MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 72129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017448	TTGC	2	8	1	8	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017448	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017448	TTG	2	6	58	63	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
4	NC_017448	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	385789061
5	NC_017448	TGA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789061
6	NC_017448	TTG	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
7	NC_017448	TTG	2	6	281	286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
8	NC_017448	AAG	2	6	370	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
9	NC_017448	AGC	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789061
10	NC_017448	TTG	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
11	NC_017448	TGC	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789061
12	NC_017448	AGA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
13	NC_017448	GCC	2	6	593	598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789061
14	NC_017448	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	385789061
15	NC_017448	CAA	2	6	672	677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789061
16	NC_017448	GGT	2	6	873	878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789061
17	NC_017448	AAG	2	6	934	939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
18	NC_017448	CCT	2	6	956	961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789061
19	NC_017448	TGA	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789061
20	NC_017448	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
21	NC_017448	GAA	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
22	NC_017448	GGC	2	6	1207	1212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789061
23	NC_017448	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789061
24	NC_017448	CGC	2	6	1413	1418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789061
25	NC_017448	CGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017448	GT	4	8	1577	1584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017448	CGAG	2	8	1629	1636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017448	GTC	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017448	GGC	2	6	1717	1722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017448	CCG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017448	AAAG	2	8	1882	1889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017448	GGC	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017448	CTGA	2	8	2174	2181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017448	GTG	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017448	TGG	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017448	GCC	2	6	2309	2314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017448	ACT	2	6	2346	2351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017448	CT	3	6	2412	2417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017448	ATA	2	6	2487	2492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017448	T	6	6	2525	2530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017448	AAT	2	6	2570	2575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017448	A	6	6	2599	2604	100 %	0 %	0 %	0 %	385789062
43	NC_017448	A	6	6	2677	2682	100 %	0 %	0 %	0 %	385789062
44	NC_017448	TCA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789062
45	NC_017448	TCT	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789062
46	NC_017448	GAT	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789062
47	NC_017448	GAAGT	2	10	2734	2743	40 %	20 %	40 %	0 %	385789062
48	NC_017448	CCT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789062
49	NC_017448	AAG	2	6	2767	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789062
50	NC_017448	GAC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789062
51	NC_017448	AAG	2	6	2797	2802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789062
52	NC_017448	ATA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789062
53	NC_017448	CTC	2	6	2853	2858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789062
54	NC_017448	TTC	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789062
55	NC_017448	GTCTTC	2	12	2910	2921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385789062
56	NC_017448	GTT	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
57	NC_017448	AGCA	2	8	3022	3029	50 %	0 %	25 %	25 %	385789062
58	NC_017448	TTG	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
59	NC_017448	TCG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789062
60	NC_017448	CGT	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789062
61	NC_017448	ACG	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789062
62	NC_017448	ACGTTC	2	12	3364	3375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385789062
63	NC_017448	GGC	2	6	3433	3438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789062
64	NC_017448	GTT	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
65	NC_017448	CGGAA	2	10	3522	3531	40 %	0 %	40 %	20 %	385789062
66	NC_017448	ACG	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789062
67	NC_017448	CGAATA	2	12	3594	3605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385789062
68	NC_017448	TCG	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789062
69	NC_017448	TTG	2	6	3698	3703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
70	NC_017448	CAA	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789062
71	NC_017448	TGA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789062
72	NC_017448	CAA	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789062
73	NC_017448	AGT	3	9	3947	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789062
74	NC_017448	TC	3	6	3977	3982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017448	CTAA	2	8	3992	3999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017448	A	6	6	4031	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	385789063
77	NC_017448	T	7	7	4060	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	385789063
78	NC_017448	TGAAA	2	10	4088	4097	60 %	20 %	20 %	0 %	385789063
79	NC_017448	TTC	2	6	4293	4298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789063
80	NC_017448	TG	3	6	4300	4305	0 %	50 %	50 %	0 %	385789063
81	NC_017448	CGC	2	6	4324	4329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789063
82	NC_017448	GGTC	2	8	4373	4380	0 %	25 %	50 %	25 %	385789063
83	NC_017448	ACG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789063
84	NC_017448	ATT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789063
85	NC_017448	TGA	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789063
86	NC_017448	TGT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789063
87	NC_017448	CAA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789063
88	NC_017448	TGC	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789063
89	NC_017448	CGA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789063
90	NC_017448	TCG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789063
91	NC_017448	CCG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789063
92	NC_017448	TC	3	6	5507	5512	0 %	50 %	0 %	50 %	385789063
93	NC_017448	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789063
94	NC_017448	TC	3	6	5628	5633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017448	CTA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017448	A	6	6	5770	5775	100 %	0 %	0 %	0 %	385789064
97	NC_017448	GTC	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
98	NC_017448	CGT	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
99	NC_017448	GGTC	2	8	5903	5910	0 %	25 %	50 %	25 %	385789064
100	NC_017448	GTC	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
101	NC_017448	ACG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789064
102	NC_017448	GGT	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789064
103	NC_017448	TAT	2	6	6107	6112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789064
104	NC_017448	GAA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789064
105	NC_017448	CTG	3	9	6215	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
106	NC_017448	GGT	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789064
107	NC_017448	ACG	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789064
108	NC_017448	GCG	2	6	6259	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789064
109	NC_017448	AAG	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789064
110	NC_017448	CGAATG	2	12	6275	6286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385789064
111	NC_017448	CAA	2	6	6299	6304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789064
112	NC_017448	CGG	2	6	6323	6328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789064
113	NC_017448	GTAA	2	8	6361	6368	50 %	25 %	25 %	0 %	385789064
114	NC_017448	A	6	6	6399	6404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017448	A	6	6	6409	6414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017448	T	7	7	6442	6448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017448	ATTTA	2	10	6449	6458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017448	GGA	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017448	TCG	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789065
120	NC_017448	CCT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789065
121	NC_017448	GAA	2	6	6647	6652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
122	NC_017448	GAA	2	6	6707	6712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
123	NC_017448	CTC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789065
124	NC_017448	GCTA	2	8	6947	6954	25 %	25 %	25 %	25 %	385789065
125	NC_017448	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789065
126	NC_017448	CGA	2	6	7065	7070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789065
127	NC_017448	GAA	2	6	7159	7164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
128	NC_017448	CT	3	6	7234	7239	0 %	50 %	0 %	50 %	385789065
129	NC_017448	GCT	2	6	7337	7342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789065
130	NC_017448	GGCG	2	8	7378	7385	0 %	0 %	75 %	25 %	385789065
131	NC_017448	CAAG	2	8	7494	7501	50 %	0 %	25 %	25 %	385789065
132	NC_017448	GAA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
133	NC_017448	CAA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789065
134	NC_017448	TTG	2	6	7653	7658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789065
135	NC_017448	GTT	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789065
136	NC_017448	ACGCT	2	10	7677	7686	20 %	20 %	20 %	40 %	385789065
137	NC_017448	ATA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789065
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162	NC_017448	TC	3	6	9119	9124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017448	TC	3	6	9222	9227	0 %	50 %	0 %	50 %	385789067
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269	NC_017448	GCG	2	6	15275	15280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789071
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275	NC_017448	T	7	7	15674	15680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017448	AATA	2	8	15687	15694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017448	GCC	2	6	15855	15860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789072
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397	NC_017448	CCTTGG	2	12	22317	22328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789077
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399	NC_017448	CCG	2	6	22469	22474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789077
400	NC_017448	CTTG	2	8	22489	22496	0 %	50 %	25 %	25 %	385789077
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