MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 64502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013410	GCC	2	6	539616	539621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414879
9002	NC_013410	ATTG	2	8	539646	539653	25 %	50 %	25 %	0 %	261414879
9003	NC_013410	AGA	2	6	539858	539863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9004	NC_013410	GAAA	2	8	539867	539874	75 %	0 %	25 %	0 %	261414880
9005	NC_013410	GAA	2	6	539955	539960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9006	NC_013410	ATCC	2	8	540017	540024	25 %	25 %	0 %	50 %	261414880
9007	NC_013410	GCC	2	6	540036	540041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414880
9008	NC_013410	AAG	2	6	540184	540189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9009	NC_013410	TGG	2	6	540239	540244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261414880
9010	NC_013410	GCC	2	6	540310	540315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414880
9011	NC_013410	CGA	2	6	540383	540388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414880
9012	NC_013410	AGA	2	6	540421	540426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9013	NC_013410	AAC	2	6	540564	540569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414880
9014	NC_013410	CTA	2	6	540581	540586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414880
9015	NC_013410	TAC	2	6	540636	540641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414880
9016	NC_013410	AAG	2	6	540792	540797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9017	NC_013410	GCC	2	6	540825	540830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414880
9018	NC_013410	ACC	2	6	540874	540879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414880
9019	NC_013410	CCG	2	6	540880	540885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414880
9020	NC_013410	TCA	2	6	540955	540960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414880
9021	NC_013410	GAA	2	6	540969	540974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9022	NC_013410	TCA	2	6	541015	541020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414880
9023	NC_013410	GAA	2	6	541041	541046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9024	NC_013410	GAA	2	6	541052	541057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9025	NC_013410	GTGA	2	8	541059	541066	25 %	25 %	50 %	0 %	261414880
9026	NC_013410	GAA	2	6	541086	541091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414880
9027	NC_013410	CGG	2	6	541106	541111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414880
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9029	NC_013410	CGA	2	6	541178	541183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414880
9030	NC_013410	GGA	2	6	541222	541227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261414880
9031	NC_013410	CG	3	6	541499	541504	0 %	0 %	50 %	50 %	261414881
9032	NC_013410	GCATCA	2	12	541626	541637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261414881
9033	NC_013410	CAC	2	6	541711	541716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414881
9034	NC_013410	TCG	2	6	541791	541796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414881
9035	NC_013410	GAA	2	6	541817	541822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414881
9036	NC_013410	CGA	2	6	541891	541896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414881
9037	NC_013410	ACT	2	6	541920	541925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414881
9038	NC_013410	GAA	2	6	541955	541960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414881
9039	NC_013410	GTCG	2	8	542045	542052	0 %	25 %	50 %	25 %	261414881
9040	NC_013410	CT	3	6	542069	542074	0 %	50 %	0 %	50 %	261414881
9041	NC_013410	TC	3	6	542105	542110	0 %	50 %	0 %	50 %	261414881
9042	NC_013410	AC	3	6	542125	542130	50 %	0 %	0 %	50 %	261414881
9043	NC_013410	CGT	2	6	542131	542136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414881
9044	NC_013410	TAGA	2	8	542173	542180	50 %	25 %	25 %	0 %	261414881
9045	NC_013410	A	6	6	542328	542333	100 %	0 %	0 %	0 %	261414882
9046	NC_013410	AAT	2	6	542335	542340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261414882
9047	NC_013410	TTG	2	6	542342	542347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414882
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9049	NC_013410	CT	3	6	542378	542383	0 %	50 %	0 %	50 %	261414882
9050	NC_013410	TAC	2	6	542455	542460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414882
9051	NC_013410	A	7	7	542480	542486	100 %	0 %	0 %	0 %	261414882
9052	NC_013410	TAC	2	6	542500	542505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414882
9053	NC_013410	GAA	2	6	542554	542559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414882
9054	NC_013410	A	6	6	542567	542572	100 %	0 %	0 %	0 %	261414882
9055	NC_013410	ACA	2	6	542606	542611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414882
9056	NC_013410	AAC	2	6	542662	542667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414882
9057	NC_013410	CGTT	2	8	542673	542680	0 %	50 %	25 %	25 %	261414882
9058	NC_013410	ATG	2	6	542701	542706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414882
9059	NC_013410	AGA	2	6	542730	542735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414882
9060	NC_013410	GGT	2	6	542833	542838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261414882
9061	NC_013410	GAC	2	6	542839	542844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414882
9062	NC_013410	ATG	2	6	542875	542880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414882
9063	NC_013410	CTC	2	6	542884	542889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261414882
9064	NC_013410	GAA	2	6	542946	542951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414882
9065	NC_013410	TCA	2	6	542999	543004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414882
9066	NC_013410	AAC	2	6	543028	543033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414882
9067	NC_013410	TCGC	2	8	543077	543084	0 %	25 %	25 %	50 %	261414882
9068	NC_013410	CG	3	6	543131	543136	0 %	0 %	50 %	50 %	261414882
9069	NC_013410	TCC	2	6	543151	543156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261414882
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9072	NC_013410	TGCGC	2	10	543257	543266	0 %	20 %	40 %	40 %	261414882
9073	NC_013410	AAG	2	6	543317	543322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414882
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9079	NC_013410	GAAGCC	2	12	543606	543617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414882
9080	NC_013410	AACG	2	8	543735	543742	50 %	0 %	25 %	25 %	261414882
9081	NC_013410	AAC	2	6	543766	543771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414882
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9087	NC_013410	TTC	2	6	544185	544190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414883
9088	NC_013410	TCA	2	6	544204	544209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414883
9089	NC_013410	GC	3	6	544309	544314	0 %	0 %	50 %	50 %	261414883
9090	NC_013410	ATTG	2	8	544346	544353	25 %	50 %	25 %	0 %	261414883
9091	NC_013410	GAT	2	6	544382	544387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414883
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9093	NC_013410	ACC	2	6	544417	544422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261414883
9094	NC_013410	CTT	2	6	544454	544459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414883
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9100	NC_013410	ATT	2	6	544763	544768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261414884
9101	NC_013410	A	6	6	544825	544830	100 %	0 %	0 %	0 %	261414885
9102	NC_013410	GTC	2	6	544867	544872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414885
9103	NC_013410	CTC	2	6	544903	544908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261414885
9104	NC_013410	GCC	2	6	544957	544962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414885
9105	NC_013410	ATCC	2	8	544992	544999	25 %	25 %	0 %	50 %	261414885
9106	NC_013410	GCA	2	6	545152	545157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414885
9107	NC_013410	GTC	2	6	545200	545205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414885
9108	NC_013410	GCA	2	6	545221	545226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414885
9109	NC_013410	CGA	2	6	545264	545269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414885
9110	NC_013410	TCG	2	6	545414	545419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414885
9111	NC_013410	GCC	2	6	545455	545460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414885
9112	NC_013410	GAA	2	6	545476	545481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414885
9113	NC_013410	GAACGC	2	12	545848	545859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414886
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9115	NC_013410	TC	3	6	545983	545988	0 %	50 %	0 %	50 %	261414886
9116	NC_013410	CCAGTC	2	12	546036	546047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261414886
9117	NC_013410	CG	3	6	546086	546091	0 %	0 %	50 %	50 %	261414886
9118	NC_013410	TCCGC	2	10	546129	546138	0 %	20 %	20 %	60 %	261414886
9119	NC_013410	TAC	2	6	546250	546255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414886
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9121	NC_013410	TCG	2	6	546308	546313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414886
9122	NC_013410	CTG	2	6	546348	546353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414886
9123	NC_013410	CGA	2	6	546366	546371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261414886
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9147	NC_013410	CGT	2	6	547591	547596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414886
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9150	NC_013410	GAA	2	6	547765	547770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414886
9151	NC_013410	TCA	2	6	547772	547777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414886
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9153	NC_013410	GCTTC	2	10	548124	548133	0 %	40 %	20 %	40 %	261414887
9154	NC_013410	TTG	2	6	548231	548236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414887
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9156	NC_013410	GCGA	2	8	548278	548285	25 %	0 %	50 %	25 %	261414887
9157	NC_013410	ATG	2	6	548303	548308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414887
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9232	NC_013410	GA	3	6	553307	553312	50 %	0 %	50 %	0 %	261414890
9233	NC_013410	A	6	6	553322	553327	100 %	0 %	0 %	0 %	261414890
9234	NC_013410	GACG	2	8	553375	553382	25 %	0 %	50 %	25 %	261414890
9235	NC_013410	CGT	2	6	553549	553554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414891
9236	NC_013410	ATC	2	6	553619	553624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261414891
9237	NC_013410	CGGA	2	8	553629	553636	25 %	0 %	50 %	25 %	261414891
9238	NC_013410	ATCGAC	2	12	553720	553731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261414891
9239	NC_013410	GCT	2	6	553750	553755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414891
9240	NC_013410	GA	3	6	553822	553827	50 %	0 %	50 %	0 %	261414891
9241	NC_013410	TGA	2	6	553845	553850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261414891
9242	NC_013410	CAA	2	6	553956	553961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261414891
9243	NC_013410	GA	3	6	554047	554052	50 %	0 %	50 %	0 %	261414891
9244	NC_013410	GTT	2	6	554115	554120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261414891
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9247	NC_013410	CGC	2	6	554263	554268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261414891
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9351	NC_013410	GCT	2	6	560029	560034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261414895
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9359	NC_013410	AACG	2	8	560430	560437	50 %	0 %	25 %	25 %	261414896
9360	NC_013410	GCG	2	6	560514	560519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414896
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9484	NC_013410	CGG	2	6	568242	568247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414904
9485	NC_013410	GCAG	2	8	568291	568298	25 %	0 %	50 %	25 %	261414904
9486	NC_013410	AAGG	2	8	568312	568319	50 %	0 %	50 %	0 %	261414904
9487	NC_013410	A	6	6	568402	568407	100 %	0 %	0 %	0 %	261414904
9488	NC_013410	GAA	2	6	568507	568512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261414904
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9490	NC_013410	TCT	2	6	568547	568552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261414904
9491	NC_013410	CAGC	2	8	568653	568660	25 %	0 %	25 %	50 %	261414904
9492	NC_013410	CGG	2	6	568683	568688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261414904
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