MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 42550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017449	A	8	8	168	175	100 %	0 %	0 %	0 %	387823584
2	NC_017449	A	9	9	177	185	100 %	0 %	0 %	0 %	387823584
3	NC_017449	T	6	6	257	262	0 %	100 %	0 %	0 %	387823584
4	NC_017449	TAA	2	6	264	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823584
5	NC_017449	A	6	6	280	285	100 %	0 %	0 %	0 %	387823584
6	NC_017449	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823584
7	NC_017449	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823584
8	NC_017449	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	387823584
9	NC_017449	A	6	6	386	391	100 %	0 %	0 %	0 %	387823584
10	NC_017449	TTA	2	6	401	406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823584
11	NC_017449	T	7	7	426	432	0 %	100 %	0 %	0 %	387823584
12	NC_017449	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
13	NC_017449	GAA	2	6	501	506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
14	NC_017449	TCTT	2	8	522	529	0 %	75 %	0 %	25 %	387823584
15	NC_017449	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823584
16	NC_017449	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
17	NC_017449	AGC	3	9	669	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823584
18	NC_017449	TGG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823584
19	NC_017449	GCAA	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	387823584
20	NC_017449	TTA	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823584
21	NC_017449	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387823584
22	NC_017449	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823584
23	NC_017449	GAT	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823584
24	NC_017449	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
25	NC_017449	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
26	NC_017449	CAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823584
27	NC_017449	CATT	2	8	1184	1191	25 %	50 %	0 %	25 %	387823584
28	NC_017449	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823584
29	NC_017449	AAGAA	2	10	1325	1334	80 %	0 %	20 %	0 %	387823584
30	NC_017449	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823584
31	NC_017449	GTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823584
32	NC_017449	AAG	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
33	NC_017449	TGG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823584
34	NC_017449	ACA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823584
35	NC_017449	ATGC	2	8	1528	1535	25 %	25 %	25 %	25 %	387823584
36	NC_017449	GAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823584
37	NC_017449	TAAA	2	8	1618	1625	75 %	25 %	0 %	0 %	387823584
38	NC_017449	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	387823585
39	NC_017449	TAT	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
40	NC_017449	TAT	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
41	NC_017449	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
42	NC_017449	TGAA	2	8	1898	1905	50 %	25 %	25 %	0 %	387823585
43	NC_017449	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
44	NC_017449	AGCA	2	8	2027	2034	50 %	0 %	25 %	25 %	387823585
45	NC_017449	TCA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823585
46	NC_017449	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
47	NC_017449	ATG	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823585
48	NC_017449	ATA	2	6	2242	2247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
49	NC_017449	A	7	7	2250	2256	100 %	0 %	0 %	0 %	387823585
50	NC_017449	A	7	7	2272	2278	100 %	0 %	0 %	0 %	387823585
51	NC_017449	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823585
52	NC_017449	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
53	NC_017449	AT	3	6	2513	2518	50 %	50 %	0 %	0 %	387823585
54	NC_017449	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
55	NC_017449	GAA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823585
56	NC_017449	ATA	2	6	2723	2728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
57	NC_017449	TTAT	2	8	2731	2738	25 %	75 %	0 %	0 %	387823585
58	NC_017449	TAT	3	9	2736	2744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
59	NC_017449	GAAT	2	8	2823	2830	50 %	25 %	25 %	0 %	387823586
60	NC_017449	A	7	7	2842	2848	100 %	0 %	0 %	0 %	387823586
61	NC_017449	TA	4	8	2866	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	387823586
62	NC_017449	AGT	3	9	2896	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823586
63	NC_017449	TAA	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
64	NC_017449	GCA	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823586
65	NC_017449	TCC	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823586
66	NC_017449	CTATTT	2	12	2981	2992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387823586
67	NC_017449	CAC	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
68	NC_017449	A	6	6	3063	3068	100 %	0 %	0 %	0 %	387823586
69	NC_017449	T	6	6	3092	3097	0 %	100 %	0 %	0 %	387823586
70	NC_017449	ATA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
71	NC_017449	AT	3	6	3109	3114	50 %	50 %	0 %	0 %	387823586
72	NC_017449	T	6	6	3160	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	387823586
73	NC_017449	ACC	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
74	NC_017449	AT	3	6	3185	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	387823586
75	NC_017449	GAA	2	6	3203	3208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823586
76	NC_017449	TAT	2	6	3220	3225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
77	NC_017449	AAT	2	6	3270	3275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
78	NC_017449	AT	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	387823586
79	NC_017449	ATG	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823586
80	NC_017449	AGAA	2	8	3338	3345	75 %	0 %	25 %	0 %	387823586
81	NC_017449	TAA	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
82	NC_017449	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
83	NC_017449	T	7	7	3409	3415	0 %	100 %	0 %	0 %	387823586
84	NC_017449	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823586
85	NC_017449	AAT	2	6	3478	3483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
86	NC_017449	ATT	2	6	3532	3537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
87	NC_017449	CAA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823586
88	NC_017449	TAA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
89	NC_017449	TAAC	2	8	3560	3567	50 %	25 %	0 %	25 %	387823586
90	NC_017449	A	7	7	3589	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	387823586
91	NC_017449	GAA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823586
92	NC_017449	TTA	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
93	NC_017449	GCT	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823586
94	NC_017449	CCA	2	6	3671	3676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
95	NC_017449	CCA	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
96	NC_017449	AT	3	6	3736	3741	50 %	50 %	0 %	0 %	387823586
97	NC_017449	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
98	NC_017449	AAT	2	6	3812	3817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
99	NC_017449	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	387823586
100	NC_017449	AGA	2	6	3855	3860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823586
101	NC_017449	TAA	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
102	NC_017449	A	7	7	3880	3886	100 %	0 %	0 %	0 %	387823586
103	NC_017449	TAAAG	2	10	3889	3898	60 %	20 %	20 %	0 %	387823586
104	NC_017449	GTAT	2	8	3904	3911	25 %	50 %	25 %	0 %	387823586
105	NC_017449	TTG	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823586
106	NC_017449	GCA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823586
107	NC_017449	CATAC	2	10	3976	3985	40 %	20 %	0 %	40 %	387823586
108	NC_017449	AT	3	6	4032	4037	50 %	50 %	0 %	0 %	387823586
109	NC_017449	T	6	6	4037	4042	0 %	100 %	0 %	0 %	387823586
110	NC_017449	TTA	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823587
111	NC_017449	AGC	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823587
112	NC_017449	TAT	2	6	4432	4437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823587
113	NC_017449	AGCT	2	8	4441	4448	25 %	25 %	25 %	25 %	387823587
114	NC_017449	CAA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823587
115	NC_017449	ATT	2	6	4469	4474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823587
116	NC_017449	CA	3	6	4495	4500	50 %	0 %	0 %	50 %	387823587
117	NC_017449	CA	3	6	4580	4585	50 %	0 %	0 %	50 %	387823588
118	NC_017449	AT	4	8	4586	4593	50 %	50 %	0 %	0 %	387823588
119	NC_017449	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	387823588
120	NC_017449	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823588
121	NC_017449	TAG	2	6	4660	4665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823588
122	NC_017449	GCA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823588
123	NC_017449	AAC	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823588
124	NC_017449	GCA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823588
125	NC_017449	GA	3	6	4822	4827	50 %	0 %	50 %	0 %	387823588
126	NC_017449	T	6	6	4899	4904	0 %	100 %	0 %	0 %	387823588
127	NC_017449	CAG	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823588
128	NC_017449	TAGT	2	8	4972	4979	25 %	50 %	25 %	0 %	387823588
129	NC_017449	TTAT	2	8	4995	5002	25 %	75 %	0 %	0 %	387823588
130	NC_017449	AT	3	6	5001	5006	50 %	50 %	0 %	0 %	387823588
131	NC_017449	TAC	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823588
132	NC_017449	TGG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823588
133	NC_017449	CAGGTA	2	12	5167	5178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387823588
134	NC_017449	TTAT	2	8	5179	5186	25 %	75 %	0 %	0 %	387823588
135	NC_017449	AAATG	2	10	5210	5219	60 %	20 %	20 %	0 %	387823588
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137	NC_017449	CTT	2	6	5353	5358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823588
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