MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 46404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	GCTT	2	8	23	30	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017450	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017450	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017450	T	6	6	136	141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017450	A	8	8	168	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017450	A	9	9	177	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017450	A	6	6	280	285	100 %	0 %	0 %	0 %	385791933
8	NC_017450	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791933
9	NC_017450	ATT	2	6	352	357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791933
10	NC_017450	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791933
11	NC_017450	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	385791933
12	NC_017450	A	6	6	386	391	100 %	0 %	0 %	0 %	385791933
13	NC_017450	T	7	7	426	432	0 %	100 %	0 %	0 %	385791933
14	NC_017450	CAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791933
15	NC_017450	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
16	NC_017450	AGT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
17	NC_017450	AAG	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
18	NC_017450	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791933
19	NC_017450	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
20	NC_017450	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
21	NC_017450	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791933
22	NC_017450	AGC	3	9	669	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791933
23	NC_017450	TGG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385791933
24	NC_017450	GCAA	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	385791933
25	NC_017450	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791933
26	NC_017450	TTA	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791933
27	NC_017450	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385791933
28	NC_017450	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791933
29	NC_017450	GAT	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
30	NC_017450	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
31	NC_017450	A	6	6	1138	1143	100 %	0 %	0 %	0 %	385791933
32	NC_017450	CAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791933
33	NC_017450	GTAC	2	8	1201	1208	25 %	25 %	25 %	25 %	385791933
34	NC_017450	AG	3	6	1216	1221	50 %	0 %	50 %	0 %	385791933
35	NC_017450	TAC	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791933
36	NC_017450	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791933
37	NC_017450	GCTT	2	8	1297	1304	0 %	50 %	25 %	25 %	385791933
38	NC_017450	AAGAA	2	10	1325	1334	80 %	0 %	20 %	0 %	385791933
39	NC_017450	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791933
40	NC_017450	GTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791933
41	NC_017450	AAG	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
42	NC_017450	TGG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385791933
43	NC_017450	ATGC	2	8	1528	1535	25 %	25 %	25 %	25 %	385791933
44	NC_017450	GAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
45	NC_017450	TAAA	2	8	1618	1625	75 %	25 %	0 %	0 %	385791933
46	NC_017450	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	385791934
47	NC_017450	TAT	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791934
48	NC_017450	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
49	NC_017450	AGTT	2	8	1830	1837	25 %	50 %	25 %	0 %	385791934
50	NC_017450	TGAA	2	8	1898	1905	50 %	25 %	25 %	0 %	385791934
51	NC_017450	TGAT	2	8	1913	1920	25 %	50 %	25 %	0 %	385791934
52	NC_017450	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
53	NC_017450	AGCA	2	8	2027	2034	50 %	0 %	25 %	25 %	385791934
54	NC_017450	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791934
55	NC_017450	TCA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791934
56	NC_017450	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791934
57	NC_017450	ATG	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791934
58	NC_017450	CTA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791934
59	NC_017450	A	7	7	2250	2256	100 %	0 %	0 %	0 %	385791934
60	NC_017450	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791934
61	NC_017450	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
62	NC_017450	ATT	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791934
63	NC_017450	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
64	NC_017450	GAA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791934
65	NC_017450	TCTA	2	8	2671	2678	25 %	50 %	0 %	25 %	385791934
66	NC_017450	ATA	2	6	2723	2728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
67	NC_017450	GTTT	2	8	2729	2736	0 %	75 %	25 %	0 %	385791934
68	NC_017450	ATC	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791934
69	NC_017450	TAA	2	6	2762	2767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017450	GAAT	2	8	2805	2812	50 %	25 %	25 %	0 %	385791935
71	NC_017450	A	7	7	2824	2830	100 %	0 %	0 %	0 %	385791935
72	NC_017450	TA	3	6	2848	2853	50 %	50 %	0 %	0 %	385791935
73	NC_017450	AGT	3	9	2878	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
74	NC_017450	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
75	NC_017450	TATTTC	2	12	2964	2975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385791935
76	NC_017450	CAC	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
77	NC_017450	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	385791935
78	NC_017450	TGA	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
79	NC_017450	T	6	6	3074	3079	0 %	100 %	0 %	0 %	385791935
80	NC_017450	ATA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
81	NC_017450	T	6	6	3142	3147	0 %	100 %	0 %	0 %	385791935
82	NC_017450	ACC	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
83	NC_017450	AT	3	6	3167	3172	50 %	50 %	0 %	0 %	385791935
84	NC_017450	GAA	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791935
85	NC_017450	TAT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
86	NC_017450	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
87	NC_017450	AT	3	6	3275	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	385791935
88	NC_017450	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
89	NC_017450	AGAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	25 %	0 %	385791935
90	NC_017450	TAA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
91	NC_017450	ATT	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
92	NC_017450	T	7	7	3391	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	385791935
93	NC_017450	TGA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
94	NC_017450	AT	3	6	3443	3448	50 %	50 %	0 %	0 %	385791935
95	NC_017450	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
96	NC_017450	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
97	NC_017450	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
98	NC_017450	A	7	7	3571	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	385791935
99	NC_017450	GAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791935
100	NC_017450	TTA	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
101	NC_017450	GCT	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385791935
102	NC_017450	CCA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
103	NC_017450	CCA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
104	NC_017450	AT	3	6	3718	3723	50 %	50 %	0 %	0 %	385791935
105	NC_017450	TAA	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
106	NC_017450	AAT	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
107	NC_017450	T	8	8	3801	3808	0 %	100 %	0 %	0 %	385791935
108	NC_017450	AGA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791935
109	NC_017450	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
110	NC_017450	A	7	7	3862	3868	100 %	0 %	0 %	0 %	385791935
111	NC_017450	TAAAG	2	10	3871	3880	60 %	20 %	20 %	0 %	385791935
112	NC_017450	GTAT	2	8	3886	3893	25 %	50 %	25 %	0 %	385791935
113	NC_017450	TTG	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791935
114	NC_017450	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791935
115	NC_017450	CATAC	2	10	3958	3967	40 %	20 %	0 %	40 %	385791935
116	NC_017450	AT	3	6	4014	4019	50 %	50 %	0 %	0 %	385791935
117	NC_017450	T	6	6	4019	4024	0 %	100 %	0 %	0 %	385791935
118	NC_017450	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017450	T	6	6	4071	4076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017450	T	6	6	4100	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017450	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017450	T	6	6	4128	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017450	A	6	6	4134	4139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017450	TA	3	6	4154	4159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017450	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017450	ATT	2	6	4183	4188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017450	ATA	2	6	4205	4210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017450	A	7	7	4255	4261	100 %	0 %	0 %	0 %	385791936
129	NC_017450	TTA	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791936
130	NC_017450	AGC	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791936
131	NC_017450	AGC	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791936
132	NC_017450	TAT	2	6	4413	4418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791936
133	NC_017450	AGCT	2	8	4422	4429	25 %	25 %	25 %	25 %	385791936
134	NC_017450	CAA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791936
135	NC_017450	ATT	2	6	4450	4455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791936
136	NC_017450	CA	3	6	4561	4566	50 %	0 %	0 %	50 %	385791936
137	NC_017450	AT	4	8	4567	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	385791936
138	NC_017450	TA	4	8	4579	4586	50 %	50 %	0 %	0 %	385791936
139	NC_017450	ACTT	2	8	4621	4628	25 %	50 %	0 %	25 %	385791936
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141	NC_017450	ATA	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791936
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143	NC_017450	TTCA	2	8	4782	4789	25 %	50 %	0 %	25 %	385791936
144	NC_017450	GTA	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791936
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149	NC_017450	TA	3	6	4981	4986	50 %	50 %	0 %	0 %	385791936
150	NC_017450	TAC	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791936
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161	NC_017450	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791936
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163	NC_017450	TCA	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791936
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165	NC_017450	AT	3	6	5670	5675	50 %	50 %	0 %	0 %	385791936
166	NC_017450	CTT	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791936
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175	NC_017450	A	6	6	5995	6000	100 %	0 %	0 %	0 %	385791937
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404	NC_017450	TTA	2	6	13919	13924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_017450	T	6	6	14201	14206	0 %	100 %	0 %	0 %	385791949
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