MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 64502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013410	CAC	2	6	657095	657100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414976
11002	NC_013410	CCAC	2	8	657121	657128	25 %	0 %	0 %	75 %	261414976
11003	NC_013410	TCG	2	6	657134	657139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414976
11004	NC_013410	CTT	2	6	657152	657157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414976
11005	NC_013410	CGT	3	9	657180	657188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414976
11006	NC_013410	GT	3	6	657198	657203	0 %	50 %	50 %	0 %	261414976
11007	NC_013410	GCG	2	6	657258	657263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414976
11008	NC_013410	CGG	2	6	657277	657282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414976
11009	NC_013410	CAA	2	6	657293	657298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414976
11010	NC_013410	AGT	2	6	657404	657409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414976
11011	NC_013410	CAC	2	6	657444	657449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414976
11012	NC_013410	GGC	2	6	657518	657523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414976
11013	NC_013410	TC	3	6	657557	657562	0 %	50 %	0 %	50 %	261414977
11014	NC_013410	AAT	2	6	657572	657577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261414977
11015	NC_013410	GGC	2	6	657620	657625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414977
11016	NC_013410	TCA	3	9	657696	657704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414977
11017	NC_013410	GTT	2	6	657932	657937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414977
11018	NC_013410	TTC	2	6	658013	658018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414977
11019	NC_013410	CAG	2	6	658036	658041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414977
11020	NC_013410	CGA	2	6	658057	658062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414977
11021	NC_013410	CAG	2	6	658114	658119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414977
11022	NC_013410	GCC	2	6	658322	658327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414977
11023	NC_013410	CTT	2	6	658355	658360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414977
11024	NC_013410	ACA	2	6	658362	658367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414977
11025	NC_013410	TTC	2	6	658490	658495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414977
11026	NC_013410	TCT	2	6	658540	658545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414977
11027	NC_013410	CCA	2	6	658584	658589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414977
11028	NC_013410	CAAA	2	8	658599	658606	75 %	0 %	0 %	25 %	261414977
11029	NC_013410	CTT	2	6	658631	658636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414978
11030	NC_013410	GTT	2	6	658678	658683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414978
11031	NC_013410	TCG	2	6	658713	658718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414978
11032	NC_013410	AT	3	6	658725	658730	50 %	50 %	0 %	0 %	261414978
11033	NC_013410	CAA	2	6	658732	658737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414978
11034	NC_013410	CGT	2	6	658807	658812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414978
11035	NC_013410	CACGCA	2	12	658825	658836	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	261414978
11036	NC_013410	CGT	2	6	658903	658908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414978
11037	NC_013410	TTC	2	6	658990	658995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414978
11038	NC_013410	CCA	2	6	659084	659089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414978
11039	NC_013410	CAT	2	6	659145	659150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414978
11040	NC_013410	GCAAA	2	10	659191	659200	60 %	0 %	20 %	20 %	261414978
11041	NC_013410	GCAA	2	8	659207	659214	50 %	0 %	25 %	25 %	261414978
11042	NC_013410	CAA	2	6	659284	659289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414978
11043	NC_013410	GAG	2	6	659302	659307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414978
11044	NC_013410	AGT	2	6	659313	659318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414978
11045	NC_013410	AGCA	2	8	659329	659336	50 %	0 %	25 %	25 %	261414978
11046	NC_013410	CCG	2	6	659361	659366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414978
11047	NC_013410	CAG	2	6	659432	659437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414978
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11050	NC_013410	TTC	2	6	659672	659677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414978
11051	NC_013410	AAAAGC	2	12	659747	659758	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261414978
11052	NC_013410	ACCTT	2	10	659803	659812	20 %	40 %	0 %	40 %	261414979
11053	NC_013410	GGA	2	6	659837	659842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414979
11054	NC_013410	ACC	2	6	659851	659856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414979
11055	NC_013410	CGA	2	6	659909	659914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414979
11056	NC_013410	TTC	2	6	659965	659970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414979
11057	NC_013410	CTT	2	6	660000	660005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414979
11058	NC_013410	GAG	2	6	660024	660029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414979
11059	NC_013410	TCG	2	6	660173	660178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414979
11060	NC_013410	T	6	6	660566	660571	0 %	100 %	0 %	0 %	261414979
11061	NC_013410	GCGG	2	8	660665	660672	0 %	0 %	75 %	25 %	261414979
11062	NC_013410	ACA	2	6	660703	660708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414979
11063	NC_013410	GTT	2	6	660762	660767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414979
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11065	NC_013410	TAC	2	6	660848	660853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414979
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11067	NC_013410	AG	3	6	660911	660916	50 %	0 %	50 %	0 %	261414979
11068	NC_013410	TCG	2	6	660920	660925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414979
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11086	NC_013410	CATC	2	8	662004	662011	25 %	25 %	0 %	50 %	261414980
11087	NC_013410	TGG	2	6	662090	662095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261414980
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11089	NC_013410	ATGGC	2	10	662321	662330	20 %	20 %	40 %	20 %	261414980
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11098	NC_013410	GTA	2	6	663003	663008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414981
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11102	NC_013410	CAC	2	6	663264	663269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414981
11103	NC_013410	CTT	2	6	663342	663347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414981
11104	NC_013410	GAC	2	6	663348	663353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414981
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11108	NC_013410	CT	3	6	663563	663568	0 %	50 %	0 %	50 %	261414981
11109	NC_013410	TCGCT	2	10	663662	663671	0 %	40 %	20 %	40 %	261414981
11110	NC_013410	TTCA	2	8	663744	663751	25 %	50 %	0 %	25 %	261414981
11111	NC_013410	GCA	2	6	663793	663798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414981
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11113	NC_013410	GGCACT	2	12	663954	663965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261414981
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11117	NC_013410	CCATGC	2	12	664169	664180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261414981
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11119	NC_013410	ATT	2	6	664260	664265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414981
11120	NC_013410	ATA	2	6	664312	664317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261414981
11121	NC_013410	TTG	2	6	664586	664591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414982
11122	NC_013410	T	6	6	664767	664772	0 %	100 %	0 %	0 %	261414982
11123	NC_013410	TTC	2	6	664891	664896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414983
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11132	NC_013410	ATC	2	6	665304	665309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414983
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11147	NC_013410	CTG	2	6	666676	666681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414985
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11149	NC_013410	CTG	2	6	666943	666948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414985
11150	NC_013410	GAA	2	6	666950	666955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414985
11151	NC_013410	TTG	2	6	667008	667013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414985
11152	NC_013410	GAC	2	6	667025	667030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414985
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11160	NC_013410	A	6	6	667446	667451	100 %	0 %	0 %	0 %	261414985
11161	NC_013410	AGCA	2	8	667487	667494	50 %	0 %	25 %	25 %	261414985
11162	NC_013410	GAA	2	6	667508	667513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414985
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11213	NC_013410	GCG	2	6	671511	671516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414988
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11224	NC_013410	TCTTTT	2	12	672353	672364	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	261414989
11225	NC_013410	AGCGT	2	10	672389	672398	20 %	20 %	40 %	20 %	261414989
11226	NC_013410	GCTT	2	8	672412	672419	0 %	50 %	25 %	25 %	261414989
11227	NC_013410	AGT	2	6	672429	672434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414989
11228	NC_013410	ATCTT	2	10	672514	672523	20 %	60 %	0 %	20 %	261414989
11229	NC_013410	AGGT	2	8	672551	672558	25 %	25 %	50 %	0 %	261414989
11230	NC_013410	ATC	2	6	672567	672572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414989
11231	NC_013410	TC	3	6	672571	672576	0 %	50 %	0 %	50 %	261414989
11232	NC_013410	ACGTT	2	10	672620	672629	20 %	40 %	20 %	20 %	261414989
11233	NC_013410	ATTAT	2	10	672808	672817	40 %	60 %	0 %	0 %	261414989
11234	NC_013410	CAAGAG	2	12	672831	672842	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	261414989
11235	NC_013410	GTA	2	6	672879	672884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414989
11236	NC_013410	GTCTTC	2	12	672975	672986	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261414989
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11240	NC_013410	TTC	2	6	673257	673262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414989
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11358	NC_013410	TTC	2	6	680664	680669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414991
11359	NC_013410	GAA	2	6	680690	680695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414991
11360	NC_013410	TCA	2	6	680810	680815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414991
11361	NC_013410	ATC	2	6	680944	680949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414991
11362	NC_013410	CGC	2	6	681050	681055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414991
11363	NC_013410	TCATAA	2	12	681190	681201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261414991
11364	NC_013410	A	6	6	681200	681205	100 %	0 %	0 %	0 %	261414991
11365	NC_013410	CCGAG	2	10	681216	681225	20 %	0 %	40 %	40 %	261414991
11366	NC_013410	TCCCA	2	10	681239	681248	20 %	20 %	0 %	60 %	261414991
11367	NC_013410	AAACGA	2	12	681255	681266	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261414991
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11370	NC_013410	GGT	3	9	681728	681736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261414992
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11373	NC_013410	CAA	2	6	681952	681957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414992
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11376	NC_013410	GTC	2	6	682070	682075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414992
11377	NC_013410	GGC	2	6	682079	682084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414992
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11379	NC_013410	ATC	2	6	682124	682129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414992
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11382	NC_013410	TGA	2	6	682242	682247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414992
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11385	NC_013410	CTC	2	6	682322	682327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261414992
11386	NC_013410	TCG	2	6	682356	682361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414992
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11389	NC_013410	CGT	2	6	682420	682425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414992
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11480	NC_013410	T	8	8	689739	689746	0 %	100 %	0 %	0 %	261415000
11481	NC_013410	ACAT	2	8	689776	689783	50 %	25 %	0 %	25 %	261415000
11482	NC_013410	CAA	2	6	689795	689800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261415000
11483	NC_013410	T	7	7	689819	689825	0 %	100 %	0 %	0 %	261415000
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