MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 41014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008601	TAA	2	6	232128	232133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496825
5002	NC_008601	ATT	2	6	232293	232298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496826
5003	NC_008601	TTTAT	2	10	232313	232322	20 %	80 %	0 %	0 %	118496826
5004	NC_008601	AT	3	6	232333	232338	50 %	50 %	0 %	0 %	118496826
5005	NC_008601	T	6	6	232360	232365	0 %	100 %	0 %	0 %	118496826
5006	NC_008601	TTA	2	6	232410	232415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496826
5007	NC_008601	AAT	2	6	232462	232467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496826
5008	NC_008601	AGC	2	6	232480	232485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496826
5009	NC_008601	A	6	6	232489	232494	100 %	0 %	0 %	0 %	118496826
5010	NC_008601	T	6	6	232565	232570	0 %	100 %	0 %	0 %	118496826
5011	NC_008601	ATT	2	6	232591	232596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496826
5012	NC_008601	GAT	2	6	232603	232608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496826
5013	NC_008601	ATG	2	6	232649	232654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496826
5014	NC_008601	TTATT	2	10	232656	232665	20 %	80 %	0 %	0 %	118496826
5015	NC_008601	ATT	2	6	232676	232681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496826
5016	NC_008601	TTA	2	6	232716	232721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496826
5017	NC_008601	TTTA	2	8	232735	232742	25 %	75 %	0 %	0 %	118496826
5018	NC_008601	TGA	2	6	232788	232793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496827
5019	NC_008601	GAT	2	6	232928	232933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496827
5020	NC_008601	CAT	2	6	232970	232975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496827
5021	NC_008601	AG	3	6	232991	232996	50 %	0 %	50 %	0 %	118496827
5022	NC_008601	ATA	3	9	233007	233015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496827
5023	NC_008601	ATTT	2	8	233037	233044	25 %	75 %	0 %	0 %	118496827
5024	NC_008601	ATG	2	6	233058	233063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496827
5025	NC_008601	TAAT	2	8	233067	233074	50 %	50 %	0 %	0 %	118496827
5026	NC_008601	CAA	2	6	233138	233143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496827
5027	NC_008601	AAG	2	6	233168	233173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496827
5028	NC_008601	TAC	2	6	233180	233185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496827
5029	NC_008601	A	6	6	233186	233191	100 %	0 %	0 %	0 %	118496827
5030	NC_008601	CTAA	2	8	233220	233227	50 %	25 %	0 %	25 %	118496827
5031	NC_008601	AAAT	2	8	234232	234239	75 %	25 %	0 %	0 %	118496828
5032	NC_008601	ACC	2	6	234350	234355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496828
5033	NC_008601	AG	3	6	234503	234508	50 %	0 %	50 %	0 %	118496828
5034	NC_008601	GA	3	6	234550	234555	50 %	0 %	50 %	0 %	118496828
5035	NC_008601	GA	3	6	234651	234656	50 %	0 %	50 %	0 %	118496828
5036	NC_008601	AAG	2	6	234690	234695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496828
5037	NC_008601	GA	3	6	234738	234743	50 %	0 %	50 %	0 %	118496828
5038	NC_008601	CAAG	2	8	234806	234813	50 %	0 %	25 %	25 %	118496828
5039	NC_008601	TGA	2	6	234851	234856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5040	NC_008601	CAA	2	6	234871	234876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496828
5041	NC_008601	AGA	2	6	234923	234928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496828
5042	NC_008601	TTGG	2	8	234945	234952	0 %	50 %	50 %	0 %	118496828
5043	NC_008601	GAT	2	6	234956	234961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5044	NC_008601	TGA	2	6	235001	235006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5045	NC_008601	TGA	2	6	235118	235123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5046	NC_008601	AGATA	2	10	235223	235232	60 %	20 %	20 %	0 %	118496828
5047	NC_008601	CTAA	2	8	235293	235300	50 %	25 %	0 %	25 %	118496828
5048	NC_008601	GA	3	6	235412	235417	50 %	0 %	50 %	0 %	118496828
5049	NC_008601	GT	3	6	235430	235435	0 %	50 %	50 %	0 %	118496828
5050	NC_008601	TGG	2	6	235449	235454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496828
5051	NC_008601	ATG	2	6	235477	235482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5052	NC_008601	TGA	2	6	235544	235549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5053	NC_008601	CAA	2	6	235663	235668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496828
5054	NC_008601	TCT	3	9	235696	235704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496828
5055	NC_008601	ATG	3	9	235716	235724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5056	NC_008601	ATGA	2	8	235740	235747	50 %	25 %	25 %	0 %	118496828
5057	NC_008601	ACT	2	6	235887	235892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496828
5058	NC_008601	CTA	2	6	235933	235938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496828
5059	NC_008601	A	6	6	235938	235943	100 %	0 %	0 %	0 %	118496828
5060	NC_008601	TGC	2	6	235997	236002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496828
5061	NC_008601	TGA	3	9	236098	236106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5062	NC_008601	TGA	2	6	236111	236116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5063	NC_008601	TACTGC	2	12	236180	236191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118496828
5064	NC_008601	TAG	2	6	236230	236235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5065	NC_008601	GAT	2	6	236310	236315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5066	NC_008601	CAA	2	6	236328	236333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496828
5067	NC_008601	A	7	7	236332	236338	100 %	0 %	0 %	0 %	118496828
5068	NC_008601	CAG	2	6	236427	236432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496828
5069	NC_008601	ATG	2	6	236449	236454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496828
5070	NC_008601	TGT	2	6	236546	236551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496828
5071	NC_008601	TGC	2	6	236627	236632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496828
5072	NC_008601	AATA	2	8	236687	236694	75 %	25 %	0 %	0 %	118496828
5073	NC_008601	CCA	2	6	236715	236720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496828
5074	NC_008601	A	6	6	236849	236854	100 %	0 %	0 %	0 %	118496828
5075	NC_008601	TGC	2	6	236903	236908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496828
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5077	NC_008601	GAT	3	9	237335	237343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496829
5078	NC_008601	TAG	2	6	237370	237375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496829
5079	NC_008601	GAA	3	9	237416	237424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496829
5080	NC_008601	ATC	2	6	237450	237455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496829
5081	NC_008601	ATT	2	6	237504	237509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496829
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5086	NC_008601	TCC	2	6	237664	237669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118496829
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5088	NC_008601	TAT	2	6	237746	237751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496829
5089	NC_008601	T	6	6	237787	237792	0 %	100 %	0 %	0 %	118496829
5090	NC_008601	TAA	2	6	237799	237804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496829
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5093	NC_008601	A	6	6	237833	237838	100 %	0 %	0 %	0 %	118496829
5094	NC_008601	T	7	7	237853	237859	0 %	100 %	0 %	0 %	118496829
5095	NC_008601	TCA	2	6	237890	237895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496829
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5098	NC_008601	ATT	2	6	238119	238124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496830
5099	NC_008601	TTGTT	3	15	238148	238162	0 %	80 %	20 %	0 %	118496830
5100	NC_008601	TCT	2	6	238202	238207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496830
5101	NC_008601	TTTG	2	8	238241	238248	0 %	75 %	25 %	0 %	118496830
5102	NC_008601	TA	3	6	238255	238260	50 %	50 %	0 %	0 %	118496830
5103	NC_008601	CAA	2	6	238327	238332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496830
5104	NC_008601	TTA	2	6	238337	238342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496830
5105	NC_008601	GAT	2	6	238351	238356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496830
5106	NC_008601	TGC	2	6	238396	238401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496830
5107	NC_008601	ATATT	2	10	238406	238415	40 %	60 %	0 %	0 %	118496830
5108	NC_008601	ATT	2	6	238462	238467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496831
5109	NC_008601	ATT	2	6	238688	238693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496831
5110	NC_008601	CCA	2	6	238739	238744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496831
5111	NC_008601	TAT	2	6	238756	238761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496831
5112	NC_008601	ATA	2	6	238787	238792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496831
5113	NC_008601	ATA	2	6	238808	238813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496831
5114	NC_008601	ATC	2	6	238823	238828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496831
5115	NC_008601	CCATT	2	10	238832	238841	20 %	40 %	0 %	40 %	118496831
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5118	NC_008601	GGT	2	6	239042	239047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496831
5119	NC_008601	T	6	6	239060	239065	0 %	100 %	0 %	0 %	118496831
5120	NC_008601	TCA	2	6	239175	239180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496831
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5122	NC_008601	AGC	2	6	239290	239295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496831
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5489	NC_008601	CTG	2	6	257039	257044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496850
5490	NC_008601	TCTGG	2	10	257057	257066	0 %	40 %	40 %	20 %	118496850
5491	NC_008601	ATT	2	6	257101	257106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496850
5492	NC_008601	GT	3	6	257305	257310	0 %	50 %	50 %	0 %	118496850
5493	NC_008601	TGT	2	6	257340	257345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496850
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5495	NC_008601	CTTA	2	8	257443	257450	25 %	50 %	0 %	25 %	118496850
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5497	NC_008601	GAA	2	6	257491	257496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496850
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5499	NC_008601	GGC	2	6	257517	257522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118496850
5500	NC_008601	AGA	2	6	257535	257540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496850

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