MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 70132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009613	TTA	2	6	41994	41999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1002	NC_009613	GGT	2	6	42045	42050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024130
1003	NC_009613	CTTTA	2	10	42099	42108	20 %	60 %	0 %	20 %	150024130
1004	NC_009613	TCCAAT	2	12	42183	42194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1005	NC_009613	ACA	2	6	42226	42231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024130
1006	NC_009613	AG	3	6	42268	42273	50 %	0 %	50 %	0 %	150024130
1007	NC_009613	TAT	2	6	42347	42352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1008	NC_009613	ACT	2	6	42358	42363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1009	NC_009613	TGTAA	2	10	42376	42385	40 %	40 %	20 %	0 %	150024130
1010	NC_009613	TTA	2	6	42395	42400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1011	NC_009613	GGA	2	6	42415	42420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150024130
1012	NC_009613	ACG	2	6	42530	42535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024130
1013	NC_009613	ATT	2	6	42604	42609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1014	NC_009613	TAG	2	6	42620	42625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150024130
1015	NC_009613	TG	3	6	42631	42636	0 %	50 %	50 %	0 %	150024130
1016	NC_009613	CAG	2	6	42674	42679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024130
1017	NC_009613	TCA	2	6	42757	42762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1018	NC_009613	TACA	2	8	42767	42774	50 %	25 %	0 %	25 %	150024130
1019	NC_009613	CAAC	2	8	42862	42869	50 %	0 %	0 %	50 %	150024130
1020	NC_009613	TTATAC	2	12	42930	42941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150024130
1021	NC_009613	TAT	2	6	42944	42949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1022	NC_009613	GTA	2	6	42961	42966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150024130
1023	NC_009613	AGCC	2	8	43000	43007	25 %	0 %	25 %	50 %	150024130
1024	NC_009613	TTAAC	2	10	43157	43166	40 %	40 %	0 %	20 %	150024130
1025	NC_009613	CTG	2	6	43205	43210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150024130
1026	NC_009613	TAC	2	6	43218	43223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1027	NC_009613	ATT	2	6	43225	43230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1028	NC_009613	TCA	2	6	43234	43239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1029	NC_009613	GTT	2	6	43282	43287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
1030	NC_009613	AAT	2	6	43315	43320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
1031	NC_009613	CCA	2	6	43354	43359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150024130
1032	NC_009613	TGC	2	6	43383	43388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150024130
1033	NC_009613	CTA	2	6	43412	43417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1034	NC_009613	GGT	2	6	43438	43443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024130
1035	NC_009613	GTG	2	6	43478	43483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024130
1036	NC_009613	TGC	2	6	43527	43532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150024130
1037	NC_009613	GTT	2	6	43571	43576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
1038	NC_009613	ACTGCT	2	12	43582	43593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150024130
1039	NC_009613	TAA	2	6	43595	43600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
1040	NC_009613	TA	3	6	43606	43611	50 %	50 %	0 %	0 %	150024130
1041	NC_009613	GTT	2	6	43630	43635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
1042	NC_009613	AAT	2	6	43639	43644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
1043	NC_009613	TAC	2	6	43656	43661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1044	NC_009613	TGG	2	6	43695	43700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024130
1045	NC_009613	CAA	2	6	43739	43744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024130
1046	NC_009613	AC	3	6	43772	43777	50 %	0 %	0 %	50 %	150024130
1047	NC_009613	ATTA	2	8	43890	43897	50 %	50 %	0 %	0 %	150024130
1048	NC_009613	ATA	2	6	43898	43903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
1049	NC_009613	ATA	2	6	43928	43933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
1050	NC_009613	GAT	3	9	43960	43968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150024130
1051	NC_009613	CAA	2	6	43976	43981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024130
1052	NC_009613	TAGTGC	2	12	44046	44057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150024130
1053	NC_009613	AT	3	6	44092	44097	50 %	50 %	0 %	0 %	150024130
1054	NC_009613	CCA	2	6	44122	44127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150024130
1055	NC_009613	CAA	2	6	44165	44170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024130
1056	NC_009613	AAC	2	6	44224	44229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024130
1057	NC_009613	TGG	2	6	44253	44258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024130
1058	NC_009613	CTA	2	6	44399	44404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1059	NC_009613	AACC	2	8	44415	44422	50 %	0 %	0 %	50 %	150024130
1060	NC_009613	CAA	2	6	44423	44428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024130
1061	NC_009613	TAA	2	6	44429	44434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
1062	NC_009613	TGC	3	9	44445	44453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150024130
1063	NC_009613	CTTG	2	8	44464	44471	0 %	50 %	25 %	25 %	150024130
1064	NC_009613	TTG	2	6	44507	44512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
1065	NC_009613	ATT	2	6	44528	44533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1066	NC_009613	CTA	2	6	44558	44563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024130
1067	NC_009613	CAAC	2	8	44692	44699	50 %	0 %	0 %	50 %	150024130
1068	NC_009613	TGT	2	6	44700	44705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
1069	NC_009613	TATAGT	2	12	44794	44805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150024130
1070	NC_009613	TAT	2	6	44887	44892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1071	NC_009613	ATT	2	6	44970	44975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
1072	NC_009613	TTA	2	6	45020	45025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024130
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1074	NC_009613	GGT	2	6	45090	45095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024130
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1081	NC_009613	TCTAT	2	10	45506	45515	20 %	60 %	0 %	20 %	150024130
1082	NC_009613	ATTT	2	8	45560	45567	25 %	75 %	0 %	0 %	150024130
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1086	NC_009613	TA	4	8	45969	45976	50 %	50 %	0 %	0 %	150024130
1087	NC_009613	TTG	2	6	46097	46102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
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1089	NC_009613	ATA	2	6	46151	46156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024130
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1091	NC_009613	ATG	2	6	46229	46234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150024130
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1094	NC_009613	CTAAT	2	10	46334	46343	40 %	40 %	0 %	20 %	150024130
1095	NC_009613	GATA	2	8	46357	46364	50 %	25 %	25 %	0 %	150024130
1096	NC_009613	TAG	3	9	46373	46381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150024130
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1099	NC_009613	TGA	2	6	46479	46484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150024130
1100	NC_009613	TTG	2	6	46487	46492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024130
1101	NC_009613	ATA	2	6	46535	46540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009613	TAAA	2	8	46545	46552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009613	GCCA	2	8	46633	46640	25 %	0 %	25 %	50 %	150024131
1104	NC_009613	CA	3	6	46639	46644	50 %	0 %	0 %	50 %	150024131
1105	NC_009613	TA	3	6	46816	46821	50 %	50 %	0 %	0 %	150024131
1106	NC_009613	ATT	3	9	46890	46898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024131
1107	NC_009613	TC	3	6	46921	46926	0 %	50 %	0 %	50 %	150024131
1108	NC_009613	TGT	2	6	47028	47033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150024131
1109	NC_009613	A	7	7	47038	47044	100 %	0 %	0 %	0 %	150024131
1110	NC_009613	TAAA	2	8	47079	47086	75 %	25 %	0 %	0 %	150024131
1111	NC_009613	ATC	2	6	47104	47109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150024131
1112	NC_009613	CAAC	2	8	47281	47288	50 %	0 %	0 %	50 %	150024131
1113	NC_009613	A	6	6	47378	47383	100 %	0 %	0 %	0 %	150024131
1114	NC_009613	AGCA	2	8	47488	47495	50 %	0 %	25 %	25 %	150024131
1115	NC_009613	T	7	7	47535	47541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009613	A	8	8	47548	47555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009613	ATT	2	6	47566	47571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009613	TAA	2	6	47604	47609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009613	ACA	2	6	47631	47636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009613	AC	3	6	47645	47650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_009613	A	6	6	47695	47700	100 %	0 %	0 %	0 %	150024132
1122	NC_009613	TAA	2	6	47705	47710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024132
1123	NC_009613	CAA	2	6	47783	47788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150024132
1124	NC_009613	TAAA	2	8	47789	47796	75 %	25 %	0 %	0 %	150024132
1125	NC_009613	TGG	2	6	47808	47813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024132
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1127	NC_009613	GAA	2	6	47944	47949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150024132
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