MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 41014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008601	ATTT	2	8	135342	135349	25 %	75 %	0 %	0 %	118496740
3002	NC_008601	TAA	2	6	135350	135355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496740
3003	NC_008601	AGG	2	6	135377	135382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118496740
3004	NC_008601	TGC	2	6	135395	135400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496740
3005	NC_008601	ATT	2	6	135417	135422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496740
3006	NC_008601	ATC	2	6	135454	135459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496740
3007	NC_008601	A	7	7	135460	135466	100 %	0 %	0 %	0 %	118496740
3008	NC_008601	ATA	2	6	135505	135510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496740
3009	NC_008601	A	6	6	135585	135590	100 %	0 %	0 %	0 %	118496741
3010	NC_008601	TATT	2	8	135595	135602	25 %	75 %	0 %	0 %	118496741
3011	NC_008601	TTA	2	6	135633	135638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496741
3012	NC_008601	AGT	2	6	135642	135647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3013	NC_008601	GGTT	2	8	135680	135687	0 %	50 %	50 %	0 %	118496741
3014	NC_008601	CTAT	2	8	135697	135704	25 %	50 %	0 %	25 %	118496741
3015	NC_008601	TAA	2	6	135746	135751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496741
3016	NC_008601	TAA	2	6	135820	135825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496741
3017	NC_008601	TAA	2	6	135848	135853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496741
3018	NC_008601	TAT	2	6	135881	135886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496741
3019	NC_008601	TAA	2	6	135953	135958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496741
3020	NC_008601	ATG	2	6	135976	135981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3021	NC_008601	GAT	3	9	136062	136070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3022	NC_008601	TCA	2	6	136107	136112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496741
3023	NC_008601	CAG	2	6	136119	136124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496741
3024	NC_008601	GCA	2	6	136202	136207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496741
3025	NC_008601	A	6	6	136210	136215	100 %	0 %	0 %	0 %	118496741
3026	NC_008601	ATG	2	6	136302	136307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3027	NC_008601	TAA	2	6	136360	136365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496741
3028	NC_008601	CTG	2	6	136369	136374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496741
3029	NC_008601	A	6	6	136412	136417	100 %	0 %	0 %	0 %	118496741
3030	NC_008601	AGA	2	6	136451	136456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496741
3031	NC_008601	TAC	2	6	136523	136528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496741
3032	NC_008601	TTGAT	2	10	136570	136579	20 %	60 %	20 %	0 %	118496741
3033	NC_008601	TGA	2	6	136592	136597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3034	NC_008601	ATT	2	6	136626	136631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496741
3035	NC_008601	TAGA	2	8	136642	136649	50 %	25 %	25 %	0 %	118496741
3036	NC_008601	AAT	2	6	136655	136660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496741
3037	NC_008601	ATC	2	6	136720	136725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496741
3038	NC_008601	CAA	2	6	136738	136743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496741
3039	NC_008601	ATT	2	6	136758	136763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496741
3040	NC_008601	A	6	6	136802	136807	100 %	0 %	0 %	0 %	118496741
3041	NC_008601	TG	3	6	136833	136838	0 %	50 %	50 %	0 %	118496741
3042	NC_008601	AATG	2	8	136877	136884	50 %	25 %	25 %	0 %	118496741
3043	NC_008601	GAT	2	6	136923	136928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3044	NC_008601	TGA	2	6	136957	136962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3045	NC_008601	TAG	3	9	137023	137031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3046	NC_008601	TAC	2	6	137087	137092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496741
3047	NC_008601	ATC	2	6	137153	137158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496741
3048	NC_008601	T	6	6	137163	137168	0 %	100 %	0 %	0 %	118496741
3049	NC_008601	AGC	2	6	137233	137238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496741
3050	NC_008601	GAT	2	6	137303	137308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3051	NC_008601	ATG	2	6	137422	137427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3052	NC_008601	GAT	2	6	137432	137437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3053	NC_008601	TA	3	6	137530	137535	50 %	50 %	0 %	0 %	118496741
3054	NC_008601	AAG	2	6	137546	137551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496741
3055	NC_008601	TGA	2	6	137630	137635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496741
3056	NC_008601	TAA	2	6	137698	137703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496742
3057	NC_008601	TAA	2	6	137718	137723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496742
3058	NC_008601	TGC	2	6	137875	137880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496742
3059	NC_008601	GGT	2	6	137904	137909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496742
3060	NC_008601	TGA	2	6	137932	137937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496742
3061	NC_008601	AGGGT	2	10	138087	138096	20 %	20 %	60 %	0 %	118496742
3062	NC_008601	ATT	2	6	138099	138104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496742
3063	NC_008601	GCA	2	6	138122	138127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496742
3064	NC_008601	GAT	2	6	138154	138159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496742
3065	NC_008601	GCT	2	6	138170	138175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496742
3066	NC_008601	CTC	2	6	138225	138230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118496742
3067	NC_008601	AG	3	6	138248	138253	50 %	0 %	50 %	0 %	118496742
3068	NC_008601	TGA	2	6	138274	138279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496742
3069	NC_008601	CAA	2	6	138398	138403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496742
3070	NC_008601	GCA	2	6	138404	138409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496742
3071	NC_008601	TTAA	2	8	138662	138669	50 %	50 %	0 %	0 %	118496742
3072	NC_008601	GAT	2	6	138704	138709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496742
3073	NC_008601	TGG	2	6	138739	138744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496742
3074	NC_008601	CTA	2	6	138783	138788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496742
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3076	NC_008601	TAT	2	6	138844	138849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496742
3077	NC_008601	ATA	2	6	138897	138902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496742
3078	NC_008601	TTC	2	6	138926	138931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496742
3079	NC_008601	AATCA	2	10	138944	138953	60 %	20 %	0 %	20 %	118496742
3080	NC_008601	ATGGT	2	10	138978	138987	20 %	40 %	40 %	0 %	118496742
3081	NC_008601	AG	3	6	139058	139063	50 %	0 %	50 %	0 %	118496742
3082	NC_008601	TGA	2	6	139069	139074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496742
3083	NC_008601	GTTA	2	8	139122	139129	25 %	50 %	25 %	0 %	118496742
3084	NC_008601	AT	3	6	139224	139229	50 %	50 %	0 %	0 %	118496743
3085	NC_008601	TTTGC	2	10	139238	139247	0 %	60 %	20 %	20 %	118496743
3086	NC_008601	CT	3	6	139288	139293	0 %	50 %	0 %	50 %	118496743
3087	NC_008601	CGTAC	2	10	139382	139391	20 %	20 %	20 %	40 %	118496743
3088	NC_008601	AGT	3	9	139451	139459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496743
3089	NC_008601	AGC	2	6	139489	139494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496743
3090	NC_008601	TGC	2	6	139537	139542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496743
3091	NC_008601	AGC	2	6	139560	139565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496743
3092	NC_008601	T	6	6	139602	139607	0 %	100 %	0 %	0 %	118496743
3093	NC_008601	GAT	2	6	139621	139626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496743
3094	NC_008601	TCT	2	6	139648	139653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496743
3095	NC_008601	TACT	2	8	139662	139669	25 %	50 %	0 %	25 %	118496743
3096	NC_008601	T	6	6	139679	139684	0 %	100 %	0 %	0 %	118496743
3097	NC_008601	TTCAA	2	10	139753	139762	40 %	40 %	0 %	20 %	118496743
3098	NC_008601	TTG	2	6	139800	139805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496743
3099	NC_008601	CTA	2	6	139814	139819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496743
3100	NC_008601	CTG	2	6	139857	139862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496743
3101	NC_008601	TGG	2	6	139999	140004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496743
3102	NC_008601	ATT	2	6	140018	140023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496743
3103	NC_008601	ATT	2	6	140092	140097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496743
3104	NC_008601	TTG	2	6	140175	140180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496743
3105	NC_008601	TGTT	2	8	140328	140335	0 %	75 %	25 %	0 %	118496743
3106	NC_008601	GTT	2	6	140359	140364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496743
3107	NC_008601	TCG	2	6	140626	140631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496744
3108	NC_008601	GGT	2	6	140642	140647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496744
3109	NC_008601	GTT	2	6	140768	140773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496744
3110	NC_008601	TTA	2	6	140850	140855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496744
3111	NC_008601	GAT	2	6	140885	140890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496744
3112	NC_008601	CGT	2	6	140942	140947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496744
3113	NC_008601	ATTA	2	8	140965	140972	50 %	50 %	0 %	0 %	118496744
3114	NC_008601	ATA	2	6	141012	141017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496744
3115	NC_008601	GATA	2	8	141173	141180	50 %	25 %	25 %	0 %	118496744
3116	NC_008601	TGA	2	6	141205	141210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496744
3117	NC_008601	AGAT	2	8	141246	141253	50 %	25 %	25 %	0 %	118496744
3118	NC_008601	TGA	2	6	141271	141276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496744
3119	NC_008601	GA	3	6	141299	141304	50 %	0 %	50 %	0 %	118496744
3120	NC_008601	AGA	2	6	141445	141450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496744
3121	NC_008601	GAT	2	6	141556	141561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496744
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3242	NC_008601	TGGGA	2	10	147825	147834	20 %	20 %	60 %	0 %	118496748
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