MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis FSC198 chromosome

Total Repeats: 36362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008245	TTA	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669658
2	NC_008245	T	6	6	37	42	0 %	100 %	0 %	0 %	110669658
3	NC_008245	A	8	8	69	76	100 %	0 %	0 %	0 %	110669658
4	NC_008245	A	9	9	78	86	100 %	0 %	0 %	0 %	110669658
5	NC_008245	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	110669658
6	NC_008245	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669658
7	NC_008245	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669658
8	NC_008245	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669658
9	NC_008245	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	110669658
10	NC_008245	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	110669658
11	NC_008245	T	7	7	327	333	0 %	100 %	0 %	0 %	110669658
12	NC_008245	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669658
13	NC_008245	AGA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669658
14	NC_008245	AGT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669658
15	NC_008245	AAG	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669658
16	NC_008245	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669658
17	NC_008245	AGA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669658
18	NC_008245	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669658
19	NC_008245	AGC	3	9	570	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669658
20	NC_008245	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669658
21	NC_008245	GCAA	2	8	663	670	50 %	0 %	25 %	25 %	110669658
22	NC_008245	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669658
23	NC_008245	TTA	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669658
24	NC_008245	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110669658
25	NC_008245	TGAT	2	8	815	822	25 %	50 %	25 %	0 %	110669658
26	NC_008245	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669658
27	NC_008245	A	6	6	1039	1044	100 %	0 %	0 %	0 %	110669658
28	NC_008245	CAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669658
29	NC_008245	GTAC	2	8	1102	1109	25 %	25 %	25 %	25 %	110669658
30	NC_008245	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669658
31	NC_008245	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669658
32	NC_008245	GCTT	2	8	1198	1205	0 %	50 %	25 %	25 %	110669658
33	NC_008245	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	110669658
34	NC_008245	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669658
35	NC_008245	GTT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669658
36	NC_008245	AAG	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669658
37	NC_008245	TGG	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669658
38	NC_008245	ATGC	2	8	1429	1436	25 %	25 %	25 %	25 %	110669658
39	NC_008245	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669658
40	NC_008245	TAAA	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	110669658
41	NC_008245	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	110669659
42	NC_008245	TAT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669659
43	NC_008245	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669659
44	NC_008245	AGTT	2	8	1731	1738	25 %	50 %	25 %	0 %	110669659
45	NC_008245	TGAT	2	8	1814	1821	25 %	50 %	25 %	0 %	110669659
46	NC_008245	TAA	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669659
47	NC_008245	AGCA	2	8	1928	1935	50 %	0 %	25 %	25 %	110669659
48	NC_008245	CAA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669659
49	NC_008245	TCA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669659
50	NC_008245	TAT	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669659
51	NC_008245	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669659
52	NC_008245	CTA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669659
53	NC_008245	A	7	7	2151	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	110669659
54	NC_008245	AGA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669659
55	NC_008245	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669659
56	NC_008245	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669659
57	NC_008245	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669659
58	NC_008245	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669659
59	NC_008245	TCTA	2	8	2572	2579	25 %	50 %	0 %	25 %	110669659
60	NC_008245	ATA	2	6	2624	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669659
61	NC_008245	GTTT	2	8	2630	2637	0 %	75 %	25 %	0 %	110669659
62	NC_008245	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669659
63	NC_008245	ATA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669660
64	NC_008245	TAG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669660
65	NC_008245	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669660
66	NC_008245	CAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669660
67	NC_008245	CTT	3	9	3463	3471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669660
68	NC_008245	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	110669660
69	NC_008245	TA	3	6	3609	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	110669660
70	NC_008245	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	110669660
71	NC_008245	T	7	7	3658	3664	0 %	100 %	0 %	0 %	110669660
72	NC_008245	CTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669660
73	NC_008245	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669660
74	NC_008245	GAT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669660
75	NC_008245	TCAA	2	8	3780	3787	50 %	25 %	0 %	25 %	110669660
76	NC_008245	CAAC	2	8	3819	3826	50 %	0 %	0 %	50 %	110669660
77	NC_008245	AAC	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110669660
78	NC_008245	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	110669660
79	NC_008245	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669660
80	NC_008245	ATTA	2	8	3947	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	110669660
81	NC_008245	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669660
82	NC_008245	AT	3	6	4722	4727	50 %	50 %	0 %	0 %	110669661
83	NC_008245	TTTGC	2	10	4736	4745	0 %	60 %	20 %	20 %	110669661
84	NC_008245	AATA	2	8	4868	4875	75 %	25 %	0 %	0 %	110669661
85	NC_008245	CGTAC	2	10	4880	4889	20 %	20 %	20 %	40 %	110669661
86	NC_008245	AGT	3	9	4949	4957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669661
87	NC_008245	AGC	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669661
88	NC_008245	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669661
89	NC_008245	TTA	2	6	5045	5050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669661
90	NC_008245	AGC	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110669661
91	NC_008245	AGA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669661
92	NC_008245	T	6	6	5100	5105	0 %	100 %	0 %	0 %	110669661
93	NC_008245	GAT	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669661
94	NC_008245	TCT	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110669661
95	NC_008245	TACT	2	8	5160	5167	25 %	50 %	0 %	25 %	110669661
96	NC_008245	T	6	6	5177	5182	0 %	100 %	0 %	0 %	110669661
97	NC_008245	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669661
98	NC_008245	TTCAA	2	10	5251	5260	40 %	40 %	0 %	20 %	110669661
99	NC_008245	TTG	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669661
100	NC_008245	CTA	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110669661
101	NC_008245	TTGCG	2	10	5339	5348	0 %	40 %	40 %	20 %	110669661
102	NC_008245	CTG	3	9	5355	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669661
103	NC_008245	TGG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669661
104	NC_008245	ATT	2	6	5516	5521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669661
105	NC_008245	CTAT	2	8	5579	5586	25 %	50 %	0 %	25 %	110669661
106	NC_008245	ATT	2	6	5590	5595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669661
107	NC_008245	CTG	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669661
108	NC_008245	TTG	2	6	5673	5678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669661
109	NC_008245	TGTT	2	8	5826	5833	0 %	75 %	25 %	0 %	110669661
110	NC_008245	TA	3	6	5835	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	110669661
111	NC_008245	GTT	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669661
112	NC_008245	TCG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669662
113	NC_008245	GGT	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669662
114	NC_008245	GTT	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669662
115	NC_008245	TTA	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669662
116	NC_008245	GAT	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669662
117	NC_008245	CGT	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110669662
118	NC_008245	ATTA	2	8	6463	6470	50 %	50 %	0 %	0 %	110669662
119	NC_008245	ATA	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669662
120	NC_008245	GATA	2	8	6671	6678	50 %	25 %	25 %	0 %	110669662
121	NC_008245	TGA	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669662
122	NC_008245	AGAT	2	8	6744	6751	50 %	25 %	25 %	0 %	110669662
123	NC_008245	TGA	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669662
124	NC_008245	GA	3	6	6797	6802	50 %	0 %	50 %	0 %	110669662
125	NC_008245	AGA	2	6	6943	6948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669662
126	NC_008245	GAT	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669662
127	NC_008245	TTG	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669662
128	NC_008245	AT	3	6	7108	7113	50 %	50 %	0 %	0 %	110669662
129	NC_008245	A	6	6	7165	7170	100 %	0 %	0 %	0 %	110669662
130	NC_008245	GAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110669662
131	NC_008245	TGAT	2	8	7197	7204	25 %	50 %	25 %	0 %	110669662
132	NC_008245	TAT	2	6	7230	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669662
133	NC_008245	TAA	2	6	7318	7323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110669662
134	NC_008245	GTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669662
135	NC_008245	GAT	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110669662
136	NC_008245	ATGCA	2	10	7386	7395	40 %	20 %	20 %	20 %	110669662
137	NC_008245	AGTT	2	8	7417	7424	25 %	50 %	25 %	0 %	110669662
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152	NC_008245	TTTCT	2	10	11665	11674	0 %	80 %	0 %	20 %	110669663
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264	NC_008245	A	6	6	17097	17102	100 %	0 %	0 %	0 %	110669668
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395	NC_008245	TA	3	6	23088	23093	50 %	50 %	0 %	0 %	110669675
396	NC_008245	GTT	2	6	23094	23099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669675
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399	NC_008245	GTG	2	6	23205	23210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110669675
400	NC_008245	TTG	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669675
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402	NC_008245	T	6	6	23362	23367	0 %	100 %	0 %	0 %	110669675
403	NC_008245	GTT	3	9	23372	23380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110669675
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497	NC_008245	TTA	2	6	27112	27117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110669678
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