MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 46518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	A	7	7	7	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019551	A	7	7	18	24	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019551	TAA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019551	A	6	6	45	50	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019551	TTA	2	6	60	65	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019551	AT	3	6	70	75	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019551	TTA	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019551	ATA	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019551	ATTA	2	8	129	136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019551	ACTT	2	8	153	160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019551	TTAT	2	8	173	180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019551	TTA	2	6	255	260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019551	T	6	6	266	271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019551	A	8	8	298	305	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
15	NC_019551	A	9	9	307	315	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
16	NC_019551	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
17	NC_019551	CAA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937996
18	NC_019551	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937996
19	NC_019551	TAA	2	6	496	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937996
20	NC_019551	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
21	NC_019551	A	6	6	516	521	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
22	NC_019551	T	7	7	556	562	0 %	100 %	0 %	0 %	422937996
23	NC_019551	CAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937996
24	NC_019551	AGA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
25	NC_019551	AGT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937996
26	NC_019551	AAG	2	6	632	637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
27	NC_019551	TCA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937996
28	NC_019551	AGA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
29	NC_019551	TGT	2	6	769	774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937996
30	NC_019551	AGC	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422937996
31	NC_019551	TGG	2	6	859	864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422937996
32	NC_019551	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	422937996
33	NC_019551	ATT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937996
34	NC_019551	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937996
35	NC_019551	CAAGAT	2	12	995	1006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422937996
36	NC_019551	TGAT	2	8	1044	1051	25 %	50 %	25 %	0 %	422937996
37	NC_019551	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
38	NC_019551	A	6	6	1268	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	422937996
39	NC_019551	CAG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422937996
40	NC_019551	GTAC	2	8	1331	1338	25 %	25 %	25 %	25 %	422937996
41	NC_019551	TAC	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937996
42	NC_019551	CTA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937996
43	NC_019551	GCTT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	422937996
44	NC_019551	AAGAA	2	10	1455	1464	80 %	0 %	20 %	0 %	422937996
45	NC_019551	ATA	2	6	1476	1481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937996
46	NC_019551	GTT	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937996
47	NC_019551	AAG	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937996
48	NC_019551	TGG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422937996
49	NC_019551	ATGC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	25 %	25 %	422937996
50	NC_019551	GAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937996
51	NC_019551	TAAA	2	8	1748	1755	75 %	25 %	0 %	0 %	422937996
52	NC_019551	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	422937997
53	NC_019551	TAT	2	6	1872	1877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
54	NC_019551	ATA	3	9	1899	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
55	NC_019551	AGTT	2	8	1960	1967	25 %	50 %	25 %	0 %	422937997
56	NC_019551	TGAT	2	8	2043	2050	25 %	50 %	25 %	0 %	422937997
57	NC_019551	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
58	NC_019551	AGCA	2	8	2157	2164	50 %	0 %	25 %	25 %	422937997
59	NC_019551	CAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422937997
60	NC_019551	TCA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937997
61	NC_019551	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
62	NC_019551	ATG	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422937997
63	NC_019551	CTA	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422937997
64	NC_019551	A	7	7	2380	2386	100 %	0 %	0 %	0 %	422937997
65	NC_019551	AGA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937997
66	NC_019551	ATA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
67	NC_019551	ATT	2	6	2590	2595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
68	NC_019551	TAA	2	6	2674	2679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
69	NC_019551	GAA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422937997
70	NC_019551	TCTA	2	8	2801	2808	25 %	50 %	0 %	25 %	422937997
71	NC_019551	ATA	2	6	2853	2858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422937997
72	NC_019551	GTTT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	422937997
73	NC_019551	ATT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422937997
74	NC_019551	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019551	GAAT	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019551	A	7	7	2954	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019551	TA	3	6	2977	2982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019551	AGT	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019551	TAA	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019551	TATTTC	2	12	3093	3104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019551	CAC	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019551	A	6	6	3174	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019551	TGA	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019551	T	6	6	3203	3208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019551	ATA	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019551	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019551	ACC	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019551	AT	3	6	3296	3301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019551	GAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019551	TAT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019551	T	7	7	3416	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019551	ATA	2	6	3479	3484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019551	TAG	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019551	ATG	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019551	CAA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019551	CTT	3	9	3691	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019551	CATCT	2	10	3786	3795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019551	TA	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019551	TTCTT	2	10	3858	3867	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019551	T	7	7	3886	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019551	CTT	2	6	3933	3938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019551	CTT	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019551	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019551	TCAA	2	8	4008	4015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019551	CAAC	2	8	4047	4054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019551	CCTTG	2	10	4056	4065	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019551	AAC	2	6	4106	4111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019551	A	6	6	4130	4135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019551	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019551	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019551	ATG	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019551	TTA	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019551	TAG	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019551	GGT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019551	TAC	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019551	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019551	GAT	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019551	TTA	2	6	4484	4489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019551	CAA	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019551	GT	3	6	4526	4531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019551	TGA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019551	ATT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019551	TGTT	2	8	4598	4605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019551	GGTA	2	8	4608	4615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019551	AT	3	6	4647	4652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019551	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019551	GGT	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019551	T	6	6	4850	4855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019551	TA	3	6	4864	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019551	TAG	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019551	ATT	2	6	4978	4983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019551	GAA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019551	TA	4	8	5032	5039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019551	CT	3	6	5053	5058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019551	T	6	6	5062	5067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019551	TTC	2	6	5083	5088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019551	ATC	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019551	CAT	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019551	ATA	2	6	5240	5245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019551	ATTT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019551	TGG	2	6	5294	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019551	GCA	2	6	5360	5365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019551	TTGA	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019551	ACA	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019551	TA	3	6	5511	5516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019551	TTTC	2	8	5535	5542	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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402	NC_019551	T	7	7	16314	16320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_019551	ATA	2	6	16377	16382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_019551	CTT	3	9	16589	16597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_019551	TA	3	6	16735	16740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_019551	TTCTT	2	10	16756	16765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
411	NC_019551	T	7	7	16784	16790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_019551	CTT	2	6	16831	16836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_019551	CTT	2	6	16856	16861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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415	NC_019551	TCAA	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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423	NC_019551	TTA	2	6	17117	17122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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