MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 259180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014666	CAC	2	6	346189	346194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194167
10002	NC_014666	CGCGG	2	10	346231	346240	0 %	0 %	60 %	40 %	312194167
10003	NC_014666	CGG	2	6	346308	346313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194167
10004	NC_014666	CGG	2	6	346322	346327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194167
10005	NC_014666	GCC	2	6	346349	346354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194167
10006	NC_014666	CGG	2	6	346374	346379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194167
10007	NC_014666	CGC	2	6	346414	346419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194167
10008	NC_014666	CCT	2	6	346470	346475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194167
10009	NC_014666	TCG	2	6	346476	346481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194167
10010	NC_014666	TCG	2	6	346534	346539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10011	NC_014666	GGCC	2	8	346547	346554	0 %	0 %	50 %	50 %	312194168
10012	NC_014666	CGT	2	6	346597	346602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10013	NC_014666	CGG	2	6	346604	346609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194168
10014	NC_014666	GCA	2	6	346613	346618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10015	NC_014666	CGGCAC	2	12	346625	346636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312194168
10016	NC_014666	GTC	2	6	346650	346655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10017	NC_014666	TCG	2	6	346657	346662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10018	NC_014666	GGTC	2	8	346679	346686	0 %	25 %	50 %	25 %	312194168
10019	NC_014666	ACG	2	6	346687	346692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10020	NC_014666	GGC	2	6	346712	346717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194168
10021	NC_014666	GC	3	6	346724	346729	0 %	0 %	50 %	50 %	312194168
10022	NC_014666	CGC	2	6	346818	346823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194168
10023	NC_014666	GTC	3	9	346824	346832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10024	NC_014666	GCC	2	6	346881	346886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194168
10025	NC_014666	ACC	2	6	346954	346959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194168
10026	NC_014666	GGT	2	6	347039	347044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194168
10027	NC_014666	GCC	2	6	347089	347094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194168
10028	NC_014666	CGGC	2	8	347099	347106	0 %	0 %	50 %	50 %	312194168
10029	NC_014666	TGC	2	6	347116	347121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10030	NC_014666	GCC	2	6	347137	347142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194168
10031	NC_014666	CTG	2	6	347166	347171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10032	NC_014666	CGA	2	6	347177	347182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10033	NC_014666	GCCGC	2	10	347211	347220	0 %	0 %	40 %	60 %	312194168
10034	NC_014666	GTC	3	9	347268	347276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194168
10035	NC_014666	CGGGC	2	10	347323	347332	0 %	0 %	60 %	40 %	312194169
10036	NC_014666	CG	3	6	347333	347338	0 %	0 %	50 %	50 %	312194169
10037	NC_014666	CGCCGG	2	12	347377	347388	0 %	0 %	50 %	50 %	312194169
10038	NC_014666	CAGGT	2	10	347430	347439	20 %	20 %	40 %	20 %	312194169
10039	NC_014666	GCGG	2	8	347463	347470	0 %	0 %	75 %	25 %	312194169
10040	NC_014666	GCT	2	6	347497	347502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194169
10041	NC_014666	CGG	2	6	347521	347526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194169
10042	NC_014666	GTC	2	6	347543	347548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194169
10043	NC_014666	GAG	2	6	347549	347554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194169
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10045	NC_014666	CGG	2	6	347590	347595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194169
10046	NC_014666	GCT	2	6	347597	347602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194169
10047	NC_014666	GCG	2	6	347627	347632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194170
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10049	NC_014666	CAG	2	6	347666	347671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194170
10050	NC_014666	CCGG	2	8	347687	347694	0 %	0 %	50 %	50 %	312194170
10051	NC_014666	TCG	2	6	347729	347734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194170
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10053	NC_014666	CAG	2	6	347845	347850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194170
10054	NC_014666	GC	3	6	347855	347860	0 %	0 %	50 %	50 %	312194170
10055	NC_014666	CGG	2	6	347861	347866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194170
10056	NC_014666	CAG	2	6	347876	347881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194170
10057	NC_014666	GCG	2	6	347923	347928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194170
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10065	NC_014666	GCT	2	6	348053	348058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194170
10066	NC_014666	CGGG	2	8	348061	348068	0 %	0 %	75 %	25 %	312194170
10067	NC_014666	TCC	2	6	348093	348098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_014666	CGGG	2	8	348148	348155	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10069	NC_014666	GAC	2	6	348245	348250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194171
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10071	NC_014666	GC	5	10	348287	348296	0 %	0 %	50 %	50 %	312194171
10072	NC_014666	CGA	2	6	348311	348316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194171
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10074	NC_014666	CG	3	6	348451	348456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10075	NC_014666	GACG	2	8	348461	348468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_014666	TCGG	2	8	348509	348516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_014666	ACGG	2	8	348540	348547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_014666	TGG	2	6	348677	348682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10085	NC_014666	GCGT	2	8	348855	348862	0 %	25 %	50 %	25 %	312194172
10086	NC_014666	CGCGT	2	10	348944	348953	0 %	20 %	40 %	40 %	312194172
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10088	NC_014666	AGA	2	6	349029	349034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194172
10089	NC_014666	CCTC	2	8	349072	349079	0 %	25 %	0 %	75 %	312194172
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10100	NC_014666	GGC	2	6	349578	349583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_014666	GAC	2	6	349624	349629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_014666	TGG	2	6	349630	349635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014666	GGCCG	2	10	349640	349649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10104	NC_014666	GAC	2	6	349677	349682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194173
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10107	NC_014666	GGCC	2	8	349799	349806	0 %	0 %	50 %	50 %	312194173
10108	NC_014666	GCGG	2	8	349856	349863	0 %	0 %	75 %	25 %	312194173
10109	NC_014666	GCCG	2	8	349886	349893	0 %	0 %	50 %	50 %	312194173
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10113	NC_014666	CGGCG	2	10	349956	349965	0 %	0 %	60 %	40 %	312194173
10114	NC_014666	ACG	2	6	349966	349971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194173
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10119	NC_014666	ACC	2	6	350161	350166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194173
10120	NC_014666	GC	3	6	350216	350221	0 %	0 %	50 %	50 %	312194173
10121	NC_014666	CGGGGA	2	12	350234	350245	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	312194173
10122	NC_014666	GC	4	8	350309	350316	0 %	0 %	50 %	50 %	312194173
10123	NC_014666	CCA	2	6	350393	350398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194173
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10125	NC_014666	ACC	2	6	350443	350448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194173
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10140	NC_014666	CGT	2	6	351223	351228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10157	NC_014666	GCCG	2	8	351678	351685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10187	NC_014666	GGCT	2	8	352612	352619	0 %	25 %	50 %	25 %	312194176
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10226	NC_014666	GCC	2	6	354084	354089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10228	NC_014666	CAG	2	6	354140	354145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10229	NC_014666	CGGC	3	12	354168	354179	0 %	0 %	50 %	50 %	312194177
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10231	NC_014666	CAG	2	6	354199	354204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194177
10232	NC_014666	GCCGG	2	10	354237	354246	0 %	0 %	60 %	40 %	312194177
10233	NC_014666	GGCA	2	8	354247	354254	25 %	0 %	50 %	25 %	312194177
10234	NC_014666	GCG	2	6	354275	354280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194177
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10237	NC_014666	TCGT	2	8	354394	354401	0 %	50 %	25 %	25 %	312194177
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10239	NC_014666	CCG	2	6	354440	354445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10240	NC_014666	TGG	2	6	354516	354521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194178
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10242	NC_014666	CG	3	6	354538	354543	0 %	0 %	50 %	50 %	312194178
10243	NC_014666	CG	3	6	354548	354553	0 %	0 %	50 %	50 %	312194178
10244	NC_014666	GCC	2	6	354561	354566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194178
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10357	NC_014666	GAT	2	6	357765	357770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194180
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10363	NC_014666	CGG	2	6	357968	357973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194180
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10470	NC_014666	CGA	2	6	361632	361637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10472	NC_014666	GCGGG	2	10	361745	361754	0 %	0 %	80 %	20 %	312194184
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10477	NC_014666	CGAC	2	8	361927	361934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10478	NC_014666	CGT	2	6	361992	361997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10483	NC_014666	CGT	2	6	362134	362139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194185
10484	NC_014666	CGC	3	9	362190	362198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194185
10485	NC_014666	CAT	2	6	362212	362217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194185
10486	NC_014666	CGGGC	2	10	362251	362260	0 %	0 %	60 %	40 %	312194185
10487	NC_014666	GC	3	6	362292	362297	0 %	0 %	50 %	50 %	312194185
10488	NC_014666	CGG	3	9	362305	362313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194185
10489	NC_014666	CGA	2	6	362319	362324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194185
10490	NC_014666	GTC	3	9	362327	362335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194185
10491	NC_014666	CCG	2	6	362337	362342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194185
10492	NC_014666	GCC	2	6	362359	362364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194185
10493	NC_014666	CCG	2	6	362382	362387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194185
10494	NC_014666	CTC	2	6	362444	362449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194185
10495	NC_014666	CGG	2	6	362473	362478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194185
10496	NC_014666	CGA	2	6	362544	362549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194185
10497	NC_014666	CGG	2	6	362550	362555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194185
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10499	NC_014666	GCGCG	2	10	362659	362668	0 %	0 %	60 %	40 %	312194185
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