MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 259180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014666	CGCCT	2	10	557274	557283	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16002	NC_014666	CG	3	6	557284	557289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16003	NC_014666	GCC	2	6	557291	557296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_014666	GGC	2	6	557304	557309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_014666	CCT	2	6	557335	557340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16006	NC_014666	AGG	2	6	557359	557364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_014666	ACC	2	6	557381	557386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194352
16008	NC_014666	GC	3	6	557406	557411	0 %	0 %	50 %	50 %	312194352
16009	NC_014666	GCCGTC	2	12	557417	557428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312194352
16010	NC_014666	AGGCCG	2	12	557439	557450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312194352
16011	NC_014666	TGC	2	6	557451	557456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194352
16012	NC_014666	CG	3	6	557601	557606	0 %	0 %	50 %	50 %	312194352
16013	NC_014666	CAC	2	6	557614	557619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194352
16014	NC_014666	GTG	2	6	557651	557656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194352
16015	NC_014666	CCA	2	6	557721	557726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194352
16016	NC_014666	GGC	2	6	557742	557747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194352
16017	NC_014666	CCGC	2	8	557751	557758	0 %	0 %	25 %	75 %	312194352
16018	NC_014666	GAC	2	6	557860	557865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194352
16019	NC_014666	GCC	2	6	557882	557887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16020	NC_014666	CGG	2	6	557922	557927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_014666	CG	3	6	557928	557933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16022	NC_014666	TAC	2	6	558013	558018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194353
16023	NC_014666	CGGG	2	8	558027	558034	0 %	0 %	75 %	25 %	312194353
16024	NC_014666	GGGT	2	8	558059	558066	0 %	25 %	75 %	0 %	312194353
16025	NC_014666	TGG	2	6	558086	558091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194353
16026	NC_014666	GAC	2	6	558111	558116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16027	NC_014666	GCT	2	6	558117	558122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16028	NC_014666	GCT	2	6	558126	558131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16029	NC_014666	GGCG	2	8	558132	558139	0 %	0 %	75 %	25 %	312194353
16030	NC_014666	CGG	2	6	558153	558158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16031	NC_014666	GCG	2	6	558173	558178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16032	NC_014666	GCA	2	6	558192	558197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16033	NC_014666	TCG	2	6	558200	558205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16034	NC_014666	CGA	2	6	558216	558221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16035	NC_014666	CTG	2	6	558238	558243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16036	NC_014666	GGCC	2	8	558276	558283	0 %	0 %	50 %	50 %	312194353
16037	NC_014666	ATG	2	6	558307	558312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194353
16038	NC_014666	CGA	3	9	558318	558326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16039	NC_014666	GGC	2	6	558327	558332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16040	NC_014666	GGC	2	6	558376	558381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16041	NC_014666	ACG	2	6	558383	558388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16042	NC_014666	CGG	2	6	558474	558479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16043	NC_014666	GCT	2	6	558507	558512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16044	NC_014666	TGC	3	9	558530	558538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16045	NC_014666	GCTG	2	8	558578	558585	0 %	25 %	50 %	25 %	312194353
16046	NC_014666	AGC	2	6	558590	558595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16047	NC_014666	GCT	2	6	558642	558647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16048	NC_014666	CGC	2	6	558654	558659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194353
16049	NC_014666	CGAGC	2	10	558678	558687	20 %	0 %	40 %	40 %	312194353
16050	NC_014666	CGG	2	6	558689	558694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16051	NC_014666	CGG	2	6	558714	558719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16052	NC_014666	CAG	2	6	558748	558753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16053	NC_014666	GAG	2	6	558769	558774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194353
16054	NC_014666	CGGC	2	8	558777	558784	0 %	0 %	50 %	50 %	312194353
16055	NC_014666	TCG	2	6	558818	558823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16056	NC_014666	GCA	2	6	558831	558836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16057	NC_014666	GC	3	6	558844	558849	0 %	0 %	50 %	50 %	312194353
16058	NC_014666	GGC	2	6	558876	558881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16059	NC_014666	GAG	2	6	558904	558909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194353
16060	NC_014666	CGC	2	6	558917	558922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194353
16061	NC_014666	GCC	2	6	558927	558932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194353
16062	NC_014666	GCC	2	6	558935	558940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194353
16063	NC_014666	GGC	2	6	558964	558969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194353
16064	NC_014666	CG	3	6	558982	558987	0 %	0 %	50 %	50 %	312194353
16065	NC_014666	CTG	2	6	559099	559104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16066	NC_014666	GCT	2	6	559107	559112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16067	NC_014666	GC	3	6	559156	559161	0 %	0 %	50 %	50 %	312194353
16068	NC_014666	ACGC	2	8	559186	559193	25 %	0 %	25 %	50 %	312194353
16069	NC_014666	TCG	2	6	559220	559225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
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16071	NC_014666	TGC	2	6	559274	559279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16072	NC_014666	CAG	2	6	559336	559341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16073	NC_014666	CTG	3	9	559357	559365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16074	NC_014666	GCA	2	6	559376	559381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16075	NC_014666	CTG	2	6	559387	559392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16076	NC_014666	CGA	2	6	559395	559400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194353
16077	NC_014666	CCGA	2	8	559402	559409	25 %	0 %	25 %	50 %	312194353
16078	NC_014666	CCG	2	6	559427	559432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194353
16079	NC_014666	CG	3	6	559500	559505	0 %	0 %	50 %	50 %	312194353
16080	NC_014666	GCCG	2	8	559673	559680	0 %	0 %	50 %	50 %	312194354
16081	NC_014666	CGG	2	6	559711	559716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
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16083	NC_014666	GCAG	2	8	559794	559801	25 %	0 %	50 %	25 %	312194354
16084	NC_014666	CAG	2	6	559811	559816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16085	NC_014666	CGC	3	9	559819	559827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194354
16086	NC_014666	CGG	4	12	559834	559845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
16087	NC_014666	GTC	3	9	559850	559858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16088	NC_014666	GGC	2	6	559865	559870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
16089	NC_014666	CG	3	6	559970	559975	0 %	0 %	50 %	50 %	312194354
16090	NC_014666	GC	3	6	559997	560002	0 %	0 %	50 %	50 %	312194354
16091	NC_014666	GTC	3	9	560003	560011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16092	NC_014666	TTC	2	6	560070	560075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312194354
16093	NC_014666	TCC	2	6	560092	560097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194354
16094	NC_014666	CGT	2	6	560146	560151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194354
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16096	NC_014666	GTG	2	6	560280	560285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194354
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16101	NC_014666	CGG	2	6	560416	560421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
16102	NC_014666	TCGCG	2	10	560464	560473	0 %	20 %	40 %	40 %	312194354
16103	NC_014666	GAT	2	6	560561	560566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194354
16104	NC_014666	TCG	2	6	560583	560588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16105	NC_014666	GTG	2	6	560627	560632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194354
16106	NC_014666	CGG	2	6	560633	560638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
16107	NC_014666	ACCGA	2	10	560661	560670	40 %	0 %	20 %	40 %	312194354
16108	NC_014666	GAC	2	6	560675	560680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16109	NC_014666	GGCCTG	2	12	560699	560710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312194354
16110	NC_014666	TGA	2	6	560719	560724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194354
16111	NC_014666	GCC	2	6	560735	560740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194354
16112	NC_014666	GGTG	2	8	560752	560759	0 %	25 %	75 %	0 %	312194354
16113	NC_014666	GTC	2	6	560771	560776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16114	NC_014666	CA	3	6	560828	560833	50 %	0 %	0 %	50 %	312194354
16115	NC_014666	CGT	2	6	560845	560850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194354
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16117	NC_014666	GGC	2	6	560909	560914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
16118	NC_014666	GC	3	6	560913	560918	0 %	0 %	50 %	50 %	312194354
16119	NC_014666	CCG	2	6	560921	560926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194354
16120	NC_014666	GCA	2	6	560932	560937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16121	NC_014666	ACG	2	6	560946	560951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194354
16122	NC_014666	CCGC	2	8	560962	560969	0 %	0 %	25 %	75 %	312194354
16123	NC_014666	CGG	2	6	560991	560996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194354
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16125	NC_014666	CGC	3	9	561110	561118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16126	NC_014666	CTG	2	6	561119	561124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16156	NC_014666	GCCG	2	8	562323	562330	0 %	0 %	50 %	50 %	312194356
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16227	NC_014666	GC	3	6	565301	565306	0 %	0 %	50 %	50 %	312194359
16228	NC_014666	GC	3	6	565309	565314	0 %	0 %	50 %	50 %	312194359
16229	NC_014666	CGG	2	6	565341	565346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194359
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16237	NC_014666	GTC	2	6	565522	565527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194359
16238	NC_014666	CGCGG	2	10	565558	565567	0 %	0 %	60 %	40 %	312194359
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16240	NC_014666	TCC	2	6	565661	565666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194359
16241	NC_014666	GC	4	8	565680	565687	0 %	0 %	50 %	50 %	312194359
16242	NC_014666	GCG	2	6	565754	565759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194359
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16244	NC_014666	TCG	2	6	565793	565798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194359
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16273	NC_014666	GC	3	6	566750	566755	0 %	0 %	50 %	50 %	312194359
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16289	NC_014666	CCGG	2	8	567279	567286	0 %	0 %	50 %	50 %	312194359
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16307	NC_014666	CGG	2	6	568101	568106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16308	NC_014666	TACCGG	2	12	568122	568133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16309	NC_014666	CGGC	2	8	568215	568222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16310	NC_014666	CGG	2	6	568282	568287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16311	NC_014666	CCG	2	6	568292	568297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16312	NC_014666	TCCCGA	2	12	568310	568321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16313	NC_014666	AGGC	2	8	568322	568329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16314	NC_014666	CGGCG	2	10	568388	568397	0 %	0 %	60 %	40 %	312194360
16315	NC_014666	CTG	2	6	568398	568403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194360
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16317	NC_014666	GCCG	2	8	568487	568494	0 %	0 %	50 %	50 %	312194360
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16332	NC_014666	CGT	2	6	569120	569125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194361
16333	NC_014666	CCTG	2	8	569152	569159	0 %	25 %	25 %	50 %	312194361
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16344	NC_014666	CGA	2	6	569474	569479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194361
16345	NC_014666	CG	3	6	569486	569491	0 %	0 %	50 %	50 %	312194361
16346	NC_014666	TGGC	2	8	569494	569501	0 %	25 %	50 %	25 %	312194361
16347	NC_014666	CGGG	2	8	569542	569549	0 %	0 %	75 %	25 %	312194361
16348	NC_014666	GCG	2	6	569587	569592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194361
16349	NC_014666	GAG	2	6	569718	569723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194362
16350	NC_014666	GGTG	2	8	569768	569775	0 %	25 %	75 %	0 %	312194362
16351	NC_014666	GGTC	2	8	569782	569789	0 %	25 %	50 %	25 %	312194362
16352	NC_014666	GAC	2	6	569810	569815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194362
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16355	NC_014666	AGC	2	6	569952	569957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194362
16356	NC_014666	GCA	2	6	569974	569979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194362
16357	NC_014666	GTCG	2	8	569981	569988	0 %	25 %	50 %	25 %	312194362
16358	NC_014666	CGG	2	6	570028	570033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194362
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16360	NC_014666	GGT	2	6	570059	570064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194362
16361	NC_014666	CGG	2	6	570083	570088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194362
16362	NC_014666	GC	3	6	570094	570099	0 %	0 %	50 %	50 %	312194362
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16365	NC_014666	GGC	2	6	570216	570221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194362
16366	NC_014666	CGT	2	6	570223	570228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194362
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