MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia sp. EuI1c chromosome

Total Repeats: 259180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014666	CGA	2	6	169331	169336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194029
5002	NC_014666	GTG	2	6	169350	169355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194029
5003	NC_014666	GC	3	6	169378	169383	0 %	0 %	50 %	50 %	312194029
5004	NC_014666	GCG	2	6	169408	169413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194029
5005	NC_014666	ATC	2	6	169416	169421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194029
5006	NC_014666	CGA	2	6	169430	169435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194029
5007	NC_014666	CGA	2	6	169493	169498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194029
5008	NC_014666	TCGGC	2	10	169522	169531	0 %	20 %	40 %	40 %	312194029
5009	NC_014666	CGAC	2	8	169540	169547	25 %	0 %	25 %	50 %	312194029
5010	NC_014666	GCCCG	2	10	169628	169637	0 %	0 %	40 %	60 %	312194029
5011	NC_014666	CGG	2	6	169651	169656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194029
5012	NC_014666	CGG	2	6	169712	169717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194029
5013	NC_014666	GCG	2	6	169756	169761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194029
5014	NC_014666	GCCG	2	8	169817	169824	0 %	0 %	50 %	50 %	312194029
5015	NC_014666	TGG	2	6	169921	169926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194029
5016	NC_014666	CGT	2	6	169946	169951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194029
5017	NC_014666	CGG	2	6	169964	169969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194029
5018	NC_014666	AGGCG	2	10	170098	170107	20 %	0 %	60 %	20 %	312194029
5019	NC_014666	GAG	2	6	170131	170136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194029
5020	NC_014666	GGC	3	9	170164	170172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194030
5021	NC_014666	AGC	2	6	170187	170192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5022	NC_014666	GCT	2	6	170260	170265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5023	NC_014666	CGG	3	9	170307	170315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194030
5024	NC_014666	TCA	2	6	170463	170468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194030
5025	NC_014666	GTG	2	6	170471	170476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194030
5026	NC_014666	GGC	2	6	170497	170502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194030
5027	NC_014666	CGGCG	2	10	170542	170551	0 %	0 %	60 %	40 %	312194030
5028	NC_014666	TCT	2	6	170586	170591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312194030
5029	NC_014666	TGG	2	6	170604	170609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194030
5030	NC_014666	ACC	2	6	170651	170656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194030
5031	NC_014666	GTG	2	6	170675	170680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194030
5032	NC_014666	ACG	2	6	170702	170707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5033	NC_014666	TGC	2	6	170715	170720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5034	NC_014666	GCCG	2	8	170737	170744	0 %	0 %	50 %	50 %	312194030
5035	NC_014666	GTC	3	9	170756	170764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5036	NC_014666	GCT	2	6	170785	170790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5037	NC_014666	GCCG	2	8	170815	170822	0 %	0 %	50 %	50 %	312194030
5038	NC_014666	ACG	2	6	170873	170878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5039	NC_014666	AGC	2	6	170895	170900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5040	NC_014666	CTG	2	6	170912	170917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5041	NC_014666	TCG	2	6	170928	170933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5042	NC_014666	GAT	2	6	171007	171012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312194030
5043	NC_014666	GC	3	6	171039	171044	0 %	0 %	50 %	50 %	312194030
5044	NC_014666	GTC	3	9	171116	171124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5045	NC_014666	GGC	2	6	171133	171138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194030
5046	NC_014666	CAT	2	6	171142	171147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312194030
5047	NC_014666	CAC	2	6	171148	171153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194030
5048	NC_014666	CGG	2	6	171160	171165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194030
5049	NC_014666	CGA	2	6	171183	171188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5050	NC_014666	CTC	2	6	171200	171205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194030
5051	NC_014666	GGCCG	2	10	171221	171230	0 %	0 %	60 %	40 %	312194030
5052	NC_014666	CGC	2	6	171250	171255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194030
5053	NC_014666	GGCT	2	8	171270	171277	0 %	25 %	50 %	25 %	312194030
5054	NC_014666	TGG	2	6	171344	171349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194030
5055	NC_014666	GTCGGC	2	12	171356	171367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312194030
5056	NC_014666	CGT	2	6	171391	171396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5057	NC_014666	TCG	2	6	171411	171416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5058	NC_014666	CGC	2	6	171422	171427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194030
5059	NC_014666	GAG	2	6	171428	171433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312194030
5060	NC_014666	CGC	2	6	171453	171458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194030
5061	NC_014666	ACG	2	6	171466	171471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5062	NC_014666	CGG	2	6	171474	171479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194030
5063	NC_014666	ACC	2	6	171500	171505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194030
5064	NC_014666	CGA	2	6	171527	171532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194030
5065	NC_014666	AGCCCC	2	12	171554	171565	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_014666	GTC	2	6	171594	171599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_014666	CCGC	2	8	171610	171617	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5068	NC_014666	GGCGA	2	10	171710	171719	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5069	NC_014666	GAT	2	6	171742	171747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014666	TGATG	2	10	171798	171807	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014666	GTGG	2	8	171823	171830	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_014666	ATGT	2	8	171864	171871	25 %	50 %	25 %	0 %	312194031
5073	NC_014666	GGT	2	6	171929	171934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194031
5074	NC_014666	CCG	2	6	171970	171975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194031
5075	NC_014666	GCC	2	6	171981	171986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194031
5076	NC_014666	GCA	3	9	172002	172010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5077	NC_014666	CGCCGG	2	12	172016	172027	0 %	0 %	50 %	50 %	312194031
5078	NC_014666	CGC	2	6	172028	172033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194031
5079	NC_014666	AGC	2	6	172034	172039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5080	NC_014666	GCC	2	6	172065	172070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194031
5081	NC_014666	GC	3	6	172100	172105	0 %	0 %	50 %	50 %	312194031
5082	NC_014666	CAG	3	9	172111	172119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5083	NC_014666	CCCG	2	8	172131	172138	0 %	0 %	25 %	75 %	312194031
5084	NC_014666	GCA	2	6	172164	172169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5085	NC_014666	CAG	2	6	172315	172320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5086	NC_014666	CGGGC	2	10	172341	172350	0 %	0 %	60 %	40 %	312194031
5087	NC_014666	GGC	3	9	172348	172356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194031
5088	NC_014666	TGG	2	6	172379	172384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194031
5089	NC_014666	AGA	2	6	172391	172396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194031
5090	NC_014666	G	6	6	172440	172445	0 %	0 %	100 %	0 %	312194031
5091	NC_014666	GGT	2	6	172461	172466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194031
5092	NC_014666	GAA	2	6	172488	172493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194031
5093	NC_014666	CTCG	2	8	172512	172519	0 %	25 %	25 %	50 %	312194031
5094	NC_014666	CGG	2	6	172556	172561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194031
5095	NC_014666	GTC	3	9	172612	172620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5096	NC_014666	CCGG	2	8	172623	172630	0 %	0 %	50 %	50 %	312194031
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5100	NC_014666	TCG	2	6	172757	172762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5101	NC_014666	CGAGGT	2	12	172770	172781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312194031
5102	NC_014666	ACG	2	6	172828	172833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5103	NC_014666	CGT	2	6	172845	172850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5104	NC_014666	GCT	2	6	172878	172883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194031
5105	NC_014666	CGG	2	6	172956	172961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_014666	GGC	2	6	172962	172967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014666	GCCC	2	8	172970	172977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5108	NC_014666	GCTC	2	8	172986	172993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_014666	GCC	2	6	173025	173030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_014666	CAA	2	6	173045	173050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_014666	AGA	2	6	173125	173130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312194032
5112	NC_014666	CCT	2	6	173142	173147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312194032
5113	NC_014666	CCGG	2	8	173148	173155	0 %	0 %	50 %	50 %	312194032
5114	NC_014666	CGC	2	6	173206	173211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194032
5115	NC_014666	GAC	2	6	173247	173252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194032
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5117	NC_014666	GCT	2	6	173339	173344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194032
5118	NC_014666	TGG	2	6	173431	173436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194032
5119	NC_014666	CGCCGA	2	12	173468	173479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312194032
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5121	NC_014666	GCC	2	6	173531	173536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194032
5122	NC_014666	CGA	2	6	173558	173563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194032
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5242	NC_014666	CGG	2	6	177945	177950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_014666	C	6	6	177962	177967	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5368	NC_014666	GTC	2	6	182018	182023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194037
5369	NC_014666	ACG	2	6	182024	182029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194037
5370	NC_014666	CGG	2	6	182036	182041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NC_014666	CAGG	2	8	182046	182053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5372	NC_014666	CCGCG	2	10	182103	182112	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5373	NC_014666	CACCC	2	10	182148	182157	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5374	NC_014666	CG	3	6	182236	182241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5375	NC_014666	CGC	2	6	182250	182255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5376	NC_014666	GGC	2	6	182351	182356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5377	NC_014666	GAC	2	6	182407	182412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194038
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5379	NC_014666	GTC	2	6	182521	182526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194038
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5384	NC_014666	GGT	2	6	182701	182706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312194038
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5392	NC_014666	GCG	2	6	182947	182952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194038
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5401	NC_014666	CCGA	2	8	183129	183136	25 %	0 %	25 %	50 %	312194039
5402	NC_014666	CGG	2	6	183149	183154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194039
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5415	NC_014666	G	6	6	183439	183444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5416	NC_014666	CCGA	2	8	183449	183456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5417	NC_014666	CCAG	2	8	183557	183564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5418	NC_014666	CG	3	6	183587	183592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5420	NC_014666	GCCG	2	8	183647	183654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5421	NC_014666	CGGC	2	8	183664	183671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5457	NC_014666	TGA	2	6	185069	185074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5471	NC_014666	GGC	2	6	185461	185466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194041
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5479	NC_014666	CCGG	2	8	185596	185603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5480	NC_014666	GCC	3	9	185679	185687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194042
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5487	NC_014666	TCCAGC	2	12	186012	186023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312194042
5488	NC_014666	CGA	2	6	186061	186066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312194042
5489	NC_014666	CGC	2	6	186133	186138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194042
5490	NC_014666	ACC	2	6	186159	186164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194042
5491	NC_014666	CGT	2	6	186175	186180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194042
5492	NC_014666	GCG	2	6	186192	186197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194042
5493	NC_014666	GCG	2	6	186270	186275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312194042
5494	NC_014666	TCG	2	6	186301	186306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312194042
5495	NC_014666	CCGGC	2	10	186309	186318	0 %	0 %	40 %	60 %	312194042
5496	NC_014666	GCC	2	6	186326	186331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194042
5497	NC_014666	ACC	2	6	186354	186359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312194042
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5499	NC_014666	GCC	2	6	186548	186553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194042
5500	NC_014666	GCC	2	6	186560	186565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312194042

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