MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 64502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013410	CCG	2	6	29449	29454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414440
502	NC_013410	A	6	6	29506	29511	100 %	0 %	0 %	0 %	261414440
503	NC_013410	TCGC	2	8	29581	29588	0 %	25 %	25 %	50 %	261414440
504	NC_013410	GAAGCT	2	12	29640	29651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261414440
505	NC_013410	GCA	2	6	29652	29657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414440
506	NC_013410	ATG	2	6	29778	29783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414440
507	NC_013410	AAGT	2	8	29868	29875	50 %	25 %	25 %	0 %	261414440
508	NC_013410	GAC	2	6	30000	30005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414441
509	NC_013410	TCG	2	6	30022	30027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414441
510	NC_013410	GCA	2	6	30276	30281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414441
511	NC_013410	CAG	2	6	30292	30297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414441
512	NC_013410	CCA	2	6	30304	30309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414441
513	NC_013410	GCG	2	6	30316	30321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414441
514	NC_013410	TTC	2	6	30347	30352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414441
515	NC_013410	ATC	2	6	30372	30377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414441
516	NC_013410	ACG	2	6	30481	30486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414441
517	NC_013410	AGT	2	6	30493	30498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414441
518	NC_013410	TAA	2	6	30594	30599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261414441
519	NC_013410	CCT	2	6	30664	30669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261414442
520	NC_013410	GGC	2	6	30681	30686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414442
521	NC_013410	CTTT	2	8	30697	30704	0 %	75 %	0 %	25 %	261414442
522	NC_013410	A	6	6	30740	30745	100 %	0 %	0 %	0 %	261414442
523	NC_013410	ATC	2	6	30768	30773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414442
524	NC_013410	ATC	2	6	30792	30797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414442
525	NC_013410	CATTT	2	10	30819	30828	20 %	60 %	0 %	20 %	261414442
526	NC_013410	CAA	2	6	30842	30847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414442
527	NC_013410	TTC	2	6	30864	30869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414442
528	NC_013410	TCA	2	6	30874	30879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414442
529	NC_013410	CAAG	2	8	30922	30929	50 %	0 %	25 %	25 %	261414442
530	NC_013410	GCC	2	6	30938	30943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414442
531	NC_013410	AAC	2	6	30946	30951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414442
532	NC_013410	GTT	2	6	31134	31139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414442
533	NC_013410	TCTT	2	8	31153	31160	0 %	75 %	0 %	25 %	261414442
534	NC_013410	AAGCA	2	10	31173	31182	60 %	0 %	20 %	20 %	261414442
535	NC_013410	CATC	2	8	31190	31197	25 %	25 %	0 %	50 %	261414442
536	NC_013410	TTC	2	6	31206	31211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414442
537	NC_013410	CAA	2	6	31214	31219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414442
538	NC_013410	CAAC	2	8	31285	31292	50 %	0 %	0 %	50 %	261414442
539	NC_013410	CGAT	2	8	31300	31307	25 %	25 %	25 %	25 %	261414442
540	NC_013410	A	6	6	31314	31319	100 %	0 %	0 %	0 %	261414442
541	NC_013410	GAG	2	6	31360	31365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414442
542	NC_013410	ATT	2	6	31389	31394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414442
543	NC_013410	TCA	2	6	31476	31481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414443
544	NC_013410	TATAT	2	10	31544	31553	40 %	60 %	0 %	0 %	261414443
545	NC_013410	ATG	2	6	31573	31578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414443
546	NC_013410	ATG	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414443
547	NC_013410	ATG	2	6	31861	31866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414443
548	NC_013410	T	7	7	32197	32203	0 %	100 %	0 %	0 %	261414443
549	NC_013410	ATC	2	6	32231	32236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414443
550	NC_013410	CAA	2	6	32292	32297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414443
551	NC_013410	AT	3	6	32428	32433	50 %	50 %	0 %	0 %	261414443
552	NC_013410	AT	3	6	32587	32592	50 %	50 %	0 %	0 %	261414443
553	NC_013410	CTT	2	6	32677	32682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414443
554	NC_013410	GAT	2	6	32696	32701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414443
555	NC_013410	AGC	2	6	32741	32746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414443
556	NC_013410	CAT	2	6	32747	32752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414443
557	NC_013410	ACG	2	6	32949	32954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414444
558	NC_013410	TCG	2	6	32958	32963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414444
559	NC_013410	GAT	2	6	32972	32977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414444
560	NC_013410	ATTTT	2	10	33000	33009	20 %	80 %	0 %	0 %	261414444
561	NC_013410	TC	3	6	33206	33211	0 %	50 %	0 %	50 %	261414444
562	NC_013410	ATT	2	6	33345	33350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414444
563	NC_013410	CATT	2	8	33367	33374	25 %	50 %	0 %	25 %	261414444
564	NC_013410	TCTT	2	8	33379	33386	0 %	75 %	0 %	25 %	261414444
565	NC_013410	AGG	2	6	33454	33459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414444
566	NC_013410	TTGTAC	2	12	33498	33509	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261414444
567	NC_013410	AT	3	6	33619	33624	50 %	50 %	0 %	0 %	261414444
568	NC_013410	T	6	6	33634	33639	0 %	100 %	0 %	0 %	261414444
569	NC_013410	T	6	6	33669	33674	0 %	100 %	0 %	0 %	261414444
570	NC_013410	GAA	2	6	33761	33766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414444
571	NC_013410	CAAT	2	8	33859	33866	50 %	25 %	0 %	25 %	261414444
572	NC_013410	TCA	2	6	33902	33907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414444
573	NC_013410	CAA	2	6	33937	33942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414444
574	NC_013410	T	7	7	34043	34049	0 %	100 %	0 %	0 %	261414444
575	NC_013410	CAA	2	6	34165	34170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414444
576	NC_013410	CAAAGA	2	12	34323	34334	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261414445
577	NC_013410	TCCGCA	2	12	34369	34380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261414445
578	NC_013410	TCA	2	6	34394	34399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414445
579	NC_013410	TCA	2	6	34406	34411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414445
580	NC_013410	A	6	6	34489	34494	100 %	0 %	0 %	0 %	261414445
581	NC_013410	AGA	2	6	34539	34544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414445
582	NC_013410	CAAC	2	8	34645	34652	50 %	0 %	0 %	50 %	261414446
583	NC_013410	CGA	2	6	34736	34741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414446
584	NC_013410	TTCT	2	8	34794	34801	0 %	75 %	0 %	25 %	261414446
585	NC_013410	CTT	2	6	34891	34896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414447
586	NC_013410	CTT	2	6	34913	34918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414447
587	NC_013410	GCG	2	6	34928	34933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414447
588	NC_013410	GCA	2	6	34971	34976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414447
589	NC_013410	GAGC	2	8	35059	35066	25 %	0 %	50 %	25 %	261414447
590	NC_013410	CGA	2	6	35070	35075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414447
591	NC_013410	CAG	2	6	35095	35100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414447
592	NC_013410	GCA	3	9	35127	35135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414447
593	NC_013410	GCG	2	6	35177	35182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414447
594	NC_013410	CGCGG	2	10	35185	35194	0 %	0 %	60 %	40 %	261414447
595	NC_013410	TGT	3	9	35211	35219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414447
596	NC_013410	TGAGCC	2	12	35247	35258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261414447
597	NC_013410	TGC	2	6	35259	35264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414447
598	NC_013410	TTA	2	6	35280	35285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414447
599	NC_013410	TTG	2	6	35286	35291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414447
600	NC_013410	TTG	2	6	35325	35330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414447
601	NC_013410	CCA	2	6	35331	35336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414447
602	NC_013410	CTT	2	6	35405	35410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414447
603	NC_013410	TTA	2	6	35442	35447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414447
604	NC_013410	GAG	2	6	35483	35488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414447
605	NC_013410	ATT	2	6	35505	35510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414447
606	NC_013410	TTG	2	6	35849	35854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414448
607	NC_013410	TTC	2	6	35917	35922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414448
608	NC_013410	CCT	2	6	35949	35954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261414448
609	NC_013410	AGC	2	6	35961	35966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414448
610	NC_013410	GAC	2	6	35999	36004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414448
611	NC_013410	CTA	2	6	36262	36267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414449
612	NC_013410	GCG	2	6	36285	36290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414449
613	NC_013410	CTT	2	6	36440	36445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414450
614	NC_013410	CG	3	6	36459	36464	0 %	0 %	50 %	50 %	261414450
615	NC_013410	CAA	2	6	36484	36489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414450
616	NC_013410	ACGC	2	8	36528	36535	25 %	0 %	25 %	50 %	261414450
617	NC_013410	TCA	2	6	36702	36707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414450
618	NC_013410	TCA	2	6	36732	36737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414450
619	NC_013410	TTCA	2	8	36911	36918	25 %	50 %	0 %	25 %	261414450
620	NC_013410	CGG	2	6	36970	36975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414450
621	NC_013410	GCC	2	6	37011	37016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414450
622	NC_013410	TG	3	6	37092	37097	0 %	50 %	50 %	0 %	261414450
623	NC_013410	GAA	2	6	37112	37117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414450
624	NC_013410	GCC	2	6	37181	37186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414450
625	NC_013410	GCC	2	6	37268	37273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414450
626	NC_013410	ACC	2	6	37353	37358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414450
627	NC_013410	TCG	2	6	37365	37370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414450
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742	NC_013410	CTT	2	6	43435	43440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414456
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746	NC_013410	GA	3	6	43565	43570	50 %	0 %	50 %	0 %	261414456
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754	NC_013410	CGT	2	6	43977	43982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414457
755	NC_013410	GA	3	6	44083	44088	50 %	0 %	50 %	0 %	261414457
756	NC_013410	CGAC	2	8	44261	44268	25 %	0 %	25 %	50 %	261414457
757	NC_013410	CTT	2	6	44290	44295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414457
758	NC_013410	CGA	2	6	44354	44359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414457
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760	NC_013410	AGGA	2	8	44425	44432	50 %	0 %	50 %	0 %	261414457
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763	NC_013410	CGA	2	6	44823	44828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414458
764	NC_013410	GGT	2	6	44910	44915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261414458
765	NC_013410	CGG	2	6	45149	45154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414458
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770	NC_013410	CG	3	6	45372	45377	0 %	0 %	50 %	50 %	261414458
771	NC_013410	GGC	2	6	45444	45449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414458
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777	NC_013410	TCA	2	6	45874	45879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414459
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780	NC_013410	TCA	2	6	46041	46046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414459
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783	NC_013410	ATCA	2	8	46224	46231	50 %	25 %	0 %	25 %	261414460
784	NC_013410	CATT	2	8	46327	46334	25 %	50 %	0 %	25 %	261414460
785	NC_013410	GAG	2	6	46404	46409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414460
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789	NC_013410	CCA	2	6	46666	46671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414460
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792	NC_013410	AAGGC	2	10	46817	46826	40 %	0 %	40 %	20 %	261414461
793	NC_013410	A	6	6	46840	46845	100 %	0 %	0 %	0 %	261414461
794	NC_013410	AAG	2	6	46924	46929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414461
795	NC_013410	AAAT	2	8	46988	46995	75 %	25 %	0 %	0 %	261414461
796	NC_013410	ACA	2	6	47016	47021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414461
797	NC_013410	GCA	2	6	47066	47071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414461
798	NC_013410	GCTT	2	8	47098	47105	0 %	50 %	25 %	25 %	261414461
799	NC_013410	ACA	2	6	47114	47119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414461
800	NC_013410	TAGC	2	8	47123	47130	25 %	25 %	25 %	25 %	261414461
801	NC_013410	AT	3	6	47142	47147	50 %	50 %	0 %	0 %	261414461
802	NC_013410	ACA	2	6	47189	47194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414461
803	NC_013410	CAG	2	6	47278	47283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414462
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815	NC_013410	GA	3	6	48108	48113	50 %	0 %	50 %	0 %	261414462
816	NC_013410	TC	3	6	48130	48135	0 %	50 %	0 %	50 %	261414462
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820	NC_013410	TTC	2	6	48227	48232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414462
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822	NC_013410	CGG	2	6	48357	48362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414462
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825	NC_013410	CTT	2	6	48485	48490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414463
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833	NC_013410	TGA	2	6	49173	49178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414464
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851	NC_013410	A	7	7	50550	50556	100 %	0 %	0 %	0 %	261414465
852	NC_013410	ATGT	2	8	50611	50618	25 %	50 %	25 %	0 %	261414465
853	NC_013410	GGTTTC	2	12	50629	50640	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	261414465
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858	NC_013410	ACA	2	6	51163	51168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414465
859	NC_013410	ATCGC	2	10	51226	51235	20 %	20 %	20 %	40 %	261414465
860	NC_013410	TTC	2	6	51256	51261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414465
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864	NC_013410	ATC	2	6	51757	51762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414466
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866	NC_013410	TTC	2	6	51816	51821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414466
867	NC_013410	CTG	2	6	51861	51866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414466
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871	NC_013410	TGC	2	6	52178	52183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414466
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873	NC_013410	ACC	2	6	52488	52493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414466
874	NC_013410	ATG	2	6	52674	52679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414467
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876	NC_013410	ACA	2	6	52731	52736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414467
877	NC_013410	GCC	2	6	52850	52855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414467
878	NC_013410	AAG	2	6	52862	52867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414467
879	NC_013410	CGA	2	6	53125	53130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414467
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