MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 219400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009921	GAC	2	6	527974	527979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13002	NC_009921	GGC	2	6	527980	527985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312310
13003	NC_009921	TCG	2	6	528017	528022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13004	NC_009921	CGG	2	6	528063	528068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312310
13005	NC_009921	CG	3	6	528069	528074	0 %	0 %	50 %	50 %	158312310
13006	NC_009921	CGA	2	6	528078	528083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13007	NC_009921	CGCC	2	8	528210	528217	0 %	0 %	25 %	75 %	158312310
13008	NC_009921	GAC	2	6	528283	528288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13009	NC_009921	GGGC	2	8	528317	528324	0 %	0 %	75 %	25 %	158312310
13010	NC_009921	CGG	2	6	528366	528371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312310
13011	NC_009921	GCT	2	6	528386	528391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13012	NC_009921	GGT	2	6	528409	528414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312310
13013	NC_009921	GCA	2	6	528438	528443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13014	NC_009921	GCT	2	6	528460	528465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312310
13015	NC_009921	GCC	2	6	528485	528490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312310
13016	NC_009921	CTCGGC	2	12	528514	528525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158312310
13017	NC_009921	CTT	2	6	528532	528537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158312310
13018	NC_009921	GA	3	6	528600	528605	50 %	0 %	50 %	0 %	158312310
13019	NC_009921	CG	3	6	528617	528622	0 %	0 %	50 %	50 %	158312310
13020	NC_009921	GCAG	2	8	529094	529101	25 %	0 %	50 %	25 %	158312311
13021	NC_009921	CG	3	6	529205	529210	0 %	0 %	50 %	50 %	158312311
13022	NC_009921	TCGT	2	8	529285	529292	0 %	50 %	25 %	25 %	158312311
13023	NC_009921	AG	3	6	529359	529364	50 %	0 %	50 %	0 %	158312311
13024	NC_009921	ACT	2	6	529370	529375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312311
13025	NC_009921	CGG	2	6	529380	529385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312311
13026	NC_009921	CGCGGT	2	12	529446	529457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158312311
13027	NC_009921	ACC	2	6	529462	529467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158312311
13028	NC_009921	GC	3	6	529514	529519	0 %	0 %	50 %	50 %	158312311
13029	NC_009921	CGA	2	6	529539	529544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13030	NC_009921	CGT	2	6	529551	529556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13031	NC_009921	CTG	2	6	529585	529590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13032	NC_009921	GCG	2	6	529607	529612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312311
13033	NC_009921	CGGT	2	8	529667	529674	0 %	25 %	50 %	25 %	158312311
13034	NC_009921	CGC	2	6	529735	529740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312311
13035	NC_009921	ACT	2	6	529745	529750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312311
13036	NC_009921	GCGG	2	8	529881	529888	0 %	0 %	75 %	25 %	158312311
13037	NC_009921	CGC	2	6	529899	529904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312311
13038	NC_009921	CGT	2	6	529905	529910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13039	NC_009921	TCG	2	6	530027	530032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13040	NC_009921	GCT	2	6	530037	530042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13041	NC_009921	CCGA	2	8	530059	530066	25 %	0 %	25 %	50 %	158312311
13042	NC_009921	ACG	2	6	530113	530118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13043	NC_009921	GC	3	6	530136	530141	0 %	0 %	50 %	50 %	158312311
13044	NC_009921	CTG	2	6	530149	530154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312311
13045	NC_009921	ACG	3	9	530260	530268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312311
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13050	NC_009921	GGA	2	6	530415	530420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158312311
13051	NC_009921	GGCA	2	8	530471	530478	25 %	0 %	50 %	25 %	158312311
13052	NC_009921	C	6	6	530531	530536	0 %	0 %	0 %	100 %	158312311
13053	NC_009921	TCT	2	6	530537	530542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158312311
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13055	NC_009921	CGG	2	6	530670	530675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312312
13056	NC_009921	GTG	2	6	530688	530693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312312
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13058	NC_009921	TTC	2	6	530721	530726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158312312
13059	NC_009921	CTG	2	6	530727	530732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312312
13060	NC_009921	TTCG	2	8	530738	530745	0 %	50 %	25 %	25 %	158312312
13061	NC_009921	CCT	2	6	530762	530767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158312312
13062	NC_009921	TGCA	2	8	530794	530801	25 %	25 %	25 %	25 %	158312312
13063	NC_009921	CTGG	2	8	530852	530859	0 %	25 %	50 %	25 %	158312312
13064	NC_009921	GTC	2	6	530910	530915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312312
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13070	NC_009921	CTCG	2	8	531053	531060	0 %	25 %	25 %	50 %	158312312
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13074	NC_009921	CGA	2	6	531161	531166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312312
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13085	NC_009921	CTG	2	6	531686	531691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312313
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13087	NC_009921	GC	3	6	531708	531713	0 %	0 %	50 %	50 %	158312313
13088	NC_009921	ACT	2	6	531721	531726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312313
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13102	NC_009921	CGGA	2	8	532282	532289	25 %	0 %	50 %	25 %	158312313
13103	NC_009921	CGC	2	6	532318	532323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312313
13104	NC_009921	TCA	2	6	532386	532391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312313
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13119	NC_009921	CGA	2	6	533061	533066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312313
13120	NC_009921	CTG	2	6	533105	533110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312313
13121	NC_009921	AC	3	6	533153	533158	50 %	0 %	0 %	50 %	158312313
13122	NC_009921	GTG	2	6	533168	533173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312313
13123	NC_009921	TCG	2	6	533217	533222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312313
13124	NC_009921	TGC	2	6	533277	533282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312313
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13132	NC_009921	GTG	2	6	533653	533658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312314
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13134	NC_009921	CG	3	6	533767	533772	0 %	0 %	50 %	50 %	158312314
13135	NC_009921	CTG	2	6	533773	533778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312314
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13226	NC_009921	GGCC	2	8	537801	537808	0 %	0 %	50 %	50 %	158312316
13227	NC_009921	CAT	2	6	537822	537827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312316
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13229	NC_009921	GAG	2	6	538338	538343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158312317
13230	NC_009921	TGG	2	6	538361	538366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312317
13231	NC_009921	CGGC	2	8	538407	538414	0 %	0 %	50 %	50 %	158312317
13232	NC_009921	CGG	3	9	538510	538518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312317
13233	NC_009921	TCG	2	6	538527	538532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312317
13234	NC_009921	CGGCG	2	10	538559	538568	0 %	0 %	60 %	40 %	158312317
13235	NC_009921	GCT	2	6	538679	538684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312317
13236	NC_009921	GCG	2	6	538701	538706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312317
13237	NC_009921	AAC	2	6	538764	538769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158312317
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13239	NC_009921	CGA	2	6	538805	538810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312317
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13359	NC_009921	CGA	2	6	543828	543833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158312319
13360	NC_009921	CTA	2	6	543879	543884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312319
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13363	NC_009921	CCG	2	6	544017	544022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312320
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13371	NC_009921	CTT	2	6	544541	544546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158312322
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13392	NC_009921	GTC	2	6	545204	545209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312322
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13471	NC_009921	TGG	2	6	549763	549768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158312325
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13475	NC_009921	CCG	2	6	549916	549921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312325
13476	NC_009921	CA	3	6	549943	549948	50 %	0 %	0 %	50 %	158312325
13477	NC_009921	GAT	2	6	550494	550499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158312326
13478	NC_009921	GCGG	3	12	550515	550526	0 %	0 %	75 %	25 %	158312326
13479	NC_009921	TCG	2	6	550600	550605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312326
13480	NC_009921	G	6	6	550661	550666	0 %	0 %	100 %	0 %	158312326
13481	NC_009921	GCG	2	6	550801	550806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312326
13482	NC_009921	CAC	2	6	550818	550823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158312326
13483	NC_009921	GCGCG	2	10	550859	550868	0 %	0 %	60 %	40 %	158312326
13484	NC_009921	CGG	2	6	551000	551005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312326
13485	NC_009921	GTCA	2	8	551031	551038	25 %	25 %	25 %	25 %	158312326
13486	NC_009921	CAC	2	6	551046	551051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158312326
13487	NC_009921	CGAG	2	8	551063	551070	25 %	0 %	50 %	25 %	158312326
13488	NC_009921	CCA	2	6	551102	551107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158312326
13489	NC_009921	CGAC	2	8	551144	551151	25 %	0 %	25 %	50 %	158312326
13490	NC_009921	CCGC	2	8	551161	551168	0 %	0 %	25 %	75 %	158312326
13491	NC_009921	GAG	2	6	551329	551334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158312327
13492	NC_009921	CTCG	2	8	551385	551392	0 %	25 %	25 %	50 %	158312327
13493	NC_009921	ACT	2	6	551438	551443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158312327
13494	NC_009921	GCT	2	6	551460	551465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312327
13495	NC_009921	TCC	2	6	551474	551479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158312327
13496	NC_009921	CTG	2	6	551509	551514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312327
13497	NC_009921	GCC	2	6	551551	551556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158312327
13498	NC_009921	CACG	2	8	551625	551632	25 %	0 %	25 %	50 %	158312327
13499	NC_009921	GCG	2	6	551749	551754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158312327
13500	NC_009921	CTG	2	6	551761	551766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158312327

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