MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 64502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_013410	ATCAAG	2	12	3257004	3257015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261417004
54502	NC_013410	ATT	2	6	3257056	3257061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417004
54503	NC_013410	CGA	3	9	3257089	3257097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417004
54504	NC_013410	ACT	2	6	3257098	3257103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417004
54505	NC_013410	TCA	2	6	3257146	3257151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417004
54506	NC_013410	GGC	2	6	3257244	3257249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417004
54507	NC_013410	CCG	2	6	3257258	3257263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417004
54508	NC_013410	CAA	2	6	3257345	3257350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417004
54509	NC_013410	GTG	2	6	3257427	3257432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417004
54510	NC_013410	TTA	2	6	3257498	3257503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417004
54511	NC_013410	CTA	2	6	3257531	3257536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417004
54512	NC_013410	GCCC	2	8	3257539	3257546	0 %	0 %	25 %	75 %	261417004
54513	NC_013410	GTT	2	6	3257552	3257557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417004
54514	NC_013410	AAG	2	6	3257616	3257621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417004
54515	NC_013410	CTT	2	6	3257627	3257632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417004
54516	NC_013410	GAAG	2	8	3257681	3257688	50 %	0 %	50 %	0 %	261417004
54517	NC_013410	TCA	2	6	3257701	3257706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417004
54518	NC_013410	CCG	2	6	3257775	3257780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417004
54519	NC_013410	TGG	2	6	3257795	3257800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417004
54520	NC_013410	ACG	2	6	3257802	3257807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417004
54521	NC_013410	GC	3	6	3257814	3257819	0 %	0 %	50 %	50 %	261417004
54522	NC_013410	GTT	2	6	3257925	3257930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417004
54523	NC_013410	CGT	2	6	3257934	3257939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417004
54524	NC_013410	CGTTC	2	10	3257964	3257973	0 %	40 %	20 %	40 %	261417004
54525	NC_013410	TAC	2	6	3258005	3258010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417004
54526	NC_013410	AAT	2	6	3258028	3258033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261417004
54527	NC_013410	CTG	2	6	3258120	3258125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417005
54528	NC_013410	GTG	2	6	3258182	3258187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417005
54529	NC_013410	AAT	2	6	3258224	3258229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261417005
54530	NC_013410	TTA	2	6	3258352	3258357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417005
54531	NC_013410	GGAC	2	8	3258471	3258478	25 %	0 %	50 %	25 %	261417005
54532	NC_013410	TCGT	2	8	3258537	3258544	0 %	50 %	25 %	25 %	261417005
54533	NC_013410	ATT	2	6	3258558	3258563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417005
54534	NC_013410	GTTC	2	8	3258576	3258583	0 %	50 %	25 %	25 %	261417005
54535	NC_013410	ACA	2	6	3258639	3258644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417005
54536	NC_013410	CGC	2	6	3258665	3258670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417005
54537	NC_013410	GGT	2	6	3258686	3258691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417005
54538	NC_013410	GAA	2	6	3258695	3258700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417005
54539	NC_013410	CTG	2	6	3258757	3258762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417005
54540	NC_013410	CAG	2	6	3258764	3258769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417005
54541	NC_013410	CG	3	6	3258845	3258850	0 %	0 %	50 %	50 %	261417005
54542	NC_013410	TGG	2	6	3258868	3258873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417005
54543	NC_013410	GCG	3	9	3258918	3258926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417005
54544	NC_013410	TCATAT	2	12	3258997	3259008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261417005
54545	NC_013410	TGT	2	6	3259015	3259020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417005
54546	NC_013410	GCA	2	6	3259137	3259142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417005
54547	NC_013410	CGG	2	6	3259182	3259187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417005
54548	NC_013410	CAT	2	6	3259213	3259218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417005
54549	NC_013410	GGC	2	6	3259259	3259264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417005
54550	NC_013410	CCG	2	6	3259322	3259327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417005
54551	NC_013410	TGA	2	6	3259365	3259370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417005
54552	NC_013410	TTC	2	6	3259430	3259435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417005
54553	NC_013410	CTT	2	6	3259456	3259461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417005
54554	NC_013410	GGC	2	6	3259553	3259558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417005
54555	NC_013410	GTT	2	6	3259577	3259582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417005
54556	NC_013410	CAG	2	6	3259858	3259863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417005
54557	NC_013410	ACT	2	6	3259953	3259958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417005
54558	NC_013410	TCA	2	6	3260011	3260016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417005
54559	NC_013410	A	7	7	3260057	3260063	100 %	0 %	0 %	0 %	261417005
54560	NC_013410	TAA	2	6	3260086	3260091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261417005
54561	NC_013410	AGTGA	2	10	3260119	3260128	40 %	20 %	40 %	0 %	261417005
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54564	NC_013410	GGGC	2	8	3260312	3260319	0 %	0 %	75 %	25 %	261417006
54565	NC_013410	CGG	2	6	3260511	3260516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417006
54566	NC_013410	TCG	2	6	3260560	3260565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417006
54567	NC_013410	GGAC	2	8	3260621	3260628	25 %	0 %	50 %	25 %	261417006
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54570	NC_013410	TGC	2	6	3260893	3260898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417006
54571	NC_013410	A	6	6	3260899	3260904	100 %	0 %	0 %	0 %	261417006
54572	NC_013410	AAC	2	6	3260920	3260925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417006
54573	NC_013410	GGC	2	6	3260965	3260970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417006
54574	NC_013410	CT	3	6	3260993	3260998	0 %	50 %	0 %	50 %	261417006
54575	NC_013410	GGT	2	6	3261007	3261012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417006
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54582	NC_013410	GA	3	6	3261471	3261476	50 %	0 %	50 %	0 %	261417006
54583	NC_013410	CAT	2	6	3261591	3261596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417006
54584	NC_013410	TTG	2	6	3261719	3261724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417006
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54587	NC_013410	A	6	6	3261790	3261795	100 %	0 %	0 %	0 %	261417006
54588	NC_013410	CGG	2	6	3261905	3261910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417006
54589	NC_013410	TGG	2	6	3261918	3261923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417006
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54593	NC_013410	TC	3	6	3262062	3262067	0 %	50 %	0 %	50 %	261417006
54594	NC_013410	GATG	2	8	3262068	3262075	25 %	25 %	50 %	0 %	261417006
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54596	NC_013410	GAT	3	9	3262437	3262445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417007
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54598	NC_013410	TGG	2	6	3262481	3262486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261417007
54599	NC_013410	TCT	4	12	3262491	3262502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417007
54600	NC_013410	TGC	2	6	3262511	3262516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417007
54601	NC_013410	A	7	7	3262534	3262540	100 %	0 %	0 %	0 %	261417007
54602	NC_013410	TGT	2	6	3262643	3262648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417007
54603	NC_013410	CAAC	2	8	3262699	3262706	50 %	0 %	0 %	50 %	261417007
54604	NC_013410	GCT	2	6	3262707	3262712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417007
54605	NC_013410	GT	3	6	3262762	3262767	0 %	50 %	50 %	0 %	261417007
54606	NC_013410	ACA	2	6	3262894	3262899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417007
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54608	NC_013410	TGT	2	6	3263030	3263035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417007
54609	NC_013410	GAA	2	6	3263115	3263120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417007
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54611	NC_013410	CGA	2	6	3263182	3263187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417007
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54614	NC_013410	TGA	2	6	3263432	3263437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417007
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54734	NC_013410	GAA	2	6	3270240	3270245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417017
54735	NC_013410	CGG	2	6	3270248	3270253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417017
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