MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 259180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_014666	ACG	2	6	416335	416340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194230
12002	NC_014666	GGCC	2	8	416372	416379	0 %	0 %	50 %	50 %	312194230
12003	NC_014666	CCG	2	6	416396	416401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194230
12004	NC_014666	GTC	2	6	416486	416491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194230
12005	NC_014666	GGT	2	6	416495	416500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194230
12006	NC_014666	CGG	2	6	416511	416516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194230
12007	NC_014666	GCC	2	6	416521	416526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194230
12008	NC_014666	ACG	2	6	416577	416582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194230
12009	NC_014666	CTC	2	6	416621	416626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194230
12010	NC_014666	CGC	2	6	416644	416649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194230
12011	NC_014666	GCG	2	6	416667	416672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194230
12012	NC_014666	GAA	2	6	416705	416710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194230
12013	NC_014666	GCC	2	6	416763	416768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194230
12014	NC_014666	CTT	2	6	416813	416818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312194230
12015	NC_014666	CGA	2	6	416848	416853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194230
12016	NC_014666	GCG	2	6	416863	416868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194230
12017	NC_014666	CCG	2	6	416927	416932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194230
12018	NC_014666	CCG	2	6	416936	416941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194230
12019	NC_014666	GCG	2	6	416953	416958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194230
12020	NC_014666	TGCC	2	8	416978	416985	0 %	25 %	25 %	50 %	312194230
12021	NC_014666	TGCC	2	8	416993	417000	0 %	25 %	25 %	50 %	312194230
12022	NC_014666	TGCC	2	8	417008	417015	0 %	25 %	25 %	50 %	312194230
12023	NC_014666	TGCC	2	8	417023	417030	0 %	25 %	25 %	50 %	312194230
12024	NC_014666	TGGC	2	8	417070	417077	0 %	25 %	50 %	25 %	312194230
12025	NC_014666	GAGCC	2	10	417080	417089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12026	NC_014666	TCC	2	6	417093	417098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12027	NC_014666	GGC	2	6	417131	417136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12028	NC_014666	CGGA	2	8	417149	417156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12029	NC_014666	CGGT	2	8	417158	417165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12030	NC_014666	GC	3	6	417183	417188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12031	NC_014666	GGT	2	6	417202	417207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_014666	GCC	2	6	417219	417224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194231
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12035	NC_014666	TCG	2	6	417312	417317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194231
12036	NC_014666	CGG	2	6	417361	417366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194231
12037	NC_014666	AGC	2	6	417411	417416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194231
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12039	NC_014666	TGG	2	6	417462	417467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_014666	ACG	2	6	417468	417473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_014666	CCG	2	6	417529	417534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12042	NC_014666	ACT	2	6	417561	417566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12045	NC_014666	GACCGC	2	12	417936	417947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312194232
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12047	NC_014666	GCT	3	9	418032	418040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194232
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12050	NC_014666	GCT	2	6	418128	418133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194232
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12053	NC_014666	CAA	2	6	418257	418262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312194232
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12055	NC_014666	TGC	2	6	418319	418324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194232
12056	NC_014666	CGC	2	6	418345	418350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194232
12057	NC_014666	GCCG	2	8	418364	418371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12058	NC_014666	CGGC	2	8	418376	418383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12059	NC_014666	TCCGC	2	10	418387	418396	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12060	NC_014666	TCG	2	6	418449	418454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12062	NC_014666	GTC	2	6	418478	418483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12064	NC_014666	GT	3	6	418515	418520	0 %	50 %	50 %	0 %	312194233
12065	NC_014666	GT	3	6	418533	418538	0 %	50 %	50 %	0 %	312194233
12066	NC_014666	CG	4	8	418591	418598	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
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12070	NC_014666	CGGTCG	2	12	418672	418683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312194233
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12072	NC_014666	GC	4	8	418693	418700	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12073	NC_014666	GCC	2	6	418715	418720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194233
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12082	NC_014666	CAG	2	6	418898	418903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12083	NC_014666	GCTC	2	8	418912	418919	0 %	25 %	25 %	50 %	312194233
12084	NC_014666	GCA	2	6	418936	418941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12086	NC_014666	GCCG	2	8	418960	418967	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12087	NC_014666	CGGGCG	2	12	418968	418979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
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12089	NC_014666	TCG	2	6	419076	419081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12091	NC_014666	GC	3	6	419128	419133	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12092	NC_014666	CGA	2	6	419134	419139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12093	NC_014666	GGCC	2	8	419146	419153	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12094	NC_014666	CCG	2	6	419268	419273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194233
12095	NC_014666	CGCGG	2	10	419288	419297	0 %	0 %	60 %	40 %	312194233
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12097	NC_014666	CGG	2	6	419338	419343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
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12099	NC_014666	GCGCCC	2	12	419425	419436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194233
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12105	NC_014666	TGC	2	6	419595	419600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12106	NC_014666	CG	3	6	419617	419622	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12107	NC_014666	GTC	2	6	419624	419629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12108	NC_014666	CGG	2	6	419634	419639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
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12110	NC_014666	GCG	2	6	419688	419693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
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12112	NC_014666	GTC	2	6	419741	419746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12119	NC_014666	CGGTG	2	10	420022	420031	0 %	20 %	60 %	20 %	312194233
12120	NC_014666	GTC	2	6	420032	420037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12121	NC_014666	GGC	2	6	420047	420052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
12122	NC_014666	GCA	2	6	420064	420069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12123	NC_014666	CG	3	6	420088	420093	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12124	NC_014666	TCGG	2	8	420108	420115	0 %	25 %	50 %	25 %	312194233
12125	NC_014666	CGA	2	6	420128	420133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12126	NC_014666	GTGG	2	8	420158	420165	0 %	25 %	75 %	0 %	312194233
12127	NC_014666	CGA	2	6	420166	420171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
12128	NC_014666	GCGG	2	8	420218	420225	0 %	0 %	75 %	25 %	312194233
12129	NC_014666	GCGCC	2	10	420236	420245	0 %	0 %	40 %	60 %	312194233
12130	NC_014666	GC	3	6	420364	420369	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12131	NC_014666	CTC	2	6	420392	420397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194233
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12134	NC_014666	CGG	3	9	420439	420447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
12135	NC_014666	GTC	2	6	420479	420484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12138	NC_014666	GCCT	2	8	420591	420598	0 %	25 %	25 %	50 %	312194233
12139	NC_014666	CAG	2	6	420620	420625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12143	NC_014666	GC	3	6	420691	420696	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12144	NC_014666	CCG	2	6	420708	420713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194233
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12151	NC_014666	CGA	2	6	420838	420843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12153	NC_014666	GCG	2	6	420867	420872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
12154	NC_014666	GTC	2	6	420899	420904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194233
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12162	NC_014666	GCG	2	6	421240	421245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194233
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12186	NC_014666	GC	3	6	422102	422107	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12187	NC_014666	CGGC	2	8	422116	422123	0 %	0 %	50 %	50 %	312194233
12188	NC_014666	C	6	6	422150	422155	0 %	0 %	0 %	100 %	312194233
12189	NC_014666	GC	3	6	422260	422265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12190	NC_014666	GGAG	2	8	422335	422342	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12191	NC_014666	CGC	2	6	422351	422356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12192	NC_014666	G	9	9	422511	422519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12193	NC_014666	GC	3	6	422535	422540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12194	NC_014666	CGG	2	6	422549	422554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12195	NC_014666	CGGA	2	8	422610	422617	25 %	0 %	50 %	25 %	312194234
12196	NC_014666	CGG	2	6	422623	422628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194234
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12225	NC_014666	CGG	2	6	423543	423548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194235
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12228	NC_014666	CG	3	6	423640	423645	0 %	0 %	50 %	50 %	312194235
12229	NC_014666	CGG	2	6	423715	423720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194235
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12231	NC_014666	CGG	2	6	423823	423828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194235
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12233	NC_014666	GCG	2	6	423859	423864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194235
12234	NC_014666	AGC	2	6	423905	423910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194235
12235	NC_014666	CAG	2	6	423940	423945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194235
12236	NC_014666	GGCCG	2	10	424036	424045	0 %	0 %	60 %	40 %	312194235
12237	NC_014666	CTC	2	6	424063	424068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194235
12238	NC_014666	CCG	2	6	424083	424088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194235
12239	NC_014666	GC	3	6	424140	424145	0 %	0 %	50 %	50 %	312194235
12240	NC_014666	CGGG	2	8	424149	424156	0 %	0 %	75 %	25 %	312194235
12241	NC_014666	CCG	2	6	424185	424190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194235
12242	NC_014666	GCC	2	6	424201	424206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194235
12243	NC_014666	GAC	2	6	424255	424260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194235
12244	NC_014666	GCC	2	6	424273	424278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194235
12245	NC_014666	GCA	3	9	424290	424298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194235
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12251	NC_014666	CTCGAC	2	12	424504	424515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312194236
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12353	NC_014666	CG	3	6	427731	427736	0 %	0 %	50 %	50 %	312194239
12354	NC_014666	CGG	2	6	427782	427787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12355	NC_014666	CG	4	8	427855	427862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12356	NC_014666	GTG	2	6	427899	427904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12357	NC_014666	GGT	2	6	427920	427925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194240
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12485	NC_014666	CTGG	2	8	432238	432245	0 %	25 %	50 %	25 %	312194243
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12488	NC_014666	CGC	2	6	432339	432344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194243
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