MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 66645

< Previous12...122123124125126127128129130131132133134Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
66501	NC_016510	GAA	2	6	3154519	3154524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961724
66502	NC_016510	GAAT	2	8	3154542	3154549	50 %	25 %	25 %	0 %	365961724
66503	NC_016510	TA	3	6	3154579	3154584	50 %	50 %	0 %	0 %	365961724
66504	NC_016510	AT	3	6	3154956	3154961	50 %	50 %	0 %	0 %	365961725
66505	NC_016510	T	6	6	3154965	3154970	0 %	100 %	0 %	0 %	365961725
66506	NC_016510	TTGC	2	8	3154993	3155000	0 %	50 %	25 %	25 %	365961725
66507	NC_016510	TAA	2	6	3155028	3155033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961725
66508	NC_016510	AGA	2	6	3155034	3155039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961725
66509	NC_016510	GAAT	2	8	3155049	3155056	50 %	25 %	25 %	0 %	365961725
66510	NC_016510	A	6	6	3155070	3155075	100 %	0 %	0 %	0 %	365961725
66511	NC_016510	ATG	2	6	3155096	3155101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365961725
66512	NC_016510	TAG	2	6	3155124	3155129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365961725
66513	NC_016510	CAC	2	6	3155144	3155149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365961725
66514	NC_016510	GAA	2	6	3155185	3155190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961725
66515	NC_016510	TAA	2	6	3155196	3155201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961725
66516	NC_016510	AGC	2	6	3155229	3155234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365961725
66517	NC_016510	GAA	2	6	3155321	3155326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961725
66518	NC_016510	ATC	2	6	3155373	3155378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961725
66519	NC_016510	AGG	2	6	3155384	3155389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365961725
66520	NC_016510	CAG	2	6	3155402	3155407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365961725
66521	NC_016510	A	6	6	3155429	3155434	100 %	0 %	0 %	0 %	365961725
66522	NC_016510	CTG	2	6	3155552	3155557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365961725
66523	NC_016510	TTA	2	6	3155604	3155609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961725
66524	NC_016510	A	7	7	3155688	3155694	100 %	0 %	0 %	0 %	365961725
66525	NC_016510	AT	3	6	3155721	3155726	50 %	50 %	0 %	0 %	365961725
66526	NC_016510	GAAA	2	8	3155731	3155738	75 %	0 %	25 %	0 %	365961725
66527	NC_016510	TA	3	6	3155749	3155754	50 %	50 %	0 %	0 %	365961725
66528	NC_016510	TA	3	6	3155777	3155782	50 %	50 %	0 %	0 %	365961725
66529	NC_016510	CTA	2	6	3155891	3155896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961725
66530	NC_016510	AGG	2	6	3155931	3155936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365961725
66531	NC_016510	TGG	2	6	3155946	3155951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365961725
66532	NC_016510	GCA	2	6	3155959	3155964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365961725
66533	NC_016510	ATT	2	6	3156119	3156124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961725
66534	NC_016510	GAA	2	6	3156133	3156138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961725
66535	NC_016510	TA	3	6	3156143	3156148	50 %	50 %	0 %	0 %	365961725
66536	NC_016510	TGA	2	6	3156162	3156167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365961725
66537	NC_016510	A	7	7	3156172	3156178	100 %	0 %	0 %	0 %	365961725
66538	NC_016510	ATT	2	6	3156226	3156231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961725
66539	NC_016510	TAA	2	6	3156237	3156242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961725
66540	NC_016510	A	6	6	3156264	3156269	100 %	0 %	0 %	0 %	365961725
66541	NC_016510	GTA	2	6	3156287	3156292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365961725
66542	NC_016510	ACC	2	6	3156306	3156311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365961725
66543	NC_016510	CAG	2	6	3156323	3156328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365961725
66544	NC_016510	TTA	2	6	3156343	3156348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961725
66545	NC_016510	ATTT	2	8	3156398	3156405	25 %	75 %	0 %	0 %	365961725
66546	NC_016510	ATA	2	6	3156407	3156412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961725
66547	NC_016510	GAAC	2	8	3156455	3156462	50 %	0 %	25 %	25 %	365961725
66548	NC_016510	AACAGA	2	12	3156489	3156500	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365961725
66549	NC_016510	A	6	6	3156533	3156538	100 %	0 %	0 %	0 %	365961725
66550	NC_016510	ATA	2	6	3156545	3156550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961725
66551	NC_016510	TAA	2	6	3157798	3157803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961726
66552	NC_016510	ACTT	2	8	3157879	3157886	25 %	50 %	0 %	25 %	365961726
66553	NC_016510	ACC	2	6	3157909	3157914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365961726
66554	NC_016510	TAA	2	6	3157974	3157979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961726
66555	NC_016510	TGAGG	2	10	3158034	3158043	20 %	20 %	60 %	0 %	365961726
66556	NC_016510	TAA	2	6	3158061	3158066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961726
66557	NC_016510	TGT	2	6	3158139	3158144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365961726
66558	NC_016510	T	9	9	3158150	3158158	0 %	100 %	0 %	0 %	365961726
66559	NC_016510	TTC	2	6	3158167	3158172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365961726
66560	NC_016510	A	6	6	3158204	3158209	100 %	0 %	0 %	0 %	365961726
66561	NC_016510	GTA	2	6	3158258	3158263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365961726
66562	NC_016510	ATA	2	6	3158312	3158317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961726
66563	NC_016510	AAG	2	6	3158337	3158342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961726
66564	NC_016510	TTA	2	6	3158358	3158363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961726
66565	NC_016510	AGCAGA	2	12	3158458	3158469	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365961726
66566	NC_016510	GAA	2	6	3158576	3158581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961726
66567	NC_016510	TGG	2	6	3158604	3158609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365961726
66568	NC_016510	T	6	6	3158645	3158650	0 %	100 %	0 %	0 %	365961726
66569	NC_016510	TTAAAG	2	12	3158660	3158671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365961726
66570	NC_016510	TTA	2	6	3158772	3158777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961727
66571	NC_016510	AAG	2	6	3158802	3158807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961727
66572	NC_016510	CAT	2	6	3158813	3158818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961727
66573	NC_016510	T	6	6	3158818	3158823	0 %	100 %	0 %	0 %	365961727
66574	NC_016510	AAC	2	6	3158987	3158992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365961727
66575	NC_016510	TATGAA	2	12	3159067	3159078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365961727
66576	NC_016510	T	8	8	3159083	3159090	0 %	100 %	0 %	0 %	365961727
66577	NC_016510	TTA	2	6	3159114	3159119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961727
66578	NC_016510	T	6	6	3159136	3159141	0 %	100 %	0 %	0 %	365961727
66579	NC_016510	AT	3	6	3159143	3159148	50 %	50 %	0 %	0 %	365961727
66580	NC_016510	TTA	2	6	3159153	3159158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365961727
66581	NC_016510	CAG	2	6	3159271	3159276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365961727
66582	NC_016510	CAT	2	6	3159313	3159318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961727
66583	NC_016510	TAA	2	6	3159374	3159379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961727
66584	NC_016510	TA	3	6	3159389	3159394	50 %	50 %	0 %	0 %	365961727
66585	NC_016510	CT	3	6	3159425	3159430	0 %	50 %	0 %	50 %	365961727
66586	NC_016510	AGG	2	6	3159431	3159436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365961727
66587	NC_016510	A	6	6	3159486	3159491	100 %	0 %	0 %	0 %	365961727
66588	NC_016510	T	6	6	3159494	3159499	0 %	100 %	0 %	0 %	365961727
66589	NC_016510	AAG	2	6	3159568	3159573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961727
66590	NC_016510	AAG	2	6	3159613	3159618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961727
66591	NC_016510	T	8	8	3159679	3159686	0 %	100 %	0 %	0 %	365961727
66592	NC_016510	A	6	6	3159699	3159704	100 %	0 %	0 %	0 %	365961727
66593	NC_016510	AAC	2	6	3159738	3159743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365961727
66594	NC_016510	TGT	2	6	3159757	3159762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365961727
66595	NC_016510	GAT	2	6	3159808	3159813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365961727
66596	NC_016510	CAT	2	6	3159847	3159852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961727
66597	NC_016510	GTT	2	6	3160028	3160033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365961728
66598	NC_016510	TTC	2	6	3160045	3160050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365961728
66599	NC_016510	AT	3	6	3160097	3160102	50 %	50 %	0 %	0 %	365961728
66600	NC_016510	ACT	2	6	3160226	3160231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961728
66601	NC_016510	TCTAAT	2	12	3160331	3160342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365961728
66602	NC_016510	TCA	2	6	3160355	3160360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961728
66603	NC_016510	AATG	2	8	3160374	3160381	50 %	25 %	25 %	0 %	365961728
66604	NC_016510	CTTT	2	8	3160431	3160438	0 %	75 %	0 %	25 %	365961728
66605	NC_016510	CTT	2	6	3160518	3160523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365961728
66606	NC_016510	CTA	2	6	3160524	3160529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961728
66607	NC_016510	CAT	2	6	3160582	3160587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961728
66608	NC_016510	T	6	6	3160629	3160634	0 %	100 %	0 %	0 %	365961728
66609	NC_016510	A	7	7	3160663	3160669	100 %	0 %	0 %	0 %	365961728
66610	NC_016510	TCG	2	6	3160715	3160720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365961728
66611	NC_016510	ATGGGT	2	12	3160741	3160752	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	365961728
66612	NC_016510	AAT	2	6	3161011	3161016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961729
66613	NC_016510	ATTTC	2	10	3161088	3161097	20 %	60 %	0 %	20 %	365961729
66614	NC_016510	A	6	6	3161133	3161138	100 %	0 %	0 %	0 %	365961729
66615	NC_016510	GAA	2	6	3161155	3161160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961729
66616	NC_016510	ATTT	2	8	3161180	3161187	25 %	75 %	0 %	0 %	365961729
66617	NC_016510	ATA	2	6	3161280	3161285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961729
66618	NC_016510	AT	3	6	3161295	3161300	50 %	50 %	0 %	0 %	365961729
66619	NC_016510	TTTGA	2	10	3161301	3161310	20 %	60 %	20 %	0 %	365961729
66620	NC_016510	ATTC	2	8	3161338	3161345	25 %	50 %	0 %	25 %	365961729
66621	NC_016510	TCA	2	6	3161373	3161378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961729
66622	NC_016510	ACT	2	6	3161391	3161396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365961729
66623	NC_016510	TGT	2	6	3161429	3161434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365961729
66624	NC_016510	AGA	2	6	3161453	3161458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365961729
66625	NC_016510	TCT	2	6	3161484	3161489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365961729
66626	NC_016510	AAAC	2	8	3161501	3161508	75 %	0 %	0 %	25 %	365961729
66627	NC_016510	AAT	2	6	3161557	3161562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961729
66628	NC_016510	AATG	2	8	3161581	3161588	50 %	25 %	25 %	0 %	365961729
66629	NC_016510	ACA	2	6	3161595	3161600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365961729
66630	NC_016510	TTG	2	6	3161659	3161664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365961729
66631	NC_016510	TG	3	6	3161682	3161687	0 %	50 %	50 %	0 %	365961729
66632	NC_016510	T	6	6	3161728	3161733	0 %	100 %	0 %	0 %	365961729
66633	NC_016510	ACA	2	6	3161739	3161744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365961729
66634	NC_016510	T	6	6	3161835	3161840	0 %	100 %	0 %	0 %	365961729
66635	NC_016510	T	7	7	3161928	3161934	0 %	100 %	0 %	0 %	365961729
66636	NC_016510	TTC	2	6	3161981	3161986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365961729
66637	NC_016510	TG	3	6	3161988	3161993	0 %	50 %	50 %	0 %	365961729
66638	NC_016510	TAA	2	6	3162101	3162106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365961729
66639	NC_016510	TTC	2	6	3162113	3162118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365961729
66640	NC_016510	T	8	8	3162139	3162146	0 %	100 %	0 %	0 %	365961729
66641	NC_016510	AGG	3	9	3162163	3162171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365961729
66642	NC_016510	T	6	6	3162188	3162193	0 %	100 %	0 %	0 %	365961729
66643	NC_016510	CAA	2	6	3162262	3162267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365961729
66644	NC_016510	AG	3	6	3162287	3162292	50 %	0 %	50 %	0 %	365961729
66645	NC_016510	TGCC	2	8	3162334	3162341	0 %	25 %	25 %	50 %	365961729

< Previous12...122123124125126127128129130131132133134Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.