MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 138229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020054	CAT	2	6	579289	579294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833839
12002	NC_020054	GGCAG	2	10	579310	579319	20 %	0 %	60 %	20 %	436833839
12003	NC_020054	T	6	6	579329	579334	0 %	100 %	0 %	0 %	436833839
12004	NC_020054	TGG	2	6	579336	579341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833839
12005	NC_020054	AG	3	6	579364	579369	50 %	0 %	50 %	0 %	436833839
12006	NC_020054	CCT	2	6	579387	579392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833839
12007	NC_020054	AAGG	2	8	579461	579468	50 %	0 %	50 %	0 %	436833839
12008	NC_020054	GGA	2	6	579541	579546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833839
12009	NC_020054	TGC	2	6	579651	579656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833839
12010	NC_020054	GCT	2	6	579677	579682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833839
12011	NC_020054	AAT	2	6	579689	579694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436833839
12012	NC_020054	TTC	2	6	579737	579742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833839
12013	NC_020054	GCAC	2	8	579747	579754	25 %	0 %	25 %	50 %	436833839
12014	NC_020054	GCT	2	6	579766	579771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833839
12015	NC_020054	GCC	3	9	579872	579880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833839
12016	NC_020054	TCA	2	6	579894	579899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833839
12017	NC_020054	GCC	2	6	579907	579912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833839
12018	NC_020054	GCC	2	6	579958	579963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833839
12019	NC_020054	GCG	2	6	580085	580090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833839
12020	NC_020054	GGT	2	6	580097	580102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833839
12021	NC_020054	CGA	2	6	580159	580164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833839
12022	NC_020054	GAA	2	6	580214	580219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833839
12023	NC_020054	CG	3	6	580236	580241	0 %	0 %	50 %	50 %	436833839
12024	NC_020054	CTA	2	6	580309	580314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833839
12025	NC_020054	ACC	2	6	580317	580322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833839
12026	NC_020054	CAA	2	6	580369	580374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833839
12027	NC_020054	TTCG	2	8	580429	580436	0 %	50 %	25 %	25 %	436833839
12028	NC_020054	CCG	2	6	580458	580463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833839
12029	NC_020054	TCA	2	6	580491	580496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833839
12030	NC_020054	CAAA	2	8	580511	580518	75 %	0 %	0 %	25 %	436833839
12031	NC_020054	AGG	2	6	580533	580538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833839
12032	NC_020054	ATG	2	6	580556	580561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833839
12033	NC_020054	CTG	2	6	580613	580618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833839
12034	NC_020054	ACG	2	6	580805	580810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_020054	ACA	2	6	580857	580862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_020054	ACT	2	6	580863	580868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_020054	CAG	2	6	580895	580900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833840
12038	NC_020054	CGA	2	6	580943	580948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833840
12039	NC_020054	CCG	2	6	580966	580971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833840
12040	NC_020054	GCA	2	6	581071	581076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833840
12041	NC_020054	CGG	2	6	581203	581208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833840
12042	NC_020054	GCC	2	6	581258	581263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833840
12043	NC_020054	A	6	6	581296	581301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_020054	CTG	2	6	581305	581310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_020054	T	6	6	581319	581324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_020054	CTT	2	6	581374	581379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833841
12047	NC_020054	TGC	2	6	581476	581481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833841
12048	NC_020054	TGC	2	6	581500	581505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833841
12049	NC_020054	GTT	2	6	581756	581761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833841
12050	NC_020054	AGC	2	6	581802	581807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833841
12051	NC_020054	CGAC	2	8	581866	581873	25 %	0 %	25 %	50 %	436833841
12052	NC_020054	GGTT	2	8	581905	581912	0 %	50 %	50 %	0 %	436833841
12053	NC_020054	GAT	2	6	581927	581932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833841
12054	NC_020054	GCA	2	6	581962	581967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833841
12055	NC_020054	GCCC	2	8	581987	581994	0 %	0 %	25 %	75 %	436833841
12056	NC_020054	TTG	2	6	582024	582029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833841
12057	NC_020054	CT	3	6	582090	582095	0 %	50 %	0 %	50 %	436833841
12058	NC_020054	GGCC	2	8	582199	582206	0 %	0 %	50 %	50 %	436833841
12059	NC_020054	TGC	2	6	582255	582260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833841
12060	NC_020054	AAAC	2	8	582307	582314	75 %	0 %	0 %	25 %	436833841
12061	NC_020054	CGA	2	6	582333	582338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833841
12062	NC_020054	TG	3	6	582354	582359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_020054	T	6	6	582363	582368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_020054	GAACA	2	10	582386	582395	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12065	NC_020054	CGG	2	6	582396	582401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12066	NC_020054	GCTG	2	8	582410	582417	0 %	25 %	50 %	25 %	436833842
12067	NC_020054	ATG	2	6	582418	582423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833842
12068	NC_020054	TTG	2	6	582483	582488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833842
12069	NC_020054	TCG	2	6	582499	582504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833842
12070	NC_020054	TCG	2	6	582517	582522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833843
12071	NC_020054	TACC	2	8	582527	582534	25 %	25 %	0 %	50 %	436833843
12072	NC_020054	GTTT	2	8	582577	582584	0 %	75 %	25 %	0 %	436833843
12073	NC_020054	CAGGT	2	10	582589	582598	20 %	20 %	40 %	20 %	436833843
12074	NC_020054	CGA	2	6	582615	582620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833843
12075	NC_020054	TTA	2	6	582655	582660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833843
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12077	NC_020054	TCA	2	6	582700	582705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833843
12078	NC_020054	CGT	2	6	582815	582820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833843
12079	NC_020054	CTT	2	6	582827	582832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833843
12080	NC_020054	ACGA	2	8	582876	582883	50 %	0 %	25 %	25 %	436833843
12081	NC_020054	CCG	2	6	582980	582985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833843
12082	NC_020054	CAG	2	6	583038	583043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833843
12083	NC_020054	CGA	2	6	583046	583051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833843
12084	NC_020054	TACCCG	2	12	583073	583084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436833843
12085	NC_020054	GCA	2	6	583139	583144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833843
12086	NC_020054	TTC	2	6	583293	583298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833844
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12088	NC_020054	GGC	2	6	583338	583343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833844
12089	NC_020054	GAAGA	2	10	583438	583447	60 %	0 %	40 %	0 %	436833844
12090	NC_020054	CCA	2	6	583535	583540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833844
12091	NC_020054	ATC	2	6	583576	583581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833844
12092	NC_020054	GTA	2	6	583585	583590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833844
12093	NC_020054	GAC	2	6	583605	583610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833844
12094	NC_020054	GACCC	2	10	583699	583708	20 %	0 %	20 %	60 %	436833844
12095	NC_020054	G	6	6	583736	583741	0 %	0 %	100 %	0 %	436833844
12096	NC_020054	GCGATG	2	12	583759	583770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436833844
12097	NC_020054	TGA	2	6	583844	583849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833844
12098	NC_020054	CGT	2	6	583889	583894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833844
12099	NC_020054	GAT	2	6	583905	583910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833844
12100	NC_020054	G	7	7	583926	583932	0 %	0 %	100 %	0 %	436833844
12101	NC_020054	A	6	6	583947	583952	100 %	0 %	0 %	0 %	436833844
12102	NC_020054	GGA	2	6	584041	584046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833844
12103	NC_020054	AGA	2	6	584105	584110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_020054	GCT	2	6	584147	584152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12105	NC_020054	TGTA	2	8	584206	584213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_020054	CAC	2	6	584276	584281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833845
12107	NC_020054	ACGCA	2	10	584303	584312	40 %	0 %	20 %	40 %	436833845
12108	NC_020054	CGA	2	6	584404	584409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12109	NC_020054	GCA	2	6	584424	584429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12110	NC_020054	TTC	2	6	584438	584443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833845
12111	NC_020054	GGGGC	2	10	584474	584483	0 %	0 %	80 %	20 %	436833845
12112	NC_020054	CTTA	2	8	584486	584493	25 %	50 %	0 %	25 %	436833845
12113	NC_020054	GCA	2	6	584545	584550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12114	NC_020054	CGG	2	6	584579	584584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833845
12115	NC_020054	CGA	2	6	584608	584613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12116	NC_020054	TAACGA	2	12	584644	584655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436833845
12117	NC_020054	CCG	2	6	584688	584693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833845
12118	NC_020054	GCA	2	6	584776	584781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12119	NC_020054	GAA	2	6	584795	584800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833845
12120	NC_020054	CCA	2	6	584905	584910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833845
12121	NC_020054	CGA	2	6	584932	584937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12122	NC_020054	CAG	2	6	584954	584959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12123	NC_020054	ACT	2	6	585006	585011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833845
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12125	NC_020054	CCG	2	6	585068	585073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833845
12126	NC_020054	CGA	2	6	585085	585090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833845
12127	NC_020054	GC	3	6	585140	585145	0 %	0 %	50 %	50 %	436833845
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12129	NC_020054	AGT	2	6	585180	585185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833845
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12131	NC_020054	TGGTGC	2	12	585346	585357	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436833846
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12133	NC_020054	GCG	2	6	585448	585453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833846
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12139	NC_020054	GGC	2	6	585654	585659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833846
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12145	NC_020054	TTA	2	6	585920	585925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_020054	AGC	2	6	586008	586013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833847
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12149	NC_020054	CAT	2	6	586171	586176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833847
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12152	NC_020054	TGCC	2	8	586291	586298	0 %	25 %	25 %	50 %	436833848
12153	NC_020054	TCG	2	6	586310	586315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833848
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12162	NC_020054	ATGG	2	8	587064	587071	25 %	25 %	50 %	0 %	436833849
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12169	NC_020054	GT	3	6	587269	587274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12170	NC_020054	GCC	2	6	587291	587296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12178	NC_020054	ACCG	2	8	587615	587622	25 %	0 %	25 %	50 %	436833850
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12213	NC_020054	TCA	2	6	589993	589998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833850
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12219	NC_020054	TCGGT	2	10	590470	590479	0 %	40 %	40 %	20 %	436833850
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12222	NC_020054	TTC	2	6	590596	590601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833850
12223	NC_020054	CTT	2	6	590626	590631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833850
12224	NC_020054	TCG	2	6	590633	590638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833850
12225	NC_020054	CGAT	2	8	590742	590749	25 %	25 %	25 %	25 %	436833850
12226	NC_020054	TCTG	2	8	590764	590771	0 %	50 %	25 %	25 %	436833850
12227	NC_020054	CAT	2	6	590790	590795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12228	NC_020054	GCCC	2	8	590808	590815	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12229	NC_020054	AAT	2	6	590819	590824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12230	NC_020054	CA	3	6	590854	590859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12231	NC_020054	ACA	2	6	590864	590869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12232	NC_020054	GCT	2	6	590897	590902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833851
12233	NC_020054	CGA	2	6	590952	590957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833851
12234	NC_020054	AGAA	2	8	591006	591013	75 %	0 %	25 %	0 %	436833851
12235	NC_020054	AAG	2	6	591026	591031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833851
12236	NC_020054	GAA	2	6	591101	591106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833851
12237	NC_020054	CGC	2	6	591218	591223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833851
12238	NC_020054	TCG	2	6	591227	591232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833851
12239	NC_020054	GAA	2	6	591233	591238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833851
12240	NC_020054	CAT	2	6	591327	591332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833851
12241	NC_020054	GAA	2	6	591442	591447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833851
12242	NC_020054	GGA	2	6	591452	591457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833851
12243	NC_020054	GAA	2	6	591478	591483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833851
12244	NC_020054	CGG	2	6	591489	591494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833851
12245	NC_020054	CGC	2	6	591604	591609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833851
12246	NC_020054	CGA	2	6	591637	591642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833851
12247	NC_020054	TCG	2	6	591680	591685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833851
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12249	NC_020054	GCAA	2	8	591708	591715	50 %	0 %	25 %	25 %	436833851
12250	NC_020054	GGTC	2	8	591770	591777	0 %	25 %	50 %	25 %	436833851
12251	NC_020054	ACG	2	6	591780	591785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833851
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12253	NC_020054	A	6	6	591965	591970	100 %	0 %	0 %	0 %	436833851
12254	NC_020054	ATC	2	6	591983	591988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833851
12255	NC_020054	GAT	2	6	591989	591994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833851
12256	NC_020054	ATG	2	6	592026	592031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833851
12257	NC_020054	CTGG	2	8	592039	592046	0 %	25 %	50 %	25 %	436833851
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12259	NC_020054	GCTACG	2	12	592082	592093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436833851
12260	NC_020054	GTCG	2	8	592121	592128	0 %	25 %	50 %	25 %	436833851
12261	NC_020054	CGA	2	6	592140	592145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12271	NC_020054	CGT	2	6	592759	592764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833852
12272	NC_020054	TTC	2	6	592807	592812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833852
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12275	NC_020054	ACCG	2	8	592880	592887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12276	NC_020054	ATG	2	6	592926	592931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12279	NC_020054	TCAA	2	8	593038	593045	50 %	25 %	0 %	25 %	436833853
12280	NC_020054	GTT	2	6	593055	593060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833853
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12351	NC_020054	TCA	2	6	596428	596433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833854
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12353	NC_020054	ACA	2	6	596528	596533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833854
12354	NC_020054	TACG	2	8	596729	596736	25 %	25 %	25 %	25 %	436833855
12355	NC_020054	GTA	2	6	596745	596750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833855
12356	NC_020054	GCT	2	6	596775	596780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833855
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12359	NC_020054	CGG	2	6	596912	596917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833855
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12477	NC_020054	GAAC	2	8	603473	603480	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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