA	2	10	281829	281838	40 %	60 %	0 %	0 %	385792226
6048	NC_017450	AAG	2	6	281887	281892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385792226
6049	NC_017450	ACT	2	6	281951	281956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792226
6050	NC_017450	A	6	6	281965	281970	100 %	0 %	0 %	0 %	385792226
6051	NC_017450	CAA	3	9	281974	281982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385792226
6052	NC_017450	TTG	2	6	282155	282160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792227
6053	NC_017450	ATA	2	6	282246	282251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792227
6054	NC_017450	ATA	2	6	282270	282275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792227
6055	NC_017450	ATT	2	6	282296	282301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385792227
6056	NC_017450	AT	4	8	282330	282337	50 %	50 %	0 %	0 %	385792227
6057	NC_017450	TTCA	2	8	282415	282422	25 %	50 %	0 %	25 %	385792227
6058	NC_017450	GTT	2	6	282448	282453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792227
6059	NC_017450	GTAAAG	2	12	282465	282476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385792227
6060	NC_017450	CTTAT	2	10	282541	282550	20 %	60 %	0 %	20 %	385792227
6061	NC_017450	AT	3	6	282574	282579	50 %	50 %	0 %	0 %	385792227
6062	NC_017450	ATAA	2	8	282611	282618	75 %	25 %	0 %	0 %	385792228
6063	NC_017450	ATC	2	6	282653	282658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792228
6064	NC_017450	CTT	2	6	282681	282686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385792228
6065	NC_017450	TTG	2	6	282756	282761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792228
6066	NC_017450	CCA	2	6	282809	282814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
6067	NC_017450	TATAA	2	10	282823	282832	60 %	40 %	0 %	0 %	385792228
6068	NC_017450	AT	3	6	282873	282878	50 %	50 %	0 %	0 %	385792228
6069	NC_017450	TGGA	2	8	282913	282920	25 %	25 %	50 %	0 %	385792228
6070	NC_017450	TAAA	2	8	282954	282961	75 %	25 %	0 %	0 %	385792228
6071	NC_017450	ATC	2	6	282971	282976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792228
6072	NC_017450	CCA	2	6	282983	282988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
6073	NC_017450	CCA	2	6	282998	283003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
6074	NC_017450	ACC	2	6	283006	283011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
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6077	NC_017450	GATA	2	8	283099	283106	50 %	25 %	25 %	0 %	385792228
6078	NC_017450	ATAC	2	8	283178	283185	50 %	25 %	0 %	25 %	385792228
6079	NC_017450	AAG	2	6	283205	283210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385792228
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6081	NC_017450	TA	3	6	283273	283278	50 %	50 %	0 %	0 %	385792228
6082	NC_017450	TAG	2	6	283293	283298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792228
6083	NC_017450	AAGAA	2	10	283304	283313	80 %	0 %	20 %	0 %	385792228
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6088	NC_017450	ACC	2	6	283573	283578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
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6090	NC_017450	ACC	2	6	283627	283632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
6091	NC_017450	TGT	2	6	283646	283651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792228
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6093	NC_017450	ACC	2	6	283702	283707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385792228
6094	NC_017450	GTA	2	6	283712	283717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792228
6095	NC_017450	AT	3	6	283778	283783	50 %	50 %	0 %	0 %	385792228
6096	NC_017450	ATTTG	2	10	283861	283870	20 %	60 %	20 %	0 %	385792228
6097	NC_017450	A	6	6	283889	283894	100 %	0 %	0 %	0 %	385792228
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6099	NC_017450	TA	4	8	283952	283959	50 %	50 %	0 %	0 %	385792228
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6104	NC_017450	ATA	2	6	284192	284197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792229
6105	NC_017450	A	6	6	284197	284202	100 %	0 %	0 %	0 %	385792229
6106	NC_017450	AGAA	2	8	284282	284289	75 %	0 %	25 %	0 %	385792229
6107	NC_017450	AAT	2	6	284354	284359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792229
6108	NC_017450	A	6	6	284610	284615	100 %	0 %	0 %	0 %	385792230
6109	NC_017450	ATT	2	6	284624	284629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385792230
6110	NC_017450	TGC	2	6	284693	284698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385792230
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6116	NC_017450	AATTT	2	10	284921	284930	40 %	60 %	0 %	0 %	385792231
6117	NC_017450	TGT	2	6	284976	284981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792231
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6119	NC_017450	T	7	7	285076	285082	0 %	100 %	0 %	0 %	385792231
6120	NC_017450	CAT	2	6	285105	285110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792231
6121	NC_017450	TGT	2	6	285160	285165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792231
6122	NC_017450	T	6	6	285187	285192	0 %	100 %	0 %	0 %	385792231
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6124	NC_017450	TTGA	2	8	285250	285257	25 %	50 %	25 %	0 %	385792231
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6494	NC_017450	CAA	2	6	301292	301297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385792245
6495	NC_017450	T	6	6	301335	301340	0 %	100 %	0 %	0 %	385792245
6496	NC_017450	TA	3	6	301451	301456	50 %	50 %	0 %	0 %	385792245
6497	NC_017450	AAGA	2	8	301463	301470	75 %	0 %	25 %	0 %	385792245
6498	NC_017450	GCA	2	6	301544	301549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385792245
6499	NC_017450	GAT	2	6	301550	301555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792245
6500	NC_017450	TATT	2	8	301556	301563	25 %	75 %	0 %	0 %	385792245

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