MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata plasmid pFSYMDG02

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015657	ATT	2	6	226	231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336176137
2	NC_015657	CTA	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
3	NC_015657	CTA	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
4	NC_015657	CGA	3	9	384	392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
5	NC_015657	TCA	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
6	NC_015657	CAA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
7	NC_015657	CAA	2	6	514	519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
8	NC_015657	TAC	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
9	NC_015657	CTC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176137
10	NC_015657	GGA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176137
11	NC_015657	AAC	2	6	672	677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
12	NC_015657	TAC	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
13	NC_015657	AAC	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
14	NC_015657	CTCAC	2	10	831	840	20 %	20 %	0 %	60 %	336176137
15	NC_015657	AGA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
16	NC_015657	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
17	NC_015657	TG	3	6	982	987	0 %	50 %	50 %	0 %	336176137
18	NC_015657	GAA	2	6	991	996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
19	NC_015657	ACG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
20	NC_015657	AAGG	2	8	1057	1064	50 %	0 %	50 %	0 %	336176137
21	NC_015657	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
22	NC_015657	AGA	3	9	1083	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
23	NC_015657	AG	3	6	1138	1143	50 %	0 %	50 %	0 %	336176137
24	NC_015657	CCA	2	6	1179	1184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176137
25	NC_015657	TCC	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176137
26	NC_015657	AAC	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
27	NC_015657	AT	3	6	1390	1395	50 %	50 %	0 %	0 %	336176137
28	NC_015657	CAA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
29	NC_015657	AT	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	336176137
30	NC_015657	AC	4	8	1546	1553	50 %	0 %	0 %	50 %	336176137
31	NC_015657	ATC	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
32	NC_015657	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
33	NC_015657	AAG	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
34	NC_015657	CTGC	2	8	1614	1621	0 %	25 %	25 %	50 %	336176137
35	NC_015657	GGT	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176137
36	NC_015657	TC	3	6	1769	1774	0 %	50 %	0 %	50 %	336176137
37	NC_015657	AGA	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
38	NC_015657	GGAA	2	8	1914	1921	50 %	0 %	50 %	0 %	336176137
39	NC_015657	TAA	2	6	1932	1937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336176137
40	NC_015657	TAC	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
41	NC_015657	TAC	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
42	NC_015657	CAG	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
43	NC_015657	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
44	NC_015657	GTC	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176137
45	NC_015657	GA	3	6	2265	2270	50 %	0 %	50 %	0 %	336176137
46	NC_015657	CGT	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176137
47	NC_015657	TTC	2	6	2492	2497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176137
48	NC_015657	ACCCA	2	10	2526	2535	40 %	0 %	0 %	60 %	336176137
49	NC_015657	GAG	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176137
50	NC_015657	TCCA	3	12	2576	2587	25 %	25 %	0 %	50 %	336176137
51	NC_015657	CAT	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176137
52	NC_015657	AGA	3	9	2621	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
53	NC_015657	CCA	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176137
54	NC_015657	CAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
55	NC_015657	AGA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
56	NC_015657	GTACA	2	10	2701	2710	40 %	20 %	20 %	20 %	336176137
57	NC_015657	ACG	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
58	NC_015657	CAC	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176137
59	NC_015657	CAATA	2	10	2857	2866	60 %	20 %	0 %	20 %	336176137
60	NC_015657	ACC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176137
61	NC_015657	GTC	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176137
62	NC_015657	ATG	3	9	2990	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176137
63	NC_015657	CAG	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
64	NC_015657	CCA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176137
65	NC_015657	ACC	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176137
66	NC_015657	GAC	2	6	3136	3141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
67	NC_015657	ATAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	336176137
68	NC_015657	AGA	2	6	3177	3182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
69	NC_015657	CAA	2	6	3242	3247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
70	NC_015657	CGA	2	6	3330	3335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176137
71	NC_015657	GAG	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176137
72	NC_015657	ACA	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176137
73	NC_015657	ATA	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336176137
74	NC_015657	AGA	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
75	NC_015657	GATC	2	8	3521	3528	25 %	25 %	25 %	25 %	336176137
76	NC_015657	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
77	NC_015657	TCAGAC	2	12	3634	3645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336176137
78	NC_015657	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
79	NC_015657	GAA	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
80	NC_015657	GAA	2	6	3859	3864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176137
81	NC_015657	CAC	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176138
82	NC_015657	AAG	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176138
83	NC_015657	CAA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176138
84	NC_015657	TCA	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176138
85	NC_015657	GAA	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176138
86	NC_015657	CAC	3	9	4141	4149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176138
87	NC_015657	TAAA	2	8	4180	4187	75 %	25 %	0 %	0 %	336176138
88	NC_015657	TTA	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336176138
89	NC_015657	ACG	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176138
90	NC_015657	ATG	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176138
91	NC_015657	CA	3	6	4435	4440	50 %	0 %	0 %	50 %	336176138
92	NC_015657	AGA	2	6	4445	4450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176138
93	NC_015657	A	6	6	4497	4502	100 %	0 %	0 %	0 %	336176138
94	NC_015657	TCT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176138
95	NC_015657	AGGAA	2	10	4625	4634	60 %	0 %	40 %	0 %	336176138
96	NC_015657	TAC	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176138
97	NC_015657	ATT	2	6	4852	4857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336176138
98	NC_015657	AAC	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176138
99	NC_015657	GCA	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176138
100	NC_015657	ACA	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176138
101	NC_015657	AGC	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176138
102	NC_015657	TAC	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176138
103	NC_015657	ACAG	2	8	5115	5122	50 %	0 %	25 %	25 %	336176138
104	NC_015657	AAT	2	6	5138	5143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336176138
105	NC_015657	GTA	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176138
106	NC_015657	GAT	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176138
107	NC_015657	AT	3	6	5240	5245	50 %	50 %	0 %	0 %	336176138

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.