MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 259180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014666	GAG	2	6	484788	484793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_014666	CATG	2	8	484823	484830	25 %	25 %	25 %	25 %	312194287
14003	NC_014666	GGCC	2	8	484836	484843	0 %	0 %	50 %	50 %	312194287
14004	NC_014666	CCGG	2	8	484895	484902	0 %	0 %	50 %	50 %	312194287
14005	NC_014666	CTG	2	6	484920	484925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194287
14006	NC_014666	GCGG	2	8	484958	484965	0 %	0 %	75 %	25 %	312194287
14007	NC_014666	GCCA	2	8	485067	485074	25 %	0 %	25 %	50 %	312194287
14008	NC_014666	CGG	2	6	485095	485100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194287
14009	NC_014666	GAC	2	6	485112	485117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194287
14010	NC_014666	CG	3	6	485132	485137	0 %	0 %	50 %	50 %	312194287
14011	NC_014666	CCGG	2	8	485165	485172	0 %	0 %	50 %	50 %	312194287
14012	NC_014666	TCT	2	6	485221	485226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312194287
14013	NC_014666	CTGT	2	8	485279	485286	0 %	50 %	25 %	25 %	312194287
14014	NC_014666	CGGCGC	2	12	485299	485310	0 %	0 %	50 %	50 %	312194287
14015	NC_014666	GGC	2	6	485326	485331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194287
14016	NC_014666	CCG	2	6	485353	485358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194287
14017	NC_014666	CCA	2	6	485371	485376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194287
14018	NC_014666	CCG	2	6	485392	485397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194287
14019	NC_014666	CCGAG	2	10	485413	485422	20 %	0 %	40 %	40 %	312194287
14020	NC_014666	CGG	2	6	485492	485497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194287
14021	NC_014666	ACG	2	6	485506	485511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194287
14022	NC_014666	GGGCG	2	10	485528	485537	0 %	0 %	80 %	20 %	312194287
14023	NC_014666	GAGC	2	8	485613	485620	25 %	0 %	50 %	25 %	312194287
14024	NC_014666	C	7	7	485674	485680	0 %	0 %	0 %	100 %	312194287
14025	NC_014666	GAT	2	6	485696	485701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194287
14026	NC_014666	CAG	2	6	485706	485711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194287
14027	NC_014666	TAC	2	6	485718	485723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194287
14028	NC_014666	CGA	2	6	485794	485799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194287
14029	NC_014666	ACG	2	6	485838	485843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194287
14030	NC_014666	TGCCGG	2	12	485902	485913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312194287
14031	NC_014666	TGG	2	6	485951	485956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194287
14032	NC_014666	GACG	2	8	485962	485969	25 %	0 %	50 %	25 %	312194287
14033	NC_014666	CAC	2	6	485995	486000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194287
14034	NC_014666	GCG	2	6	486001	486006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194287
14035	NC_014666	GGCC	2	8	486014	486021	0 %	0 %	50 %	50 %	312194287
14036	NC_014666	GCC	2	6	486054	486059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194287
14037	NC_014666	GCTG	2	8	486095	486102	0 %	25 %	50 %	25 %	312194287
14038	NC_014666	GACC	2	8	486189	486196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_014666	GAG	2	6	486214	486219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_014666	GGACG	2	10	486220	486229	20 %	0 %	60 %	20 %	312194288
14041	NC_014666	CGGCGT	2	12	486260	486271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312194288
14042	NC_014666	GCGCGG	2	12	486335	486346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14043	NC_014666	CGG	3	9	486344	486352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14044	NC_014666	GC	3	6	486377	486382	0 %	0 %	50 %	50 %	312194288
14045	NC_014666	GCT	2	6	486390	486395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14046	NC_014666	GCT	2	6	486405	486410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14047	NC_014666	TCG	2	6	486424	486429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14048	NC_014666	ATC	2	6	486496	486501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194288
14049	NC_014666	CGC	2	6	486594	486599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194288
14050	NC_014666	CGC	2	6	486654	486659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194288
14051	NC_014666	TGC	2	6	486665	486670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14052	NC_014666	TGC	2	6	486713	486718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14053	NC_014666	CGG	2	6	486729	486734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14054	NC_014666	CGG	2	6	486755	486760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14055	NC_014666	CGG	2	6	486804	486809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14056	NC_014666	CTG	3	9	486811	486819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14057	NC_014666	GCG	2	6	486830	486835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14058	NC_014666	GC	3	6	486878	486883	0 %	0 %	50 %	50 %	312194288
14059	NC_014666	CGC	2	6	486891	486896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194288
14060	NC_014666	CCG	2	6	486900	486905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194288
14061	NC_014666	GCCG	2	8	486909	486916	0 %	0 %	50 %	50 %	312194288
14062	NC_014666	C	6	6	486924	486929	0 %	0 %	0 %	100 %	312194288
14063	NC_014666	GCCCG	2	10	486943	486952	0 %	0 %	40 %	60 %	312194288
14064	NC_014666	CTGCTC	2	12	486964	486975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312194288
14065	NC_014666	CGC	2	6	487034	487039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194288
14066	NC_014666	GTC	2	6	487072	487077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14067	NC_014666	TG	3	6	487172	487177	0 %	50 %	50 %	0 %	312194288
14068	NC_014666	GGC	2	6	487191	487196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14069	NC_014666	TCG	2	6	487211	487216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14070	NC_014666	TGA	2	6	487256	487261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194288
14071	NC_014666	GCT	2	6	487272	487277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14072	NC_014666	TGG	3	9	487376	487384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194288
14073	NC_014666	CG	3	6	487453	487458	0 %	0 %	50 %	50 %	312194288
14074	NC_014666	GCTGGT	2	12	487485	487496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	312194288
14075	NC_014666	AGC	2	6	487520	487525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14076	NC_014666	CGT	2	6	487551	487556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14077	NC_014666	TCG	2	6	487589	487594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194288
14078	NC_014666	CGG	2	6	487609	487614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194288
14079	NC_014666	TCA	2	6	487661	487666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194288
14080	NC_014666	CGC	2	6	487692	487697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194288
14081	NC_014666	CCTC	2	8	487704	487711	0 %	25 %	0 %	75 %	312194288
14082	NC_014666	GCCGC	2	10	487713	487722	0 %	0 %	40 %	60 %	312194288
14083	NC_014666	GGGC	2	8	487765	487772	0 %	0 %	75 %	25 %	312194289
14084	NC_014666	AGCG	2	8	487791	487798	25 %	0 %	50 %	25 %	312194289
14085	NC_014666	CG	3	6	487797	487802	0 %	0 %	50 %	50 %	312194289
14086	NC_014666	GTC	2	6	487863	487868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14087	NC_014666	CGG	2	6	487888	487893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194289
14088	NC_014666	GCC	2	6	487920	487925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194289
14089	NC_014666	CAC	2	6	487937	487942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194289
14090	NC_014666	GC	4	8	487997	488004	0 %	0 %	50 %	50 %	312194289
14091	NC_014666	GCT	2	6	488006	488011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14092	NC_014666	GATG	2	8	488014	488021	25 %	25 %	50 %	0 %	312194289
14093	NC_014666	GCC	2	6	488028	488033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194289
14094	NC_014666	TCG	2	6	488061	488066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14095	NC_014666	CCG	2	6	488079	488084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194289
14096	NC_014666	GGCG	2	8	488086	488093	0 %	0 %	75 %	25 %	312194289
14097	NC_014666	GGACG	2	10	488146	488155	20 %	0 %	60 %	20 %	312194289
14098	NC_014666	CCA	2	6	488197	488202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194289
14099	NC_014666	GAC	2	6	488207	488212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14100	NC_014666	CGA	2	6	488230	488235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14101	NC_014666	GCG	2	6	488307	488312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194289
14102	NC_014666	CCG	2	6	488348	488353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194289
14103	NC_014666	AGCC	2	8	488449	488456	25 %	0 %	25 %	50 %	312194289
14104	NC_014666	AAG	2	6	488534	488539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194289
14105	NC_014666	C	6	6	488569	488574	0 %	0 %	0 %	100 %	312194289
14106	NC_014666	GCTCCG	2	12	488595	488606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312194289
14107	NC_014666	CAGC	2	8	488644	488651	25 %	0 %	25 %	50 %	312194289
14108	NC_014666	GAC	2	6	488654	488659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14109	NC_014666	GTC	2	6	488708	488713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14110	NC_014666	GTC	2	6	488750	488755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194289
14111	NC_014666	GGA	2	6	488782	488787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194289
14112	NC_014666	GC	3	6	488856	488861	0 %	0 %	50 %	50 %	312194290
14113	NC_014666	CCT	2	6	488892	488897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194290
14114	NC_014666	GCCG	2	8	488898	488905	0 %	0 %	50 %	50 %	312194290
14115	NC_014666	CCG	2	6	488910	488915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194290
14116	NC_014666	GTA	2	6	488947	488952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194290
14117	NC_014666	GCG	2	6	488953	488958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194290
14118	NC_014666	CCTGC	2	10	488962	488971	0 %	20 %	20 %	60 %	312194290
14119	NC_014666	CGA	2	6	489009	489014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194290
14120	NC_014666	CCCTG	2	10	489057	489066	0 %	20 %	20 %	60 %	312194290
14121	NC_014666	CGA	2	6	489087	489092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194290
14122	NC_014666	GAA	2	6	489136	489141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194290
14123	NC_014666	AT	4	8	489180	489187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_014666	GGCG	2	8	489265	489272	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14125	NC_014666	GTC	2	6	489320	489325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_014666	GCG	2	6	489347	489352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_014666	CCGG	2	8	489353	489360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14128	NC_014666	CGG	2	6	489365	489370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_014666	CGG	2	6	489401	489406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194291
14130	NC_014666	CTG	2	6	489418	489423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
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14133	NC_014666	CGCGG	2	10	489468	489477	0 %	0 %	60 %	40 %	312194291
14134	NC_014666	GCT	2	6	489507	489512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
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14139	NC_014666	TCG	2	6	489626	489631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
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14142	NC_014666	CTG	2	6	489784	489789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
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14145	NC_014666	ACC	2	6	489895	489900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194291
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14150	NC_014666	GGT	2	6	490023	490028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194291
14151	NC_014666	GGCTC	2	10	490031	490040	0 %	20 %	40 %	40 %	312194291
14152	NC_014666	CGC	2	6	490077	490082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194291
14153	NC_014666	GTC	2	6	490102	490107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
14154	NC_014666	CGGC	2	8	490120	490127	0 %	0 %	50 %	50 %	312194291
14155	NC_014666	CTG	2	6	490159	490164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
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14158	NC_014666	GTC	2	6	490294	490299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194291
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14176	NC_014666	CACG	2	8	490914	490921	25 %	0 %	25 %	50 %	312194291
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14199	NC_014666	CG	3	6	491881	491886	0 %	0 %	50 %	50 %	312194291
14200	NC_014666	CGC	2	6	491989	491994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194292
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14204	NC_014666	GGCC	2	8	492078	492085	0 %	0 %	50 %	50 %	312194292
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14224	NC_014666	GCA	2	6	492708	492713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194292
14225	NC_014666	GTG	2	6	492721	492726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194292
14226	NC_014666	CGTG	2	8	492729	492736	0 %	25 %	50 %	25 %	312194292
14227	NC_014666	GAC	2	6	492796	492801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14228	NC_014666	CTG	2	6	492821	492826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14229	NC_014666	GAC	2	6	492944	492949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194293
14230	NC_014666	GCC	3	9	493020	493028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194293
14231	NC_014666	GGCC	2	8	493033	493040	0 %	0 %	50 %	50 %	312194293
14232	NC_014666	GGT	2	6	493082	493087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194293
14233	NC_014666	GGCG	2	8	493126	493133	0 %	0 %	75 %	25 %	312194293
14234	NC_014666	AGG	2	6	493135	493140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194293
14235	NC_014666	ACG	2	6	493167	493172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194293
14236	NC_014666	CTCCTG	2	12	493236	493247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312194293
14237	NC_014666	GAT	2	6	493283	493288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194293
14238	NC_014666	CG	3	6	493306	493311	0 %	0 %	50 %	50 %	312194293
14239	NC_014666	CGG	2	6	493316	493321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194293
14240	NC_014666	GTG	2	6	493347	493352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194293
14241	NC_014666	CG	3	6	493422	493427	0 %	0 %	50 %	50 %	312194293
14242	NC_014666	CGG	2	6	493458	493463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194293
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14483	NC_014666	GGC	2	6	501943	501948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194303
14484	NC_014666	CCG	2	6	502191	502196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14485	NC_014666	TG	3	6	502247	502252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14487	NC_014666	GTCG	2	8	502310	502317	0 %	25 %	50 %	25 %	312194304
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14491	NC_014666	CGGC	2	8	502409	502416	0 %	0 %	50 %	50 %	312194304
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