MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 259180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014666	CCG	2	6	291321	291326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194113
8502	NC_014666	CGG	2	6	291355	291360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194113
8503	NC_014666	AGG	2	6	291380	291385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194113
8504	NC_014666	GGC	2	6	291390	291395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194113
8505	NC_014666	TCG	2	6	291419	291424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194113
8506	NC_014666	GCTGAT	2	12	291468	291479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312194113
8507	NC_014666	CCGCGA	2	12	291498	291509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312194113
8508	NC_014666	GCGAC	2	10	291512	291521	20 %	0 %	40 %	40 %	312194113
8509	NC_014666	C	6	6	291597	291602	0 %	0 %	0 %	100 %	312194113
8510	NC_014666	GAC	2	6	291610	291615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194113
8511	NC_014666	GAG	2	6	291628	291633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194113
8512	NC_014666	GAC	2	6	291673	291678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194113
8513	NC_014666	CAT	2	6	291687	291692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194113
8514	NC_014666	CGCT	2	8	291694	291701	0 %	25 %	25 %	50 %	312194113
8515	NC_014666	CCGG	2	8	291710	291717	0 %	0 %	50 %	50 %	312194113
8516	NC_014666	G	6	6	291716	291721	0 %	0 %	100 %	0 %	312194113
8517	NC_014666	CGC	2	6	291727	291732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194113
8518	NC_014666	GCC	2	6	291743	291748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194113
8519	NC_014666	GCCTC	2	10	291752	291761	0 %	20 %	20 %	60 %	312194113
8520	NC_014666	CGTC	2	8	291762	291769	0 %	25 %	25 %	50 %	312194113
8521	NC_014666	CGA	2	6	291798	291803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194113
8522	NC_014666	GGC	2	6	291811	291816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194113
8523	NC_014666	CGA	2	6	292062	292067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_014666	TCGG	2	8	292095	292102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_014666	CGG	2	6	292130	292135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_014666	CA	3	6	292178	292183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8527	NC_014666	CAC	2	6	292216	292221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194114
8528	NC_014666	CGT	2	6	292228	292233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8529	NC_014666	GTG	2	6	292248	292253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194114
8530	NC_014666	GAA	2	6	292315	292320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194114
8531	NC_014666	CGGT	2	8	292385	292392	0 %	25 %	50 %	25 %	312194114
8532	NC_014666	ACA	2	6	292431	292436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312194114
8533	NC_014666	GCA	2	6	292450	292455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8534	NC_014666	TCA	2	6	292530	292535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194114
8535	NC_014666	CGA	2	6	292552	292557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8536	NC_014666	CCG	2	6	292632	292637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194114
8537	NC_014666	CGG	2	6	292699	292704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194114
8538	NC_014666	CTG	2	6	292724	292729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8539	NC_014666	CGT	2	6	292744	292749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8540	NC_014666	CCAC	2	8	292761	292768	25 %	0 %	0 %	75 %	312194114
8541	NC_014666	CGG	2	6	292783	292788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194114
8542	NC_014666	GAC	2	6	292790	292795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8543	NC_014666	ACC	2	6	292815	292820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194114
8544	NC_014666	GGC	2	6	292894	292899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194114
8545	NC_014666	CAG	2	6	293063	293068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8546	NC_014666	CGT	2	6	293110	293115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8547	NC_014666	TCG	2	6	293118	293123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8548	NC_014666	GCCG	2	8	293140	293147	0 %	0 %	50 %	50 %	312194114
8549	NC_014666	TCG	2	6	293148	293153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8550	NC_014666	CGG	2	6	293173	293178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194114
8551	NC_014666	GTC	2	6	293213	293218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8552	NC_014666	CTG	2	6	293273	293278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8553	NC_014666	CAT	2	6	293323	293328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194114
8554	NC_014666	CGA	2	6	293361	293366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8555	NC_014666	ACG	2	6	293384	293389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8556	NC_014666	CCGT	2	8	293405	293412	0 %	25 %	25 %	50 %	312194114
8557	NC_014666	GGC	2	6	293446	293451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194114
8558	NC_014666	ACA	2	6	293454	293459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312194114
8559	NC_014666	CG	3	6	293502	293507	0 %	0 %	50 %	50 %	312194114
8560	NC_014666	CGG	2	6	293611	293616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194114
8561	NC_014666	GGA	3	9	293674	293682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194114
8562	NC_014666	AGC	2	6	293685	293690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8563	NC_014666	GAG	2	6	293696	293701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194114
8564	NC_014666	GAG	2	6	293801	293806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194114
8565	NC_014666	GC	3	6	293821	293826	0 %	0 %	50 %	50 %	312194114
8566	NC_014666	CGC	2	6	293848	293853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194114
8567	NC_014666	GAG	2	6	293870	293875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194114
8568	NC_014666	CGGC	2	8	293937	293944	0 %	0 %	50 %	50 %	312194114
8569	NC_014666	CGA	3	9	293965	293973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8570	NC_014666	GTG	2	6	293975	293980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194114
8571	NC_014666	TCG	2	6	293991	293996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194114
8572	NC_014666	GAG	2	6	293999	294004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194114
8573	NC_014666	CGC	2	6	294020	294025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194115
8574	NC_014666	CCG	2	6	294049	294054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194115
8575	NC_014666	GTG	2	6	294058	294063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194115
8576	NC_014666	CGG	2	6	294070	294075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8577	NC_014666	GGC	3	9	294111	294119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8578	NC_014666	CGG	3	9	294143	294151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8579	NC_014666	GGC	2	6	294156	294161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8580	NC_014666	CGG	2	6	294165	294170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8581	NC_014666	GCT	2	6	294195	294200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194115
8582	NC_014666	CCG	3	9	294282	294290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194115
8583	NC_014666	GCT	2	6	294336	294341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194115
8584	NC_014666	TGC	2	6	294350	294355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194115
8585	NC_014666	GAC	2	6	294364	294369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194115
8586	NC_014666	TGC	2	6	294497	294502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194115
8587	NC_014666	GGC	2	6	294583	294588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8588	NC_014666	CCG	2	6	294644	294649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194115
8589	NC_014666	CGG	2	6	294653	294658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194115
8590	NC_014666	CGC	2	6	294671	294676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194115
8591	NC_014666	GAC	2	6	294682	294687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194115
8592	NC_014666	CTCG	2	8	294746	294753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8593	NC_014666	AG	3	6	294828	294833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_014666	ACT	2	6	294872	294877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194116
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8596	NC_014666	AAG	2	6	294922	294927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194116
8597	NC_014666	GC	3	6	294991	294996	0 %	0 %	50 %	50 %	312194116
8598	NC_014666	ACG	2	6	295019	295024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194116
8599	NC_014666	CGA	2	6	295032	295037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194116
8600	NC_014666	ACG	2	6	295055	295060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194116
8601	NC_014666	CGG	2	6	295095	295100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8602	NC_014666	CGG	3	9	295122	295130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8603	NC_014666	GCGG	2	8	295159	295166	0 %	0 %	75 %	25 %	312194116
8604	NC_014666	CGG	2	6	295173	295178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8605	NC_014666	CTC	2	6	295179	295184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194116
8606	NC_014666	CGG	2	6	295185	295190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8607	NC_014666	CGG	2	6	295212	295217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8608	NC_014666	GCC	2	6	295348	295353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194116
8609	NC_014666	CCGG	2	8	295383	295390	0 %	0 %	50 %	50 %	312194116
8610	NC_014666	ACC	2	6	295508	295513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194116
8611	NC_014666	GCC	2	6	295538	295543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194116
8612	NC_014666	AGC	2	6	295553	295558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194116
8613	NC_014666	GCATCC	2	12	295559	295570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312194116
8614	NC_014666	CCG	2	6	295571	295576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194116
8615	NC_014666	GCG	2	6	295631	295636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8616	NC_014666	GCC	2	6	295803	295808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194116
8617	NC_014666	GCG	2	6	295865	295870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194116
8618	NC_014666	CAG	2	6	296011	296016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194116
8619	NC_014666	GGCCG	2	10	296051	296060	0 %	0 %	60 %	40 %	312194117
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8621	NC_014666	GCC	2	6	296071	296076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194117
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8745	NC_014666	GCCA	2	8	300238	300245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8748	NC_014666	GCG	2	6	300380	300385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8871	NC_014666	CGGA	2	8	304977	304984	25 %	0 %	50 %	25 %	312194124
8872	NC_014666	ACCT	2	8	305168	305175	25 %	25 %	0 %	50 %	312194125
8873	NC_014666	TCA	2	6	305250	305255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194125
8874	NC_014666	CGA	3	9	305290	305298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194125
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8879	NC_014666	GTC	2	6	305504	305509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194125
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8881	NC_014666	GCG	2	6	305669	305674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194125
8882	NC_014666	GTCACC	2	12	305744	305755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312194125
8883	NC_014666	CAG	2	6	305816	305821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194125
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8902	NC_014666	CGG	2	6	306534	306539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194125
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8932	NC_014666	CGG	2	6	307631	307636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8982	NC_014666	GCGG	2	8	309818	309825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8983	NC_014666	AGCGA	2	10	309855	309864	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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8985	NC_014666	CCCG	2	8	309900	309907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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8992	NC_014666	GAC	2	6	310041	310046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8994	NC_014666	TGG	2	6	310154	310159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8996	NC_014666	GC	3	6	310259	310264	0 %	0 %	50 %	50 %	312194128
8997	NC_014666	TGG	2	6	310288	310293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194128
8998	NC_014666	TCG	2	6	310415	310420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8999	NC_014666	ATC	2	6	310448	310453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9000	NC_014666	GGGT	2	8	310471	310478	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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