MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 219400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_009921	TCC	2	6	575983	575988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158312353
14003	NC_009921	GGC	2	6	575989	575994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312353
14004	NC_009921	GGGTC	2	10	576405	576414	0 %	20 %	60 %	20 %	158312354
14005	NC_009921	CTG	2	6	576422	576427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312354
14006	NC_009921	GCCGA	2	10	576446	576455	20 %	0 %	40 %	40 %	158312354
14007	NC_009921	GAC	2	6	576464	576469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312354
14008	NC_009921	CGGCGC	2	12	576496	576507	0 %	0 %	50 %	50 %	158312354
14009	NC_009921	TGG	2	6	576534	576539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312354
14010	NC_009921	CGG	2	6	576580	576585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312354
14011	NC_009921	GAG	2	6	576608	576613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158312354
14012	NC_009921	CGG	2	6	576630	576635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312354
14013	NC_009921	TGT	2	6	576706	576711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158312354
14014	NC_009921	GGT	2	6	576713	576718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312354
14015	NC_009921	GGC	2	6	576734	576739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312354
14016	NC_009921	GGAACC	2	12	576769	576780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312354
14017	NC_009921	CTG	2	6	576821	576826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312355
14018	NC_009921	GAA	2	6	576855	576860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158312355
14019	NC_009921	CAG	2	6	576879	576884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312355
14020	NC_009921	GAA	2	6	576898	576903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158312355
14021	NC_009921	GT	3	6	576962	576967	0 %	50 %	50 %	0 %	158312355
14022	NC_009921	CCGA	2	8	577022	577029	25 %	0 %	25 %	50 %	158312355
14023	NC_009921	GCG	2	6	577060	577065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312355
14024	NC_009921	GGA	2	6	577098	577103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158312355
14025	NC_009921	GCG	3	9	577165	577173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312355
14026	NC_009921	AGC	2	6	577244	577249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312355
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14028	NC_009921	CAG	2	6	577283	577288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312355
14029	NC_009921	CGC	2	6	577360	577365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312355
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14031	NC_009921	CAGC	2	8	577387	577394	25 %	0 %	25 %	50 %	158312355
14032	NC_009921	AGA	2	6	577406	577411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158312355
14033	NC_009921	ATC	2	6	577444	577449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312355
14034	NC_009921	GCC	2	6	578632	578637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312356
14035	NC_009921	GC	3	6	578676	578681	0 %	0 %	50 %	50 %	158312356
14036	NC_009921	CTCGCA	2	12	578702	578713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158312356
14037	NC_009921	CGCACC	2	12	578785	578796	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158312356
14038	NC_009921	GC	3	6	578805	578810	0 %	0 %	50 %	50 %	158312356
14039	NC_009921	GCACTT	2	12	578834	578845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158312356
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14042	NC_009921	GC	4	8	578949	578956	0 %	0 %	50 %	50 %	158312356
14043	NC_009921	GTCG	2	8	578986	578993	0 %	25 %	50 %	25 %	158312356
14044	NC_009921	GCG	2	6	578996	579001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312356
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14050	NC_009921	GCG	2	6	579206	579211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312356
14051	NC_009921	CAT	2	6	579238	579243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312356
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14053	NC_009921	CGT	2	6	579396	579401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312356
14054	NC_009921	GCC	2	6	579409	579414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312356
14055	NC_009921	GT	3	6	579460	579465	0 %	50 %	50 %	0 %	158312356
14056	NC_009921	TCG	2	6	579532	579537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312357
14057	NC_009921	GCG	2	6	579611	579616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312357
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14059	NC_009921	CCCGC	2	10	579675	579684	0 %	0 %	20 %	80 %	158312357
14060	NC_009921	CCGCCT	2	12	579723	579734	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158312357
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14084	NC_009921	ACG	2	6	581471	581476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312359
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14102	NC_009921	CGGCCG	2	12	582549	582560	0 %	0 %	50 %	50 %	158312360
14103	NC_009921	GTT	2	6	582599	582604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158312360
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14109	NC_009921	CAG	2	6	582787	582792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312360
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14111	NC_009921	TGAC	2	8	582850	582857	25 %	25 %	25 %	25 %	158312360
14112	NC_009921	TCG	2	6	582895	582900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312361
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14114	NC_009921	GCTCC	2	10	582915	582924	0 %	20 %	20 %	60 %	158312361
14115	NC_009921	CGT	2	6	582974	582979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312361
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14118	NC_009921	GCT	2	6	583025	583030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312361
14119	NC_009921	GCG	2	6	583111	583116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312361
14120	NC_009921	TTC	2	6	583119	583124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158312361
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14232	NC_009921	CG	3	6	587514	587519	0 %	0 %	50 %	50 %	158312364
14233	NC_009921	CTC	2	6	587534	587539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158312364
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14236	NC_009921	CGGA	2	8	587580	587587	25 %	0 %	50 %	25 %	158312364
14237	NC_009921	GCG	2	6	587634	587639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312364
14238	NC_009921	CGT	2	6	587752	587757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312364
14239	NC_009921	GACC	2	8	587761	587768	25 %	0 %	25 %	50 %	158312364
14240	NC_009921	CAC	2	6	587775	587780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158312364
14241	NC_009921	TCC	2	6	587790	587795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158312364
14242	NC_009921	TCA	2	6	587836	587841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312364
14243	NC_009921	AGC	2	6	588036	588041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312365
14244	NC_009921	TCA	2	6	588046	588051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312365
14245	NC_009921	GCGCG	2	10	588134	588143	0 %	0 %	60 %	40 %	158312365
14246	NC_009921	CGC	2	6	588180	588185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312365
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14248	NC_009921	CGT	2	6	588233	588238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312365
14249	NC_009921	GCGG	2	8	588242	588249	0 %	0 %	75 %	25 %	158312365
14250	NC_009921	GAG	2	6	588317	588322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158312365
14251	NC_009921	GCC	2	6	588376	588381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312365
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14254	NC_009921	AGA	2	6	588535	588540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158312366
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14256	NC_009921	CACG	2	8	588631	588638	25 %	0 %	25 %	50 %	158312366
14257	NC_009921	GCT	2	6	588655	588660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312366
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14264	NC_009921	CGT	2	6	588853	588858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312366
14265	NC_009921	GAT	2	6	588859	588864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158312366
14266	NC_009921	TCG	2	6	588885	588890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312366
14267	NC_009921	CTG	3	9	588905	588913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312366
14268	NC_009921	CGAC	2	8	588927	588934	25 %	0 %	25 %	50 %	158312366
14269	NC_009921	ACG	2	6	588957	588962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312366
14270	NC_009921	GCT	2	6	589014	589019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312366
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14272	NC_009921	CCGA	2	8	589048	589055	25 %	0 %	25 %	50 %	158312366
14273	NC_009921	CGCGG	2	10	589108	589117	0 %	0 %	60 %	40 %	158312366
14274	NC_009921	TGCGA	2	10	589156	589165	20 %	20 %	40 %	20 %	158312366
14275	NC_009921	TCCG	2	8	589174	589181	0 %	25 %	25 %	50 %	158312366
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14277	NC_009921	CGAG	2	8	589249	589256	25 %	0 %	50 %	25 %	158312366
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14282	NC_009921	GTC	2	6	589434	589439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312366
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14300	NC_009921	GCCA	2	8	590101	590108	25 %	0 %	25 %	50 %	158312367
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14302	NC_009921	TCG	3	9	590218	590226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312367
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14353	NC_009921	CA	3	6	592313	592318	50 %	0 %	0 %	50 %	158312368
14354	NC_009921	GCG	2	6	592332	592337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312368
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14357	NC_009921	GCA	2	6	592381	592386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312368
14358	NC_009921	CGG	2	6	592423	592428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312368
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14475	NC_009921	GTC	2	6	599207	599212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312372
14476	NC_009921	AGA	2	6	599221	599226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158312372
14477	NC_009921	CTG	2	6	599240	599245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312372
14478	NC_009921	ACA	2	6	599325	599330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158312372
14479	NC_009921	GCACC	2	10	599383	599392	20 %	0 %	20 %	60 %	158312372
14480	NC_009921	TCG	2	6	599397	599402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312372
14481	NC_009921	ACGC	2	8	599491	599498	25 %	0 %	25 %	50 %	158312373
14482	NC_009921	GACCGG	2	12	599532	599543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158312373
14483	NC_009921	CGG	2	6	599594	599599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312373
14484	NC_009921	CGT	2	6	599630	599635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312373
14485	NC_009921	GCG	2	6	599659	599664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312373
14486	NC_009921	CGT	2	6	599669	599674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312373
14487	NC_009921	GAT	2	6	599726	599731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158312373
14488	NC_009921	ACG	2	6	599767	599772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312373
14489	NC_009921	ACCG	2	8	600036	600043	25 %	0 %	25 %	50 %	158312373
14490	NC_009921	GTC	2	6	600048	600053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312373
14491	NC_009921	TCG	2	6	600073	600078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312373
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14495	NC_009921	GCG	2	6	600136	600141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312373
14496	NC_009921	GCGTT	2	10	600211	600220	0 %	40 %	40 %	20 %	158312373
14497	NC_009921	TCG	2	6	600244	600249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312373
14498	NC_009921	CAC	2	6	600266	600271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158312373
14499	NC_009921	GGC	2	6	600409	600414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312374
14500	NC_009921	ATC	2	6	600437	600442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312374

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