MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 138229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020054	CTTGGC	2	12	527517	527528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11002	NC_020054	CCG	2	6	527588	527593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833793
11003	NC_020054	GC	3	6	527638	527643	0 %	0 %	50 %	50 %	436833793
11004	NC_020054	TGCC	2	8	527646	527653	0 %	25 %	25 %	50 %	436833793
11005	NC_020054	CAG	2	6	527661	527666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11006	NC_020054	TACG	2	8	527697	527704	25 %	25 %	25 %	25 %	436833793
11007	NC_020054	GTT	2	6	527799	527804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833793
11008	NC_020054	TTC	2	6	527817	527822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833793
11009	NC_020054	TCG	2	6	527884	527889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11010	NC_020054	GTA	2	6	527895	527900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833793
11011	NC_020054	TTG	2	6	527926	527931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833793
11012	NC_020054	CTG	2	6	527970	527975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11013	NC_020054	CAGC	2	8	527985	527992	25 %	0 %	25 %	50 %	436833793
11014	NC_020054	TGC	2	6	528010	528015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11015	NC_020054	ATAC	2	8	528027	528034	50 %	25 %	0 %	25 %	436833793
11016	NC_020054	ACG	2	6	528050	528055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11017	NC_020054	CAC	2	6	528060	528065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833793
11018	NC_020054	ACCG	2	8	528119	528126	25 %	0 %	25 %	50 %	436833793
11019	NC_020054	CAG	2	6	528153	528158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833793
11020	NC_020054	CGG	2	6	528170	528175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833793
11021	NC_020054	TGT	2	6	528196	528201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833793
11022	NC_020054	TTTC	2	8	528271	528278	0 %	75 %	0 %	25 %	436833793
11023	NC_020054	CTA	2	6	528467	528472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_020054	TA	3	6	528583	528588	50 %	50 %	0 %	0 %	436833794
11025	NC_020054	CGA	2	6	528671	528676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_020054	TCG	2	6	528678	528683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_020054	CTC	3	9	528696	528704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_020054	TGAA	2	8	528754	528761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_020054	CAG	2	6	528860	528865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11030	NC_020054	TCG	2	6	528910	528915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11031	NC_020054	TGC	2	6	528966	528971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11032	NC_020054	ACCG	2	8	529013	529020	25 %	0 %	25 %	50 %	436833795
11033	NC_020054	GTG	2	6	529039	529044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833795
11034	NC_020054	CGG	2	6	529063	529068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833795
11035	NC_020054	CCA	2	6	529072	529077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833795
11036	NC_020054	ACC	4	12	529104	529115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833795
11037	NC_020054	TGATC	2	10	529156	529165	20 %	40 %	20 %	20 %	436833795
11038	NC_020054	TCC	2	6	529236	529241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833795
11039	NC_020054	GCC	2	6	529245	529250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833795
11040	NC_020054	CGCC	2	8	529261	529268	0 %	0 %	25 %	75 %	436833795
11041	NC_020054	TGT	2	6	529288	529293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833795
11042	NC_020054	G	6	6	529395	529400	0 %	0 %	100 %	0 %	436833795
11043	NC_020054	CGG	2	6	529429	529434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833795
11044	NC_020054	TCG	2	6	529437	529442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11045	NC_020054	GTC	2	6	529488	529493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11046	NC_020054	TGA	3	9	529545	529553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833795
11047	NC_020054	CGA	2	6	529567	529572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11048	NC_020054	CGC	2	6	529597	529602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833795
11049	NC_020054	GCGA	2	8	529617	529624	25 %	0 %	50 %	25 %	436833795
11050	NC_020054	CCCA	2	8	529628	529635	25 %	0 %	0 %	75 %	436833795
11051	NC_020054	GCC	4	12	529664	529675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833795
11052	NC_020054	CGT	2	6	529678	529683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833795
11053	NC_020054	TGAGCG	2	12	529759	529770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436833795
11054	NC_020054	AAC	2	6	529784	529789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_020054	CCA	2	6	529827	529832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833796
11056	NC_020054	CCG	2	6	529836	529841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833796
11057	NC_020054	ACCC	2	8	529844	529851	25 %	0 %	0 %	75 %	436833796
11058	NC_020054	TGA	2	6	529870	529875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833796
11059	NC_020054	CG	3	6	530161	530166	0 %	0 %	50 %	50 %	436833797
11060	NC_020054	ATCA	2	8	530186	530193	50 %	25 %	0 %	25 %	436833797
11061	NC_020054	GTAA	2	8	530210	530217	50 %	25 %	25 %	0 %	436833797
11062	NC_020054	GC	3	6	530264	530269	0 %	0 %	50 %	50 %	436833797
11063	NC_020054	CGGT	2	8	530310	530317	0 %	25 %	50 %	25 %	436833797
11064	NC_020054	GAC	2	6	530357	530362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11065	NC_020054	CAG	2	6	530423	530428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11066	NC_020054	TCA	2	6	530448	530453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833797
11067	NC_020054	CGT	2	6	530476	530481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11068	NC_020054	GCT	2	6	530545	530550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11069	NC_020054	TAG	2	6	530636	530641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833797
11070	NC_020054	ACC	2	6	530647	530652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833797
11071	NC_020054	AAC	2	6	530709	530714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833797
11072	NC_020054	CGT	2	6	530785	530790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11073	NC_020054	CGT	2	6	530867	530872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11074	NC_020054	CGC	3	9	530900	530908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833797
11075	NC_020054	CAG	2	6	530929	530934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11076	NC_020054	AGCG	2	8	530960	530967	25 %	0 %	50 %	25 %	436833797
11077	NC_020054	GT	3	6	530983	530988	0 %	50 %	50 %	0 %	436833797
11078	NC_020054	GAATC	2	10	531016	531025	40 %	20 %	20 %	20 %	436833797
11079	NC_020054	GCA	2	6	531067	531072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833797
11080	NC_020054	GT	3	6	531107	531112	0 %	50 %	50 %	0 %	436833797
11081	NC_020054	GTG	2	6	531135	531140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833798
11082	NC_020054	AC	3	6	531204	531209	50 %	0 %	0 %	50 %	436833798
11083	NC_020054	ACG	2	6	531254	531259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833798
11084	NC_020054	CGAC	2	8	531294	531301	25 %	0 %	25 %	50 %	436833798
11085	NC_020054	GCTGG	2	10	531310	531319	0 %	20 %	60 %	20 %	436833798
11086	NC_020054	TTC	2	6	531430	531435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833798
11087	NC_020054	GAA	2	6	531475	531480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833798
11088	NC_020054	ATC	2	6	531712	531717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833798
11089	NC_020054	TGG	2	6	531725	531730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833798
11090	NC_020054	GTC	2	6	531739	531744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833798
11091	NC_020054	A	6	6	531814	531819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_020054	GT	3	6	531927	531932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_020054	A	7	7	531949	531955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_020054	TCA	2	6	531970	531975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_020054	TGG	2	6	532146	532151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833799
11096	NC_020054	AC	3	6	532395	532400	50 %	0 %	0 %	50 %	436833799
11097	NC_020054	CGC	2	6	532428	532433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833799
11098	NC_020054	GCT	2	6	532444	532449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833799
11099	NC_020054	AGC	2	6	532466	532471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833799
11100	NC_020054	CCG	2	6	532509	532514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833799
11101	NC_020054	GCGCT	2	10	532556	532565	0 %	20 %	40 %	40 %	436833799
11102	NC_020054	GCC	3	9	532586	532594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833799
11103	NC_020054	CGA	2	6	532606	532611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833799
11104	NC_020054	CCAG	2	8	532636	532643	25 %	0 %	25 %	50 %	436833799
11105	NC_020054	GCT	2	6	532648	532653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833799
11106	NC_020054	AAG	2	6	532701	532706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833799
11107	NC_020054	GCT	2	6	532717	532722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833799
11108	NC_020054	CGA	2	6	532723	532728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833799
11109	NC_020054	GTGG	2	8	532784	532791	0 %	25 %	75 %	0 %	436833799
11110	NC_020054	CAA	2	6	532798	532803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833799
11111	NC_020054	GCC	2	6	532850	532855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833799
11112	NC_020054	CCA	2	6	532908	532913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833799
11113	NC_020054	GGC	2	6	532951	532956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833799
11114	NC_020054	CCGGG	2	10	532958	532967	0 %	0 %	60 %	40 %	436833799
11115	NC_020054	CCA	2	6	533049	533054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833799
11116	NC_020054	C	6	6	533130	533135	0 %	0 %	0 %	100 %	436833799
11117	NC_020054	GCTG	2	8	533136	533143	0 %	25 %	50 %	25 %	436833799
11118	NC_020054	CCTG	2	8	533192	533199	0 %	25 %	25 %	50 %	436833799
11119	NC_020054	CCA	2	6	533218	533223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833799
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11121	NC_020054	CGA	2	6	533254	533259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833799
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11227	NC_020054	CAGC	2	8	538670	538677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11228	NC_020054	GAC	2	6	538700	538705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11230	NC_020054	GGC	2	6	538881	538886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833804
11231	NC_020054	CGAT	2	8	538974	538981	25 %	25 %	25 %	25 %	436833804
11232	NC_020054	CAG	2	6	539002	539007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833804
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11481	NC_020054	GTC	2	6	551402	551407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833817
11482	NC_020054	TGC	2	6	551416	551421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833817
11483	NC_020054	ACG	2	6	551512	551517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833817
11484	NC_020054	ACA	2	6	551557	551562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833817
11485	NC_020054	TGGGC	2	10	551693	551702	0 %	20 %	60 %	20 %	436833817
11486	NC_020054	CGA	2	6	551801	551806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833817
11487	NC_020054	TCA	2	6	551908	551913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833817
11488	NC_020054	CGG	2	6	551915	551920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833817
11489	NC_020054	CACACC	2	12	551922	551933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833817
11490	NC_020054	CCAACG	2	12	551959	551970	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	436833817
11491	NC_020054	TGA	2	6	552105	552110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11492	NC_020054	GTT	2	6	552207	552212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833818
11493	NC_020054	TTC	2	6	552232	552237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833818
11494	NC_020054	CCG	2	6	552313	552318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833818
11495	NC_020054	GGT	2	6	552336	552341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833818
11496	NC_020054	CGG	2	6	552395	552400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833818
11497	NC_020054	CTC	2	6	552408	552413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833818
11498	NC_020054	CGA	3	9	552438	552446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833818
11499	NC_020054	CAC	2	6	552530	552535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833818
11500	NC_020054	CCG	2	6	552659	552664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833818

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